MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces flavogriseus ATCC 33331 plasmid pSFLA01

Total Repeats: 191

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016110	CTGC	2	8	197	204	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016110	GCAG	2	8	218	225	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016110	CAAG	2	8	286	293	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016110	CAAC	2	8	468	475	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016110	AATG	2	8	787	794	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016110	CATT	2	8	827	834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016110	AGGC	2	8	2006	2013	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016110	GCGT	2	8	2867	2874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016110	GTGC	2	8	2989	2996	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016110	CGGC	2	8	3008	3015	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016110	CCGC	2	8	3058	3065	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12	NC_016110	CCCA	2	8	3082	3089	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_016110	CGGC	2	8	3287	3294	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016110	CGGG	2	8	3590	3597	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016110	GACG	2	8	3634	3641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016110	GAGG	2	8	3669	3676	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016110	CGGT	2	8	3934	3941	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016110	CCAG	2	8	4050	4057	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016110	TCCG	2	8	4374	4381	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016110	CGGA	2	8	4499	4506	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016110	CGGC	2	8	4510	4517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016110	ACGG	2	8	4581	4588	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016110	GTCA	2	8	6321	6328	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016110	TCCC	2	8	7402	7409	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_016110	GACG	2	8	8343	8350	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016110	CGCC	2	8	10166	10173	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_016110	CCGA	2	8	10342	10349	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016110	GCCG	2	8	13195	13202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016110	CGAT	2	8	13742	13749	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016110	ACGA	2	8	13767	13774	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016110	AGGC	2	8	17290	17297	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016110	AAAG	2	8	17988	17995	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016110	CGGC	2	8	18321	18328	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016110	GGTG	2	8	19143	19150	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016110	GGCC	2	8	19254	19261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016110	CCAT	2	8	20188	20195	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016110	GTCG	2	8	20337	20344	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016110	CACC	2	8	21124	21131	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_016110	GCCC	2	8	21140	21147	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_016110	CGCT	2	8	21163	21170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016110	CGTG	2	8	22592	22599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016110	CGAC	2	8	25552	25559	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016110	CGGA	2	8	25793	25800	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016110	GAGC	2	8	27928	27935	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016110	CCCG	2	8	28183	28190	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_016110	CCGC	2	8	28276	28283	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
47	NC_016110	CCCG	2	8	28430	28437	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_016110	CGCT	2	8	28948	28955	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016110	ACCC	2	8	29356	29363	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_016110	ACGG	2	8	30674	30681	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016110	AGGG	2	8	33022	33029	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016110	CCGG	2	8	33106	33113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016110	GCCT	2	8	33115	33122	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016110	AGGC	2	8	33144	33151	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016110	TGAC	2	8	33997	34004	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016110	GACG	2	8	35081	35088	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016110	CGAT	2	8	35167	35174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016110	CAGG	2	8	35373	35380	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016110	GCTC	2	8	35451	35458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016110	GTCG	2	8	35522	35529	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016110	CGGA	2	8	35715	35722	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016110	GCCG	2	8	35817	35824	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016110	CCTC	2	8	37861	37868	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_016110	GAGC	2	8	38408	38415	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016110	ACGG	2	8	38456	38463	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016110	TGGG	2	8	38469	38476	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016110	GCCC	2	8	44160	44167	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_016110	GTCC	2	8	45234	45241	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016110	ACCC	2	8	49047	49054	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
70	NC_016110	GCTT	2	8	50956	50963	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016110	TACT	2	8	51005	51012	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016110	CGGT	2	8	52320	52327	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016110	ACCC	2	8	56063	56070	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
74	NC_016110	TCCG	2	8	63229	63236	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016110	CGGG	2	8	67400	67407	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016110	GCCA	2	8	71646	71653	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016110	CCCA	2	8	73425	73432	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
78	NC_016110	GCCG	2	8	73699	73706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016110	GTCC	2	8	73968	73975	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016110	CGAA	2	8	74079	74086	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016110	TGGG	2	8	79233	79240	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016110	TCCC	2	8	80977	80984	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_016110	CCGG	2	8	88271	88278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016110	GCTC	2	8	88312	88319	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016110	CTGC	2	8	88320	88327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016110	CGGC	2	8	89884	89891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016110	CCGA	2	8	90076	90083	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016110	CCTG	2	8	91711	91718	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016110	CGGC	2	8	92257	92264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016110	CGCC	2	8	95356	95363	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
91	NC_016110	GCCG	2	8	96308	96315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016110	ATCG	2	8	97753	97760	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016110	GCGG	2	8	98016	98023	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016110	GCCG	2	8	98386	98393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016110	CCAG	2	8	98433	98440	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016110	TCCG	2	8	98648	98655	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016110	ATCG	2	8	99370	99377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016110	CGGA	2	8	99608	99615	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016110	CGCC	2	8	99788	99795	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
