MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY030

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016028	CATC	2	8	485	492	25 %	25 %	0 %	50 %	347762034
2	NC_016028	CTCG	2	8	643	650	0 %	25 %	25 %	50 %	347762034
3	NC_016028	ATCT	2	8	1078	1085	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016028	GGGC	2	8	1268	1275	0 %	0 %	75 %	25 %	347762035
5	NC_016028	TTGT	2	8	1402	1409	0 %	75 %	25 %	0 %	347762036
6	NC_016028	AGGC	2	8	1644	1651	25 %	0 %	50 %	25 %	347762036
7	NC_016028	CGCT	2	8	2418	2425	0 %	25 %	25 %	50 %	347762037
8	NC_016028	CCCT	2	8	2775	2782	0 %	25 %	0 %	75 %	347762038
9	NC_016028	GCCA	2	8	2811	2818	25 %	0 %	25 %	50 %	347762038
10	NC_016028	GCGA	2	8	2986	2993	25 %	0 %	50 %	25 %	347762038
11	NC_016028	GGGC	2	8	3611	3618	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016028	TCGT	2	8	3774	3781	0 %	50 %	25 %	25 %	347762039
13	NC_016028	CGCC	2	8	3956	3963	0 %	0 %	25 %	75 %	347762039
14	NC_016028	CCAG	2	8	4144	4151	25 %	0 %	25 %	50 %	347762039
15	NC_016028	CGGG	2	8	4391	4398	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016028	CCCG	2	8	4459	4466	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_016028	CGCC	2	8	4699	4706	0 %	0 %	25 %	75 %	347762040
18	NC_016028	TGCG	2	8	4773	4780	0 %	25 %	50 %	25 %	347762040
19	NC_016028	CCTC	2	8	4885	4892	0 %	25 %	0 %	75 %	347762040
20	NC_016028	CTGC	2	8	5915	5922	0 %	25 %	25 %	50 %	347762042
21	NC_016028	CGCC	2	8	5945	5952	0 %	0 %	25 %	75 %	347762042
22	NC_016028	GCCG	2	8	6090	6097	0 %	0 %	50 %	50 %	347762042
23	NC_016028	GCTT	2	8	6777	6784	0 %	50 %	25 %	25 %	347762042
24	NC_016028	CTTC	2	8	7009	7016	0 %	50 %	0 %	50 %	347762042
25	NC_016028	GAGC	2	8	7244	7251	25 %	0 %	50 %	25 %	347762043
26	NC_016028	CGGG	2	8	7308	7315	0 %	0 %	75 %	25 %	347762044
27	NC_016028	GCCA	2	8	7717	7724	25 %	0 %	25 %	50 %	347762045
28	NC_016028	CCGC	2	8	7972	7979	0 %	0 %	25 %	75 %	347762045
29	NC_016028	GCGA	2	8	8994	9001	25 %	0 %	50 %	25 %	347762047
30	NC_016028	AGCG	2	8	9384	9391	25 %	0 %	50 %	25 %	347762048
31	NC_016028	CCGA	2	8	9411	9418	25 %	0 %	25 %	50 %	347762048
32	NC_016028	GCCT	2	8	10145	10152	0 %	25 %	25 %	50 %	347762048
33	NC_016028	TCCC	2	8	10172	10179	0 %	25 %	0 %	75 %	347762048
34	NC_016028	TCGG	2	8	10422	10429	0 %	25 %	50 %	25 %	347762048
35	NC_016028	CCAC	2	8	10875	10882	25 %	0 %	0 %	75 %	347762048
36	NC_016028	CGCC	2	8	10988	10995	0 %	0 %	25 %	75 %	347762048
37	NC_016028	CGGG	2	8	11611	11618	0 %	0 %	75 %	25 %	347762048
38	NC_016028	CGAC	2	8	11690	11697	25 %	0 %	25 %	50 %	347762048
39	NC_016028	AGGC	2	8	12991	12998	25 %	0 %	50 %	25 %	347762049
40	NC_016028	CGTA	2	8	14172	14179	25 %	25 %	25 %	25 %	347762051
41	NC_016028	CCGC	2	8	14348	14355	0 %	0 %	25 %	75 %	347762051
