MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Tetragenococcus halophilus NBRC 12172

Total Repeats: 1556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016052	TTGAT	2	10	3934	3943	20 %	60 %	20 %	0 %	352516177
2	NC_016052	TGTTT	2	10	4892	4901	0 %	80 %	20 %	0 %	352516178
3	NC_016052	CTTAA	2	10	7157	7166	40 %	40 %	0 %	20 %	352516179
4	NC_016052	TCTTT	2	10	7963	7972	0 %	80 %	0 %	20 %	352516179
5	NC_016052	ATGAA	2	10	8992	9001	60 %	20 %	20 %	0 %	352516180
6	NC_016052	AATAT	2	10	11920	11929	60 %	40 %	0 %	0 %	352516184
7	NC_016052	TTTCA	2	10	14791	14800	20 %	60 %	0 %	20 %	352516186
8	NC_016052	CATAT	2	10	16126	16135	40 %	40 %	0 %	20 %	352516187
9	NC_016052	AATTT	2	10	19070	19079	40 %	60 %	0 %	0 %	352516189
10	NC_016052	GTTTT	2	10	19549	19558	0 %	80 %	20 %	0 %	352516189
11	NC_016052	TGTAT	2	10	20544	20553	20 %	60 %	20 %	0 %	352516191
12	NC_016052	AATTG	2	10	21022	21031	40 %	40 %	20 %	0 %	352516191
13	NC_016052	CAAAT	2	10	24617	24626	60 %	20 %	0 %	20 %	352516195
14	NC_016052	GTATT	2	10	24929	24938	20 %	60 %	20 %	0 %	352516195
15	NC_016052	CTTGG	2	10	25687	25696	0 %	40 %	40 %	20 %	352516196
16	NC_016052	GAAAG	2	10	28210	28219	60 %	0 %	40 %	0 %	352516197
17	NC_016052	TTAGT	2	10	32142	32151	20 %	60 %	20 %	0 %	352516202
18	NC_016052	CAAAA	2	10	32379	32388	80 %	0 %	0 %	20 %	352516202
19	NC_016052	CAATC	2	10	34193	34202	40 %	20 %	0 %	40 %	352516205
20	NC_016052	AAATT	2	10	34309	34318	60 %	40 %	0 %	0 %	352516205
21	NC_016052	TTCAA	2	10	36016	36025	40 %	40 %	0 %	20 %	352516206
22	NC_016052	ATCTC	2	10	37612	37621	20 %	40 %	0 %	40 %	352516208
23	NC_016052	AACAA	2	10	38094	38103	80 %	0 %	0 %	20 %	352516209
24	NC_016052	CCGGA	2	10	38939	38948	20 %	0 %	40 %	40 %	352516209
25	NC_016052	CGCTG	2	10	40957	40966	0 %	20 %	40 %	40 %	352516211
26	NC_016052	ATCTT	2	10	41093	41102	20 %	60 %	0 %	20 %	352516211
27	NC_016052	GTGGG	2	10	42781	42790	0 %	20 %	80 %	0 %	352516212
28	NC_016052	TTTGC	2	10	45940	45949	0 %	60 %	20 %	20 %	352516214
29	NC_016052	TTGCC	2	10	45967	45976	0 %	40 %	20 %	40 %	352516214
30	NC_016052	GTTTT	2	10	46592	46601	0 %	80 %	20 %	0 %	352516215
31	NC_016052	AAACA	2	10	48199	48208	80 %	0 %	0 %	20 %	352516216
32	NC_016052	GAATG	2	10	50200	50209	40 %	20 %	40 %	0 %	352516218
33	NC_016052	TTAAT	2	10	53936	53945	40 %	60 %	0 %	0 %	352516222
34	NC_016052	TGTTA	2	10	55678	55687	20 %	60 %	20 %	0 %	352516224
35	NC_016052	GAAAA	2	10	58710	58719	80 %	0 %	20 %	0 %	352516227
36	NC_016052	TTACT	2	10	61539	61548	20 %	60 %	0 %	20 %	352516231
37	NC_016052	GGCGA	2	10	61812	61821	20 %	0 %	60 %	20 %	352516231
38	NC_016052	TTACG	2	10	62300	62309	20 %	40 %	20 %	20 %	352516231
39	NC_016052	ACAAG	2	10	62508	62517	60 %	0 %	20 %	20 %	352516231
40	NC_016052	CCTTA	2	10	63572	63581	20 %	40 %	0 %	40 %	352516233
41	NC_016052	CAAAC	2	10	68388	68397	60 %	0 %	0 %	40 %	352516237
42	NC_016052	CAAGT	2	10	68422	68431	40 %	20 %	20 %	20 %	352516237
43	NC_016052	TTTTC	2	10	75590	75599	0 %	80 %	0 %	20 %	352516242
44	NC_016052	AGAAA	2	10	77177	77186	80 %	0 %	20 %	0 %	352516243
45	NC_016052	TATAA	2	10	77282	77291	60 %	40 %	0 %	0 %	352516243