100	NC_016110	GGGC	2	8	99973	99980	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016110	CGAA	2	8	101238	101245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016110	GACT	2	8	101649	101656	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016110	GCCT	2	8	102838	102845	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016110	GCTG	2	8	105547	105554	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016110	CACC	2	8	106599	106606	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_016110	GCCA	2	8	106695	106702	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016110	CCGA	2	8	106786	106793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016110	CACC	2	8	106811	106818	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_016110	CTGG	2	8	106996	107003	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016110	CGGG	2	8	111215	111222	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016110	GCCT	2	8	111654	111661	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016110	AGGC	2	8	111683	111690	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016110	TGAC	2	8	112536	112543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016110	CAGG	2	8	114932	114939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016110	GCCC	2	8	115845	115852	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_016110	ACCG	2	8	116103	116110	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016110	CAGA	2	8	119186	119193	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016110	CCAC	2	8	119367	119374	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
119	NC_016110	CCCA	2	8	119648	119655	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
120	NC_016110	CAAC	2	8	123034	123041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016110	GCCG	2	8	124438	124445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016110	CGTG	2	8	124475	124482	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016110	CGGG	2	8	125444	125451	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_016110	CGAC	2	8	125796	125803	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016110	AGCG	2	8	125878	125885	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016110	CGAG	2	8	127790	127797	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016110	CCCG	2	8	127798	127805	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
128	NC_016110	GCCG	2	8	132993	133000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016110	GGTC	2	8	134077	134084	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016110	AATC	2	8	134092	134099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016110	AGGG	2	8	134140	134147	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016110	GCAC	2	8	134157	134164	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016110	GGGC	2	8	134534	134541	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016110	TCGG	2	8	144317	144324	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016110	CCGA	2	8	144427	144434	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016110	CACC	2	8	145341	145348	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_016110	CGGG	2	8	146190	146197	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
138	NC_016110	CGGC	2	8	146858	146865	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016110	CCTC	2	8	146898	146905	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_016110	CGTA	2	8	147163	147170	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016110	GACT	2	8	147396	147403	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016110	TACT	2	8	150738	150745	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016110	GTCG	2	8	150885	150892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016110	ACCT	2	8	151014	151021	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016110	ACCG	2	8	151230	151237	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016110	GCTT	2	8	151788	151795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016110	CGGG	2	8	152024	152031	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
148	NC_016110	GCCG	2	8	152945	152952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016110	CCCG	2	8	152959	152966	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_016110	TTCA	2	8	153397	153404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016110	CCGG	2	8	156404	156411	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_016110	CGCC	2	8	157585	157592	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
153	NC_016110	GCCG	2	8	159049	159056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_016110	GGAT	2	8	159254	159261	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016110	TGGC	2	8	160419	160426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
156	NC_016110	GAGC	2	8	160779	160786	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
157	NC_016110	TGCC	2	8	161639	161646	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
158	NC_016110	CGCC	2	8	162151	162158	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
159	NC_016110	ACCT	2	8	162291	162298	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_016110	CCGG	2	8	162398	162405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
161	NC_016110	GCGG	2	8	162645	162652	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
162	NC_016110	AACC	2	8	165067	165074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
163	NC_016110	GCCG	2	8	165633	165640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
164	NC_016110	CGCC	2	8	166018	166025	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
165	NC_016110	GTCC	2	8	166320	166327	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
166	NC_016110	GTGA	2	8	166447	166454	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
167	NC_016110	GCGG	2	8	166612	166619	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
168	NC_016110	GGCC	2	8	167160	167167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
169	NC_016110	CTCG	2	8	167537	167544	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
170	NC_016110	GCCC	2	8	168255	168262	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
171	NC_016110	GGGC	2	8	168276	168283	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
172	NC_016110	CGCC	2	8	169804	169811	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
173	NC_016110	GTGG	2	8	170312	170319	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
174	NC_016110	GCAT	2	8	177216	177223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
175	NC_016110	AAGA	2	8	179358	179365	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
176	NC_016110	CGGG	2	8	180717	180724	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
177	NC_016110	AGCC	2	8	180764	180771	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
178	NC_016110	CTGG	2	8	180866	180873	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
179	NC_016110	GTCG	2	8	180875	180882	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
180	NC_016110	GGCG	2	8	181246	181253	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
181	NC_016110	CACC	2	8	182832	182839	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
182	NC_016110	CGAT	2	8	182862	182869	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
183	NC_016110	GGTG	2	8	184797	184804	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
184	NC_016110	CGCC	2	8	185443	185450	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
185	NC_016110	GCCC	2	8	185657	185664	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
186	NC_016110	GTTG	2	8	186963	186970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
187	NC_016110	CCAT	2	8	187136	187143	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
188	NC_016110	CCTT	2	8	187221	187228	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
189	NC_016110	TACC	2	8	187261	187268	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
190	NC_016110	CGGC	2	8	187305	187312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
191	NC_016110	ACGC	2	8	188018	188025	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.