42	NC_016028	GCCT	2	8	14505	14512	0 %	25 %	25 %	50 %	347762051
43	NC_016028	GGCG	2	8	15866	15873	0 %	0 %	75 %	25 %	347762052
44	NC_016028	GACA	2	8	16053	16060	50 %	0 %	25 %	25 %	347762052
45	NC_016028	CACC	2	8	16099	16106	25 %	0 %	0 %	75 %	347762053
46	NC_016028	CAGC	2	8	16844	16851	25 %	0 %	25 %	50 %	347762053
47	NC_016028	CCTT	2	8	17320	17327	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016028	GATG	2	8	17618	17625	25 %	25 %	50 %	0 %	347762054
49	NC_016028	TCTG	2	8	17986	17993	0 %	50 %	25 %	25 %	347762055
50	NC_016028	GGAT	2	8	18346	18353	25 %	25 %	50 %	0 %	347762055
51	NC_016028	CCCG	2	8	18461	18468	0 %	0 %	25 %	75 %	347762055
52	NC_016028	ATCA	2	8	18780	18787	50 %	25 %	0 %	25 %	347762055
53	NC_016028	AGGT	2	8	18913	18920	25 %	25 %	50 %	0 %	347762055
54	NC_016028	GCTG	2	8	19155	19162	0 %	25 %	50 %	25 %	347762056
55	NC_016028	ACCC	2	8	19336	19343	25 %	0 %	0 %	75 %	347762056
56	NC_016028	CTGC	2	8	19446	19453	0 %	25 %	25 %	50 %	347762056
57	NC_016028	CTGA	2	8	19944	19951	25 %	25 %	25 %	25 %	347762057
58	NC_016028	GATC	2	8	20274	20281	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016028	CATC	2	8	21938	21945	25 %	25 %	0 %	50 %	347762062
60	NC_016028	GCCT	2	8	22063	22070	0 %	25 %	25 %	50 %	347762062
61	NC_016028	GACA	2	8	22269	22276	50 %	0 %	25 %	25 %	347762062
62	NC_016028	TCCG	2	8	22852	22859	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016028	CACC	2	8	23000	23007	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
64	NC_016028	GACA	2	8	23037	23044	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016028	CCCG	2	8	23495	23502	0 %	0 %	25 %	75 %	347762063
66	NC_016028	GCCG	2	8	23757	23764	0 %	0 %	50 %	50 %	347762063
67	NC_016028	GATC	2	8	23789	23796	25 %	25 %	25 %	25 %	347762063
68	NC_016028	ACGA	2	8	23806	23813	50 %	0 %	25 %	25 %	347762063
69	NC_016028	CAGC	2	8	23846	23853	25 %	0 %	25 %	50 %	347762063
70	NC_016028	GCGA	2	8	23863	23870	25 %	0 %	50 %	25 %	347762063
71	NC_016028	TGCA	2	8	24366	24373	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016028	TCGA	2	8	24675	24682	25 %	25 %	25 %	25 %	347762064
73	NC_016028	AGGG	2	8	24778	24785	25 %	0 %	75 %	0 %	347762064
74	NC_016028	GCAC	2	8	24898	24905	25 %	0 %	25 %	50 %	347762065
75	NC_016028	TGAC	2	8	25170	25177	25 %	25 %	25 %	25 %	347762065
76	NC_016028	GCCG	2	8	25351	25358	0 %	0 %	50 %	50 %	347762066
77	NC_016028	GGGC	2	8	25565	25572	0 %	0 %	75 %	25 %	347762066
78	NC_016028	GCTG	2	8	26494	26501	0 %	25 %	50 %	25 %	347762069
79	NC_016028	CGGC	3	12	26875	26886	0 %	0 %	50 %	50 %	347762070
80	NC_016028	GAGT	2	8	27684	27691	25 %	25 %	50 %	0 %	347762072
81	NC_016028	ATGG	2	8	27847	27854	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016028	TTGG	2	8	28296	28303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.