MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 2587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016050	TTAT	2	8	2544	2551	25 %	75 %	0 %	0 %	350273057
2	NC_016050	TTAT	2	8	2766	2773	25 %	75 %	0 %	0 %	350273057
3	NC_016050	CAAA	2	8	3195	3202	75 %	0 %	0 %	25 %	350273058
4	NC_016050	TATT	2	8	3462	3469	25 %	75 %	0 %	0 %	350273058
5	NC_016050	TCGC	2	8	3523	3530	0 %	25 %	25 %	50 %	350273058
6	NC_016050	AATA	2	8	5094	5101	75 %	25 %	0 %	0 %	350273058
7	NC_016050	ATTC	2	8	5131	5138	25 %	50 %	0 %	25 %	350273058
8	NC_016050	ATAA	2	8	6873	6880	75 %	25 %	0 %	0 %	350273060
9	NC_016050	ACTT	2	8	7256	7263	25 %	50 %	0 %	25 %	350273061
10	NC_016050	ATTT	2	8	7663	7670	25 %	75 %	0 %	0 %	350273061
11	NC_016050	CTGT	2	8	8093	8100	0 %	50 %	25 %	25 %	350273062
12	NC_016050	ATGA	2	8	13205	13212	50 %	25 %	25 %	0 %	350273063
13	NC_016050	AGTA	2	8	15314	15321	50 %	25 %	25 %	0 %	350273064
14	NC_016050	GCTT	2	8	15840	15847	0 %	50 %	25 %	25 %	350273065
15	NC_016050	AATT	2	8	16189	16196	50 %	50 %	0 %	0 %	350273065
16	NC_016050	GCTT	2	8	16460	16467	0 %	50 %	25 %	25 %	350273065
17	NC_016050	AATA	2	8	16813	16820	75 %	25 %	0 %	0 %	350273066
18	NC_016050	TCTA	2	8	17280	17287	25 %	50 %	0 %	25 %	350273066
19	NC_016050	ACGT	2	8	17703	17710	25 %	25 %	25 %	25 %	350273066
20	NC_016050	CTTG	2	8	17818	17825	0 %	50 %	25 %	25 %	350273066
21	NC_016050	AAAT	2	8	20406	20413	75 %	25 %	0 %	0 %	350273067
22	NC_016050	GTAA	2	8	21029	21036	50 %	25 %	25 %	0 %	350273067
23	NC_016050	AGAT	2	8	21283	21290	50 %	25 %	25 %	0 %	350273067
24	NC_016050	AGCA	2	8	21402	21409	50 %	0 %	25 %	25 %	350273067
25	NC_016050	AAAT	2	8	21445	21452	75 %	25 %	0 %	0 %	350273067
26	NC_016050	AATG	2	8	21646	21653	50 %	25 %	25 %	0 %	350273067
27	NC_016050	ATTA	2	8	21884	21891	50 %	50 %	0 %	0 %	350273067
28	NC_016050	ATAG	2	8	21932	21939	50 %	25 %	25 %	0 %	350273067
29	NC_016050	ATAG	2	8	21944	21951	50 %	25 %	25 %	0 %	350273067
30	NC_016050	AACA	2	8	22625	22632	75 %	0 %	0 %	25 %	350273067
31	NC_016050	CAAA	2	8	22679	22686	75 %	0 %	0 %	25 %	350273067
32	NC_016050	TAGT	2	8	22794	22801	25 %	50 %	25 %	0 %	350273067
33	NC_016050	GTTA	2	8	23642	23649	25 %	50 %	25 %	0 %	350273067
34	NC_016050	AAGC	2	8	23837	23844	50 %	0 %	25 %	25 %	350273067
35	NC_016050	ATCT	2	8	24715	24722	25 %	50 %	0 %	25 %	350273067
36	NC_016050	AAGT	2	8	24756	24763	50 %	25 %	25 %	0 %	350273067
37	NC_016050	TTCA	2	8	25398	25405	25 %	50 %	0 %	25 %	350273067
38	NC_016050	AATA	2	8	25891	25898	75 %	25 %	0 %	0 %	350273067
39	NC_016050	TAAA	2	8	26037	26044	75 %	25 %	0 %	0 %	350273067
40	NC_016050	TTTA	2	8	26769	26776	25 %	75 %	0 %	0 %	350273068
41	NC_016050	CTAT	2	8	30279	30286	25 %	50 %	0 %	25 %	350273070
42	NC_016050	ATTT	2	8	30322	30329	25 %	75 %	0 %	0 %	350273070
43	NC_016050	ATAC	2	8	30983	30990	50 %	25 %	0 %	25 %	350273072
44	NC_016050	ATAA	2	8	31407	31414	75 %	25 %	0 %	0 %	350273072
