MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY010

Total Repeats: 148

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016037	CAAAA	2	10	1037	1046	80 %	0 %	0 %	20 %	347822694
2	NC_016037	TGGGT	2	10	2570	2579	0 %	40 %	60 %	0 %	347822695
3	NC_016037	GGCGA	2	10	4342	4351	20 %	0 %	60 %	20 %	347822696
4	NC_016037	GATGT	2	10	5161	5170	20 %	40 %	40 %	0 %	347822696
5	NC_016037	GAACG	2	10	6230	6239	40 %	0 %	40 %	20 %	347822696
6	NC_016037	GGCGC	2	10	9799	9808	0 %	0 %	60 %	40 %	347822697
7	NC_016037	GCGCC	2	10	10788	10797	0 %	0 %	40 %	60 %	347822697
8	NC_016037	CTCGC	2	10	10891	10900	0 %	20 %	20 %	60 %	347822697
9	NC_016037	GCCGG	2	10	13276	13285	0 %	0 %	60 %	40 %	347822700
10	NC_016037	ACGCA	2	10	14431	14440	40 %	0 %	20 %	40 %	347822701
11	NC_016037	GCACG	2	10	22907	22916	20 %	0 %	40 %	40 %	347822711
12	NC_016037	CTGTC	2	10	23342	23351	0 %	40 %	20 %	40 %	347822712
13	NC_016037	GCATG	2	10	23650	23659	20 %	20 %	40 %	20 %	347822713
14	NC_016037	GCTTG	2	10	25522	25531	0 %	40 %	40 %	20 %	347822713
15	NC_016037	CTTTT	2	10	25635	25644	0 %	80 %	0 %	20 %	347822714
16	NC_016037	TGGCA	2	10	26107	26116	20 %	20 %	40 %	20 %	347822715
17	NC_016037	CGGGG	2	10	26361	26370	0 %	0 %	80 %	20 %	347822715
18	NC_016037	CGCCC	2	10	29350	29359	0 %	0 %	20 %	80 %	347822719
19	NC_016037	TGCCG	2	10	31542	31551	0 %	20 %	40 %	40 %	347822722
20	NC_016037	TGGCT	2	10	32260	32269	0 %	40 %	40 %	20 %	347822723
21	NC_016037	ATGCC	2	10	33477	33486	20 %	20 %	20 %	40 %	347822724
22	NC_016037	GGCAC	2	10	39318	39327	20 %	0 %	40 %	40 %	347822730
23	NC_016037	GGACT	2	10	41906	41915	20 %	20 %	40 %	20 %	347822732
24	NC_016037	CGGCC	2	10	45546	45555	0 %	0 %	40 %	60 %	347822737
25	NC_016037	CAGGC	2	10	46600	46609	20 %	0 %	40 %	40 %	347822738
26	NC_016037	GGGTG	2	10	46800	46809	0 %	20 %	80 %	0 %	347822738
27	NC_016037	AAAAT	2	10	49491	49500	80 %	20 %	0 %	0 %	347822740
28	NC_016037	GTTGC	2	10	51098	51107	0 %	40 %	40 %	20 %	347822741
29	NC_016037	CTTGC	2	10	51225	51234	0 %	40 %	20 %	40 %	347822741
30	NC_016037	TTGAG	2	10	51339	51348	20 %	40 %	40 %	0 %	347822741
31	NC_016037	GACCA	2	10	52837	52846	40 %	0 %	20 %	40 %	347822743
32	NC_016037	CGATC	2	10	55390	55399	20 %	20 %	20 %	40 %	347822746
33	NC_016037	GCCAG	2	10	64492	64501	20 %	0 %	40 %	40 %	347822756
34	NC_016037	ATGGA	2	10	65926	65935	40 %	20 %	40 %	0 %	347822759
35	NC_016037	GGGCA	2	10	66293	66302	20 %	0 %	60 %	20 %	347822760
36	NC_016037	CGGAA	2	10	68528	68537	40 %	0 %	40 %	20 %	347822762
37	NC_016037	CAGGG	2	10	70986	70995	20 %	0 %	60 %	20 %	347822763
