MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Micavibrio aeruginosavorus ARL-13 chromosome

Total Repeats: 82

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016026	CTCCCT	2	12	26346	26357	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_016026	AAGGAA	2	12	37745	37756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016026	GTTTTT	2	12	173206	173217	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016026	CGCGGG	2	12	192326	192337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016026	AGGCGC	2	12	220198	220209	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016026	CCGGCT	2	12	233704	233715	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016026	GCAAAA	2	12	243723	243734	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016026	GAAAAA	2	12	254274	254285	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016026	AGGGTC	2	12	261028	261039	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016026	GATGCA	2	12	264303	264314	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016026	GAAAAA	2	12	301106	301117	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016026	TATTGC	2	12	332216	332227	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016026	GTGTTG	2	12	334029	334040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016026	TTGCGG	2	12	342435	342446	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016026	CTGAAG	2	12	342800	342811	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016026	TGTGCC	2	12	343198	343209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016026	AAAAGA	2	12	378127	378138	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016026	GCATGT	2	12	380250	380261	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016026	TGTCCT	2	12	391449	391460	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016026	AATGCA	2	12	429069	429080	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016026	CTTATA	2	12	429145	429156	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016026	AAGAAA	2	12	471681	471692	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016026	TCTTTC	2	12	493060	493071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016026	TGGATC	2	12	587439	587450	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016026	GACCCA	2	12	588541	588552	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016026	TATTAA	3	18	737457	737474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016026	TAAAAC	2	12	872894	872905	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016026	TATGAA	2	12	907059	907070	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016026	AAATAA	2	12	939457	939468	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016026	GCTCTC	2	12	951526	951537	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016026	AGGGGA	2	12	993490	993501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016026	CAAAAG	2	12	999480	999491	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_016026	TGGATC	2	12	1014893	1014904	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016026	TTACAT	2	12	1039881	1039892	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016026	GTGCAG	2	12	1054409	1054420	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016026	GCAGGG	2	12	1062025	1062036	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016026	GATTAA	2	12	1065514	1065525	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016026	TGATCC	2	12	1066655	1066666	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016026	CCTGTG	2	12	1099415	1099426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016026	AACGGT	2	12	1113765	1113776	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016026	CCAAGG	2	12	1243439	1243450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016026	AAAACA	2	12	1250075	1250086	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016026	AACAAA	2	12	1302180	1302191	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016026	AATCCC	2	12	1334903	1334914	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016026	GTTTTT	2	12	1402045	1402056	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016026	TTTGAT	2	12	1417071	1417082	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016026	TATAAA	2	12	1420317	1420328	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016026	CCGAAA	2	12	1461057	1461068	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016026	ATAAAC	2	12	1484780	1484791	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016026	TCTCTT	2	12	1512539	1512550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016026	CCCCCA	2	12	1547914	1547925	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
52	NC_016026	TATCCA	2	12	1581620	1581631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016026	GCATTC	2	12	1618009	1618020	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016026	CCCCCA	2	12	1692650	1692661	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
55	NC_016026	GCCCCT	2	12	1695386	1695397	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_016026	AGGCTC	2	12	1713758	1713769	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016026	TTTTTC	2	12	1717370	1717381	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016026	AAACAA	2	12	1723790	1723801	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016026	ACAAAA	2	12	1762454	1762465	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016026	TCCATC	2	12	1771537	1771548	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016026	TGGAGG	2	12	1771717	1771728	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016026	CCATCC	2	12	1771910	1771921	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_016026	AGGGAG	2	12	1786053	1786064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016026	AACCGG	2	12	1790904	1790915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016026	GCCACC	2	12	1857331	1857342	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_016026	GAACCC	2	12	1866571	1866582	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016026	CTTTCG	2	12	1882569	1882580	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016026	AAAACG	2	12	1897172	1897183	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016026	CAAGAA	2	12	1960404	1960415	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016026	AAAAAC	2	12	1987027	1987038	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016026	TCTCAA	2	12	2094843	2094854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016026	TAAAAA	2	12	2156157	2156168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016026	CCATAA	2	12	2169563	2169574	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016026	AAGCGT	2	12	2173246	2173257	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016026	TTCTTT	2	12	2180167	2180178	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_016026	ATTTTC	2	12	2180976	2180987	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016026	GGGCTG	2	12	2239858	2239869	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016026	AAAAGA	2	12	2291948	2291959	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016026	TAAAGT	2	12	2321803	2321814	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016026	TTTTCC	2	12	2401330	2401341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016026	CAATAA	2	12	2461221	2461232	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_016026	TGCGGG	2	12	2480286	2480297	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.