MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces flavogriseus ATCC 33331 plasmid pSFLA01

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016110	ACCGC	2	10	7362	7371	20 %	0 %	20 %	60 %	357409097
2	NC_016110	GTGGA	2	10	8436	8445	20 %	20 %	60 %	0 %	357409099
3	NC_016110	CGGTC	2	10	9324	9333	0 %	20 %	40 %	40 %	357409100
4	NC_016110	ACTGC	2	10	10660	10669	20 %	20 %	20 %	40 %	357409101
5	NC_016110	TCCCT	2	10	12675	12684	0 %	40 %	0 %	60 %	357409104
6	NC_016110	TCTGC	2	10	14792	14801	0 %	40 %	20 %	40 %	357409105
7	NC_016110	GCTGC	2	10	15309	15318	0 %	20 %	40 %	40 %	357409106
8	NC_016110	GTGCG	2	10	15519	15528	0 %	20 %	60 %	20 %	357409107
9	NC_016110	CCCGT	2	10	15960	15969	0 %	20 %	20 %	60 %	357409107
10	NC_016110	CGGGG	2	10	16550	16559	0 %	0 %	80 %	20 %	357409108
11	NC_016110	AGCAG	2	10	19535	19544	40 %	0 %	40 %	20 %	357409110
12	NC_016110	CTCAC	2	10	20028	20037	20 %	20 %	0 %	60 %	357409110
13	NC_016110	CGGGA	2	10	20862	20871	20 %	0 %	60 %	20 %	357409111
14	NC_016110	CGGGC	2	10	21412	21421	0 %	0 %	60 %	40 %	357409112
15	NC_016110	GCCCC	2	10	23062	23071	0 %	0 %	20 %	80 %	357409114
16	NC_016110	TGCGG	2	10	24804	24813	0 %	20 %	60 %	20 %	357409116
17	NC_016110	GACGG	2	10	24925	24934	20 %	0 %	60 %	20 %	357409116
18	NC_016110	GGGCG	2	10	25165	25174	0 %	0 %	80 %	20 %	357409116
19	NC_016110	AGGCG	2	10	26350	26359	20 %	0 %	60 %	20 %	357409117
20	NC_016110	TGAGC	2	10	26543	26552	20 %	20 %	40 %	20 %	357409117
21	NC_016110	GCGCA	2	10	29772	29781	20 %	0 %	40 %	40 %	357409119
22	NC_016110	CGGGG	2	10	31142	31151	0 %	0 %	80 %	20 %	357409120
23	NC_016110	GGCCG	2	10	31402	31411	0 %	0 %	60 %	40 %	357409121
24	NC_016110	CGGCC	2	10	35996	36005	0 %	0 %	40 %	60 %	357409126
25	NC_016110	CGGCC	2	10	39821	39830	0 %	0 %	40 %	60 %	357409130
26	NC_016110	CGCGG	2	10	39906	39915	0 %	0 %	60 %	40 %	357409130
27	NC_016110	ACCGC	2	10	41379	41388	20 %	0 %	20 %	60 %	357409131
28	NC_016110	CCGAC	2	10	41481	41490	20 %	0 %	20 %	60 %	357409132
29	NC_016110	CGGCC	2	10	41688	41697	0 %	0 %	40 %	60 %	357409132
30	NC_016110	GATCG	2	10	43896	43905	20 %	20 %	40 %	20 %	357409134
31	NC_016110	CCGCA	2	10	45740	45749	20 %	0 %	20 %	60 %	357409136
32	NC_016110	GAGCA	2	10	46429	46438	40 %	0 %	40 %	20 %	357409138
33	NC_016110	GTCCG	2	10	46518	46527	0 %	20 %	40 %	40 %	357409139
34	NC_016110	GACCG	2	10	48151	48160	20 %	0 %	40 %	40 %	357409140
35	NC_016110	CGTTC	2	10	51283	51292	0 %	40 %	20 %	40 %	357409143
36	NC_016110	GCCGG	2	10	53048	53057	0 %	0 %	60 %	40 %	357409144
37	NC_016110	CCGCT	2	10	53400	53409	0 %	20 %	20 %	60 %	357409144
38	NC_016110	ACAGC	2	10	55074	55083	40 %	0 %	20 %	40 %	357409145
39	NC_016110	TCGAC	2	10	55908	55917	20 %	20 %	20 %	40 %	357409146
40	NC_016110	CGGCC	2	10	56551	56560	0 %	0 %	40 %	60 %	357409147
41	NC_016110	CAGGA	2	10	56593	56602	40 %	0 %	40 %	20 %	357409147
42	NC_016110	TCGTC	2	10	56612	56621	0 %	40 %	20 %	40 %	357409147
