MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Thermococcus sp. AM4 chromosome

Total Repeats: 1015

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016051	AGCGT	2	10	522	531	20 %	20 %	40 %	20 %	223478601
2	NC_016051	TATCG	2	10	1044	1053	20 %	40 %	20 %	20 %	223478601
3	NC_016051	GCTCA	2	10	2242	2251	20 %	20 %	20 %	40 %	223478599
4	NC_016051	GCTTC	2	10	5990	5999	0 %	40 %	20 %	40 %	223478926
5	NC_016051	AGGCC	2	10	13309	13318	20 %	0 %	40 %	40 %	223478916
6	NC_016051	GGTTT	2	10	16624	16633	0 %	60 %	40 %	0 %	350525685
7	NC_016051	CTATC	2	10	17906	17915	20 %	40 %	0 %	40 %	223478487
8	NC_016051	GCTCC	2	10	18149	18158	0 %	20 %	20 %	60 %	223478487
9	NC_016051	TCCGC	2	10	18489	18498	0 %	20 %	20 %	60 %	223478487
10	NC_016051	CGTTC	2	10	20772	20781	0 %	40 %	20 %	40 %	223478573
11	NC_016051	CTTCC	2	10	21742	21751	0 %	40 %	0 %	60 %	223478725
12	NC_016051	CCGAG	2	10	23439	23448	20 %	0 %	40 %	40 %	223478634
13	NC_016051	GAACT	2	10	25956	25965	40 %	20 %	20 %	20 %	223478480
14	NC_016051	CCCCG	2	10	30812	30821	0 %	0 %	20 %	80 %	223478529
15	NC_016051	GTTCC	2	10	35341	35350	0 %	40 %	20 %	40 %	223478696
16	NC_016051	CGAGG	2	10	35820	35829	20 %	0 %	60 %	20 %	223478696
17	NC_016051	AGCTC	2	10	38037	38046	20 %	20 %	20 %	40 %	223478874
18	NC_016051	GGGGA	2	10	38824	38833	20 %	0 %	80 %	0 %	223478894
19	NC_016051	GGAAC	2	10	39441	39450	40 %	0 %	40 %	20 %	223478894
20	NC_016051	GAGCT	2	10	42851	42860	20 %	20 %	40 %	20 %	223478885
21	NC_016051	CTCGA	2	10	45997	46006	20 %	20 %	20 %	40 %	223478756
22	NC_016051	CTTCC	2	10	46155	46164	0 %	40 %	0 %	60 %	223478756
23	NC_016051	TGAGA	2	10	47333	47342	40 %	20 %	40 %	0 %	223478637
24	NC_016051	AACGG	2	10	50703	50712	40 %	0 %	40 %	20 %	223478971
25	NC_016051	GAGAC	2	10	54888	54897	40 %	0 %	40 %	20 %	223478576
26	NC_016051	ACTTC	2	10	58277	58286	20 %	40 %	0 %	40 %	223478607
27	NC_016051	AGTTG	2	10	62958	62967	20 %	40 %	40 %	0 %	223478924
28	NC_016051	ACGGA	2	10	63023	63032	40 %	0 %	40 %	20 %	223478924
29	NC_016051	TTTCC	2	10	68206	68215	0 %	60 %	0 %	40 %	223478514
30	NC_016051	TCCGC	2	10	68665	68674	0 %	20 %	20 %	60 %	223478653
31	NC_016051	CTACT	2	10	71654	71663	20 %	40 %	0 %	40 %	223478733
32	NC_016051	TTCCC	2	10	73037	73046	0 %	40 %	0 %	60 %	223478512
33	NC_016051	CCGGC	2	10	78302	78311	0 %	0 %	40 %	60 %	223478530
34	NC_016051	TCGCC	2	10	80970	80979	0 %	20 %	20 %	60 %	223478976
35	NC_016051	GGAAG	2	10	84395	84404	40 %	0 %	60 %	0 %	223478496
36	NC_016051	TGTTA	2	10	90054	90063	20 %	60 %	20 %	0 %	223478797
37	NC_016051	ATATC	2	10	91656	91665	40 %	40 %	0 %	20 %	350525695
38	NC_016051	CTGGC	2	10	95805	95814	0 %	20 %	40 %	40 %	350525697
39	NC_016051	TCCAC	2	10	96258	96267	20 %	20 %	0 %	60 %	223478903
40	NC_016051	GCTCG	2	10	101021	101030	0 %	20 %	40 %	40 %	223478567
41	NC_016051	CAGTT	2	10	101675	101684	20 %	40 %	20 %	20 %	223478567
42	NC_016051	CGGAG	2	10	105063	105072	20 %	0 %	60 %	20 %	223478750
43	NC_016051	AGGGA	2	10	106389	106398	40 %	0 %	60 %	0 %	223478493
44	NC_016051	AGTCG	2	10	107289	107298	20 %	20 %	40 %	20 %	223478621
45	NC_016051	GAGGG	2	10	111210	111219	20 %	0 %	80 %	0 %	350525698
