MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288

Total Repeats: 94

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016027	TTTCCA	2	12	47067	47078	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016027	ATTTTA	2	12	161685	161696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016027	CAGCGC	2	12	163217	163228	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016027	TTTCCT	2	12	178176	178187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016027	AAGCAA	2	12	188420	188431	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016027	CCCGAT	2	12	199459	199470	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016027	TTTATT	2	12	248973	248984	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016027	GTTTCT	2	12	252730	252741	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016027	CGCGGG	2	12	289609	289620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016027	AAAAAC	2	12	356476	356487	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016027	CCGGTC	2	12	388860	388871	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016027	ATCTGT	2	12	416118	416129	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016027	TTATTT	2	12	451923	451934	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016027	CTACGT	2	12	485662	485673	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016027	CGCACG	2	12	507534	507545	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016027	GCACCA	2	12	537974	537985	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016027	CCTTTT	2	12	542305	542316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016027	GTGGCA	2	12	547360	547371	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016027	GGGCAA	2	12	556546	556557	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_016027	GCACCA	2	12	573368	573379	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016027	TAGGGA	2	12	575976	575987	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016027	ATCAGG	2	12	577377	577388	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016027	CGGTGC	2	12	590942	590953	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016027	GTCCCG	2	12	592019	592030	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016027	TGAAAA	2	12	659757	659768	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016027	GGCCGT	2	12	716198	716209	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016027	CGCGGG	2	12	753335	753346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016027	GTTCCC	2	12	876154	876165	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016027	CTTTAT	2	12	878550	878561	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016027	TGCGGG	2	12	900450	900461	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016027	ACCACG	2	12	900527	900538	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016027	ACCATG	2	12	921846	921857	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016027	ACCCCA	2	12	932314	932325	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_016027	CCGGAC	2	12	980389	980400	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016027	GCATGG	2	12	983626	983637	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016027	CGCCCG	2	12	1023109	1023120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_016027	TGGGCC	2	12	1061371	1061382	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016027	TGAAAC	2	12	1064593	1064604	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016027	AAACGG	2	12	1072895	1072906	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016027	CAAAAT	2	12	1091287	1091298	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016027	GGCTGG	2	12	1233430	1233441	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016027	ACAAGG	2	12	1339716	1339727	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016027	TCCAGG	2	12	1355047	1355058	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016027	GCTACA	2	12	1362473	1362484	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016027	CAAAAA	2	12	1417049	1417060	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016027	ATGCTG	2	12	1441610	1441621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016027	CGGTGG	2	12	1445301	1445312	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016027	TCCGGT	2	12	1530448	1530459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016027	TGCCCC	2	12	1608979	1608990	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_016027	GCTAAG	2	12	1660642	1660653	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016027	AAAAAT	3	18	1677021	1677038	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016027	TGAAAT	2	12	1682148	1682159	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016027	ACCCCT	2	12	1688161	1688172	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016027	GGGCGC	2	12	1714206	1714217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016027	CAACCG	2	12	1737350	1737361	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016027	TTCCCC	2	12	1813705	1813716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_016027	CGAAGG	2	12	1849779	1849790	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016027	ACCAGC	2	12	1858122	1858133	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016027	CCATAA	2	12	1915124	1915135	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016027	CGAAGC	2	12	1918040	1918051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016027	TGGCGC	2	12	1968217	1968228	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016027	ACAGGG	2	12	1969494	1969505	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016027	AAAGCG	2	12	1975788	1975799	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016027	CACAGG	2	12	1986035	1986046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016027	TATTTA	2	12	2011121	2011132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016027	TGGTAG	2	12	2057146	2057157	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016027	CTTACC	2	12	2069194	2069205	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016027	AAATAT	2	12	2076584	2076595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016027	TATGCT	2	12	2097870	2097881	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016027	GCACGG	2	12	2168340	2168351	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016027	GAACCA	2	12	2183027	2183038	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016027	GGCCGG	2	12	2197735	2197746	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016027	TCAGGA	2	12	2238453	2238464	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_016027	TCGCTG	2	12	2280081	2280092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_016027	CCTGAA	2	12	2280963	2280974	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_016027	CCTGGC	2	12	2301248	2301259	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016027	CAGGAA	2	12	2405233	2405244	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016027	TCGATA	2	12	2422270	2422281	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016027	GTCGTG	2	12	2434242	2434253	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016027	GATAAA	2	12	2472741	2472752	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016027	AGAGGG	2	12	2496739	2496750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016027	CTTTTT	2	12	2498041	2498052	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016027	TGGAAA	2	12	2580462	2580473	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016027	TGTTAT	2	12	2654384	2654395	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016027	TGCCGG	2	12	2677672	2677683	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016027	CGCAGG	2	12	2758544	2758555	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016027	CATGTT	2	12	2760361	2760372	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016027	CCTAGT	2	12	2825187	2825198	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016027	CGTGGC	2	12	2885160	2885171	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016027	GGAAAG	2	12	3010334	3010345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016027	CAGAAA	2	12	3013330	3013341	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016027	CCTCCA	2	12	3062910	3062921	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_016027	AAATAT	2	12	3085558	3085569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016027	CGGGCA	2	12	3126192	3126203	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.