MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces flavogriseus ATCC 33331 plasmid pSFLA01

Total Repeats: 439

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016110	GTGG	2	8	1110	1117	0 %	25 %	75 %	0 %	357409093
2	NC_016110	GCCG	2	8	1164	1171	0 %	0 %	50 %	50 %	357409093
3	NC_016110	CGCC	2	8	1901	1908	0 %	0 %	25 %	75 %	357409093
4	NC_016110	GTTC	2	8	4988	4995	0 %	50 %	25 %	25 %	357409096
5	NC_016110	CGGT	2	8	5485	5492	0 %	25 %	50 %	25 %	357409096
6	NC_016110	AGCC	2	8	5760	5767	25 %	0 %	25 %	50 %	357409096
7	NC_016110	CGCC	2	8	6847	6854	0 %	0 %	25 %	75 %	357409097
8	NC_016110	CAGG	2	8	7034	7041	25 %	0 %	50 %	25 %	357409097
9	NC_016110	TCCC	2	8	7056	7063	0 %	25 %	0 %	75 %	357409097
10	NC_016110	CGGT	2	8	7611	7618	0 %	25 %	50 %	25 %	357409098
11	NC_016110	CTGG	2	8	8091	8098	0 %	25 %	50 %	25 %	357409098
12	NC_016110	GGTG	2	8	8375	8382	0 %	25 %	75 %	0 %	357409099
13	NC_016110	GGTT	2	8	8754	8761	0 %	50 %	50 %	0 %	357409100
14	NC_016110	AGCC	2	8	8795	8802	25 %	0 %	25 %	50 %	357409100
15	NC_016110	GGCG	2	8	8892	8899	0 %	0 %	75 %	25 %	357409100
16	NC_016110	GGCC	2	8	9111	9118	0 %	0 %	50 %	50 %	357409100
17	NC_016110	GGTT	2	8	9433	9440	0 %	50 %	50 %	0 %	357409100
18	NC_016110	GTCG	2	8	10760	10767	0 %	25 %	50 %	25 %	357409101
19	NC_016110	TTCG	2	8	11743	11750	0 %	50 %	25 %	25 %	357409103
20	NC_016110	TGCC	2	8	11962	11969	0 %	25 %	25 %	50 %	357409104
21	NC_016110	GTGA	2	8	12171	12178	25 %	25 %	50 %	0 %	357409104
22	NC_016110	TGCC	2	8	12335	12342	0 %	25 %	25 %	50 %	357409104
23	NC_016110	CGGG	2	8	12355	12362	0 %	0 %	75 %	25 %	357409104
24	NC_016110	CGCC	2	8	12895	12902	0 %	0 %	25 %	75 %	357409104
25	NC_016110	CGCC	2	8	14207	14214	0 %	0 %	25 %	75 %	357409105
26	NC_016110	GCGG	2	8	14361	14368	0 %	0 %	75 %	25 %	357409105
27	NC_016110	CTGG	2	8	14424	14431	0 %	25 %	50 %	25 %	357409105
28	NC_016110	GTCA	2	8	14490	14497	25 %	25 %	25 %	25 %	357409105
29	NC_016110	GATC	2	8	14828	14835	25 %	25 %	25 %	25 %	357409105
30	NC_016110	CGTT	2	8	15126	15133	0 %	50 %	25 %	25 %	357409106
31	NC_016110	TCGG	2	8	15186	15193	0 %	25 %	50 %	25 %	357409106
32	NC_016110	CGGC	2	8	15634	15641	0 %	0 %	50 %	50 %	357409107
33	NC_016110	CGAC	2	8	15819	15826	25 %	0 %	25 %	50 %	357409107
34	NC_016110	GGCT	2	8	15830	15837	0 %	25 %	50 %	25 %	357409107
35	NC_016110	GACC	2	8	15907	15914	25 %	0 %	25 %	50 %	357409107
36	NC_016110	GTCG	2	8	16048	16055	0 %	25 %	50 %	25 %	357409107
37	NC_016110	CCGC	2	8	16155	16162	0 %	0 %	25 %	75 %	357409107
38	NC_016110	CCGG	2	8	16569	16576	0 %	0 %	50 %	50 %	357409108
39	NC_016110	CTTC	2	8	17522	17529	0 %	50 %	0 %	50 %	357409109
40	NC_016110	TCGC	2	8	17922	17929	0 %	25 %	25 %	50 %	357409109
41	NC_016110	ATCC	2	8	19491	19498	25 %	25 %	0 %	50 %	357409110
42	NC_016110	ATCG	2	8	20477	20484	25 %	25 %	25 %	25 %	357409111
43	NC_016110	CGGG	2	8	21453	21460	0 %	0 %	75 %	25 %	357409112
44	NC_016110	GCCT	2	8	21648	21655	0 %	25 %	25 %	50 %	357409113
45	NC_016110	GCCG	2	8	22010	22017	0 %	0 %	50 %	50 %	357409113
46	NC_016110	GCTG	2	8	22213	22220	0 %	25 %	50 %	25 %	357409113