38	NC_016037	TTTCG	2	10	71430	71439	0 %	60 %	20 %	20 %	347822763
39	NC_016037	ATGGC	2	10	72004	72013	20 %	20 %	40 %	20 %	347822763
40	NC_016037	TGTCA	2	10	72257	72266	20 %	40 %	20 %	20 %	347822764
41	NC_016037	CCATG	2	10	72776	72785	20 %	20 %	20 %	40 %	347822764
42	NC_016037	GAGGG	2	10	76602	76611	20 %	0 %	80 %	0 %	347822769
43	NC_016037	CGGAA	2	10	76673	76682	40 %	0 %	40 %	20 %	347822769
44	NC_016037	GATCT	2	10	77824	77833	20 %	40 %	20 %	20 %	347822770
45	NC_016037	GAATG	2	10	78870	78879	40 %	20 %	40 %	0 %	347822771
46	NC_016037	GTCGC	2	10	82635	82644	0 %	20 %	40 %	40 %	347822775
47	NC_016037	GCTCT	2	10	84021	84030	0 %	40 %	20 %	40 %	347822777
48	NC_016037	AGGGA	2	10	85793	85802	40 %	0 %	60 %	0 %	347822778
49	NC_016037	GCGTC	2	10	87044	87053	0 %	20 %	40 %	40 %	347822779
50	NC_016037	TTCAT	2	10	88163	88172	20 %	60 %	0 %	20 %	347822779
51	NC_016037	TGTCC	2	10	90417	90426	0 %	40 %	20 %	40 %	347822783
52	NC_016037	GCTTC	2	10	91033	91042	0 %	40 %	20 %	40 %	347822784
53	NC_016037	AAAGG	2	10	93740	93749	60 %	0 %	40 %	0 %	347822787
54	NC_016037	ACGCC	2	10	94392	94401	20 %	0 %	20 %	60 %	347822788
55	NC_016037	GCGTG	2	10	95280	95289	0 %	20 %	60 %	20 %	347822789
56	NC_016037	GGGCA	2	10	95893	95902	20 %	0 %	60 %	20 %	347822790
57	NC_016037	GGCGC	2	10	96558	96567	0 %	0 %	60 %	40 %	347822790
58	NC_016037	TCTCG	2	10	98119	98128	0 %	40 %	20 %	40 %	347822792
59	NC_016037	GGCGG	2	10	98516	98525	0 %	0 %	80 %	20 %	347822792
60	NC_016037	CAACG	2	10	98866	98875	40 %	0 %	20 %	40 %	347822792
61	NC_016037	TGGCG	2	10	100750	100759	0 %	20 %	60 %	20 %	347822792
62	NC_016037	GGGCA	2	10	102672	102681	20 %	0 %	60 %	20 %	347822794
63	NC_016037	GCCGT	2	10	105608	105617	0 %	20 %	40 %	40 %	347822797
64	NC_016037	GGTCA	2	10	106721	106730	20 %	20 %	40 %	20 %	347822799
65	NC_016037	CTGGG	2	10	115155	115164	0 %	20 %	60 %	20 %	347822807
66	NC_016037	GACCA	2	10	118499	118508	40 %	0 %	20 %	40 %	347822810
67	NC_016037	GGTCG	2	10	119739	119748	0 %	20 %	60 %	20 %	347822811
68	NC_016037	CAGGC	2	10	123287	123296	20 %	0 %	40 %	40 %	347822817
69	NC_016037	CCGCC	2	10	126404	126413	0 %	0 %	20 %	80 %	347822820
70	NC_016037	GGCAG	2	10	127085	127094	20 %	0 %	60 %	20 %	347822821
71	NC_016037	CGCGC	2	10	127166	127175	0 %	0 %	40 %	60 %	347822821
72	NC_016037	GCCGG	2	10	127609	127618	0 %	0 %	60 %	40 %	347822821
73	NC_016037	CGTAC	2	10	139070	139079	20 %	20 %	20 %	40 %	347822833
74	NC_016037	GGGCC	2	10	140748	140757	0 %	0 %	60 %	40 %	347822835
75	NC_016037	CCCTG	2	10	140852	140861	0 %	20 %	20 %	60 %	347822835
