MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptomyces flavogriseus ATCC 33331 plasmid pSFLA01

Total Repeats: 129

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016110	GGTGTA	2	12	1473	1484	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	357409093
2	NC_016110	GCACCA	2	12	6667	6678	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	357409097
3	NC_016110	GTCAGG	2	12	7567	7578	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	357409098
4	NC_016110	ATCGTG	2	12	12627	12638	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357409104
5	NC_016110	CCGCAC	2	12	12707	12718	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	357409104
6	NC_016110	GCACCT	2	12	14270	14281	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	357409105
7	NC_016110	CGGCAC	2	12	14714	14725	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357409105
8	NC_016110	GGGCCT	2	12	20349	20360	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016110	CCACGG	2	12	20766	20777	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357409111
10	NC_016110	GCCTGT	2	12	23291	23302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357409114
11	NC_016110	GTGGGC	2	12	24567	24578	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016110	CGGGGC	2	12	27883	27894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016110	ACCGGC	2	12	28678	28689	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016110	CAGCGT	2	12	31214	31225	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357409120
15	NC_016110	CACCGC	2	12	32012	32023	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	357409122
16	NC_016110	GGCGCA	2	12	34396	34407	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357409125
17	NC_016110	CGAGGT	2	12	34614	34625	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	357409125
18	NC_016110	CCTCGT	2	12	37766	37777	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	357409128
19	NC_016110	GACCGA	2	12	40672	40683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357409131
20	NC_016110	GCTGGC	2	12	41050	41061	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357409131
21	NC_016110	CGGCCC	2	12	43382	43393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357409133
22	NC_016110	TACGGC	2	12	43734	43745	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357409134
23	NC_016110	GAGCCG	2	12	43792	43803	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357409134
24	NC_016110	CGCGGG	2	12	44736	44747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016110	CGCGGG	2	12	44797	44808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016110	CGCGGG	2	12	44858	44869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016110	CGCGGG	2	12	44919	44930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016110	CGCGGG	2	12	44980	44991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016110	CGCGGG	2	12	45041	45052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016110	CGTCAC	2	12	51778	51789	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	357409143
31	NC_016110	TCCGCC	2	12	51864	51875	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	357409143
32	NC_016110	CGCGGG	2	12	52242	52253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016110	CGCGGG	2	12	52364	52375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016110	CGCGGG	2	12	52425	52436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016110	CGCGGG	2	12	52492	52503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016110	CGCGGG	2	12	52553	52564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016110	CGCGGG	2	12	52614	52625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016110	CGCGGG	2	12	52675	52686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016110	CGCGGG	2	12	52736	52747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016110	CGCGGG	2	12	52797	52808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016110	CGCGGG	2	12	52858	52869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016110	GGCCGG	2	12	53541	53552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357409145
43	NC_016110	GCCGAG	2	12	54346	54357	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357409145
44	NC_016110	CAGCGG	2	12	55119	55130	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357409145
45	NC_016110	CCCGGA	2	12	56789	56800	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357409147
46	NC_016110	CCTGGG	2	12	58102	58113	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357409148
47	NC_016110	GCAGGA	2	12	60342	60353	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	357409149
48	NC_016110	TGGGGG	2	12	63414	63425	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	357409153
49	NC_016110	CAGGCC	2	12	64240	64251	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357409153
50	NC_016110	GACGCG	2	12	66148	66159	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357409156
51	NC_016110	GCTGCC	2	12	66415	66426	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	357409156
52	NC_016110	CTCGCC	2	12	66787	66798	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	357409156
53	NC_016110	CTCGGG	2	12	67758	67769	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357409157
54	NC_016110	GGAGTG	2	12	69707	69718	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	357409158
55	NC_016110	AGCGCG	2	12	70958	70969	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357409159
56	NC_016110	CGCCGA	2	12	71804	71815	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016110	TCGGCC	2	12	72558	72569	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	357409160
58	NC_016110	CGGCGC	2	12	74605	74616	0 %	0 %	50 %	50 %	357409162
59	NC_016110	CACAGC	2	12	75953	75964	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	357409164
60	NC_016110	TGGCCA	2	12	77738	77749	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357409165
61	NC_016110	GCGTCG	2	12	78045	78056	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357409166
62	NC_016110	CGGAGG	2	12	78082	78093	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	357409166
63	NC_016110	CGCCGA	2	12	78374	78385	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357409166
64	NC_016110	GAGGCG	2	12	78414	78425	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	357409166
65	NC_016110	CGGCAC	2	12	81696	81707	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357409170
