MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 3832

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016050	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016050	ATTT	2	8	1247	1254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016050	TTAT	2	8	2544	2551	25 %	75 %	0 %	0 %	350273057
4	NC_016050	TTAT	2	8	2766	2773	25 %	75 %	0 %	0 %	350273057
5	NC_016050	CAAA	2	8	3195	3202	75 %	0 %	0 %	25 %	350273058
6	NC_016050	TATT	2	8	3462	3469	25 %	75 %	0 %	0 %	350273058
7	NC_016050	TCGC	2	8	3523	3530	0 %	25 %	25 %	50 %	350273058
8	NC_016050	AATA	2	8	5094	5101	75 %	25 %	0 %	0 %	350273058
9	NC_016050	ATTC	2	8	5131	5138	25 %	50 %	0 %	25 %	350273058
10	NC_016050	TTAT	2	8	6318	6325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016050	TAAA	2	8	6416	6423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016050	ATAA	2	8	6873	6880	75 %	25 %	0 %	0 %	350273060
13	NC_016050	ACTT	2	8	7256	7263	25 %	50 %	0 %	25 %	350273061
14	NC_016050	ATTT	2	8	7663	7670	25 %	75 %	0 %	0 %	350273061
15	NC_016050	CTGT	2	8	8093	8100	0 %	50 %	25 %	25 %	350273062
16	NC_016050	CCTC	2	8	9976	9983	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_016050	CAAT	2	8	10023	10030	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016050	TCTA	2	8	10896	10903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016050	ATTT	2	8	10978	10985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016050	ATTA	2	8	11023	11030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016050	ATTA	2	8	11235	11242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016050	TTTA	2	8	11850	11857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016050	GATT	2	8	12290	12297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016050	AAAT	2	8	12298	12305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016050	AATT	2	8	12325	12332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016050	TTAA	2	8	12506	12513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016050	ATGA	2	8	13205	13212	50 %	25 %	25 %	0 %	350273063
28	NC_016050	TAAA	2	8	14227	14234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016050	TAAA	2	8	14386	14393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016050	TCAT	2	8	14507	14514	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016050	TTAG	2	8	14881	14888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016050	GCAA	2	8	14979	14986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016050	TCTT	2	8	15056	15063	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016050	AGTA	2	8	15314	15321	50 %	25 %	25 %	0 %	350273064
35	NC_016050	GCTT	2	8	15840	15847	0 %	50 %	25 %	25 %	350273065
36	NC_016050	AATT	2	8	16189	16196	50 %	50 %	0 %	0 %	350273065
37	NC_016050	GCTT	2	8	16460	16467	0 %	50 %	25 %	25 %	350273065
38	NC_016050	AATA	2	8	16813	16820	75 %	25 %	0 %	0 %	350273066
39	NC_016050	TCTA	2	8	17280	17287	25 %	50 %	0 %	25 %	350273066
40	NC_016050	ACGT	2	8	17703	17710	25 %	25 %	25 %	25 %	350273066
41	NC_016050	CTTG	2	8	17818	17825	0 %	50 %	25 %	25 %	350273066
42	NC_016050	AAGC	2	8	18815	18822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016050	AGTA	2	8	18875	18882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016050	ATTA	2	8	18900	18907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016050	AATA	2	8	18944	18951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016050	CTTT	2	8	18989	18996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016050	TAAA	2	8	19181	19188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016050	AGAT	2	8	19369	19376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016050	TAAA	2	8	19538	19545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016050	AGAT	2	8	19618	19625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016050	AGCA	2	8	19687	19694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016050	AGTA	2	8	19945	19952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016050	AAAC	2	8	19995	20002	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016050	ATTT	2	8	20101	20108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016050	AAAT	2	8	20406	20413	75 %	25 %	0 %	0 %	350273067
56	NC_016050	GTAA	2	8	21029	21036	50 %	25 %	25 %	0 %	350273067
57	NC_016050	AGAT	2	8	21283	21290	50 %	25 %	25 %	0 %	350273067
58	NC_016050	AGCA	2	8	21402	21409	50 %	0 %	25 %	25 %	350273067
59	NC_016050	AAAT	2	8	21445	21452	75 %	25 %	0 %	0 %	350273067
60	NC_016050	AATG	2	8	21646	21653	50 %	25 %	25 %	0 %	350273067
61	NC_016050	ATTA	2	8	21884	21891	50 %	50 %	0 %	0 %	350273067
62	NC_016050	ATAG	2	8	21932	21939	50 %	25 %	25 %	0 %	350273067
63	NC_016050	ATAG	2	8	21944	21951	50 %	25 %	25 %	0 %	350273067
64	NC_016050	AACA	2	8	22625	22632	75 %	0 %	0 %	25 %	350273067
65	NC_016050	CAAA	2	8	22679	22686	75 %	0 %	0 %	25 %	350273067
66	NC_016050	TAGT	2	8	22794	22801	25 %	50 %	25 %	0 %	350273067
67	NC_016050	GTTA	2	8	23642	23649	25 %	50 %	25 %	0 %	350273067
68	NC_016050	AAGC	2	8	23837	23844	50 %	0 %	25 %	25 %	350273067
69	NC_016050	ATCT	2	8	24715	24722	25 %	50 %	0 %	25 %	350273067
70	NC_016050	AAGT	2	8	24756	24763	50 %	25 %	25 %	0 %	350273067
71	NC_016050	TTCA	2	8	25398	25405	25 %	50 %	0 %	25 %	350273067
72	NC_016050	AATA	2	8	25891	25898	75 %	25 %	0 %	0 %	350273067
73	NC_016050	TAAA	2	8	26037	26044	75 %	25 %	0 %	0 %	350273067
74	NC_016050	CTTA	2	8	26191	26198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016050	TTTA	2	8	26769	26776	25 %	75 %	0 %	0 %	350273068