46	NC_016052	TTATT	2	10	78848	78857	20 %	80 %	0 %	0 %	352516245
47	NC_016052	GTGAT	2	10	80031	80040	20 %	40 %	40 %	0 %	352516246
48	NC_016052	TGAAA	2	10	80293	80302	60 %	20 %	20 %	0 %	352516246
49	NC_016052	TATTT	2	10	82354	82363	20 %	80 %	0 %	0 %	352516249
50	NC_016052	GAAAA	2	10	85776	85785	80 %	0 %	20 %	0 %	352516251
51	NC_016052	TATAT	2	10	87578	87587	40 %	60 %	0 %	0 %	352516252
52	NC_016052	TTGGA	2	10	92617	92626	20 %	40 %	40 %	0 %	352516254
53	NC_016052	AGAAA	2	10	92777	92786	80 %	0 %	20 %	0 %	352516254
54	NC_016052	GGCTT	2	10	92997	93006	0 %	40 %	40 %	20 %	352516255
55	NC_016052	AGAAA	2	10	93392	93401	80 %	0 %	20 %	0 %	352516255
56	NC_016052	TTTAA	2	10	94710	94719	40 %	60 %	0 %	0 %	352516255
57	NC_016052	AAATC	2	10	97299	97308	60 %	20 %	0 %	20 %	352516257
58	NC_016052	CGACC	2	10	97489	97498	20 %	0 %	20 %	60 %	352516257
59	NC_016052	AGATG	2	10	98118	98127	40 %	20 %	40 %	0 %	352516258
60	NC_016052	AAAAG	2	10	99049	99058	80 %	0 %	20 %	0 %	352516259
61	NC_016052	AAAAG	2	10	99299	99308	80 %	0 %	20 %	0 %	352516259
62	NC_016052	TTAGT	2	10	102027	102036	20 %	60 %	20 %	0 %	352516262
63	NC_016052	AAATT	2	10	103274	103283	60 %	40 %	0 %	0 %	352516263
64	NC_016052	GAAAA	2	10	104002	104011	80 %	0 %	20 %	0 %	352516264
65	NC_016052	TTATT	2	10	105112	105121	20 %	80 %	0 %	0 %	352516265
66	NC_016052	CCTTT	2	10	109582	109591	0 %	60 %	0 %	40 %	352516270
67	NC_016052	ATTTT	2	10	115940	115949	20 %	80 %	0 %	0 %	352516276
68	NC_016052	ACAAT	2	10	116082	116091	60 %	20 %	0 %	20 %	352516276
69	NC_016052	TAAAC	2	10	119892	119901	60 %	20 %	0 %	20 %	352516279
70	NC_016052	GGCTT	2	10	120705	120714	0 %	40 %	40 %	20 %	352516280
71	NC_016052	ATTGG	2	10	120928	120937	20 %	40 %	40 %	0 %	352516280
72	NC_016052	TAAAA	2	10	120965	120974	80 %	20 %	0 %	0 %	352516280
73	NC_016052	GGCTT	2	10	121454	121463	0 %	40 %	40 %	20 %	352516280
74	NC_016052	TTTTG	2	10	124254	124263	0 %	80 %	20 %	0 %	352516283
75	NC_016052	TTAAA	2	10	124381	124390	60 %	40 %	0 %	0 %	352516283
76	NC_016052	AAGGT	2	10	124635	124644	40 %	20 %	40 %	0 %	352516283
77	NC_016052	GAAGA	2	10	124806	124815	60 %	0 %	40 %	0 %	352516283
78	NC_016052	TTTAT	2	10	126525	126534	20 %	80 %	0 %	0 %	352516284
79	NC_016052	CTTTA	2	10	126655	126664	20 %	60 %	0 %	20 %	352516284
80	NC_016052	CGGTC	2	10	126726	126735	0 %	20 %	40 %	40 %	352516284
81	NC_016052	AATAA	2	10	127056	127065	80 %	20 %	0 %	0 %	352516284
82	NC_016052	AAGAA	2	10	127173	127182	80 %	0 %	20 %	0 %	352516285
83	NC_016052	ATTTT	2	10	127919	127928	20 %	80 %	0 %	0 %	352516286
84	NC_016052	TTTTC	2	10	128231	128240	0 %	80 %	0 %	20 %	352516286
85	NC_016052	ATCAT	2	10	128539	128548	40 %	40 %	0 %	20 %	352516286
86	NC_016052	AACAA	2	10	130302	130311	80 %	0 %	0 %	20 %	352516287
87	NC_016052	CTTGG	2	10	130714	130723	0 %	40 %	40 %	20 %	352516287
88	NC_016052	GTAAA	2	10	132782	132791	60 %	20 %	20 %	0 %	352516290
89	NC_016052	ACTTT	2	10	134240	134249	20 %	60 %	0 %	20 %	352516291
90	NC_016052	GAACA	2	10	136516	136525	60 %	0 %	20 %	20 %	352516294
91	NC_016052	ATCGA	2	10	142038	142047	40 %	20 %	20 %	20 %	352516298
