MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288

Total Repeats: 392

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016027	CGGCC	2	10	1653	1662	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_016027	TGCCC	2	10	16117	16126	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3	NC_016027	AGGGT	2	10	22899	22908	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016027	GCAAG	2	10	49041	49050	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016027	GGGAT	2	10	55368	55377	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016027	TGCAT	2	10	62039	62048	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016027	TCGTG	2	10	63614	63623	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016027	TGCAC	2	10	64766	64775	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_016027	ATCCC	2	10	67738	67747	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
10	NC_016027	CATCG	2	10	77196	77205	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_016027	GTATC	2	10	99880	99889	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016027	CCTGT	2	10	106838	106847	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016027	CCTTT	2	10	115497	115506	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016027	CGGTG	2	10	119126	119135	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016027	CGCGG	2	10	128260	128269	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016027	ACCGG	2	10	153091	153100	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016027	ATTAC	2	10	156038	156047	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016027	ACGCC	2	10	162256	162265	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_016027	TCCGT	2	10	162547	162556	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016027	GTCAG	2	10	186715	186724	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016027	GCGCG	2	10	186958	186967	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016027	TTCCG	2	10	187030	187039	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_016027	ATCCT	2	10	187307	187316	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016027	GGGCC	2	10	189036	189045	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
25	NC_016027	ATTGC	2	10	224491	224500	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016027	TAAAT	2	10	227644	227653	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016027	GCTGG	2	10	228999	229008	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016027	GCTGG	2	10	240879	240888	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016027	CGGGG	2	10	249066	249075	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016027	TGGAC	2	10	250863	250872	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016027	CGGCA	2	10	252674	252683	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016027	ACGGT	2	10	252820	252829	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016027	CTGGT	2	10	254352	254361	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016027	TATCA	2	10	254472	254481	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016027	TTCAA	2	10	261821	261830	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016027	CACGG	2	10	262115	262124	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
37	NC_016027	AGGGC	2	10	269809	269818	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016027	CACCG	2	10	273574	273583	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_016027	GCCCT	2	10	275477	275486	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_016027	TATTT	2	10	285473	285482	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016027	GACCG	2	10	285608	285617	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016027	CTGCC	2	10	286816	286825	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
43	NC_016027	GGGGA	2	10	289809	289818	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016027	GCTTT	2	10	290554	290563	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016027	CAGGG	2	10	292155	292164	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016027	GCGGA	2	10	307471	307480	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016027	GGGCA	2	10	308635	308644	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016027	TTGCA	2	10	328542	328551	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016027	GCGCG	2	10	352993	353002	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
50	NC_016027	GCAGG	2	10	353682	353691	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016027	TAATG	2	10	354482	354491	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016027	TGCCT	2	10	355382	355391	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016027	GCCGC	3	15	355426	355440	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
54	NC_016027	TAAAA	2	10	356443	356452	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016027	TGGAT	2	10	356600	356609	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016027	CATGC	2	10	356613	356622	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_016027	ATACG	2	10	356636	356645	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016027	TAATA	2	10	359521	359530	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016027	GTGGC	2	10	363541	363550	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016027	AGGGC	2	10	363571	363580	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016027	TACGG	2	10	375247	375256	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016027	CGGTC	2	10	375275	375284	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_016027	TGGTG	2	10	375291	375300	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016027	CATAT	2	10	384191	384200	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_016027	AGGGA	2	10	385236	385245	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016027	TGGGT	2	10	388745	388754	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016027	AGGGG	2	10	393530	393539	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016027	GAAAA	2	10	398971	398980	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016027	GAGGG	2	10	403424	403433	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016027	GCCAT	2	10	409451	409460	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_016027	GACAA	2	10	427066	427075	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_016027	TCATG	2	10	432683	432692	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016027	CAGGC	2	10	437716	437725	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_016027	ACACA	2	10	439691	439700	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
