MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus subtilis subsp. spizizenii TU-B-10 chromosome

Total Repeats: 146

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016047	TTTCCC	2	12	3137	3148	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016047	ATAAAT	2	12	45609	45620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016047	GCTGAA	2	12	54742	54753	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016047	GAAACA	2	12	83199	83210	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016047	AGTTGA	2	12	131028	131039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016047	TGCTGT	2	12	131064	131075	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016047	TTTGAA	2	12	180355	180366	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016047	ACAAAC	2	12	187955	187966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016047	TTTGAA	2	12	240832	240843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016047	ACAAAC	2	12	248432	248443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016047	AATGAG	2	12	326626	326637	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016047	TAAAAA	2	12	332537	332548	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016047	CAGGAT	2	12	349642	349653	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016047	TGTGAT	2	12	349660	349671	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016047	TTGAAG	2	12	352990	353001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016047	TTTATT	2	12	362552	362563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016047	GTTTTT	2	12	397791	397802	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016047	TTCATT	2	12	451043	451054	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016047	ATTTTT	2	12	492150	492161	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016047	CAGCGG	2	12	493712	493723	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016047	TTGATT	2	12	493780	493791	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016047	CATCAG	2	12	498860	498871	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016047	ATGATA	2	12	548656	548667	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016047	AGAGAC	2	12	565462	565473	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016047	TTTTTA	2	12	565946	565957	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016047	TCCTTT	2	12	609147	609158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016047	AAAGCA	2	12	633136	633147	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016047	ATTTTT	2	12	644510	644521	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016047	TTATAA	2	12	649113	649124	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016047	TTCTAG	2	12	669467	669478	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016047	ATTTTG	2	12	709432	709443	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016047	ATTTTT	2	12	709918	709929	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016047	TTCAAA	2	12	732617	732628	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016047	ATCCTC	2	12	752226	752237	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016047	CTTACA	2	12	783643	783654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016047	CGTGAT	2	12	803463	803474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016047	ATTTTG	2	12	816108	816119	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016047	CTTTCT	2	12	825650	825661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016047	AGGAAA	2	12	843618	843629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016047	ACATAT	2	12	901002	901013	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016047	TACTTT	2	12	966573	966584	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016047	GGACGG	2	12	991941	991952	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016047	GAACAA	2	12	1055289	1055300	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016047	GTGTTT	2	12	1064535	1064546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016047	CTTTTT	2	12	1065752	1065763	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016047	TAAAAA	2	12	1134001	1134012	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016047	TCTTTT	2	12	1186816	1186827	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016047	CGGAAG	2	12	1187702	1187713	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016047	TAGAAA	2	12	1206865	1206876	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016047	GAATTT	2	12	1216103	1216114	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016047	ATCTTA	2	12	1220857	1220868	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016047	CTTTTT	2	12	1227147	1227158	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016047	TTTTAT	2	12	1239105	1239116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016047	AGCATG	2	12	1286496	1286507	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016047	TTTCTC	2	12	1295630	1295641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016047	CGTCAC	2	12	1303312	1303323	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016047	ATTAAA	2	12	1337457	1337468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016047	ATGGGA	2	12	1375329	1375340	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016047	GTATCC	2	12	1385602	1385613	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016047	GAAAAG	2	12	1394335	1394346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016047	ATGGAC	2	12	1483323	1483334	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016047	CATGAC	2	12	1501498	1501509	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016047	TCTTTT	2	12	1550663	1550674	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016047	ATAATT	2	12	1557916	1557927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016047	AAAGGA	2	12	1568449	1568460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016047	ATCATT	2	12	1586935	1586946	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_016047	GCATTG	2	12	1598825	1598836	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016047	CTTTTT	2	12	1774737	1774748	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016047	AACAAA	2	12	1837791	1837802	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016047	ACATCA	2	12	1839139	1839150	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016047	TCCTTC	2	12	1845165	1845176	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016047	AACATG	2	12	1887511	1887522	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016047	CAAAAT	2	12	1985395	1985406	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016047	TTTCAT	2	12	1996650	1996661	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016047	TTTTAA	2	12	2036377	2036388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016047	AATTTC	2	12	2045724	2045735	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016047	TAAATT	2	12	2068156	2068167	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016047	AAGAGA	2	12	2102765	2102776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016047	ATCATT	2	12	2139131	2139142	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016047	TTATTT	2	12	2139287	2139298	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016047	ATTGGA	2	12	2142975	2142986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016047	CTCTCC	2	12	2148065	2148076	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_016047	CTCTTT	2	12	2160177	2160188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016047	AATCTA	2	12	2227449	2227460	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016047	CCTTAT	2	12	2249413	2249424	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016047	TTATGT	2	12	2272985	2272996	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016047	ATTTTC	2	12	2286820	2286831	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016047	ATTTTA	2	12	2355413	2355424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016047	TTCATC	2	12	2399561	2399572	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016047	TTTCGA	2	12	2410567	2410578	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_016047	TGCGAT	2	12	2411428	2411439	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016047	ATTTTG	2	12	2411543	2411554	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016047	GGTTGA	2	12	2495453	2495464	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016047	GAAAAT	2	12	2525512	2525523	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016047	TTTAAA	2	12	2568938	2568949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016047	TAAATT	2	12	2568979	2568990	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016047	TTCTAA	2	12	2580944	2580955	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016047	TGACTT	2	12	2607040	2607051	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_016047	ACAGAC	2	12	2634010	2634021	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016047	ATGAAA	2	12	2641971	2641982	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016047	GAATAA	2	12	2647601	2647612	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016047	TTACAT	2	12	2654273	2654284	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_016047	ATTACT	2	12	2665347	2665358	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_016047	ATTAAA	2	12	2666968	2666979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016047	GATTTT	2	12	2760460	2760471	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016047	GTTCAC	2	12	2763726	2763737	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016047	CCCTCT	2	12	2854055	2854066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_016047	GCTTTT	2	12	2900643	2900654	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_016047	TCATCC	2	12	2901613	2901624	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016047	CTCTTT	2	12	2903798	2903809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016047	TTTAAG	2	12	2930583	2930594	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016047	TATTCA	2	12	2931229	2931240	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_016047	CTTATC	2	12	2982195	2982206	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016047	GATTGT	2	12	3014042	3014053	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016047	ATCAGG	2	12	3135190	3135201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016047	TTGTTT	2	12	3145200	3145211	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016047	ATTGAA	2	12	3151527	3151538	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016047	AAAAAG	2	12	3165444	3165455	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016047	GAGAAA	2	12	3188536	3188547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016047	GCAAAA	2	12	3216036	3216047	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016047	ATCAAG	2	12	3216150	3216161	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_016047	TACACC	2	12	3250454	3250465	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016047	GCCTCC	2	12	3269357	3269368	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_016047	CTTTAA	2	12	3280905	3280916	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_016047	CTATCA	2	12	3301100	3301111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016047	GAAAAA	2	12	3308274	3308285	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.