76	NC_016037	GCGCC	2	10	141677	141686	0 %	0 %	40 %	60 %	347822836
77	NC_016037	GGTCC	2	10	141849	141858	0 %	20 %	40 %	40 %	347822836
78	NC_016037	TTCCC	2	10	142582	142591	0 %	40 %	0 %	60 %	347822837
79	NC_016037	CCCGC	2	10	142945	142954	0 %	0 %	20 %	80 %	347822837
80	NC_016037	GGGAT	2	10	143000	143009	20 %	20 %	60 %	0 %	347822837
81	NC_016037	AGGTC	2	10	143498	143507	20 %	20 %	40 %	20 %	347822838
82	NC_016037	GTATC	2	10	144115	144124	20 %	40 %	20 %	20 %	347822838
83	NC_016037	CGTGC	2	10	144222	144231	0 %	20 %	40 %	40 %	347822838
84	NC_016037	GGCCG	2	10	147079	147088	0 %	0 %	60 %	40 %	347822840
85	NC_016037	GGGAT	2	10	147696	147705	20 %	20 %	60 %	0 %	347822840
86	NC_016037	ATCAC	2	10	147957	147966	40 %	20 %	0 %	40 %	347822840
87	NC_016037	CCACG	2	10	150039	150048	20 %	0 %	20 %	60 %	347822843
88	NC_016037	CATCG	2	10	150446	150455	20 %	20 %	20 %	40 %	347822844
89	NC_016037	ATGAC	2	10	150597	150606	40 %	20 %	20 %	20 %	347822844
90	NC_016037	CCCAG	2	10	151932	151941	20 %	0 %	20 %	60 %	347822845
91	NC_016037	GGTCA	2	10	152146	152155	20 %	20 %	40 %	20 %	347822845
92	NC_016037	GGAGT	2	10	153173	153182	20 %	20 %	60 %	0 %	347822845
93	NC_016037	CGAGC	2	10	153290	153299	20 %	0 %	40 %	40 %	347822845
94	NC_016037	CCCTG	2	10	158562	158571	0 %	20 %	20 %	60 %	347822850
95	NC_016037	GGCGC	2	10	159057	159066	0 %	0 %	60 %	40 %	347822850
96	NC_016037	GCCCG	2	10	159203	159212	0 %	0 %	40 %	60 %	347822850
97	NC_016037	ACGCA	2	10	160196	160205	40 %	0 %	20 %	40 %	347822851
98	NC_016037	CCCGG	2	10	162215	162224	0 %	0 %	40 %	60 %	347822851
99	NC_016037	CCGGT	2	10	162578	162587	0 %	20 %	40 %	40 %	347822852
100	NC_016037	TCGGC	2	10	163014	163023	0 %	20 %	40 %	40 %	347822852
101	NC_016037	GCCCA	2	10	163450	163459	20 %	0 %	20 %	60 %	347822852
102	NC_016037	TCCAG	2	10	163781	163790	20 %	20 %	20 %	40 %	347822852
103	NC_016037	AGGAC	28	140	169857	169996	40 %	0 %	40 %	20 %	347822855
104	NC_016037	GGCGC	2	10	171382	171391	0 %	0 %	60 %	40 %	347822856
105	NC_016037	CCGTG	2	10	174941	174950	0 %	20 %	40 %	40 %	347822860
106	NC_016037	TGTCG	2	10	175113	175122	0 %	40 %	40 %	20 %	347822860
107	NC_016037	CCTGG	2	10	176332	176341	0 %	20 %	40 %	40 %	347822861
108	NC_016037	GCAGT	2	10	182711	182720	20 %	20 %	40 %	20 %	347822866
109	NC_016037	AAACG	2	10	184467	184476	60 %	0 %	20 %	20 %	347822866
110	NC_016037	CAGGA	2	10	185059	185068	40 %	0 %	40 %	20 %	347822867
111	NC_016037	GCCGT	2	10	187352	187361	0 %	20 %	40 %	40 %	347822870
112	NC_016037	CTCAA	2	10	191312	191321	40 %	20 %	0 %	40 %	347822873
