MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016050	TAATA	2	10	429	438	60 %	40 %	0 %	0 %	350273054
2	NC_016050	TTTTA	2	10	2383	2392	20 %	80 %	0 %	0 %	350273057
3	NC_016050	ATTTA	2	10	2736	2745	40 %	60 %	0 %	0 %	350273057
4	NC_016050	GGTCA	2	10	3914	3923	20 %	20 %	40 %	20 %	350273058
5	NC_016050	TAAAT	2	10	4623	4632	60 %	40 %	0 %	0 %	350273058
6	NC_016050	ACTTT	2	10	6592	6601	20 %	60 %	0 %	20 %	350273060
7	NC_016050	AATAC	2	10	7133	7142	60 %	20 %	0 %	20 %	350273060
8	NC_016050	ATCCA	2	10	7630	7639	40 %	20 %	0 %	40 %	350273061
9	NC_016050	GGCTC	2	10	13283	13292	0 %	20 %	40 %	40 %	350273063
10	NC_016050	AGCAG	2	10	13708	13717	40 %	0 %	40 %	20 %	350273063
11	NC_016050	TTAAT	2	10	13851	13860	40 %	60 %	0 %	0 %	350273063
12	NC_016050	ATTTA	2	10	16785	16794	40 %	60 %	0 %	0 %	350273066
13	NC_016050	TTTTA	2	10	17553	17562	20 %	80 %	0 %	0 %	350273066
14	NC_016050	TCAAG	2	10	21180	21189	40 %	20 %	20 %	20 %	350273067
15	NC_016050	ATAAA	2	10	21234	21243	80 %	20 %	0 %	0 %	350273067
16	NC_016050	AGAAA	2	10	21496	21505	80 %	0 %	20 %	0 %	350273067
17	NC_016050	ACCAT	2	10	21701	21710	40 %	20 %	0 %	40 %	350273067
18	NC_016050	TAATA	2	10	22636	22645	60 %	40 %	0 %	0 %	350273067
19	NC_016050	CAAAG	2	10	22728	22737	60 %	0 %	20 %	20 %	350273067
20	NC_016050	TTAGT	2	10	22896	22905	20 %	60 %	20 %	0 %	350273067
21	NC_016050	TTTGT	2	10	30294	30303	0 %	80 %	20 %	0 %	350273070
22	NC_016050	TCATT	2	10	31681	31690	20 %	60 %	0 %	20 %	350273072
23	NC_016050	AGAAA	2	10	48732	48741	80 %	0 %	20 %	0 %	350273083
24	NC_016050	GTTTC	2	10	49172	49181	0 %	60 %	20 %	20 %	350273083
25	NC_016050	ATTTT	2	10	49721	49730	20 %	80 %	0 %	0 %	350273083
26	NC_016050	TTGAT	2	10	55262	55271	20 %	60 %	20 %	0 %	350273085
27	NC_016050	TAAAG	2	10	56289	56298	60 %	20 %	20 %	0 %	350273085
28	NC_016050	ATTAT	2	10	56362	56371	40 %	60 %	0 %	0 %	350273085
29	NC_016050	TCGGT	2	10	61817	61826	0 %	40 %	40 %	20 %	350273091
30	NC_016050	GCTTT	2	10	63418	63427	0 %	60 %	20 %	20 %	350273092
31	NC_016050	TAAAA	2	10	68144	68153	80 %	20 %	0 %	0 %	350273094
32	NC_016050	ACTTT	2	10	71166	71175	20 %	60 %	0 %	20 %	350273097
33	NC_016050	GCTTA	2	10	71355	71364	20 %	40 %	20 %	20 %	350273097
34	NC_016050	CATTT	2	10	72058	72067	20 %	60 %	0 %	20 %	350273097
35	NC_016050	TTAAA	2	10	72083	72092	60 %	40 %	0 %	0 %	350273097
36	NC_016050	ACATA	2	10	74884	74893	60 %	20 %	0 %	20 %	350273100
37	NC_016050	TTTCT	2	10	78323	78332	0 %	80 %	0 %	20 %	350273103
38	NC_016050	AAAAG	2	10	79516	79525	80 %	0 %	20 %	0 %	350273104
39	NC_016050	GGGTT	2	10	79726	79735	0 %	40 %	60 %	0 %	350273104
40	NC_016050	TTTAT	2	10	80102	80111	20 %	80 %	0 %	0 %	350273104
41	NC_016050	GCTTA	2	10	81246	81255	20 %	40 %	20 %	20 %	350273105
42	NC_016050	ACAAT	2	10	81610	81619	60 %	20 %	0 %	20 %	350273106
43	NC_016050	ACCGT	2	10	81863	81872	20 %	20 %	20 %	40 %	350273106
44	NC_016050	GTTAT	2	10	82235	82244	20 %	60 %	20 %	0 %	350273107
45	NC_016050	GTAGA	2	10	82541	82550	40 %	20 %	40 %	0 %	350273107
46	NC_016050	CAATG	2	10	84893	84902	40 %	20 %	20 %	20 %	350273109
