MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Rickettsia japonica YH

Total Repeats: 2932

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016050	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	350273054
2	NC_016050	AT	3	6	893	898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016050	TC	3	6	1368	1373	0 %	50 %	0 %	50 %	350273056
4	NC_016050	AT	3	6	1493	1498	50 %	50 %	0 %	0 %	350273056
5	NC_016050	TA	3	6	1611	1616	50 %	50 %	0 %	0 %	350273056
6	NC_016050	GA	3	6	2179	2184	50 %	0 %	50 %	0 %	350273057
7	NC_016050	TA	3	6	2343	2348	50 %	50 %	0 %	0 %	350273057
8	NC_016050	TG	3	6	2459	2464	0 %	50 %	50 %	0 %	350273057
9	NC_016050	AT	3	6	2603	2608	50 %	50 %	0 %	0 %	350273057
10	NC_016050	TC	3	6	2916	2921	0 %	50 %	0 %	50 %	350273058
11	NC_016050	TG	3	6	3284	3289	0 %	50 %	50 %	0 %	350273058
12	NC_016050	GA	3	6	3391	3396	50 %	0 %	50 %	0 %	350273058
13	NC_016050	AT	3	6	3784	3789	50 %	50 %	0 %	0 %	350273058
14	NC_016050	AT	3	6	4094	4099	50 %	50 %	0 %	0 %	350273058
15	NC_016050	AG	3	6	4113	4118	50 %	0 %	50 %	0 %	350273058
16	NC_016050	TA	3	6	4201	4206	50 %	50 %	0 %	0 %	350273058
17	NC_016050	TA	3	6	4453	4458	50 %	50 %	0 %	0 %	350273058
18	NC_016050	AT	3	6	4645	4650	50 %	50 %	0 %	0 %	350273058
19	NC_016050	AT	3	6	5679	5684	50 %	50 %	0 %	0 %	350273058
20	NC_016050	TA	3	6	6021	6026	50 %	50 %	0 %	0 %	350273059
21	NC_016050	AT	3	6	6249	6254	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016050	TA	3	6	8496	8501	50 %	50 %	0 %	0 %	350273062
23	NC_016050	TA	3	6	8927	8932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016050	AT	3	6	9261	9266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016050	GT	3	6	9760	9765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016050	TA	3	6	9861	9866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016050	AT	3	6	11661	11666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016050	TG	3	6	12361	12366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016050	AC	3	6	12371	12376	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016050	TA	3	6	12408	12413	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016050	TA	3	6	12669	12674	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016050	TA	3	6	14250	14255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016050	AG	3	6	15021	15026	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016050	AT	3	6	15434	15439	50 %	50 %	0 %	0 %	350273064
35	NC_016050	AT	3	6	15848	15853	50 %	50 %	0 %	0 %	350273065
36	NC_016050	TA	3	6	15876	15881	50 %	50 %	0 %	0 %	350273065
37	NC_016050	AT	3	6	17349	17354	50 %	50 %	0 %	0 %	350273066
38	NC_016050	TG	3	6	17888	17893	0 %	50 %	50 %	0 %	350273066
39	NC_016050	TG	3	6	18017	18022	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016050	AT	3	6	19090	19095	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016050	TA	3	6	19726	19731	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016050	AT	3	6	19963	19968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016050	TA	3	6	20082	20087	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016050	TA	3	6	20130	20135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016050	TA	3	6	22101	22106	50 %	50 %	0 %	0 %	350273067
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48	NC_016050	TA	3	6	23190	23195	50 %	50 %	0 %	0 %	350273067
49	NC_016050	GA	3	6	23236	23241	50 %	0 %	50 %	0 %	350273067
50	NC_016050	AT	3	6	23264	23269	50 %	50 %	0 %	0 %	350273067
51	NC_016050	GA	3	6	23359	23364	50 %	0 %	50 %	0 %	350273067
52	NC_016050	AT	3	6	23387	23392	50 %	50 %	0 %	0 %	350273067
53	NC_016050	GA	3	6	23482	23487	50 %	0 %	50 %	0 %	350273067
54	NC_016050	AT	3	6	23510	23515	50 %	50 %	0 %	0 %	350273067
55	NC_016050	TA	3	6	23629	23634	50 %	50 %	0 %	0 %	350273067
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57	NC_016050	TA	3	6	24425	24430	50 %	50 %	0 %	0 %	350273067
58	NC_016050	TA	3	6	24524	24529	50 %	50 %	0 %	0 %	350273067
59	NC_016050	TA	3	6	25710	25715	50 %	50 %	0 %	0 %	350273067
60	NC_016050	AT	3	6	25767	25772	50 %	50 %	0 %	0 %	350273067
61	NC_016050	TA	3	6	26123	26128	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016050	AT	3	6	26177	26182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016050	GT	3	6	26535	26540	0 %	50 %	50 %	0 %	350273068
64	NC_016050	AT	3	6	27403	27408	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016050	TA	3	6	27462	27467	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016050	AG	3	6	27825	27830	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016050	AT	3	6	28295	28300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016050	AT	3	6	28874	28879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016050	AT	4	8	29200	29207	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016050	GT	3	6	29863	29868	0 %	50 %	50 %	0 %	350273069