43	NC_016110	CGTCC	2	10	57934	57943	0 %	20 %	20 %	60 %	357409148
44	NC_016110	CCGGT	2	10	61238	61247	0 %	20 %	40 %	40 %	357409150
45	NC_016110	CGCAC	2	10	61908	61917	20 %	0 %	20 %	60 %	357409151
46	NC_016110	GGCCA	2	10	62880	62889	20 %	0 %	40 %	40 %	357409152
47	NC_016110	CTCAA	2	10	63600	63609	40 %	20 %	0 %	40 %	357409153
48	NC_016110	AGGGC	2	10	63795	63804	20 %	0 %	60 %	20 %	357409153
49	NC_016110	CTGGG	2	10	68697	68706	0 %	20 %	60 %	20 %	357409158
50	NC_016110	CCGCA	2	10	70617	70626	20 %	0 %	20 %	60 %	357409158
51	NC_016110	GCCCC	2	10	71065	71074	0 %	0 %	20 %	80 %	357409159
52	NC_016110	GGTGA	2	10	71180	71189	20 %	20 %	60 %	0 %	357409159
53	NC_016110	CCCTG	2	10	74410	74419	0 %	20 %	20 %	60 %	357409162
54	NC_016110	GGGCA	2	10	75090	75099	20 %	0 %	60 %	20 %	357409163
55	NC_016110	TGGCC	2	10	75182	75191	0 %	20 %	40 %	40 %	357409163
56	NC_016110	ACGGT	2	10	75589	75598	20 %	20 %	40 %	20 %	357409163
57	NC_016110	GCTGC	2	10	78675	78684	0 %	20 %	40 %	40 %	357409167
58	NC_016110	CCGCG	2	10	80604	80613	0 %	0 %	40 %	60 %	357409169
59	NC_016110	CCGCA	2	10	81346	81355	20 %	0 %	20 %	60 %	357409170
60	NC_016110	GTGCG	2	10	83822	83831	0 %	20 %	60 %	20 %	357409172
61	NC_016110	AGCGC	2	10	85106	85115	20 %	0 %	40 %	40 %	357409173
62	NC_016110	GATCT	2	10	85861	85870	20 %	40 %	20 %	20 %	357409173
63	NC_016110	CCGCC	2	10	88995	89004	0 %	0 %	20 %	80 %	357409175
64	NC_016110	CGCCT	2	10	90327	90336	0 %	20 %	20 %	60 %	357409176
65	NC_016110	AGTCG	2	10	91090	91099	20 %	20 %	40 %	20 %	357409176
66	NC_016110	GGTCT	2	10	93682	93691	0 %	40 %	40 %	20 %	357409180
67	NC_016110	TGCGT	2	10	94069	94078	0 %	40 %	40 %	20 %	357409180
68	NC_016110	GTCGA	2	10	95084	95093	20 %	20 %	40 %	20 %	357409181
69	NC_016110	GCGAG	2	10	95475	95484	20 %	0 %	60 %	20 %	357409182
70	NC_016110	AGGCG	2	10	100483	100492	20 %	0 %	60 %	20 %	357409184
71	NC_016110	GCCAG	2	10	100720	100729	20 %	0 %	40 %	40 %	357409184
72	NC_016110	TCCGA	2	10	103429	103438	20 %	20 %	20 %	40 %	357409187
73	NC_016110	GGCCT	2	10	103666	103675	0 %	20 %	40 %	40 %	357409187
74	NC_016110	CGCAG	2	10	105628	105637	20 %	0 %	40 %	40 %	357409190
75	NC_016110	CTCCG	2	10	106112	106121	0 %	20 %	20 %	60 %	357409190
76	NC_016110	GTCGG	2	10	106566	106575	0 %	20 %	60 %	20 %	357409190
77	NC_016110	CACAC	2	10	106589	106598	40 %	0 %	0 %	60 %	357409190
78	NC_016110	GACCG	2	10	108139	108148	20 %	0 %	40 %	40 %	357409191
79	NC_016110	CGTGG	2	10	109563	109572	0 %	20 %	60 %	20 %	357409191
80	NC_016110	TGTCC	2	10	109818	109827	0 %	40 %	20 %	40 %	357409191
81	NC_016110	AGCCC	2	10	110122	110131	20 %	0 %	20 %	60 %	357409191
82	NC_016110	CAGGT	2	10	110194	110203	20 %	20 %	40 %	20 %	357409191
83	NC_016110	CCGAG	2	10	113060	113069	20 %	0 %	40 %	40 %	357409194
84	NC_016110	GACTG	2	10	113391	113400	20 %	20 %	40 %	20 %	357409194
85	NC_016110	AAGCG	2	10	113682	113691	40 %	0 %	40 %	20 %	357409195
86	NC_016110	GCCAG	2	10	116905	116914	20 %	0 %	40 %	40 %	357409197