47	NC_016050	ATAAA	2	10	85356	85365	80 %	20 %	0 %	0 %	350273110
48	NC_016050	ATTAA	2	10	86062	86071	60 %	40 %	0 %	0 %	350273110
49	NC_016050	TAAAT	2	10	89951	89960	60 %	40 %	0 %	0 %	350273114
50	NC_016050	CGCAT	3	15	94265	94279	20 %	20 %	20 %	40 %	350273120
51	NC_016050	TGAAA	2	10	97508	97517	60 %	20 %	20 %	0 %	350273122
52	NC_016050	TTGAT	2	10	99693	99702	20 %	60 %	20 %	0 %	350273123
53	NC_016050	ATTTA	2	10	101404	101413	40 %	60 %	0 %	0 %	350273125
54	NC_016050	TCAAA	2	10	103061	103070	60 %	20 %	0 %	20 %	350273127
55	NC_016050	TTAAT	2	10	103845	103854	40 %	60 %	0 %	0 %	350273128
56	NC_016050	AAACT	2	10	106415	106424	60 %	20 %	0 %	20 %	350273130
57	NC_016050	TTAGT	2	10	106766	106775	20 %	60 %	20 %	0 %	350273131
58	NC_016050	CCAAA	2	10	109204	109213	60 %	0 %	0 %	40 %	350273133
59	NC_016050	CGGAT	2	10	109751	109760	20 %	20 %	40 %	20 %	350273134
60	NC_016050	TTGAT	2	10	111241	111250	20 %	60 %	20 %	0 %	350273135
61	NC_016050	ATTAT	2	10	111422	111431	40 %	60 %	0 %	0 %	350273135
62	NC_016050	TTATA	2	10	111801	111810	40 %	60 %	0 %	0 %	350273135
63	NC_016050	TTTTC	2	10	112323	112332	0 %	80 %	0 %	20 %	350273135
64	NC_016050	GCAAA	2	10	117187	117196	60 %	0 %	20 %	20 %	350273136
65	NC_016050	ATAAA	2	10	123097	123106	80 %	20 %	0 %	0 %	350273139
66	NC_016050	AAGTA	2	10	123703	123712	60 %	20 %	20 %	0 %	350273140
67	NC_016050	ATTCG	2	10	125535	125544	20 %	40 %	20 %	20 %	350273143
68	NC_016050	TAAAA	2	10	125873	125882	80 %	20 %	0 %	0 %	350273144
69	NC_016050	AAAAC	2	10	126569	126578	80 %	0 %	0 %	20 %	350273144
70	NC_016050	TTTAA	2	10	126645	126654	40 %	60 %	0 %	0 %	350273144
71	NC_016050	GTTAC	2	10	127734	127743	20 %	40 %	20 %	20 %	350273146
72	NC_016050	TGAAA	2	10	128095	128104	60 %	20 %	20 %	0 %	350273146
73	NC_016050	CTTGT	2	10	131171	131180	0 %	60 %	20 %	20 %	350273148
74	NC_016050	ATGAT	2	10	132235	132244	40 %	40 %	20 %	0 %	350273149
75	NC_016050	TCTTT	2	10	134020	134029	0 %	80 %	0 %	20 %	350273151
76	NC_016050	AAATC	2	10	135967	135976	60 %	20 %	0 %	20 %	350273154
77	NC_016050	TTAAC	2	10	137104	137113	40 %	40 %	0 %	20 %	350273155
78	NC_016050	TATAA	2	10	137196	137205	60 %	40 %	0 %	0 %	350273155
79	NC_016050	TTATA	2	10	137570	137579	40 %	60 %	0 %	0 %	350273156
80	NC_016050	TTTTA	2	10	139223	139232	20 %	80 %	0 %	0 %	350273157
81	NC_016050	GCTTT	2	10	140799	140808	0 %	60 %	20 %	20 %	350273158
82	NC_016050	TATGT	2	10	141449	141458	20 %	60 %	20 %	0 %	350273158
83	NC_016050	GTTTT	2	10	143636	143645	0 %	80 %	20 %	0 %	350273159
84	NC_016050	CTTGG	2	10	144453	144462	0 %	40 %	40 %	20 %	350273159
85	NC_016050	ACAAG	2	10	148197	148206	60 %	0 %	20 %	20 %	350273160
86	NC_016050	AGTTT	2	10	148533	148542	20 %	60 %	20 %	0 %	350273161
87	NC_016050	TTAGT	2	10	149056	149065	20 %	60 %	20 %	0 %	350273161
88	NC_016050	ATATA	2	10	149962	149971	60 %	40 %	0 %	0 %	350273161
89	NC_016050	TGCAG	2	10	150050	150059	20 %	20 %	40 %	20 %	350273161
90	NC_016050	GTTAT	2	10	150466	150475	20 %	60 %	20 %	0 %	350273161
91	NC_016050	AATTT	2	10	159893	159902	40 %	60 %	0 %	0 %	350273166
