MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 1245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016050	TTTA	2	8	866	873	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016050	ATTT	2	8	1247	1254	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016050	TTAT	2	8	6318	6325	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016050	TAAA	2	8	6416	6423	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016050	CCTC	2	8	9976	9983	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_016050	CAAT	2	8	10023	10030	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016050	TCTA	2	8	10896	10903	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016050	ATTT	2	8	10978	10985	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016050	ATTA	2	8	11023	11030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016050	ATTA	2	8	11235	11242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016050	TTTA	2	8	11850	11857	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016050	GATT	2	8	12290	12297	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016050	AAAT	2	8	12298	12305	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016050	AATT	2	8	12325	12332	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016050	TTAA	2	8	12506	12513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016050	TAAA	2	8	14227	14234	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016050	TAAA	2	8	14386	14393	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016050	TCAT	2	8	14507	14514	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016050	TTAG	2	8	14881	14888	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016050	GCAA	2	8	14979	14986	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016050	TCTT	2	8	15056	15063	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016050	AAGC	2	8	18815	18822	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016050	AGTA	2	8	18875	18882	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016050	ATTA	2	8	18900	18907	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016050	AATA	2	8	18944	18951	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016050	CTTT	2	8	18989	18996	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016050	TAAA	2	8	19181	19188	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016050	AGAT	2	8	19369	19376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016050	TAAA	2	8	19538	19545	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016050	AGAT	2	8	19618	19625	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016050	AGCA	2	8	19687	19694	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016050	AGTA	2	8	19945	19952	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016050	AAAC	2	8	19995	20002	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016050	ATTT	2	8	20101	20108	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016050	CTTA	2	8	26191	26198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016050	AATT	2	8	27013	27020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016050	TTAT	2	8	27329	27336	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016050	AGCA	2	8	27390	27397	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016050	TAAT	2	8	28321	28328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016050	AAGA	2	8	28469	28476	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016050	AAAT	2	8	28561	28568	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016050	ATTA	2	8	28589	28596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016050	AAAT	2	8	28880	28887	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016050	TAAA	2	8	29192	29199	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016050	GATA	2	8	29280	29287	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016050	TAAA	2	8	29519	29526	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016050	GCTA	2	8	29529	29536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016050	TAAT	2	8	30776	30783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016050	AATT	2	8	35452	35459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016050	TTGT	2	8	37493	37500	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016050	TATT	2	8	37572	37579	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016050	GTAA	2	8	37583	37590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016050	ATAA	2	8	37597	37604	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016050	AATG	2	8	38358	38365	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016050	GCTT	2	8	39139	39146	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016050	ATAA	2	8	39365	39372	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016050	AACA	2	8	39460	39467	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016050	CTGA	2	8	41239	41246	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016050	TAAA	2	8	41571	41578	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016050	ATTT	2	8	41676	41683	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016050	ATTA	2	8	41892	41899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016050	GCTT	2	8	42143	42150	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016050	ATTA	2	8	43016	43023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016050	AAAT	2	8	43113	43120	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016050	TACC	2	8	45201	45208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016050	AAAC	2	8	45209	45216	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016050	TAAT	2	8	45285	45292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016050	ATTA	2	8	45320	45327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016050	AAAT	2	8	45339	45346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016050	ATGA	2	8	45544	45551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016050	ATTC	2	8	46163	46170	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016050	CAAT	2	8	47196	47203	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016050	ATTT	2	8	48254	48261	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016050	TTAC	2	8	48333	48340	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016050	ATAC	2	8	51019	51026	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016050	TTGC	2	8	51163	51170	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016050	AAGT	2	8	51486	51493	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016050	ATCT	2	8	52119	52126	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016050	TTTA	2	8	52155	52162	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016050	CCGC	2	8	52260	52267	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
81	NC_016050	TGCT	2	8	52280	52287	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016050	TGCT	2	8	52596	52603	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016050	TTTA	2	8	52701	52708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016050	TCAC	2	8	52810	52817	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016050	TAAA	2	8	52850	52857	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016050	TATT	2	8	53865	53872	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016050	ATTA	2	8	54065	54072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016050	ATTA	2	8	56872	56879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016050	ATCT	2	8	58696	58703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016050	AACG	2	8	60074	60081	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016050	TTAT	2	8	60453	60460	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016050	AGCA	2	8	60506	60513	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016050	TAAA	2	8	64002	64009	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016050	ATTT	2	8	64028	64035	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016050	ATTT	2	8	66030	66037	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016050	CAAA	2	8	66457	66464	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016050	TGTT	2	8	66481	66488	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016050	CAAT	2	8	66790	66797	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016050	ATAA	2	8	66879	66886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016050	TCAA	2	8	66942	66949	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016050	TTAA	2	8	68187	68194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016050	ACAA	2	8	68333	68340	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016050	ATAA	2	8	70715	70722	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016050	GTAA	2	8	70763	70770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016050	CAAT	2	8	75966	75973	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016050	CAAT	2	8	76245	76252	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016050	TGAT	2	8	77011	77018	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016050	TAAG	2	8	77050	77057	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016050	GTAA	2	8	77386	77393	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016050	CAAT	2	8	77547	77554	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016050	TAGA	2	8	78583	78590	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016050	TAAA	2	8	78604	78611	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016050	TTTA	2	8	78649	78656	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016050	AATT	2	8	88241	88248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016050	ATTT	2	8	89268	89275	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016050	ATAA	2	8	95486	95493	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016050	AATT	2	8	98910	98917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016050	TAAA	2	8	100266	100273	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016050	AAAT	2	8	100286	100293	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016050	ATTA	2	8	100506	100513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016050	TCCA	2	8	103547	103554	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016050	AAGC	2	8	103642	103649	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016050	ATGT	2	8	105697	105704	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016050	ATCA	2	8	108986	108993	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016050	ATGT	2	8	110307	110314	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016050	AAAG	2	8	110468	110475	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016050	TTTA	2	8	110691	110698	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016050	ATTA	2	8	116461	116468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016050	GAAA	2	8	116582	116589	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016050	TAAA	2	8	116607	116614	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016050	ACTC	2	8	120512	120519	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016050	CAAA	2	8	120534	120541	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016050	CTAT	2	8	120604	120611	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016050	TAAG	2	8	123860	123867	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016050	AAAT	2	8	125209	125216	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016050	CTAC	2	8	125729	125736	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016050	AGTA	2	8	125835	125842	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016050	CGCT	2	8	128436	128443	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016050	TCAC	2	8	128465	128472	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016050	GCAG	2	8	128485	128492	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016050	ATTG	2	8	128840	128847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016050	AAAG	2	8	129028	129035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016050	ATAA	2	8	129040	129047	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016050	ACGT	2	8	131538	131545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016050	ATTC	2	8	132922	132929	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016050	TAAT	2	8	132943	132950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016050	TTTA	2	8	133117	133124	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016050	GAAA	2	8	134384	134391	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016050	TAAT	2	8	134664	134671	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016050	TTTG	2	8	135499	135506	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016050	AAAT	2	8	137867	137874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016050	CTGT	2	8	140322	140329	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_016050	TCGC	2	8	151296	151303	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
154	NC_016050	TAAT	2	8	152415	152422	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016050	GCTT	2	8	152454	152461	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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