MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY050

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016029	CGC	2	6	99	104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662275
2	NC_016029	CCT	2	6	188	193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347662275
3	NC_016029	CCG	2	6	330	335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662275
4	NC_016029	CTC	2	6	411	416	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347662275
5	NC_016029	TGG	2	6	485	490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347662275
6	NC_016029	GAT	2	6	502	507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347662275
7	NC_016029	CTG	2	6	508	513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347662275
8	NC_016029	ACT	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347662275
9	NC_016029	GCA	2	6	548	553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347662275
10	NC_016029	GCC	2	6	599	604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662275
11	NC_016029	GCA	2	6	674	679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347662275
12	NC_016029	CCA	2	6	731	736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347662275
13	NC_016029	CGC	2	6	756	761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662275
14	NC_016029	ATC	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347662275
15	NC_016029	AGC	2	6	1113	1118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016029	CTT	2	6	1221	1226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016029	GCC	3	9	1396	1404	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662276
18	NC_016029	GCA	2	6	1641	1646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347662276
19	NC_016029	ACA	2	6	1647	1652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347662276
20	NC_016029	TCT	2	6	1728	1733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016029	AGT	2	6	1799	1804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016029	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016029	GAA	2	6	2277	2282	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347662277
24	NC_016029	CTG	2	6	2317	2322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347662277
25	NC_016029	AGG	2	6	2447	2452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347662277
26	NC_016029	AAC	2	6	2490	2495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347662277
27	NC_016029	TGC	2	6	2503	2508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347662277
28	NC_016029	AGG	2	6	2550	2555	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347662277
29	NC_016029	ATC	2	6	2591	2596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347662277
30	NC_016029	GAA	2	6	2624	2629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016029	CTA	2	6	2722	2727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016029	CCT	2	6	2760	2765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016029	CTT	2	6	2972	2977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347662278
34	NC_016029	AAT	2	6	3092	3097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347662278
35	NC_016029	ATT	2	6	3153	3158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347662278
36	NC_016029	CAA	2	6	3165	3170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347662278
37	NC_016029	TGT	2	6	3318	3323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016029	ACA	2	6	3337	3342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016029	CAT	2	6	3449	3454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016029	CTT	2	6	3482	3487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016029	AGA	2	6	3512	3517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016029	TAC	2	6	3755	3760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016029	CCA	2	6	3920	3925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347662279
44	NC_016029	GGC	2	6	4079	4084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347662279
45	NC_016029	CTG	2	6	4149	4154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347662279
46	NC_016029	CGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347662279
47	NC_016029	GCC	2	6	4203	4208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347662279
48	NC_016029	ACG	2	6	4209	4214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347662279
49	NC_016029	GAT	2	6	4280	4285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016029	GTC	2	6	4382	4387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016029	GAA	2	6	4396	4401	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016029	CGT	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.