92	NC_016050	AGGTG	2	10	159999	160008	20 %	20 %	60 %	0 %	350273166
93	NC_016050	GAAGT	2	10	163916	163925	40 %	20 %	40 %	0 %	350273170
94	NC_016050	TATCA	2	10	167597	167606	40 %	40 %	0 %	20 %	350273173
95	NC_016050	TAGCT	2	10	167684	167693	20 %	40 %	20 %	20 %	350273173
96	NC_016050	TTATT	2	10	168546	168555	20 %	80 %	0 %	0 %	350273174
97	NC_016050	AATTT	2	10	168967	168976	40 %	60 %	0 %	0 %	350273175
98	NC_016050	ATTTT	2	10	169354	169363	20 %	80 %	0 %	0 %	350273175
99	NC_016050	AGCCG	2	10	169559	169568	20 %	0 %	40 %	40 %	350273175
100	NC_016050	TGGTG	2	10	173637	173646	0 %	40 %	60 %	0 %	350273179
101	NC_016050	TTAAT	2	10	174531	174540	40 %	60 %	0 %	0 %	350273181
102	NC_016050	AAGAA	2	10	176143	176152	80 %	0 %	20 %	0 %	350273181
103	NC_016050	CAGGG	2	10	176786	176795	20 %	0 %	60 %	20 %	350273182
104	NC_016050	TGGAT	2	10	178338	178347	20 %	40 %	40 %	0 %	350273184
105	NC_016050	GTGCC	2	10	179808	179817	0 %	20 %	40 %	40 %	350273184
106	NC_016050	ACATA	2	10	180871	180880	60 %	20 %	0 %	20 %	350273185
107	NC_016050	ACAGA	2	10	180929	180938	60 %	0 %	20 %	20 %	350273186
108	NC_016050	TAAAA	2	10	181984	181993	80 %	20 %	0 %	0 %	350273187
109	NC_016050	TATAC	2	10	192441	192450	40 %	40 %	0 %	20 %	350273192
110	NC_016050	GTAGA	2	10	192850	192859	40 %	20 %	40 %	0 %	350273192
111	NC_016050	CGATA	2	10	196107	196116	40 %	20 %	20 %	20 %	350273194
112	NC_016050	TAAAA	2	10	202009	202018	80 %	20 %	0 %	0 %	350273198
113	NC_016050	TAGCA	2	10	202120	202129	40 %	20 %	20 %	20 %	350273198
114	NC_016050	TAAAG	2	10	203005	203014	60 %	20 %	20 %	0 %	350273199
115	NC_016050	GAATT	2	10	206944	206953	40 %	40 %	20 %	0 %	350273203
116	NC_016050	ATTTT	2	10	209768	209777	20 %	80 %	0 %	0 %	350273206
117	NC_016050	ATATA	2	10	211927	211936	60 %	40 %	0 %	0 %	350273209
118	NC_016050	AATTT	2	10	211937	211946	40 %	60 %	0 %	0 %	350273209
119	NC_016050	AAAAC	2	10	212355	212364	80 %	0 %	0 %	20 %	350273210
120	NC_016050	AAAGT	2	10	212677	212686	60 %	20 %	20 %	0 %	350273210
121	NC_016050	AATAA	2	10	213243	213252	80 %	20 %	0 %	0 %	350273210
122	NC_016050	TTAAA	2	10	216071	216080	60 %	40 %	0 %	0 %	350273213
123	NC_016050	TAAAT	2	10	216216	216225	60 %	40 %	0 %	0 %	350273213
124	NC_016050	GTGCG	2	10	216717	216726	0 %	20 %	60 %	20 %	350273213
125	NC_016050	AGCTA	2	10	216936	216945	40 %	20 %	20 %	20 %	350273213
126	NC_016050	CCTTG	2	10	217259	217268	0 %	40 %	20 %	40 %	350273213
127	NC_016050	ATATA	2	10	218510	218519	60 %	40 %	0 %	0 %	350273214
128	NC_016050	CAATA	2	10	219382	219391	60 %	20 %	0 %	20 %	350273214
129	NC_016050	TAAAG	2	10	220928	220937	60 %	20 %	20 %	0 %	350273216
130	NC_016050	AAGGC	2	10	223757	223766	40 %	0 %	40 %	20 %	350273219
131	NC_016050	ATTCT	2	10	237327	237336	20 %	60 %	0 %	20 %	350273228
132	NC_016050	CCATC	2	10	238903	238912	20 %	20 %	0 %	60 %	350273230
133	NC_016050	TACCA	2	10	239315	239324	40 %	20 %	0 %	40 %	350273231
134	NC_016050	TTTGC	2	10	245189	245198	0 %	60 %	20 %	20 %	350273234
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