92	NC_016052	ATAGC	2	10	144374	144383	40 %	20 %	20 %	20 %	352516300
93	NC_016052	AACTA	2	10	144663	144672	60 %	20 %	0 %	20 %	352516300
94	NC_016052	TTGGT	2	10	146472	146481	0 %	60 %	40 %	0 %	352516301
95	NC_016052	TAATT	2	10	147120	147129	40 %	60 %	0 %	0 %	352516302
96	NC_016052	ATTTT	2	10	148302	148311	20 %	80 %	0 %	0 %	352516303
97	NC_016052	TTTAT	2	10	150302	150311	20 %	80 %	0 %	0 %	352516305
98	NC_016052	GAATT	2	10	151183	151192	40 %	40 %	20 %	0 %	352516306
99	NC_016052	ATTTT	2	10	152824	152833	20 %	80 %	0 %	0 %	352516308
100	NC_016052	TGATT	2	10	155838	155847	20 %	60 %	20 %	0 %	352516311
101	NC_016052	AATCA	2	10	156095	156104	60 %	20 %	0 %	20 %	352516311
102	NC_016052	ATTGT	2	10	159889	159898	20 %	60 %	20 %	0 %	352516314
103	NC_016052	TATTT	2	10	160102	160111	20 %	80 %	0 %	0 %	352516315
104	NC_016052	TTTAT	2	10	166160	166169	20 %	80 %	0 %	0 %	352516319
105	NC_016052	TTTAC	2	10	166376	166385	20 %	60 %	0 %	20 %	352516319
106	NC_016052	TTCTT	2	10	172593	172602	0 %	80 %	0 %	20 %	352516325
107	NC_016052	GTTGG	2	10	175755	175764	0 %	40 %	60 %	0 %	352516328
108	NC_016052	TAAAA	2	10	177533	177542	80 %	20 %	0 %	0 %	352516329
109	NC_016052	ATCAA	2	10	180864	180873	60 %	20 %	0 %	20 %	352516332
110	NC_016052	GATGA	2	10	183215	183224	40 %	20 %	40 %	0 %	352516334
111	NC_016052	AAACA	2	10	186606	186615	80 %	0 %	0 %	20 %	352516339
112	NC_016052	CGTTG	2	10	186820	186829	0 %	40 %	40 %	20 %	352516339
113	NC_016052	TACAG	2	10	190672	190681	40 %	20 %	20 %	20 %	352516343
114	NC_016052	TATTT	2	10	191249	191258	20 %	80 %	0 %	0 %	352516343
115	NC_016052	AGATA	2	10	191733	191742	60 %	20 %	20 %	0 %	352516344
116	NC_016052	AAATT	2	10	193989	193998	60 %	40 %	0 %	0 %	352516347
117	NC_016052	GCTAT	2	10	196047	196056	20 %	40 %	20 %	20 %	352516349
118	NC_016052	ATATG	2	10	196141	196150	40 %	40 %	20 %	0 %	352516349
119	NC_016052	ACAAA	2	10	199014	199023	80 %	0 %	0 %	20 %	352516352
120	NC_016052	AATGA	2	10	200978	200987	60 %	20 %	20 %	0 %	352516353
121	NC_016052	GATCG	2	10	205212	205221	20 %	20 %	40 %	20 %	352516359
122	NC_016052	GATCG	2	10	205566	205575	20 %	20 %	40 %	20 %	352516359
123	NC_016052	AGAGA	2	10	208727	208736	60 %	0 %	40 %	0 %	352516365
124	NC_016052	CGTTT	2	10	209101	209110	0 %	60 %	20 %	20 %	352516365
125	NC_016052	TGCCA	2	10	211828	211837	20 %	20 %	20 %	40 %	352516368
126	NC_016052	ATCAA	2	10	212288	212297	60 %	20 %	0 %	20 %	352516368
127	NC_016052	TAATT	2	10	212978	212987	40 %	60 %	0 %	0 %	352516369
128	NC_016052	ATCTG	2	10	213848	213857	20 %	40 %	20 %	20 %	352516370
129	NC_016052	AGAAC	2	10	220367	220376	60 %	0 %	20 %	20 %	352516377
130	NC_016052	TTATT	2	10	221241	221250	20 %	80 %	0 %	0 %	352516378
131	NC_016052	CATCG	2	10	221714	221723	20 %	20 %	20 %	40 %	352516380
132	NC_016052	ATAAA	2	10	224173	224182	80 %	20 %	0 %	0 %	352516382
133	NC_016052	GCGAT	2	10	227429	227438	20 %	20 %	40 %	20 %	352516385
134	NC_016052	AAATT	2	10	230497	230506	60 %	40 %	0 %	0 %	352516389
135	NC_016052	TAGCG	2	10	232069	232078	20 %	20 %	40 %	20 %	352516390
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