71	NC_016050	AG	3	6	30666	30671	50 %	0 %	50 %	0 %	350273071
72	NC_016050	AT	3	6	30676	30681	50 %	50 %	0 %	0 %	350273071
73	NC_016050	AT	3	6	32486	32491	50 %	50 %	0 %	0 %	350273074
74	NC_016050	AT	3	6	33299	33304	50 %	50 %	0 %	0 %	350273075
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77	NC_016050	AT	3	6	35485	35490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016050	TA	3	6	35492	35497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016050	TC	3	6	36317	36322	0 %	50 %	0 %	50 %	350273077
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81	NC_016050	AT	3	6	38290	38295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016050	AG	3	6	38737	38742	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016050	AT	3	6	39377	39382	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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85	NC_016050	AT	3	6	40820	40825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016050	TA	3	6	41027	41032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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88	NC_016050	AT	3	6	41297	41302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016050	AT	3	6	41341	41346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016050	TA	4	8	41404	41411	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016050	TA	3	6	41851	41856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016050	AT	3	6	41917	41922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016050	AT	3	6	42197	42202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016050	AT	3	6	43086	43091	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016050	AT	3	6	44092	44097	50 %	50 %	0 %	0 %	350273081
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99	NC_016050	AT	3	6	44530	44535	50 %	50 %	0 %	0 %	350273082
100	NC_016050	AT	3	6	44554	44559	50 %	50 %	0 %	0 %	350273082
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102	NC_016050	AT	4	8	45042	45049	50 %	50 %	0 %	0 %	350273082
103	NC_016050	AG	3	6	47150	47155	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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107	NC_016050	AT	3	6	49027	49032	50 %	50 %	0 %	0 %	350273083
108	NC_016050	TA	4	8	49100	49107	50 %	50 %	0 %	0 %	350273083
109	NC_016050	AT	3	6	49983	49988	50 %	50 %	0 %	0 %	350273083
110	NC_016050	CT	3	6	50275	50280	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016050	TA	3	6	50661	50666	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016050	AT	3	6	50738	50743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016050	TC	3	6	51207	51212	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016050	AT	5	10	51301	51310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016050	TA	3	6	51399	51404	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016050	AT	3	6	51551	51556	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016050	CA	3	6	52412	52417	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016050	AT	3	6	52517	52522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016050	AT	3	6	54028	54033	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016050	AT	3	6	54075	54080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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123	NC_016050	AT	3	6	57168	57173	50 %	50 %	0 %	0 %	350273086
124	NC_016050	AT	3	6	57392	57397	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016050	AT	3	6	59935	59940	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016050	CT	3	6	60114	60119	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016050	CT	4	8	60577	60584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016050	TA	3	6	60852	60857	50 %	50 %	0 %	0 %	350273089
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130	NC_016050	TA	3	6	62854	62859	50 %	50 %	0 %	0 %	350273092
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134	NC_016050	TA	3	6	66316	66321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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136	NC_016050	TA	3	6	66597	66602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016050	AT	4	8	66893	66900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_016050	AT	4	8	71992	71999	50 %	50 %	0 %	0 %	350273097
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