75	NC_016027	AGGAC	2	10	443909	443918	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016027	CTGAC	2	10	447485	447494	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
77	NC_016027	AATGT	2	10	451913	451922	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016027	ACAGG	2	10	461896	461905	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016027	ACCGT	2	10	468378	468387	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016027	TTTAT	2	10	477136	477145	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016027	TGAAA	2	10	478341	478350	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016027	TATCA	2	10	478468	478477	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_016027	CTGCG	2	10	493468	493477	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
84	NC_016027	CCAAC	2	10	499849	499858	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_016027	GCAGG	2	10	502662	502671	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016027	GGCCC	2	10	506861	506870	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
87	NC_016027	GACCA	2	10	506929	506938	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_016027	GCCAC	2	10	507210	507219	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_016027	CCGAC	2	10	507352	507361	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_016027	GGGCC	2	10	507372	507381	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_016027	CCATG	2	10	507416	507425	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_016027	GCATG	2	10	531471	531480	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016027	CTTGG	2	10	531686	531695	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016027	CGGAC	2	10	536412	536421	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
95	NC_016027	CATGC	2	10	538463	538472	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_016027	CGGTC	2	10	540467	540476	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_016027	CTGCA	2	10	542566	542575	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_016027	CGGGG	2	10	554170	554179	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016027	CCGCG	2	10	554189	554198	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
100	NC_016027	CACCC	2	10	556634	556643	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
101	NC_016027	CGGCA	2	10	560569	560578	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_016027	GGGCA	2	10	560706	560715	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016027	GGCAT	2	10	564627	564636	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
104	NC_016027	TTGTC	2	10	576093	576102	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016027	GTACC	2	10	576121	576130	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
106	NC_016027	AACGG	2	10	578736	578745	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
107	NC_016027	ACGCC	2	10	579213	579222	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
108	NC_016027	CAGGG	2	10	580886	580895	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016027	TGGGG	2	10	584673	584682	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016027	CATCA	2	10	587285	587294	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_016027	AGGAC	2	10	590977	590986	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_016027	CCCAC	2	10	593769	593778	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
113	NC_016027	ACGGC	2	10	595389	595398	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
114	NC_016027	ATTTT	2	10	607821	607830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016027	GCCAC	2	10	624706	624715	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_016027	GCGCA	2	10	625415	625424	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
117	NC_016027	CAATG	2	10	629639	629648	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_016027	GGGGA	2	10	639961	639970	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016027	GCGGG	2	10	651398	651407	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016027	TGAAG	2	10	662952	662961	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016027	CTATT	2	10	675093	675102	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
122	NC_016027	GACGG	2	10	675217	675226	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016027	TCCGT	2	10	681564	681573	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_016027	GATGG	2	10	697261	697270	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016027	TGCCC	2	10	699194	699203	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
126	NC_016027	TGCAT	2	10	703993	704002	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016027	CACGC	2	10	704008	704017	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
128	NC_016027	GGCGG	2	10	749619	749628	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016027	GCATT	2	10	753272	753281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_016027	CATCC	2	10	755853	755862	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
131	NC_016027	GGGCG	2	10	791815	791824	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016027	TTTCC	2	10	807333	807342	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_016027	CTAAT	2	10	824180	824189	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016027	TGCCT	2	10	824832	824841	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_016027	TCATT	2	10	824844	824853	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016027	CCCGT	2	10	828182	828191	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_016027	CCGGC	2	10	830377	830386	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
138	NC_016027	AATAA	2	10	837056	837065	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016027	CCTTC	2	10	837979	837988	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
140	NC_016027	CCCCT	2	10	851168	851177	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
141	NC_016027	CCTTA	2	10	868069	868078	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_016027	TTCCC	2	10	875777	875786	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
143	NC_016027	GCCGG	2	10	875828	875837	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
144	NC_016027	CATTA	2	10	884650	884659	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_016027	CTGGG	2	10	884782	884791	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