87	NC_016110	TGACC	2	10	118122	118131	20 %	20 %	20 %	40 %	357409198
88	NC_016110	TCAAC	2	10	118893	118902	40 %	20 %	0 %	40 %	357409198
89	NC_016110	CGGCC	2	10	120814	120823	0 %	0 %	40 %	60 %	357409199
90	NC_016110	GTCAT	2	10	121632	121641	20 %	40 %	20 %	20 %	357409199
91	NC_016110	CGGGC	2	10	123291	123300	0 %	0 %	60 %	40 %	357409201
92	NC_016110	CTGGT	2	10	125360	125369	0 %	40 %	40 %	20 %	357409203
93	NC_016110	GAACG	2	10	126339	126348	40 %	0 %	40 %	20 %	357409204
94	NC_016110	CGTCC	2	10	128964	128973	0 %	20 %	20 %	60 %	357409205
95	NC_016110	CCGGC	2	10	130377	130386	0 %	0 %	40 %	60 %	357409206
96	NC_016110	CGAAC	2	10	131192	131201	40 %	0 %	20 %	40 %	357409206
97	NC_016110	GCGGT	2	10	132524	132533	0 %	20 %	60 %	20 %	357409206
98	NC_016110	CTGAC	2	10	132601	132610	20 %	20 %	20 %	40 %	357409207
99	NC_016110	CAGCG	2	10	133589	133598	20 %	0 %	40 %	40 %	357409208
100	NC_016110	GGCAA	2	10	135122	135131	40 %	0 %	40 %	20 %	357409209
101	NC_016110	GGCTG	2	10	135290	135299	0 %	20 %	60 %	20 %	357409209
102	NC_016110	CGTCC	2	10	135752	135761	0 %	20 %	20 %	60 %	357409209
103	NC_016110	CCGTG	2	10	139043	139052	0 %	20 %	40 %	40 %	357409210
104	NC_016110	CGCGG	2	10	139598	139607	0 %	0 %	60 %	40 %	357409211
105	NC_016110	GCACC	2	10	139893	139902	20 %	0 %	20 %	60 %	357409211
106	NC_016110	GGCAA	2	10	142790	142799	40 %	0 %	40 %	20 %	357409214
107	NC_016110	GACGA	2	10	148057	148066	40 %	0 %	40 %	20 %	357409219
108	NC_016110	GAGTC	2	10	155490	155499	20 %	20 %	40 %	20 %	357409227
109	NC_016110	GGACC	2	10	156887	156896	20 %	0 %	40 %	40 %	357409229
110	NC_016110	CGGAC	2	10	160993	161002	20 %	0 %	40 %	40 %	357409235
111	NC_016110	CCCGG	2	10	164063	164072	0 %	0 %	40 %	60 %	357409238
112	NC_016110	CAGTC	2	10	170382	170391	20 %	20 %	20 %	40 %	357409244
113	NC_016110	CCGAC	2	10	171942	171951	20 %	0 %	20 %	60 %	357409244
114	NC_016110	GGTGC	2	10	172427	172436	0 %	20 %	60 %	20 %	357409244
115	NC_016110	GGCGC	2	10	172515	172524	0 %	0 %	60 %	40 %	357409244
116	NC_016110	TGATG	2	10	173875	173884	20 %	40 %	40 %	0 %	357409245
117	NC_016110	AGCAC	2	10	174123	174132	40 %	0 %	20 %	40 %	357409245
118	NC_016110	GCGCC	2	10	176341	176350	0 %	0 %	40 %	60 %	357409249
119	NC_016110	GACGC	2	10	177930	177939	20 %	0 %	40 %	40 %	357409250
120	NC_016110	GATCG	2	10	179595	179604	20 %	20 %	40 %	20 %	357409253
121	NC_016110	CCAGG	2	10	179850	179859	20 %	0 %	40 %	40 %	357409253
122	NC_016110	CACCG	2	10	179940	179949	20 %	0 %	20 %	60 %	357409253
123	NC_016110	GGTGG	2	10	181522	181531	0 %	20 %	80 %	0 %	357409254
124	NC_016110	GCGCA	2	10	182041	182050	20 %	0 %	40 %	40 %	357409254
125	NC_016110	GTGGC	2	10	184452	184461	0 %	20 %	60 %	20 %	357409256
126	NC_016110	CCGGG	2	10	184473	184482	0 %	0 %	60 %	40 %	357409256
127	NC_016110	TCCGC	2	10	184507	184516	0 %	20 %	20 %	60 %	357409256
128	NC_016110	ACGGA	2	10	186876	186885	40 %	0 %	40 %	20 %	357409257

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.