MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 13988

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016050	ATT	2	6	13	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273054
2	NC_016050	GCA	2	6	58	63	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273054
3	NC_016050	TAT	2	6	182	187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273054
4	NC_016050	ATT	2	6	274	279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273054
5	NC_016050	ATG	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273054
6	NC_016050	GTA	2	6	574	579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273054
7	NC_016050	TTA	2	6	587	592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273054
8	NC_016050	CAG	2	6	767	772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273054
9	NC_016050	TAA	2	6	776	781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273054
10	NC_016050	ATA	2	6	812	817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273054
11	NC_016050	ATA	2	6	1042	1047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273055
12	NC_016050	TGA	2	6	1101	1106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273055
13	NC_016050	GTA	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273055
14	NC_016050	CAA	2	6	1201	1206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273055
15	NC_016050	TAA	2	6	1230	1235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273055
16	NC_016050	TCT	2	6	1350	1355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273056
17	NC_016050	ATA	3	9	1614	1622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273056
18	NC_016050	TGG	2	6	1678	1683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	350273056
19	NC_016050	TGA	2	6	1780	1785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273056
20	NC_016050	GAA	2	6	1837	1842	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273056
21	NC_016050	AAT	2	6	1867	1872	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273056
22	NC_016050	AAG	2	6	1884	1889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273056
23	NC_016050	TTA	2	6	1922	1927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273056
24	NC_016050	CAA	3	9	1985	1993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273056
25	NC_016050	CGG	2	6	2206	2211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350273057
26	NC_016050	AGC	2	6	2237	2242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273057
27	NC_016050	ATA	2	6	2282	2287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273057
28	NC_016050	ATA	2	6	2420	2425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273057
29	NC_016050	TAA	2	6	2451	2456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273057
30	NC_016050	ATG	2	6	2681	2686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273057
31	NC_016050	TAT	2	6	2701	2706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273057
32	NC_016050	TTA	2	6	2715	2720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273057
33	NC_016050	CTC	2	6	2912	2917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	350273058
34	NC_016050	ATT	2	6	2923	2928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
35	NC_016050	ATT	2	6	2936	2941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
36	NC_016050	ATT	2	6	3049	3054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
37	NC_016050	AGA	2	6	3222	3227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
38	NC_016050	AGA	2	6	3237	3242	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
39	NC_016050	AGC	2	6	3252	3257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273058
40	NC_016050	TGC	2	6	3264	3269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273058
41	NC_016050	ATT	2	6	3455	3460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
42	NC_016050	TAT	2	6	3624	3629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
43	NC_016050	GCA	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273058
44	NC_016050	AGA	2	6	3750	3755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
45	NC_016050	CTA	2	6	3845	3850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273058
46	NC_016050	TAT	2	6	3901	3906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
47	NC_016050	TTA	2	6	3907	3912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
48	NC_016050	TGT	2	6	3927	3932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273058
49	NC_016050	ATA	2	6	4121	4126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
50	NC_016050	GGC	2	6	4372	4377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	350273058
51	NC_016050	GCA	2	6	4396	4401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273058
52	NC_016050	GGA	2	6	4473	4478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350273058
53	NC_016050	GAA	2	6	4495	4500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
54	NC_016050	AAG	2	6	4526	4531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
55	NC_016050	AAT	2	6	4537	4542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
56	NC_016050	GAA	2	6	4543	4548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
57	NC_016050	TAA	2	6	4563	4568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
58	NC_016050	CTA	2	6	4587	4592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273058
59	NC_016050	AGT	2	6	4948	4953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273058
60	NC_016050	AAG	2	6	4979	4984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
61	NC_016050	ATA	2	6	5015	5020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
62	NC_016050	ATT	2	6	5066	5071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
63	NC_016050	TAA	2	6	5088	5093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
64	NC_016050	GAT	2	6	5107	5112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273058
65	NC_016050	TGC	2	6	5145	5150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273058
66	NC_016050	ATT	2	6	5189	5194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
67	NC_016050	TGC	2	6	5202	5207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273058