76	NC_016050	AATT	2	8	27013	27020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016050	TTAT	2	8	27329	27336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016050	AGCA	2	8	27390	27397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016050	TAAT	2	8	28321	28328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016050	AAGA	2	8	28469	28476	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016050	AAAT	2	8	28561	28568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016050	ATTA	2	8	28589	28596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016050	AAAT	2	8	28880	28887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016050	TAAA	2	8	29192	29199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016050	GATA	2	8	29280	29287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016050	TAAA	2	8	29519	29526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016050	GCTA	2	8	29529	29536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016050	CTAT	2	8	30279	30286	25 %	50 %	0 %	25 %	350273070
89	NC_016050	ATTT	2	8	30322	30329	25 %	75 %	0 %	0 %	350273070
90	NC_016050	TAAT	2	8	30776	30783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016050	ATAC	2	8	30983	30990	50 %	25 %	0 %	25 %	350273072
92	NC_016050	ATAA	2	8	31407	31414	75 %	25 %	0 %	0 %	350273072
93	NC_016050	CACT	2	8	31501	31508	25 %	25 %	0 %	50 %	350273072
94	NC_016050	TATT	2	8	32324	32331	25 %	75 %	0 %	0 %	350273074
95	NC_016050	AATT	2	8	33959	33966	50 %	50 %	0 %	0 %	350273076
96	NC_016050	TACC	2	8	34049	34056	25 %	25 %	0 %	50 %	350273076
97	NC_016050	GTTA	2	8	34431	34438	25 %	50 %	25 %	0 %	350273076
98	NC_016050	AATT	2	8	35452	35459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016050	AAAC	2	8	35719	35726	75 %	0 %	0 %	25 %	350273077
100	NC_016050	TTAG	2	8	35895	35902	25 %	50 %	25 %	0 %	350273077
101	NC_016050	TTGC	2	8	36190	36197	0 %	50 %	25 %	25 %	350273077
102	NC_016050	ACTA	2	8	36344	36351	50 %	25 %	0 %	25 %	350273077
103	NC_016050	TTCC	2	8	36430	36437	0 %	50 %	0 %	50 %	350273077
104	NC_016050	TTGT	2	8	37493	37500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016050	TATT	2	8	37572	37579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016050	GTAA	2	8	37583	37590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016050	ATAA	2	8	37597	37604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016050	AATG	2	8	38358	38365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016050	GCTT	2	8	39139	39146	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016050	ATAA	2	8	39365	39372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016050	AACA	2	8	39460	39467	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016050	AGCA	2	8	40204	40211	50 %	0 %	25 %	25 %	350273078
113	NC_016050	CTGA	2	8	41239	41246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016050	TAAA	2	8	41571	41578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016050	ATTT	2	8	41676	41683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016050	ATTA	2	8	41892	41899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016050	GCTT	2	8	42143	42150	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016050	ATTA	2	8	42634	42641	50 %	50 %	0 %	0 %	350273079
119	NC_016050	CTTT	2	8	42696	42703	0 %	75 %	0 %	25 %	350273079
120	NC_016050	AAAT	2	8	42844	42851	75 %	25 %	0 %	0 %	350273079
121	NC_016050	TAAT	2	8	42945	42952	50 %	50 %	0 %	0 %	350273079
122	NC_016050	ATTA	2	8	43016	43023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016050	AAAT	2	8	43113	43120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016050	GAAA	2	8	43324	43331	75 %	0 %	25 %	0 %	350273080
125	NC_016050	ATTT	2	8	43368	43375	25 %	75 %	0 %	0 %	350273080
126	NC_016050	ACAA	2	8	43635	43642	75 %	0 %	0 %	25 %	350273080
127	NC_016050	AAAT	2	8	43839	43846	75 %	25 %	0 %	0 %	350273081
128	NC_016050	ATAA	2	8	44315	44322	75 %	25 %	0 %	0 %	350273081
129	NC_016050	TACC	2	8	45201	45208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016050	AAAC	2	8	45209	45216	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016050	TAAT	2	8	45285	45292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016050	ATTA	2	8	45320	45327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016050	AAAT	2	8	45339	45346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016050	ATGA	2	8	45544	45551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016050	ATTC	2	8	46163	46170	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016050	CAAT	2	8	47196	47203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016050	ATTT	2	8	48254	48261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016050	TTAC	2	8	48333	48340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016050	ATCA	2	8	49011	49018	50 %	25 %	0 %	25 %	350273083
140	NC_016050	TGCC	2	8	49321	49328	0 %	25 %	25 %	50 %	350273083
141	NC_016050	TATC	2	8	49880	49887	25 %	50 %	0 %	25 %	350273083
142	NC_016050	TTAA	2	8	49903	49910	50 %	50 %	0 %	0 %	350273083
143	NC_016050	ATAC	2	8	51019	51026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016050	TTGC	2	8	51163	51170	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016050	AAGT	2	8	51486	51493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016050	ATCT	2	8	52119	52126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016050	TTTA	2	8	52155	52162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016050	CCGC	2	8	52260	52267	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_016050	TGCT	2	8	52280	52287	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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