MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 7841

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016112	GAT	2	6	41	46	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016112	ATA	2	6	117	122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016112	TCT	2	6	144	149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016112	AGA	2	6	1508	1513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016112	CGG	2	6	2950	2955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016112	GCC	2	6	2964	2969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_016112	ATT	2	6	3124	3129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016112	CAA	2	6	3141	3146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016112	TTG	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016112	TAA	2	6	3207	3212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016112	GTA	2	6	4328	4333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016112	CTG	2	6	6867	6872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016112	CAA	2	6	6910	6915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016112	AGA	2	6	6972	6977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016112	ACA	2	6	6987	6992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016112	GAA	2	6	7125	7130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016112	CCA	2	6	7472	7477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_016112	GTT	2	6	7928	7933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016112	CTG	2	6	7946	7951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016112	TAA	2	6	13852	13857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016112	TTC	2	6	13896	13901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016112	TAA	2	6	13918	13923	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016112	TAA	2	6	13928	13933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016112	TAA	2	6	13937	13942	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016112	TGT	2	6	13959	13964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016112	CGG	2	6	17940	17945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016112	CGG	2	6	17954	17959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016112	GGA	2	6	18014	18019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016112	GCC	2	6	18027	18032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016112	TCC	2	6	18051	18056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_016112	CGC	2	6	18062	18067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016112	CCG	2	6	18311	18316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016112	CTG	2	6	18352	18357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016112	TCA	2	6	18550	18555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016112	CGG	2	6	21876	21881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016112	CTA	2	6	21933	21938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016112	GCC	2	6	21965	21970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016112	CTC	2	6	22032	22037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016112	TGA	2	6	22057	22062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016112	AAG	2	6	22103	22108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016112	GTT	2	6	23320	23325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016112	GCG	2	6	23424	23429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016112	CAC	2	6	25333	25338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_016112	GAG	2	6	25362	25367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016112	TGC	2	6	25945	25950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016112	ATG	2	6	25959	25964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016112	AAC	2	6	27152	27157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016112	ATC	2	6	27160	27165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016112	TGT	2	6	27175	27180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016112	CAA	2	6	27223	27228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016112	TGA	2	6	27229	27234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016112	ATT	2	6	29024	29029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016112	TTA	2	6	29276	29281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016112	ATA	2	6	31716	31721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016112	ATA	2	6	31739	31744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016112	ATA	2	6	31775	31780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016112	CTG	2	6	33191	33196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016112	GTG	2	6	33379	33384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016112	ATT	2	6	33512	33517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016112	CGG	2	6	33622	33627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016112	GCC	2	6	33684	33689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_016112	AAT	2	6	33784	33789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016112	CTG	2	6	34010	34015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016112	TGA	2	6	35242	35247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016112	AAT	2	6	38163	38168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016112	GAT	2	6	39232	39237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016112	AAT	2	6	39271	39276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016112	CTG	2	6	39297	39302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016112	CCT	2	6	39388	39393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_016112	GTC	2	6	39405	39410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016112	AAT	2	6	39494	39499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016112	TGT	3	9	39532	39540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016112	TTA	2	6	39547	39552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016112	CGG	2	6	39661	39666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016112	GCC	2	6	39673	39678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_016112	CCA	2	6	39737	39742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_016112	GCG	2	6	41143	41148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_016112	ATG	2	6	41209	41214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016112	TTA	2	6	41283	41288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016112	GGT	3	9	44554	44562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016112	AAC	2	6	44574	44579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016112	CGC	2	6	44856	44861	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_016112	AGC	2	6	44865	44870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016112	GTG	2	6	44895	44900	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016112	TTG	2	6	44962	44967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016112	AAC	2	6	44972	44977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016112	CGC	2	6	45022	45027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_016112	TAC	2	6	45058	45063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016112	CGC	2	6	45165	45170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_016112	GGC	2	6	45176	45181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016112	TTC	2	6	45193	45198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016112	ATG	2	6	45316	45321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016112	TGA	2	6	45359	45364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016112	TAC	2	6	45394	45399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016112	TCT	2	6	46602	46607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016112	CAT	2	6	46655	46660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016112	CTT	2	6	47414	47419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016112	ACA	2	6	47482	47487	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016112	CCT	2	6	50621	50626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_016112	CCG	2	6	50634	50639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_016112	CGT	2	6	51436	51441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016112	CCT	2	6	51598	51603	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_016112	ATA	2	6	51708	51713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016112	AGC	2	6	51720	51725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016112	GGC	2	6	51810	51815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016112	CTG	2	6	51969	51974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016112	AGT	2	6	52079	52084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016112	GCA	2	6	57269	57274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016112	GGC	2	6	57358	57363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016112	GAG	2	6	57464	57469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016112	CTG	2	6	57482	57487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016112	TGC	2	6	57542	57547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016112	GTT	3	9	65991	65999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016112	CCT	2	6	66804	66809	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_016112	ATT	2	6	66917	66922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016112	ATG	2	6	66946	66951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016112	TAT	2	6	66964	66969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016112	AAT	2	6	73192	73197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016112	AGT	2	6	74932	74937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016112	CGG	2	6	75002	75007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016112	ATT	2	6	75228	75233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016112	CTT	2	6	77304	77309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016112	CGG	2	6	77373	77378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016112	CTC	2	6	77443	77448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_016112	CGC	2	6	77569	77574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_016112	AAT	2	6	77644	77649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016112	CAA	2	6	77697	77702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016112	CGT	2	6	77771	77776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016112	TGA	2	6	77793	77798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016112	TTG	3	9	77830	77838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016112	TTA	2	6	78969	78974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016112	AGC	2	6	80598	80603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016112	GAG	2	6	82736	82741	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016112	TTG	2	6	82749	82754	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016112	TAC	2	6	82756	82761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016112	AGG	2	6	82765	82770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016112	AGC	2	6	87577	87582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016112	TAG	2	6	87610	87615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016112	ATT	2	6	87629	87634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016112	TGC	2	6	91242	91247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_016112	TAA	2	6	95067	95072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016112	GGC	2	6	95283	95288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016112	CAA	2	6	95424	95429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_016112	TAT	2	6	96353	96358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016112	TTA	2	6	96368	96373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016112	ATC	2	6	96422	96427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_016112	GCG	2	6	97159	97164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_016112	CAA	2	6	97192	97197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_016112	AGT	2	6	97224	97229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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163	NC_016112	GAG	2	6	116478	116483	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_016112	ATT	2	6	235308	235313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_016112	TCA	2	6	243361	243366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
450	NC_016112	TTC	2	6	245332	245337	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
451	NC_016112	CCT	2	6	245633	245638	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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