45	NC_016050	CACT	2	8	31501	31508	25 %	25 %	0 %	50 %	350273072
46	NC_016050	TATT	2	8	32324	32331	25 %	75 %	0 %	0 %	350273074
47	NC_016050	AATT	2	8	33959	33966	50 %	50 %	0 %	0 %	350273076
48	NC_016050	TACC	2	8	34049	34056	25 %	25 %	0 %	50 %	350273076
49	NC_016050	GTTA	2	8	34431	34438	25 %	50 %	25 %	0 %	350273076
50	NC_016050	AAAC	2	8	35719	35726	75 %	0 %	0 %	25 %	350273077
51	NC_016050	TTAG	2	8	35895	35902	25 %	50 %	25 %	0 %	350273077
52	NC_016050	TTGC	2	8	36190	36197	0 %	50 %	25 %	25 %	350273077
53	NC_016050	ACTA	2	8	36344	36351	50 %	25 %	0 %	25 %	350273077
54	NC_016050	TTCC	2	8	36430	36437	0 %	50 %	0 %	50 %	350273077
55	NC_016050	AGCA	2	8	40204	40211	50 %	0 %	25 %	25 %	350273078
56	NC_016050	ATTA	2	8	42634	42641	50 %	50 %	0 %	0 %	350273079
57	NC_016050	CTTT	2	8	42696	42703	0 %	75 %	0 %	25 %	350273079
58	NC_016050	AAAT	2	8	42844	42851	75 %	25 %	0 %	0 %	350273079
59	NC_016050	TAAT	2	8	42945	42952	50 %	50 %	0 %	0 %	350273079
60	NC_016050	GAAA	2	8	43324	43331	75 %	0 %	25 %	0 %	350273080
61	NC_016050	ATTT	2	8	43368	43375	25 %	75 %	0 %	0 %	350273080
62	NC_016050	ACAA	2	8	43635	43642	75 %	0 %	0 %	25 %	350273080
63	NC_016050	AAAT	2	8	43839	43846	75 %	25 %	0 %	0 %	350273081
64	NC_016050	ATAA	2	8	44315	44322	75 %	25 %	0 %	0 %	350273081
65	NC_016050	ATCA	2	8	49011	49018	50 %	25 %	0 %	25 %	350273083
66	NC_016050	TGCC	2	8	49321	49328	0 %	25 %	25 %	50 %	350273083
67	NC_016050	TATC	2	8	49880	49887	25 %	50 %	0 %	25 %	350273083
68	NC_016050	TTAA	2	8	49903	49910	50 %	50 %	0 %	0 %	350273083
69	NC_016050	TAAA	2	8	54290	54297	75 %	25 %	0 %	0 %	350273085
70	NC_016050	GAGG	2	8	54316	54323	25 %	0 %	75 %	0 %	350273085
71	NC_016050	TTAT	2	8	54913	54920	25 %	75 %	0 %	0 %	350273085
72	NC_016050	TGCT	2	8	54995	55002	0 %	50 %	25 %	25 %	350273085
73	NC_016050	GTGA	2	8	55102	55109	25 %	25 %	50 %	0 %	350273085
74	NC_016050	GTTC	2	8	55880	55887	0 %	50 %	25 %	25 %	350273085
75	NC_016050	GACC	2	8	55898	55905	25 %	0 %	25 %	50 %	350273085
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80	NC_016050	CTTT	2	8	58336	58343	0 %	75 %	0 %	25 %	350273087
81	NC_016050	ACTT	2	8	58845	58852	25 %	50 %	0 %	25 %	350273088
82	NC_016050	TTGC	2	8	59303	59310	0 %	50 %	25 %	25 %	350273088
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84	NC_016050	ATAA	2	8	59389	59396	75 %	25 %	0 %	0 %	350273088
85	NC_016050	ATTT	3	12	59702	59713	25 %	75 %	0 %	0 %	350273088
86	NC_016050	GTTT	2	8	60832	60839	0 %	75 %	25 %	0 %	350273089
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89	NC_016050	TAAA	2	8	61531	61538	75 %	25 %	0 %	0 %	350273090
90	NC_016050	AAGA	2	8	62656	62663	75 %	0 %	25 %	0 %	350273092
91	NC_016050	AGTC	2	8	62891	62898	25 %	25 %	25 %	25 %	350273092
92	NC_016050	TAAT	2	8	63478	63485	50 %	50 %	0 %	0 %	350273092
93	NC_016050	ATTA	2	8	63554	63561	50 %	50 %	0 %	0 %	350273092
94	NC_016050	GAAT	2	8	64381	64388	50 %	25 %	25 %	0 %	350273093
