MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY030

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016028	CT	3	6	684	689	0 %	50 %	0 %	50 %	347762034
2	NC_016028	TC	3	6	1253	1258	0 %	50 %	0 %	50 %	347762035
3	NC_016028	CA	3	6	1431	1436	50 %	0 %	0 %	50 %	347762036
4	NC_016028	CG	3	6	2789	2794	0 %	0 %	50 %	50 %	347762038
5	NC_016028	GC	3	6	4209	4214	0 %	0 %	50 %	50 %	347762039
6	NC_016028	CG	3	6	4592	4597	0 %	0 %	50 %	50 %	347762040
7	NC_016028	CG	3	6	4599	4604	0 %	0 %	50 %	50 %	347762040
8	NC_016028	GC	3	6	4781	4786	0 %	0 %	50 %	50 %	347762040
9	NC_016028	CG	3	6	4930	4935	0 %	0 %	50 %	50 %	347762040
10	NC_016028	CA	3	6	5023	5028	50 %	0 %	0 %	50 %	347762041
11	NC_016028	AT	3	6	5576	5581	50 %	50 %	0 %	0 %	347762041
12	NC_016028	CT	3	6	5600	5605	0 %	50 %	0 %	50 %	347762041
13	NC_016028	GT	3	6	5843	5848	0 %	50 %	50 %	0 %	347762042
14	NC_016028	GC	3	6	6294	6299	0 %	0 %	50 %	50 %	347762042
15	NC_016028	GC	3	6	6435	6440	0 %	0 %	50 %	50 %	347762042
16	NC_016028	GC	3	6	6503	6508	0 %	0 %	50 %	50 %	347762042
17	NC_016028	AT	3	6	6706	6711	50 %	50 %	0 %	0 %	347762042
18	NC_016028	CG	3	6	6840	6845	0 %	0 %	50 %	50 %	347762042
19	NC_016028	GA	3	6	7570	7575	50 %	0 %	50 %	0 %	347762044
20	NC_016028	GC	3	6	8168	8173	0 %	0 %	50 %	50 %	347762046
21	NC_016028	GC	3	6	8435	8440	0 %	0 %	50 %	50 %	347762046
22	NC_016028	GC	3	6	8961	8966	0 %	0 %	50 %	50 %	347762047
23	NC_016028	GC	3	6	9475	9480	0 %	0 %	50 %	50 %	347762048
24	NC_016028	GC	3	6	9693	9698	0 %	0 %	50 %	50 %	347762048
25	NC_016028	GC	3	6	9857	9862	0 %	0 %	50 %	50 %	347762048
26	NC_016028	AT	3	6	10166	10171	50 %	50 %	0 %	0 %	347762048
27	NC_016028	GC	3	6	10184	10189	0 %	0 %	50 %	50 %	347762048
28	NC_016028	CG	3	6	10281	10286	0 %	0 %	50 %	50 %	347762048
29	NC_016028	CG	3	6	11013	11018	0 %	0 %	50 %	50 %	347762048
30	NC_016028	CG	3	6	11251	11256	0 %	0 %	50 %	50 %	347762048
31	NC_016028	CG	3	6	11304	11309	0 %	0 %	50 %	50 %	347762048
32	NC_016028	GC	4	8	11495	11502	0 %	0 %	50 %	50 %	347762048
33	NC_016028	CA	3	6	13580	13585	50 %	0 %	0 %	50 %	347762050
34	NC_016028	CG	3	6	13807	13812	0 %	0 %	50 %	50 %	347762050
35	NC_016028	CT	3	6	14018	14023	0 %	50 %	0 %	50 %	347762050
36	NC_016028	TC	3	6	14103	14108	0 %	50 %	0 %	50 %	347762050
37	NC_016028	CG	3	6	14275	14280	0 %	0 %	50 %	50 %	347762051
38	NC_016028	GT	3	6	15151	15156	0 %	50 %	50 %	0 %	347762051
39	NC_016028	AG	3	6	15655	15660	50 %	0 %	50 %	0 %	347762052
40	NC_016028	CG	3	6	16491	16496	0 %	0 %	50 %	50 %	347762053
41	NC_016028	CG	3	6	16508	16513	0 %	0 %	50 %	50 %	347762053
42	NC_016028	GC	3	6	17237	17242	0 %	0 %	50 %	50 %	347762053
43	NC_016028	CG	3	6	17971	17976	0 %	0 %	50 %	50 %	347762055
44	NC_016028	GC	3	6	19691	19696	0 %	0 %	50 %	50 %	347762056
45	NC_016028	CG	3	6	19780	19785	0 %	0 %	50 %	50 %	347762057
46	NC_016028	GC	3	6	20798	20803	0 %	0 %	50 %	50 %	347762060
47	NC_016028	CG	3	6	21320	21325	0 %	0 %	50 %	50 %	347762062
48	NC_016028	GC	3	6	21579	21584	0 %	0 %	50 %	50 %	347762062
49	NC_016028	GA	3	6	21887	21892	50 %	0 %	50 %	0 %	347762062
50	NC_016028	CG	3	6	22211	22216	0 %	0 %	50 %	50 %	347762062
51	NC_016028	GC	3	6	23476	23481	0 %	0 %	50 %	50 %	347762063
52	NC_016028	CG	3	6	23695	23700	0 %	0 %	50 %	50 %	347762063
53	NC_016028	CG	3	6	24107	24112	0 %	0 %	50 %	50 %	347762063
54	NC_016028	TG	3	6	24507	24512	0 %	50 %	50 %	0 %	347762064
55	NC_016028	AC	3	6	25203	25208	50 %	0 %	0 %	50 %	347762066
56	NC_016028	GC	3	6	27629	27634	0 %	0 %	50 %	50 %	347762072

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.