113	NC_016037	TTCAC	2	10	191963	191972	20 %	40 %	0 %	40 %	347822874
114	NC_016037	CCTCG	2	10	192153	192162	0 %	20 %	20 %	60 %	347822874
115	NC_016037	GCGCC	2	10	192868	192877	0 %	0 %	40 %	60 %	347822875
116	NC_016037	CCTGG	2	10	195338	195347	0 %	20 %	40 %	40 %	347822878
117	NC_016037	GGACC	2	10	195893	195902	20 %	0 %	40 %	40 %	347822878
118	NC_016037	AACGC	2	10	199245	199254	40 %	0 %	20 %	40 %	347822881
119	NC_016037	CGTTT	2	10	200712	200721	0 %	60 %	20 %	20 %	347822882
120	NC_016037	ATGGT	2	10	203850	203859	20 %	40 %	40 %	0 %	347822884
121	NC_016037	CCCTG	2	10	204093	204102	0 %	20 %	20 %	60 %	347822884
122	NC_016037	CGATG	2	10	205249	205258	20 %	20 %	40 %	20 %	347822885
123	NC_016037	CCGGA	2	10	205838	205847	20 %	0 %	40 %	40 %	347822886
124	NC_016037	GCCAT	2	10	207050	207059	20 %	20 %	20 %	40 %	347822887
125	NC_016037	CGGGC	2	10	207275	207284	0 %	0 %	60 %	40 %	347822888
126	NC_016037	GCGCA	2	10	208541	208550	20 %	0 %	40 %	40 %	347822889
127	NC_016037	GACCG	2	10	210480	210489	20 %	0 %	40 %	40 %	347822891
128	NC_016037	GGGCT	2	10	211143	211152	0 %	20 %	60 %	20 %	347822892
129	NC_016037	AGCCA	2	10	214124	214133	40 %	0 %	20 %	40 %	347822895
130	NC_016037	CATGG	2	10	215912	215921	20 %	20 %	40 %	20 %	347822897
131	NC_016037	CCCTG	2	10	216459	216468	0 %	20 %	20 %	60 %	347822898
132	NC_016037	TCTGA	2	10	218234	218243	20 %	40 %	20 %	20 %	347822898
133	NC_016037	AGCCC	2	10	219099	219108	20 %	0 %	20 %	60 %	347822899
134	NC_016037	TGCGG	2	10	221133	221142	0 %	20 %	60 %	20 %	347822901
135	NC_016037	CAGCG	2	10	221272	221281	20 %	0 %	40 %	40 %	347822901
136	NC_016037	ATTGC	2	10	222721	222730	20 %	40 %	20 %	20 %	347822904
137	NC_016037	ATATC	2	10	223500	223509	40 %	40 %	0 %	20 %	347822906
138	NC_016037	AAGAC	2	10	224764	224773	60 %	0 %	20 %	20 %	347822908
139	NC_016037	GGCAC	2	10	227246	227255	20 %	0 %	40 %	40 %	347822910
140	NC_016037	CCGTT	2	10	231301	231310	0 %	40 %	20 %	40 %	347822915
141	NC_016037	GCCGG	2	10	234073	234082	0 %	0 %	60 %	40 %	347822918
142	NC_016037	GCCCG	2	10	243783	243792	0 %	0 %	40 %	60 %	347822930
143	NC_016037	AGCCA	2	10	245097	245106	40 %	0 %	20 %	40 %	347822931
144	NC_016037	AGCCA	2	10	249261	249270	40 %	0 %	20 %	40 %	347822936
145	NC_016037	TTTCA	2	10	250744	250753	20 %	60 %	0 %	20 %	347822938
146	NC_016037	TGAGC	2	10	251193	251202	20 %	20 %	40 %	20 %	347822939
147	NC_016037	ATTTC	2	10	251436	251445	20 %	60 %	0 %	20 %	347822939
148	NC_016037	ACCGC	2	10	252167	252176	20 %	0 %	20 %	60 %	347822940

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.