MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY010

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016037	AACCC	2	10	18575	18584	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_016037	CAGGG	2	10	36784	36793	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016037	TAGTA	2	10	40575	40584	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016037	ATATA	2	10	63811	63820	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016037	ACTCT	2	10	79708	79717	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016037	TGTCC	2	10	109856	109865	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016037	ATATT	2	10	111131	111140	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016037	CATTC	2	10	111236	111245	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_016037	GCCAT	2	10	113326	113335	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016037	AATTA	2	10	113664	113673	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016037	CCGTC	2	10	119237	119246	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_016037	CAGGA	2	10	126955	126964	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016037	TCCGA	2	10	134710	134719	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016037	ACACC	2	10	145434	145443	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_016037	CCCTT	2	10	155256	155265	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
16	NC_016037	TTATA	2	10	156183	156192	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016037	CCACG	2	10	189810	189819	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_016037	TATTT	2	10	199090	199099	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016037	AATGA	2	10	222309	222318	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016037	CGTAT	2	10	236631	236640	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016037	TGGAC	2	10	250005	250014	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.