MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY010

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016037	GTTT	2	8	1944	1951	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016037	GTTT	2	8	2870	2877	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016037	ACCT	2	8	2991	2998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016037	TCTT	2	8	3140	3147	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016037	CACG	2	8	3272	3279	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016037	TTTC	2	8	3325	3332	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016037	TCCC	2	8	3538	3545	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
8	NC_016037	CAGG	2	8	11258	11265	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016037	CCTG	2	8	13437	13444	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016037	ATTG	2	8	13513	13520	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016037	TCTT	2	8	13531	13538	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016037	CATG	2	8	17134	17141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016037	AGGA	2	8	20747	20754	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016037	TGCG	2	8	21577	21584	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016037	GGCG	2	8	23099	23106	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016037	CCAC	2	8	30120	30127	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_016037	GCGG	2	8	34239	34246	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016037	GGCC	2	8	36633	36640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016037	GCGT	2	8	36746	36753	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016037	AGCG	2	8	36815	36822	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016037	ACGC	2	8	48881	48888	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016037	GTTG	2	8	49004	49011	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016037	GCCT	2	8	50211	50218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016037	CTGC	2	8	62021	62028	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016037	TTTC	2	8	62603	62610	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016037	GATG	2	8	63950	63957	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016037	ACCG	2	8	64054	64061	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016037	GTTG	2	8	74434	74441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016037	CCAG	2	8	74610	74617	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016037	CCCA	2	8	74785	74792	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_016037	AAAT	2	8	80762	80769	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016037	TGCC	2	8	81936	81943	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016037	CGGC	2	8	82031	82038	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016037	GGCG	2	8	82348	82355	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016037	CTAT	2	8	89314	89321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016037	CCTC	2	8	103670	103677	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_016037	ACGG	2	8	103854	103861	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016037	CCAG	2	8	108267	108274	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016037	CGTA	2	8	109905	109912	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016037	ATGG	2	8	110063	110070	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016037	TGCA	2	8	110866	110873	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016037	CTAT	2	8	111084	111091	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016037	GCAG	2	8	113469	113476	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016037	CATG	2	8	113495	113502	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016037	GCAG	2	8	113519	113526	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016037	ATTT	2	8	113576	113583	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016037	TCTG	2	8	113765	113772	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016037	CAGG	2	8	118701	118708	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016037	GCCT	2	8	122196	122203	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016037	GCCC	2	8	130497	130504	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_016037	CCCG	2	8	134930	134937	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_016037	ACGC	2	8	135186	135193	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016037	CGGG	2	8	135560	135567	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016037	ACCG	2	8	135568	135575	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016037	TGAA	2	8	135663	135670	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016037	CCCG	2	8	136809	136816	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
57	NC_016037	CCGG	2	8	140519	140526	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016037	CCCG	2	8	145454	145461	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
59	NC_016037	GCAC	2	8	148333	148340	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016037	CAGT	2	8	148426	148433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016037	CCCG	2	8	151303	151310	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
62	NC_016037	GGAC	2	8	151474	151481	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016037	GGAG	2	8	153334	153341	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016037	AAAC	2	8	153404	153411	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016037	CCCG	2	8	153479	153486	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_016037	CCAG	2	8	153656	153663	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016037	TGGT	2	8	154123	154130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016037	CAAA	2	8	155426	155433	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016037	GTTT	2	8	172766	172773	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016037	TGAT	2	8	175751	175758	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016037	TCCC	2	8	175790	175797	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
72	NC_016037	CCGA	2	8	175816	175823	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016037	CCGT	2	8	184573	184580	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016037	AAAG	2	8	187870	187877	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016037	ACTG	2	8	188607	188614	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016037	GGCG	2	8	189798	189805	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016037	TTTC	2	8	189942	189949	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016037	AGCA	2	8	190334	190341	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016037	ACAT	2	8	190484	190491	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016037	CTCA	2	8	191450	191457	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016037	CCTT	2	8	192367	192374	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016037	GCCC	2	8	192565	192572	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
83	NC_016037	ATTA	2	8	194874	194881	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016037	TGAA	2	8	199023	199030	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016037	ACTG	2	8	199421	199428	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016037	ATTT	2	8	199608	199615	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016037	AACC	2	8	199818	199825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016037	CTGT	2	8	202554	202561	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016037	TCAA	2	8	214278	214285	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016037	ATCA	2	8	214319	214326	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016037	GGAT	2	8	214522	214529	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016037	TCAA	2	8	220659	220666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016037	ATCA	2	8	220700	220707	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016037	CTCA	2	8	227773	227780	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016037	CTTT	2	8	229177	229184	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016037	GGAA	2	8	236731	236738	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016037	TGAT	2	8	237875	237882	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016037	TTGA	2	8	237916	237923	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016037	ACCT	2	8	239904	239911	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016037	TCCA	2	8	242052	242059	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016037	CTGA	2	8	244087	244094	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016037	TCAA	2	8	245251	245258	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016037	CTTT	2	8	247744	247751	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016037	TCAA	2	8	249415	249422	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016037	TCGC	2	8	253723	253730	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016037	AAGA	2	8	255780	255787	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016037	GTCT	2	8	255847	255854	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.