46	NC_016051	GCTTC	2	10	112554	112563	0 %	40 %	20 %	40 %	223478568
47	NC_016051	CTTGT	2	10	115317	115326	0 %	60 %	20 %	20 %	223478667
48	NC_016051	GAGGG	2	10	119226	119235	20 %	0 %	80 %	0 %	350525703
49	NC_016051	TCCCG	2	10	119735	119744	0 %	20 %	20 %	60 %	223478449
50	NC_016051	CCCTT	2	10	122700	122709	0 %	40 %	0 %	60 %	223478450
51	NC_016051	CCGCT	2	10	126925	126934	0 %	20 %	20 %	60 %	223478904
52	NC_016051	CGTTC	2	10	127218	127227	0 %	40 %	20 %	40 %	223478904
53	NC_016051	CAAGC	2	10	129708	129717	40 %	0 %	20 %	40 %	223478643
54	NC_016051	TACGC	2	10	131014	131023	20 %	20 %	20 %	40 %	223478853
55	NC_016051	TCGCC	2	10	132045	132054	0 %	20 %	20 %	60 %	223478617
56	NC_016051	CGGTC	2	10	132523	132532	0 %	20 %	40 %	40 %	223478922
57	NC_016051	GCTCA	2	10	133383	133392	20 %	20 %	20 %	40 %	223478549
58	NC_016051	GTTCG	2	10	134405	134414	0 %	40 %	40 %	20 %	223478549
59	NC_016051	CCGCC	2	10	134464	134473	0 %	0 %	20 %	80 %	223478549
60	NC_016051	TCCCT	2	10	134634	134643	0 %	40 %	0 %	60 %	223478549
61	NC_016051	GAGAA	2	10	136415	136424	60 %	0 %	40 %	0 %	223478859
62	NC_016051	GGGGA	2	10	137059	137068	20 %	0 %	80 %	0 %	223478520
63	NC_016051	GCCCC	2	10	137193	137202	0 %	0 %	20 %	80 %	223478520
64	NC_016051	AGAGC	2	10	138810	138819	40 %	0 %	40 %	20 %	223478741
65	NC_016051	CCTCG	2	10	139756	139765	0 %	20 %	20 %	60 %	223478741
66	NC_016051	CCTTC	2	10	140136	140145	0 %	40 %	0 %	60 %	223478789
67	NC_016051	TGGCG	2	10	141438	141447	0 %	20 %	60 %	20 %	223478844
68	NC_016051	GGAAA	2	10	141657	141666	60 %	0 %	40 %	0 %	223478844
69	NC_016051	TTGGC	2	10	151358	151367	0 %	40 %	40 %	20 %	223478939
70	NC_016051	ACGAG	2	10	155453	155462	40 %	0 %	40 %	20 %	223478557
71	NC_016051	GAGGC	2	10	155815	155824	20 %	0 %	60 %	20 %	223478557
72	NC_016051	GATCA	2	10	157467	157476	40 %	20 %	20 %	20 %	223478978
73	NC_016051	CCTCG	2	10	163574	163583	0 %	20 %	20 %	60 %	223478506
74	NC_016051	GCTGA	2	10	164288	164297	20 %	20 %	40 %	20 %	223478506
75	NC_016051	CCTCG	2	10	167700	167709	0 %	20 %	20 %	60 %	223478715
76	NC_016051	TCGCC	2	10	168314	168323	0 %	20 %	20 %	60 %	223478715
77	NC_016051	TGCCT	2	10	169245	169254	0 %	40 %	20 %	40 %	223478715
78	NC_016051	CGCGA	2	10	171355	171364	20 %	0 %	40 %	40 %	223478575
79	NC_016051	CTCTT	2	10	178668	178677	0 %	60 %	0 %	40 %	350525710
80	NC_016051	AGAGG	2	10	183940	183949	40 %	0 %	60 %	0 %	223478862
81	NC_016051	AGCGA	2	10	185756	185765	40 %	0 %	40 %	20 %	223478657
82	NC_016051	GACGC	2	10	188624	188633	20 %	0 %	40 %	40 %	223478687
83	NC_016051	TCGGG	2	10	191072	191081	0 %	20 %	60 %	20 %	223478965
84	NC_016051	GCTCG	2	10	191097	191106	0 %	20 %	40 %	40 %	223478965
85	NC_016051	CCTCG	2	10	191556	191565	0 %	20 %	20 %	60 %	223478639
86	NC_016051	CGAAG	2	10	191771	191780	40 %	0 %	40 %	20 %	223478639
87	NC_016051	GGTTT	2	10	196030	196039	0 %	60 %	40 %	0 %	223478432
88	NC_016051	TGGGA	2	10	198302	198311	20 %	20 %	60 %	0 %	223478813
89	NC_016051	GGAAA	2	10	202478	202487	60 %	0 %	40 %	0 %	223478822
90	NC_016051	ATCCC	2	10	204215	204224	20 %	20 %	0 %	60 %	350525715
91	NC_016051	TCCCG	2	10	205122	205131	0 %	20 %	20 %	60 %	350525715