68	NC_016050	CTA	2	6	5297	5302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273058
69	NC_016050	AGT	2	6	5334	5339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273058
70	NC_016050	CGC	2	6	5360	5365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350273058
71	NC_016050	TTG	2	6	5396	5401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273058
72	NC_016050	TTA	2	6	5425	5430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273058
73	NC_016050	ATA	2	6	5447	5452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
74	NC_016050	TAA	2	6	5516	5521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
75	NC_016050	ATA	2	6	5539	5544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
76	NC_016050	GAA	2	6	5545	5550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273058
77	NC_016050	ATA	2	6	5593	5598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273058
78	NC_016050	ATG	2	6	5626	5631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273058
79	NC_016050	GTT	2	6	5833	5838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273059
80	NC_016050	CTT	2	6	5876	5881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273059
81	NC_016050	ATA	2	6	5903	5908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273059
82	NC_016050	CAA	2	6	5947	5952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273059
83	NC_016050	GTT	2	6	5984	5989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273059
84	NC_016050	GAT	2	6	6012	6017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273059
85	NC_016050	AAC	2	6	6037	6042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273059
86	NC_016050	CAA	2	6	6087	6092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273059
87	NC_016050	TAT	2	6	6112	6117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273059
88	NC_016050	CTA	3	9	6450	6458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273060
89	NC_016050	ATT	2	6	6497	6502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273060
90	NC_016050	TTC	2	6	6563	6568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273060
91	NC_016050	ATC	2	6	6714	6719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273060
92	NC_016050	CCG	2	6	6762	6767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350273060
93	NC_016050	ATT	2	6	6768	6773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273060
94	NC_016050	TAC	2	6	6824	6829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273060
95	NC_016050	ATT	2	6	6830	6835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273060
96	NC_016050	ATT	3	9	6881	6889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273060
97	NC_016050	TCA	2	6	6901	6906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273060
98	NC_016050	CCA	2	6	6909	6914	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	350273060
99	NC_016050	TAT	2	6	6955	6960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273060
100	NC_016050	TAC	2	6	7079	7084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273060
101	NC_016050	GCA	2	6	7111	7116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273060
102	NC_016050	GTA	2	6	7194	7199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273060
103	NC_016050	CTT	2	6	7412	7417	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273061
104	NC_016050	TAG	2	6	7424	7429	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273061
105	NC_016050	AGC	2	6	7455	7460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273061
106	NC_016050	CTA	2	6	7601	7606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273061
107	NC_016050	ATA	3	9	7897	7905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273062
108	NC_016050	ATA	2	6	7924	7929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273062
109	NC_016050	GCC	2	6	7944	7949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	350273062
110	NC_016050	TGC	2	6	8075	8080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273062
111	NC_016050	ATA	2	6	8107	8112	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273062
112	NC_016050	TAG	2	6	8210	8215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273062
113	NC_016050	ATT	2	6	8235	8240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273062
114	NC_016050	ACG	2	6	8341	8346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273062
115	NC_016050	TGT	2	6	8380	8385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	350273062
116	NC_016050	TAT	2	6	8450	8455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273062
117	NC_016050	TAA	2	6	8462	8467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273062
118	NC_016050	CAA	2	6	8531	8536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	350273062
119	NC_016050	ATT	2	6	8548	8553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	350273062
120	NC_016050	TAA	2	6	8631	8636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	350273062
121	NC_016050	AGC	3	9	8685	8693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273062
122	NC_016050	AGG	2	6	8808	8813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	350273062
123	NC_016050	TAC	2	6	8882	8887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273062
124	NC_016050	TTC	2	6	12973	12978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	350273063
125	NC_016050	AGA	2	6	13025	13030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	350273063
126	NC_016050	TGA	3	9	13135	13143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273063
127	NC_016050	GCT	2	6	13196	13201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	350273063
128	NC_016050	GTA	2	6	13265	13270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273063
129	NC_016050	AGC	2	6	13305	13310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	350273063
130	NC_016050	GAT	2	6	13385	13390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273063
131	NC_016050	GAT	2	6	13444	13449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	350273063
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260	NC_016050	TAC	2	6	26005	26010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	350273067
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