MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Glaciecola nitratireducens FR1064 chromosome

Total Repeats: 130

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016041	CCCAAG	2	12	18793	18804	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016041	TTAATT	2	12	31023	31034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016041	TGAAAT	2	12	38078	38089	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016041	TACTCT	2	12	54284	54295	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016041	AAAGCG	2	12	61543	61554	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016041	GAAAAA	2	12	75275	75286	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016041	AAATAA	2	12	172130	172141	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016041	AATGAC	2	12	207721	207732	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016041	TTCAAG	2	12	207762	207773	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016041	TTGTTT	2	12	216125	216136	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016041	AACTGA	2	12	302775	302786	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016041	TACAAT	2	12	453609	453620	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016041	ATGAAA	2	12	499844	499855	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016041	TCAGCA	3	18	512718	512735	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016041	TTTCAT	2	12	660080	660091	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016041	AAATTA	2	12	667484	667495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016041	GTTCAA	2	12	679032	679043	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016041	TAAGCA	2	12	730514	730525	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016041	TGAAAT	2	12	739270	739281	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016041	TTATAT	2	12	819277	819288	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016041	CTAAGT	2	12	886701	886712	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016041	TGAAAT	2	12	906289	906300	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016041	TTAAAA	2	12	922749	922760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016041	CAAAAA	2	12	953199	953210	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016041	AAACAA	2	12	955272	955283	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016041	AAATAT	2	12	1021749	1021760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016041	CTATGT	2	12	1027598	1027609	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016041	ATTCTG	2	12	1039092	1039103	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016041	GCACCG	2	12	1072862	1072873	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016041	TTTGGC	2	12	1126660	1126671	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016041	TATTTT	2	12	1171261	1171272	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016041	TGAAAT	2	12	1233513	1233524	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016041	CTTTAG	2	12	1237186	1237197	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016041	TTTAAA	2	12	1247264	1247275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016041	CTTTTA	2	12	1259516	1259527	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016041	TTTTTG	2	12	1259694	1259705	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016041	ATTACT	2	12	1270782	1270793	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016041	GGTCAA	2	12	1323276	1323287	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016041	TAAAGT	2	12	1363475	1363486	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016041	CAAAAT	2	12	1364666	1364677	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016041	ATTATA	2	12	1385261	1385272	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016041	TGATTT	5	30	1417730	1417759	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016041	TGAGTG	2	12	1456144	1456155	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016041	TAGTTT	2	12	1458883	1458894	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016041	TAAAAA	2	12	1585749	1585760	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016041	GCTTAA	2	12	1629400	1629411	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016041	TTCAGC	2	12	1684235	1684246	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016041	TAACAA	2	12	1691276	1691287	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016041	CATTGG	2	12	1762984	1762995	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016041	TGAAAA	2	12	1811084	1811095	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016041	AATCGT	2	12	1811731	1811742	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016041	CTTATG	2	12	1865374	1865385	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016041	GTAAAG	2	12	1881214	1881225	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016041	GTGTTT	2	12	1893697	1893708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016041	AAAATA	2	12	1973531	1973542	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016041	TACTTT	2	12	1987125	1987136	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_016041	TAGCGA	2	12	2039326	2039337	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016041	ATAAAA	2	12	2043506	2043517	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016041	GGTATA	2	12	2049786	2049797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016041	AATATT	2	12	2052289	2052300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016041	TTTATT	2	12	2083058	2083069	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016041	TGCATT	2	12	2161444	2161455	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016041	TTTTGA	2	12	2164656	2164667	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016041	AAACTC	2	12	2171124	2171135	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016041	AATTTG	2	12	2172006	2172017	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016041	ACTAAA	2	12	2177130	2177141	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_016041	ACGTAA	2	12	2199974	2199985	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016041	TTATTG	2	12	2220650	2220661	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016041	ATGCTT	2	12	2292744	2292755	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016041	TTTAAT	2	12	2325641	2325652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016041	ATTTAT	2	12	2365660	2365671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016041	CAAATG	2	12	2385358	2385369	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016041	TGCAAA	2	12	2385844	2385855	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016041	ATGGGG	2	12	2397790	2397801	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016041	CATTAA	2	12	2405368	2405379	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_016041	GGGGAG	2	12	2486921	2486932	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016041	GGGGAG	2	12	2487020	2487031	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016041	ATTATA	2	12	2546120	2546131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016041	TTTTCT	2	12	2553161	2553172	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016041	GCGTTG	2	12	2570242	2570253	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016041	AATTAA	2	12	2583771	2583782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016041	TTTTTA	2	12	2613977	2613988	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016041	TATTTA	2	12	2683217	2683228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016041	TGTTAA	2	12	2717743	2717754	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016041	GACCAT	2	12	2735019	2735030	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016041	GAATAA	2	12	2805520	2805531	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016041	TTTATG	2	12	2888335	2888346	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016041	ACGCTA	2	12	2897726	2897737	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016041	GCACTA	2	12	2914609	2914620	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016041	TTATAT	2	12	2922165	2922176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016041	AATTTA	2	12	2926130	2926141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016041	GCAAAG	2	12	2932260	2932271	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016041	AACTTA	2	12	2940078	2940089	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016041	ACTATT	2	12	2944589	2944600	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_016041	TAATTT	2	12	2952161	2952172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016041	CAAAAA	2	12	3002288	3002299	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016041	GAGAAG	2	12	3043431	3043442	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016041	TAAAAA	2	12	3074027	3074038	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016041	AATATT	2	12	3152523	3152534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016041	TTCTAT	2	12	3185023	3185034	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016041	ATTTAT	2	12	3256179	3256190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016041	GCAAAG	2	12	3264905	3264916	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_016041	CGTTAT	2	12	3297226	3297237	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_016041	AAATTA	2	12	3330313	3330324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016041	GTAAAT	2	12	3333450	3333461	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016041	TTAAGT	2	12	3355393	3355404	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016041	TTAAAA	2	12	3375233	3375244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016041	GTTTGA	6	36	3433395	3433430	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016041	TAAGCT	2	12	3472652	3472663	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_016041	CATTTT	2	12	3493037	3493048	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_016041	GTTGTG	2	12	3532087	3532098	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016041	AGATTA	2	12	3561128	3561139	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016041	GCCATT	2	12	3579603	3579614	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016041	TTATCT	2	12	3611584	3611595	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_016041	GATTGA	2	12	3657140	3657151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016041	AATTTA	2	12	3664538	3664549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016041	CTTATA	2	12	3690074	3690085	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_016041	TATGCT	2	12	3719679	3719690	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_016041	ATCAAA	2	12	3732424	3732435	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_016041	ACTGAA	2	12	3737055	3737066	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016041	CTGTTA	2	12	3802746	3802757	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_016041	CATTCA	2	12	3826572	3826583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016041	TAGCAT	2	12	3951088	3951099	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016041	GGTTTA	2	12	3951369	3951380	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016041	GTTATT	2	12	4016314	4016325	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016041	TTTGTT	2	12	4038372	4038383	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016041	ATCATT	2	12	4040951	4040962	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_016041	TATGTA	2	12	4085591	4085602	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016041	ACTTTG	2	12	4101143	4101154	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_016041	TTTATG	2	12	4101193	4101204	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.