47	NC_016110	GTGG	2	8	22331	22338	0 %	25 %	75 %	0 %	357409113
48	NC_016110	CGCA	2	8	22398	22405	25 %	0 %	25 %	50 %	357409113
49	NC_016110	CCTG	2	8	22654	22661	0 %	25 %	25 %	50 %	357409114
50	NC_016110	AGGC	2	8	22682	22689	25 %	0 %	50 %	25 %	357409114
51	NC_016110	GATC	2	8	23052	23059	25 %	25 %	25 %	25 %	357409114
52	NC_016110	ATCG	2	8	24452	24459	25 %	25 %	25 %	25 %	357409115
53	NC_016110	CCCA	2	8	24512	24519	25 %	0 %	0 %	75 %	357409115
54	NC_016110	GGCA	2	8	25238	25245	25 %	0 %	50 %	25 %	357409116
55	NC_016110	TCCC	2	8	25272	25279	0 %	25 %	0 %	75 %	357409116
56	NC_016110	CCAC	2	8	25341	25348	25 %	0 %	0 %	75 %	357409116
57	NC_016110	GACT	2	8	26571	26578	25 %	25 %	25 %	25 %	357409117
58	NC_016110	CCTG	2	8	26807	26814	0 %	25 %	25 %	50 %	357409118
59	NC_016110	CCCA	2	8	26907	26914	25 %	0 %	0 %	75 %	357409118
60	NC_016110	TGCA	2	8	26992	26999	25 %	25 %	25 %	25 %	357409118
61	NC_016110	GGCC	2	8	27032	27039	0 %	0 %	50 %	50 %	357409118
62	NC_016110	CGGC	2	8	27178	27185	0 %	0 %	50 %	50 %	357409118
63	NC_016110	CCCG	2	8	27462	27469	0 %	0 %	25 %	75 %	357409118
64	NC_016110	CTGC	2	8	29489	29496	0 %	25 %	25 %	50 %	357409119
65	NC_016110	GGCG	2	8	29701	29708	0 %	0 %	75 %	25 %	357409119
66	NC_016110	GCCC	2	8	29971	29978	0 %	0 %	25 %	75 %	357409119
67	NC_016110	CCAT	2	8	30153	30160	25 %	25 %	0 %	50 %	357409119
68	NC_016110	ATCC	2	8	30470	30477	25 %	25 %	0 %	50 %	357409119
69	NC_016110	GGGT	2	8	31465	31472	0 %	25 %	75 %	0 %	357409121
70	NC_016110	GACG	2	8	31706	31713	25 %	0 %	50 %	25 %	357409122
71	NC_016110	CCCG	2	8	31750	31757	0 %	0 %	25 %	75 %	357409122
72	NC_016110	GACC	2	8	31976	31983	25 %	0 %	25 %	50 %	357409122
73	NC_016110	CCTC	2	8	32140	32147	0 %	25 %	0 %	75 %	357409122
74	NC_016110	GGCC	2	8	32216	32223	0 %	0 %	50 %	50 %	357409122
75	NC_016110	CCGA	2	8	32236	32243	25 %	0 %	25 %	50 %	357409122
76	NC_016110	TCGG	2	8	32304	32311	0 %	25 %	50 %	25 %	357409122
77	NC_016110	CGAC	2	8	32518	32525	25 %	0 %	25 %	50 %	357409122
78	NC_016110	CGGG	2	8	32685	32692	0 %	0 %	75 %	25 %	357409123
79	NC_016110	GGCG	2	8	32816	32823	0 %	0 %	75 %	25 %	357409123
80	NC_016110	CAGC	2	8	33701	33708	25 %	0 %	25 %	50 %	357409124
81	NC_016110	CACC	2	8	34343	34350	25 %	0 %	0 %	75 %	357409125
82	NC_016110	TCGT	2	8	36071	36078	0 %	50 %	25 %	25 %	357409126
83	NC_016110	TGGA	2	8	36133	36140	25 %	25 %	50 %	0 %	357409126
84	NC_016110	GGCC	2	8	36399	36406	0 %	0 %	50 %	50 %	357409126
85	NC_016110	GGTC	2	8	36486	36493	0 %	25 %	50 %	25 %	357409126
86	NC_016110	CGGT	2	8	36707	36714	0 %	25 %	50 %	25 %	357409126
87	NC_016110	CGTC	2	8	37562	37569	0 %	25 %	25 %	50 %	357409128
88	NC_016110	CGCC	2	8	38565	38572	0 %	0 %	25 %	75 %	357409129
89	NC_016110	GGGT	2	8	38612	38619	0 %	25 %	75 %	0 %	357409129
90	NC_016110	CGGT	2	8	38826	38833	0 %	25 %	50 %	25 %	357409129
91	NC_016110	CCAT	2	8	39157	39164	25 %	25 %	0 %	50 %	357409130
92	NC_016110	GCCG	2	8	39315	39322	0 %	0 %	50 %	50 %	357409130
93	NC_016110	CGGC	2	8	39368	39375	0 %	0 %	50 %	50 %	357409130
94	NC_016110	CTGC	2	8	40819	40826	0 %	25 %	25 %	50 %	357409131