95	NC_016050	CAAG	2	8	64612	64619	50 %	0 %	25 %	25 %	350273093
96	NC_016050	ATGG	2	8	64935	64942	25 %	25 %	50 %	0 %	350273093
97	NC_016050	AAGA	2	8	65220	65227	75 %	0 %	25 %	0 %	350273093
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99	NC_016050	TTAA	2	8	67584	67591	50 %	50 %	0 %	0 %	350273094
100	NC_016050	GGAA	2	8	67640	67647	50 %	0 %	50 %	0 %	350273094
101	NC_016050	GCAT	2	8	67692	67699	25 %	25 %	25 %	25 %	350273094
102	NC_016050	TGCT	2	8	67919	67926	0 %	50 %	25 %	25 %	350273094
103	NC_016050	AATT	2	8	68732	68739	50 %	50 %	0 %	0 %	350273095
104	NC_016050	TGTT	2	8	68992	68999	0 %	75 %	25 %	0 %	350273095
105	NC_016050	TGAT	2	8	69541	69548	25 %	50 %	25 %	0 %	350273095
106	NC_016050	AATT	2	8	69922	69929	50 %	50 %	0 %	0 %	350273095
107	NC_016050	AAAC	2	8	70496	70503	75 %	0 %	0 %	25 %	350273096
108	NC_016050	TGTT	2	8	71009	71016	0 %	75 %	25 %	0 %	350273097
109	NC_016050	TTAT	2	8	71142	71149	25 %	75 %	0 %	0 %	350273097
110	NC_016050	AACT	2	8	71531	71538	50 %	25 %	0 %	25 %	350273097
111	NC_016050	GAAT	2	8	72301	72308	50 %	25 %	25 %	0 %	350273098
112	NC_016050	TAAT	2	8	72316	72323	50 %	50 %	0 %	0 %	350273098
113	NC_016050	TAGT	2	8	72682	72689	25 %	50 %	25 %	0 %	350273098
114	NC_016050	ATTT	2	8	72772	72779	25 %	75 %	0 %	0 %	350273098
115	NC_016050	TATT	2	8	72834	72841	25 %	75 %	0 %	0 %	350273098
116	NC_016050	CTTG	2	8	73253	73260	0 %	50 %	25 %	25 %	350273098
117	NC_016050	TGTA	2	8	73642	73649	25 %	50 %	25 %	0 %	350273098
118	NC_016050	ATTT	2	8	73726	73733	25 %	75 %	0 %	0 %	350273098
119	NC_016050	TAAT	4	16	73979	73994	50 %	50 %	0 %	0 %	350273098
120	NC_016050	TTAG	2	8	74302	74309	25 %	50 %	25 %	0 %	350273099
121	NC_016050	AAGT	2	8	74658	74665	50 %	25 %	25 %	0 %	350273100
122	NC_016050	ATTT	2	8	75276	75283	25 %	75 %	0 %	0 %	350273101
123	NC_016050	AGAT	2	8	75355	75362	50 %	25 %	25 %	0 %	350273101
124	NC_016050	TTGC	2	8	79360	79367	0 %	50 %	25 %	25 %	350273104
125	NC_016050	GATG	2	8	79461	79468	25 %	25 %	50 %	0 %	350273104
126	NC_016050	TAAA	2	8	80202	80209	75 %	25 %	0 %	0 %	350273104
127	NC_016050	TAAA	2	8	80226	80233	75 %	25 %	0 %	0 %	350273104
128	NC_016050	TGTT	2	8	81024	81031	0 %	75 %	25 %	0 %	350273105
129	NC_016050	TGTT	2	8	81041	81048	0 %	75 %	25 %	0 %	350273105
130	NC_016050	TTCT	2	8	81311	81318	0 %	75 %	0 %	25 %	350273105
131	NC_016050	GGAT	2	8	81463	81470	25 %	25 %	50 %	0 %	350273105
132	NC_016050	TACT	2	8	81678	81685	25 %	50 %	0 %	25 %	350273106
133	NC_016050	TGAT	2	8	83258	83265	25 %	50 %	25 %	0 %	350273107
134	NC_016050	ATTT	2	8	83690	83697	25 %	75 %	0 %	0 %	350273107
135	NC_016050	ATTT	2	8	83860	83867	25 %	75 %	0 %	0 %	350273107
136	NC_016050	AGTT	2	8	83931	83938	25 %	50 %	25 %	0 %	350273108
137	NC_016050	ATCA	2	8	83953	83960	50 %	25 %	0 %	25 %	350273108
138	NC_016050	ACAT	2	8	84048	84055	50 %	25 %	0 %	25 %	350273108
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