92	NC_016051	CTGAT	2	10	205338	205347	20 %	40 %	20 %	20 %	350525715
93	NC_016051	GAGAA	2	10	206871	206880	60 %	0 %	40 %	0 %	223478709
94	NC_016051	CTCCA	2	10	208245	208254	20 %	20 %	0 %	60 %	223478451
95	NC_016051	GCGTA	2	10	210062	210071	20 %	20 %	40 %	20 %	223478761
96	NC_016051	TCGGC	2	10	210262	210271	0 %	20 %	40 %	40 %	223478829
97	NC_016051	CGTAG	2	10	211390	211399	20 %	20 %	40 %	20 %	223478829
98	NC_016051	CTTTA	2	10	213907	213916	20 %	60 %	0 %	20 %	350525716
99	NC_016051	CCAGA	2	10	214942	214951	40 %	0 %	20 %	40 %	350525716
100	NC_016051	GAGCA	2	10	215449	215458	40 %	0 %	40 %	20 %	350525717
101	NC_016051	TTTAA	2	10	216293	216302	40 %	60 %	0 %	0 %	350525717
102	NC_016051	GGGTA	2	10	218016	218025	20 %	20 %	60 %	0 %	223478467
103	NC_016051	CTTCT	2	10	219811	219820	0 %	60 %	0 %	40 %	223478918
104	NC_016051	ACGGG	2	10	220177	220186	20 %	0 %	60 %	20 %	223478918
105	NC_016051	GCACG	2	10	220228	220237	20 %	0 %	40 %	40 %	223478918
106	NC_016051	CCGGA	2	10	221877	221886	20 %	0 %	40 %	40 %	223478488
107	NC_016051	CAAGG	2	10	222310	222319	40 %	0 %	40 %	20 %	223478488
108	NC_016051	GCTCC	2	10	224690	224699	0 %	20 %	20 %	60 %	223478675
109	NC_016051	GGAAC	2	10	224932	224941	40 %	0 %	40 %	20 %	223478675
110	NC_016051	CATGG	2	10	229210	229219	20 %	20 %	40 %	20 %	223478984
111	NC_016051	GGTAA	2	10	234024	234033	40 %	20 %	40 %	0 %	223478646
112	NC_016051	CAGAT	2	10	235736	235745	40 %	20 %	20 %	20 %	350525719
113	NC_016051	CCGGC	2	10	235976	235985	0 %	0 %	40 %	60 %	350525719
114	NC_016051	GGAGG	2	10	236320	236329	20 %	0 %	80 %	0 %	350525719
115	NC_016051	GCCTT	2	10	237032	237041	0 %	40 %	20 %	40 %	223478499
116	NC_016051	GTTGA	2	10	239423	239432	20 %	40 %	40 %	0 %	223478563
117	NC_016051	TGACT	2	10	239619	239628	20 %	40 %	20 %	20 %	223478563
118	NC_016051	CAGGA	2	10	240546	240555	40 %	0 %	40 %	20 %	223478640
119	NC_016051	TCATT	2	10	241438	241447	20 %	60 %	0 %	20 %	223479001
120	NC_016051	GTGGA	2	10	244843	244852	20 %	20 %	60 %	0 %	223478588
121	NC_016051	CAATG	2	10	247899	247908	40 %	20 %	20 %	20 %	223479011
122	NC_016051	TCCTC	2	10	251130	251139	0 %	40 %	0 %	60 %	223478954
123	NC_016051	GAACC	2	10	251326	251335	40 %	0 %	20 %	40 %	223478954
124	NC_016051	TTTTC	2	10	252916	252925	0 %	80 %	0 %	20 %	350525721
125	NC_016051	CTTCA	2	10	252980	252989	20 %	40 %	0 %	40 %	350525722
126	NC_016051	TCCGC	2	10	255953	255962	0 %	20 %	20 %	60 %	223478973
127	NC_016051	TCTGC	2	10	257611	257620	0 %	40 %	20 %	40 %	223478973
128	NC_016051	CTGGC	2	10	257703	257712	0 %	20 %	40 %	40 %	223478973
129	NC_016051	ACTTC	2	10	258252	258261	20 %	40 %	0 %	40 %	223478973
130	NC_016051	GGAAT	2	10	261177	261186	40 %	20 %	40 %	0 %	350525724
131	NC_016051	AGCTC	2	10	263630	263639	20 %	20 %	20 %	40 %	350525725
132	NC_016051	AAGGA	2	10	263685	263694	60 %	0 %	40 %	0 %	350525725
133	NC_016051	TTTCC	2	10	265877	265886	0 %	60 %	0 %	40 %	223479013
134	NC_016051	ATTTG	2	10	267820	267829	20 %	60 %	20 %	0 %	350525727
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261	NC_016051	ACGGG	2	10	536704	536713	20 %	0 %	60 %	20 %	223477137
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