MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces flavogriseus ATCC 33331 plasmid pSFLA01

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016110	CCGGC	2	10	756	765	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_016110	GCCGG	2	10	773	782	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016110	CAGCG	2	10	3048	3057	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_016110	GGCAG	2	10	3117	3126	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016110	TCTCT	2	10	3491	3500	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016110	GGGCC	2	10	3726	3735	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016110	ATCGG	2	10	3790	3799	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016110	CGGGG	2	10	4918	4927	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016110	AAGCC	2	10	7417	7426	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016110	GCGCC	2	10	10065	10074	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11	NC_016110	CGGCG	2	10	10413	10422	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_016110	CGCAA	2	10	13572	13581	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016110	TCCCC	2	10	14844	14853	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
14	NC_016110	CGGCC	2	10	19023	19032	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
15	NC_016110	GCCGT	2	10	22578	22587	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016110	AAGGG	2	10	23715	23724	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016110	GGTGA	2	10	23916	23925	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016110	CCGGC	2	10	25985	25994	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
19	NC_016110	TTGGC	2	10	27769	27778	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016110	AGGAC	2	10	28377	28386	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016110	CGTCA	2	10	28550	28559	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016110	GCCTC	2	10	32995	33004	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_016110	CTGCA	2	10	33032	33041	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016110	GTGGC	2	10	38190	38199	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016110	GCCCA	2	10	56018	56027	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_016110	GCCGT	2	10	65064	65073	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
27	NC_016110	CCACA	2	10	73987	73996	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_016110	GGTGG	2	10	77977	77986	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016110	GGCGG	2	10	79721	79730	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016110	GCCCG	2	10	80870	80879	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
31	NC_016110	ACACC	2	10	81912	81921	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
32	NC_016110	CGTGA	2	10	95885	95894	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016110	GGCGG	2	10	96030	96039	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016110	GACAG	2	10	97477	97486	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016110	TCGGC	2	10	98775	98784	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016110	GGCGG	2	10	107068	107077	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
37	NC_016110	CGGCG	2	10	107185	107194	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
38	NC_016110	CGCCT	2	10	111530	111539	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_016110	CGGCA	2	10	111541	111550	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
40	NC_016110	CAGGC	2	10	115303	115312	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016110	CAGGC	2	10	115505	115514	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016110	GCGTC	2	10	120109	120118	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016110	CCGCC	2	10	134445	134454	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
44	NC_016110	TCCCG	2	10	146271	146280	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
45	NC_016110	GGACT	2	10	147028	147037	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016110	CTTGG	2	10	151867	151876	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016110	GCCTT	2	10	156732	156741	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016110	GTGCG	2	10	159198	159207	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016110	GCGAC	2	10	161986	161995	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_016110	AGCCG	2	10	169618	169627	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_016110	CCGTT	2	10	173051	173060	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_016110	CGCAC	2	10	175339	175348	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
53	NC_016110	GTGCG	2	10	175370	175379	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016110	CCGCC	2	10	176256	176265	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
55	NC_016110	ACTCC	2	10	184886	184895	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_016110	CGGGC	2	10	184925	184934	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
57	NC_016110	CCGGG	2	10	185246	185255	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
58	NC_016110	TCCGC	2	10	185286	185295	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
59	NC_016110	CCGCG	2	10	185349	185358	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_016110	CGGGG	2	10	185770	185779	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016110	TGGGG	2	10	185875	185884	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.