95	NC_016110	CGGC	2	8	41536	41543	0 %	0 %	50 %	50 %	357409132
96	NC_016110	GCTC	2	8	41719	41726	0 %	25 %	25 %	50 %	357409132
97	NC_016110	CCGC	2	8	41742	41749	0 %	0 %	25 %	75 %	357409132
98	NC_016110	CGGG	2	8	42343	42350	0 %	0 %	75 %	25 %	357409132
99	NC_016110	TCGG	2	8	42881	42888	0 %	25 %	50 %	25 %	357409132
100	NC_016110	GCCT	2	8	43183	43190	0 %	25 %	25 %	50 %	357409133
101	NC_016110	GCCG	2	8	44087	44094	0 %	0 %	50 %	50 %	357409134
102	NC_016110	CCGG	2	8	44238	44245	0 %	0 %	50 %	50 %	357409135
103	NC_016110	GTGC	2	8	44248	44255	0 %	25 %	50 %	25 %	357409135
104	NC_016110	CCGA	2	8	44317	44324	25 %	0 %	25 %	50 %	357409135
105	NC_016110	GGAA	2	8	45881	45888	50 %	0 %	50 %	0 %	357409137
106	NC_016110	AGCA	2	8	45935	45942	50 %	0 %	25 %	25 %	357409137
107	NC_016110	CGGC	2	8	46271	46278	0 %	0 %	50 %	50 %	357409138
108	NC_016110	GTGC	2	8	46509	46516	0 %	25 %	50 %	25 %	357409139
109	NC_016110	CCGT	2	8	46581	46588	0 %	25 %	25 %	50 %	357409139
110	NC_016110	GTCG	2	8	46661	46668	0 %	25 %	50 %	25 %	357409139
111	NC_016110	CGCA	2	8	47215	47222	25 %	0 %	25 %	50 %	357409140
112	NC_016110	GACC	2	8	47637	47644	25 %	0 %	25 %	50 %	357409140
113	NC_016110	AGCG	2	8	47746	47753	25 %	0 %	50 %	25 %	357409140
114	NC_016110	GGCC	2	8	48000	48007	0 %	0 %	50 %	50 %	357409140
115	NC_016110	CCGC	2	8	48380	48387	0 %	0 %	25 %	75 %	357409140
116	NC_016110	AGCA	2	8	49272	49279	50 %	0 %	25 %	25 %	357409141
117	NC_016110	CATC	2	8	49948	49955	25 %	25 %	0 %	50 %	357409141
118	NC_016110	AGGC	2	8	50073	50080	25 %	0 %	50 %	25 %	357409141
119	NC_016110	CAGC	2	8	50307	50314	25 %	0 %	25 %	50 %	357409141
120	NC_016110	GCCG	2	8	50618	50625	0 %	0 %	50 %	50 %	357409142
121	NC_016110	CGTA	2	8	53252	53259	25 %	25 %	25 %	25 %	357409144
122	NC_016110	CACC	2	8	53427	53434	25 %	0 %	0 %	75 %	357409144
123	NC_016110	GAGT	2	8	53461	53468	25 %	25 %	50 %	0 %	357409144
124	NC_016110	CGAG	2	8	53994	54001	25 %	0 %	50 %	25 %	357409145
125	NC_016110	TGGG	2	8	54551	54558	0 %	25 %	75 %	0 %	357409145
126	NC_016110	GCCG	2	8	54571	54578	0 %	0 %	50 %	50 %	357409145
127	NC_016110	CCGC	2	8	54883	54890	0 %	0 %	25 %	75 %	357409145
128	NC_016110	AGGA	2	8	55389	55396	50 %	0 %	50 %	0 %	357409146
129	NC_016110	CGGC	2	8	55463	55470	0 %	0 %	50 %	50 %	357409146
130	NC_016110	CGTC	2	8	55572	55579	0 %	25 %	25 %	50 %	357409146
131	NC_016110	CCAT	2	8	55861	55868	25 %	25 %	0 %	50 %	357409146
132	NC_016110	GGTG	2	8	56417	56424	0 %	25 %	75 %	0 %	357409147
133	NC_016110	CCCA	2	8	56706	56713	25 %	0 %	0 %	75 %	357409147
134	NC_016110	CGGC	2	8	57460	57467	0 %	0 %	50 %	50 %	357409147
135	NC_016110	CGGC	2	8	57548	57555	0 %	0 %	50 %	50 %	357409147
136	NC_016110	GCCG	2	8	57561	57568	0 %	0 %	50 %	50 %	357409147
137	NC_016110	GTCG	2	8	57633	57640	0 %	25 %	50 %	25 %	357409147
138	NC_016110	CGGC	2	8	58455	58462	0 %	0 %	50 %	50 %	357409148
139	NC_016110	AGGT	2	8	58479	58486	25 %	25 %	50 %	0 %	357409148
140	NC_016110	GCAG	2	8	58612	58619	25 %	0 %	50 %	25 %	357409148
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.