MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 plasmid pCD034-1

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016035	ATT	2	6	92	97	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347825840
2	NC_016035	GTG	2	6	140	145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347825840
3	NC_016035	GGC	2	6	236	241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347825840
4	NC_016035	TAC	2	6	342	347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347825840
5	NC_016035	TTG	2	6	355	360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347825840
6	NC_016035	TTG	2	6	430	435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347825840
7	NC_016035	CAC	2	6	493	498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347825840
8	NC_016035	TAA	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347825840
9	NC_016035	TGA	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825840
10	NC_016035	AGA	2	6	840	845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347825840
11	NC_016035	TGA	2	6	879	884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825840
12	NC_016035	AGT	2	6	900	905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825840
13	NC_016035	TTG	2	6	914	919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347825840
14	NC_016035	ATT	2	6	944	949	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347825840
15	NC_016035	AAT	2	6	1045	1050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347825841
16	NC_016035	TAT	2	6	1131	1136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347825841
17	NC_016035	TTA	2	6	1137	1142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347825841
18	NC_016035	TTG	2	6	1175	1180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347825841
19	NC_016035	TTA	2	6	1223	1228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347825841
20	NC_016035	TAT	2	6	1310	1315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347825841
21	NC_016035	TGA	2	6	1443	1448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825841
22	NC_016035	ACA	2	6	1472	1477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347825841
23	NC_016035	CGG	2	6	2003	2008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347825842
24	NC_016035	GAA	2	6	2065	2070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347825842
25	NC_016035	TGA	2	6	2097	2102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825842
26	NC_016035	TGA	3	9	2139	2147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825842
27	NC_016035	ACA	2	6	2223	2228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347825842
28	NC_016035	GCA	2	6	2325	2330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347825842
29	NC_016035	AGC	2	6	2337	2342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347825842
30	NC_016035	TCG	2	6	2610	2615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347825842
31	NC_016035	CTT	2	6	2667	2672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347825842
32	NC_016035	ACA	2	6	2778	2783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347825842
33	NC_016035	TGA	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347825842

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.