66	NC_016110	CCTCAC	2	12	81783	81794	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	357409170
67	NC_016110	GCTCCA	2	12	82123	82134	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	357409171
68	NC_016110	TCCCGG	2	12	82455	82466	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	357409171
69	NC_016110	CCGAGG	2	12	83717	83728	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357409172
70	NC_016110	GGACGA	2	12	89101	89112	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	357409175
71	NC_016110	TCGACG	2	12	89914	89925	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016110	CCGCGA	2	12	91624	91635	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357409176
73	NC_016110	GAGTCA	2	12	92789	92800	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016110	GAGCGT	2	12	93258	93269	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016110	TCCCGT	2	12	95052	95063	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	357409181
76	NC_016110	GGCCTG	2	12	98179	98190	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016110	TGTAGC	2	12	100519	100530	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357409184
78	NC_016110	CCCTCC	2	12	101526	101537	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
79	NC_016110	ATCGCG	2	12	102774	102785	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357409185
80	NC_016110	CGGGCT	2	12	104039	104050	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357409187
81	NC_016110	CAACGC	2	12	104460	104471	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	357409187
82	NC_016110	CTCTGT	2	12	109724	109735	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	357409191
83	NC_016110	CGAGGT	2	12	113153	113164	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	357409194
84	NC_016110	TGTCGA	2	12	115897	115908	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016110	CGGACT	2	12	117223	117234	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357409197
86	NC_016110	ACTGGA	2	12	119489	119500	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_016110	GCCCGC	2	12	123608	123619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357409202
88	NC_016110	ACTGGC	2	12	125266	125277	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357409203
89	NC_016110	TTCCCG	2	12	125893	125904	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016110	CGTCGA	2	12	126566	126577	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357409204
91	NC_016110	GGCGGG	2	12	128015	128026	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016110	CGGGGG	2	12	132093	132104	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	357409206
93	NC_016110	TGGGGG	2	12	133271	133282	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	357409208
94	NC_016110	CCGGAT	2	12	133894	133905	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016110	CGGTGG	2	12	134027	134038	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016110	CCAGCC	2	12	134761	134772	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016110	GGCTGC	2	12	137568	137579	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357409209
98	NC_016110	GGAGCC	2	12	140517	140528	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357409212
99	NC_016110	AAGGCC	2	12	140644	140655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357409212
100	NC_016110	GTCACC	2	12	142715	142726	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	357409214
101	NC_016110	CGAGGA	2	12	143585	143596	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	357409215
102	NC_016110	CGGCAC	2	12	146703	146714	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016110	GATCCC	2	12	147957	147968	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	357409219
104	NC_016110	ACGCGG	2	12	149440	149451	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357409220
105	NC_016110	GCAGCT	2	12	155712	155723	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016110	CCAACC	2	12	156458	156469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016110	GGTGCC	2	12	159325	159336	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_016110	CGTGGA	2	12	162035	162046	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_016110	ACGCCC	2	12	163353	163364	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	357409237
110	NC_016110	GCCCAC	2	12	164309	164320	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	357409239
111	NC_016110	CGCCAC	2	12	164558	164569	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	357409239
112	NC_016110	GGGCCA	2	12	166357	166368	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016110	CGCCAG	2	12	167921	167932	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357409241
114	NC_016110	GGATGC	2	12	168440	168451	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	357409242
115	NC_016110	CAGGCC	2	12	169509	169520	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016110	CACGGT	2	12	170525	170536	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	357409244
117	NC_016110	GCCGTC	2	12	171461	171472	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	357409244
118	NC_016110	CCCGCC	2	12	173453	173464	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	357409245
119	NC_016110	CGGTGC	2	12	173715	173726	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357409245
120	NC_016110	GGTGTG	2	12	176426	176437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357409249
121	NC_016110	GAGGCG	2	12	178332	178343	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	357409251
122	NC_016110	ACCATC	2	12	178393	178404	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	357409251
123	NC_016110	TCGGTG	2	12	178810	178821	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	357409251
124	NC_016110	CCGGCC	2	12	180316	180327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357409253
125	NC_016110	CCCGCC	2	12	180399	180410	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	357409253
126	NC_016110	GGGCTT	2	12	181483	181494	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	357409254
127	NC_016110	CCAGGG	2	12	183821	183832	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357409255
128	NC_016110	GGAAGG	2	12	183872	183883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357409256
129	NC_016110	CCCCGC	2	12	185297	185308	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.