MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Acidaminococcus intestini RyC-MR95 chromosome

Total Repeats: 29566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29501	NC_016077	TCA	2	6	2481650	2481655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685804
29502	NC_016077	GAA	2	6	2482402	2482407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352685805
29503	NC_016077	TAT	2	6	2482416	2482421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352685805
29504	NC_016077	AAG	2	6	2482531	2482536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352685805
29505	NC_016077	AGA	2	6	2482602	2482607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352685806
29506	NC_016077	GTC	2	6	2482674	2482679	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685806
29507	NC_016077	CAT	2	6	2482697	2482702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685806
29508	NC_016077	TAA	2	6	2482763	2482768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352685806
29509	NC_016077	TAA	2	6	2482797	2482802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352685806
29510	NC_016077	CAA	2	6	2482858	2482863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685806
29511	NC_016077	TAA	2	6	2482987	2482992	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352685806
29512	NC_016077	GAA	2	6	2483179	2483184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352685806
29513	NC_016077	ACA	2	6	2483352	2483357	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685806
29514	NC_016077	CTT	2	6	2483380	2483385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685806
29515	NC_016077	AAG	2	6	2483420	2483425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352685806
29516	NC_016077	CAA	3	9	2483557	2483565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685807
29517	NC_016077	TGA	2	6	2483602	2483607	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685807
29518	NC_016077	CGC	2	6	2483725	2483730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685807
29519	NC_016077	GAC	2	6	2483732	2483737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685807
29520	NC_016077	CAT	2	6	2483750	2483755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685807
29521	NC_016077	CCA	2	6	2483766	2483771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352685807
29522	NC_016077	AAC	2	6	2483870	2483875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685807
29523	NC_016077	TAA	2	6	2483953	2483958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352685807
29524	NC_016077	CCA	2	6	2484172	2484177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352685807
29525	NC_016077	AGC	2	6	2484188	2484193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685807
29526	NC_016077	ACA	2	6	2484207	2484212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685807
29527	NC_016077	GCT	2	6	2484232	2484237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685807
29528	NC_016077	GCC	3	9	2484338	2484346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685807
29529	NC_016077	GAC	2	6	2484392	2484397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685807
29530	NC_016077	AGG	2	6	2484413	2484418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352685807
29531	NC_016077	AAG	2	6	2484464	2484469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352685807
29532	NC_016077	GCC	2	6	2484470	2484475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685807
29533	NC_016077	ATG	3	9	2484561	2484569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685807
29534	NC_016077	CAA	2	6	2484718	2484723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685807
29535	NC_016077	TCA	2	6	2484830	2484835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685808
29536	NC_016077	CCT	2	6	2484927	2484932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352685808
29537	NC_016077	ATC	2	6	2485034	2485039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685808
29538	NC_016077	GAT	2	6	2485040	2485045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685808
29539	NC_016077	CCG	2	6	2485059	2485064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685808
29540	NC_016077	TAT	2	6	2485102	2485107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352685808
29541	NC_016077	TGC	2	6	2485153	2485158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685808
29542	NC_016077	TGA	2	6	2485323	2485328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685808
29543	NC_016077	TGA	2	6	2485366	2485371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685808
29544	NC_016077	AGG	2	6	2485579	2485584	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352685809
29545	NC_016077	ATG	2	6	2485588	2485593	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685809
29546	NC_016077	GAT	2	6	2485644	2485649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352685809
29547	NC_016077	GCT	2	6	2485728	2485733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685810
29548	NC_016077	AAC	2	6	2485798	2485803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352685810
29549	NC_016077	CGC	2	6	2485943	2485948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685811
29550	NC_016077	TCT	2	6	2485988	2485993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685811
29551	NC_016077	GAA	2	6	2486086	2486091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352685811
29552	NC_016077	CTG	2	6	2486112	2486117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685811
29553	NC_016077	GCC	2	6	2486154	2486159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685811
29554	NC_016077	AAT	2	6	2486234	2486239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352685811
29555	NC_016077	CTG	2	6	2486335	2486340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352685811
29556	NC_016077	ACC	2	6	2486373	2486378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352685811
29557	NC_016077	GCC	2	6	2486385	2486390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685811
29558	NC_016077	ACG	2	6	2486392	2486397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685811
29559	NC_016077	GCC	2	6	2486455	2486460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685811
29560	NC_016077	TGT	2	6	2486567	2486572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352685811
29561	NC_016077	GCC	3	9	2486592	2486600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352685811
29562	NC_016077	GCA	2	6	2486788	2486793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352685811
29563	NC_016077	AAT	2	6	2486814	2486819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352685811
29564	NC_016077	CCT	2	6	2486864	2486869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352685811
29565	NC_016077	ATC	2	6	2486911	2486916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352685811
29566	NC_016077	TCT	2	6	2487352	2487357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352685812

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.