146	NC_016027	CCCGA	2	10	889851	889860	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
147	NC_016027	TCATG	2	10	890031	890040	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_016027	CCGGT	2	10	890055	890064	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
149	NC_016027	ATGCA	2	10	890836	890845	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_016027	CTTTT	2	10	897287	897296	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_016027	CCCTG	2	10	910183	910192	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
152	NC_016027	TGCCC	2	10	910461	910470	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
153	NC_016027	TCGGG	2	10	910571	910580	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
154	NC_016027	GCCAT	2	10	911667	911676	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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156	NC_016027	CATAA	2	10	961555	961564	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_016027	TGCGA	2	10	967646	967655	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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159	NC_016027	TAAAA	2	10	968229	968238	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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162	NC_016027	TCCCC	2	10	981826	981835	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
163	NC_016027	CTGTC	2	10	983578	983587	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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165	NC_016027	GCATG	2	10	985511	985520	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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167	NC_016027	CCCTT	2	10	1022253	1022262	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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183	NC_016027	GGAAC	2	10	1291110	1291119	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
184	NC_016027	ATGAA	2	10	1296921	1296930	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_016027	TACTG	2	10	1313301	1313310	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
186	NC_016027	GACCC	2	10	1320046	1320055	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
187	NC_016027	TCCTG	2	10	1322177	1322186	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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189	NC_016027	AGACC	2	10	1324745	1324754	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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197	NC_016027	ACGGT	2	10	1352885	1352894	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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252	NC_016027	GCCTG	2	10	1837974	1837983	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_016027	ACCCG	2	10	1938999	1939008	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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282	NC_016027	ATTTT	2	10	2057017	2057026	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_016027	TGCGG	2	10	2074019	2074028	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
284	NC_016027	AGGGA	2	10	2108061	2108070	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
285	NC_016027	TATCG	2	10	2117416	2117425	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_016027	AGGGA	2	10	2127195	2127204	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
288	NC_016027	TACGG	2	10	2130230	2130239	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
289	NC_016027	GGATG	2	10	2138339	2138348	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
290	NC_016027	CAGAA	2	10	2149107	2149116	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
291	NC_016027	GGTCG	2	10	2168377	2168386	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
292	NC_016027	CCGGA	2	10	2168454	2168463	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
293	NC_016027	GTCCT	2	10	2181463	2181472	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
294	NC_016027	CCCGG	2	10	2182966	2182975	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
295	NC_016027	TGATT	2	10	2191529	2191538	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
296	NC_016027	TCCTG	2	10	2197701	2197710	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
297	NC_016027	GAATC	2	10	2197813	2197822	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
298	NC_016027	CGCAA	2	10	2207692	2207701	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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301	NC_016027	CCGTG	2	10	2274202	2274211	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
302	NC_016027	CCTGC	2	10	2278338	2278347	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
303	NC_016027	GGTCA	2	10	2280164	2280173	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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315	NC_016027	TAGTT	2	10	2415537	2415546	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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322	NC_016027	CCGGC	2	10	2506626	2506635	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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331	NC_016027	TCATG	2	10	2574046	2574055	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
332	NC_016027	ATTTT	2	10	2616272	2616281	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
333	NC_016027	CTGTT	2	10	2620315	2620324	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
334	NC_016027	ATTTT	2	10	2620473	2620482	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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379	NC_016027	GGTGA	2	10	2986227	2986236	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
380	NC_016027	TGATG	2	10	3010312	3010321	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_016027	TGCCC	2	10	3030905	3030914	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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387	NC_016027	GAGCA	2	10	3080157	3080166	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
388	NC_016027	TGAAT	2	10	3099983	3099992	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
389	NC_016027	CGGCC	2	10	3110887	3110896	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
390	NC_016027	CCTGC	2	10	3126276	3126285	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
391	NC_016027	TGTTT	2	10	3136667	3136676	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
392	NC_016027	CGGGT	2	10	3136796	3136805	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.