MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Micavibrio aeruginosavorus ARL-13 chromosome

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016026	CTTTC	2	10	3756	3765	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_016026	CGAAA	2	10	5248	5257	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016026	TGGGG	2	10	11412	11421	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016026	GAGGG	2	10	26364	26373	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016026	TGGAC	2	10	36431	36440	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016026	ACCGG	2	10	42051	42060	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016026	TAAAA	2	10	61360	61369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016026	ATGGA	2	10	74258	74267	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016026	ATTCT	2	10	89298	89307	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016026	TGGGG	2	10	96927	96936	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016026	ATGTT	2	10	97064	97073	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016026	GGTTA	2	10	138554	138563	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016026	TGGCC	2	10	152371	152380	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016026	TAAGT	2	10	170598	170607	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016026	TTCGC	2	10	181012	181021	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016026	GTTCG	2	10	190131	190140	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016026	CGAGA	2	10	234635	234644	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016026	GGTGC	2	10	248786	248795	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
19	NC_016026	TGTTC	2	10	248839	248848	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016026	CCCCA	2	10	248912	248921	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
21	NC_016026	GGTGC	2	10	267184	267193	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016026	TGGGG	2	10	284363	284372	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016026	GATAA	2	10	304083	304092	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016026	TTTGG	2	10	306072	306081	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016026	CTCTG	2	10	325235	325244	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_016026	ATATT	2	10	331483	331492	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016026	CCTCT	2	10	375132	375141	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
28	NC_016026	CACGC	2	10	380048	380057	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_016026	GTGTG	2	10	391465	391474	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016026	GAAAT	2	10	398931	398940	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016026	GGTCC	2	10	399098	399107	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016026	AGCGA	2	10	429257	429266	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016026	CGGCG	2	10	429353	429362	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
34	NC_016026	AGGGT	2	10	468124	468133	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016026	ACAAA	2	10	471032	471041	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_016026	GACAC	2	10	473863	473872	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_016026	ACTGG	2	10	474756	474765	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016026	TTCGG	2	10	475044	475053	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016026	TCGTG	2	10	475091	475100	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016026	CGTCA	2	10	475425	475434	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_016026	AGCGA	2	10	476230	476239	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_016026	AGGAA	2	10	476271	476280	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016026	CTCAT	2	10	478425	478434	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_016026	CCCAT	2	10	478965	478974	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_016026	GCAAG	2	10	495297	495306	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016026	ATCGA	2	10	499113	499122	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_016026	GCGCC	2	10	535645	535654	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
48	NC_016026	AAAAG	2	10	542951	542960	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016026	GCTGT	2	10	561634	561643	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_016026	CTTTC	2	10	562761	562770	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
51	NC_016026	TGGGG	2	10	652178	652187	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016026	AGGAA	2	10	661085	661094	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016026	GGGAA	2	10	671296	671305	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016026	AACCC	2	10	695166	695175	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
55	NC_016026	TGAGA	2	10	695543	695552	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016026	ATTTT	2	10	699693	699702	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016026	CTTTT	2	10	704237	704246	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016026	ATATT	2	10	731825	731834	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016026	TGGGG	2	10	747133	747142	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016026	AAAAG	2	10	751224	751233	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016026	TTCCT	2	10	765792	765801	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_016026	GGATA	2	10	766235	766244	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016026	CCGGG	2	10	772317	772326	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_016026	ATCTC	2	10	786434	786443	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
65	NC_016026	TCAGA	2	10	795089	795098	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016026	GCGGG	2	10	812744	812753	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016026	TCAGG	2	10	848683	848692	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016026	CTATG	2	10	879510	879519	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016026	GGGGC	2	10	907287	907296	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
70	NC_016026	TAAAA	2	10	907698	907707	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016026	AAGCG	2	10	921446	921455	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_016026	CCCGC	2	10	923397	923406	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
73	NC_016026	CAATT	2	10	947999	948008	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016026	ATTTA	2	10	966702	966711	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016026	GCACT	2	10	991036	991045	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_016026	TGAAT	2	10	999409	999418	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016026	GTTTT	2	10	1025478	1025487	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016026	TTTTG	2	10	1058812	1058821	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016026	GCCGC	2	10	1070724	1070733	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_016026	CTTTT	2	10	1072778	1072787	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_016026	CGAAG	2	10	1129458	1129467	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_016026	GCTAA	2	10	1130744	1130753	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_016026	ATCCC	2	10	1137068	1137077	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
84	NC_016026	CCAAC	2	10	1138909	1138918	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
85	NC_016026	GGGGA	2	10	1155563	1155572	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016026	GGGAA	2	10	1190974	1190983	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016026	TTGAT	2	10	1220135	1220144	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016026	AACAG	2	10	1230455	1230464	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_016026	CACGC	2	10	1232446	1232455	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
90	NC_016026	ATAGA	2	10	1232846	1232855	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016026	AGGTG	2	10	1243625	1243634	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016026	TCATA	2	10	1266961	1266970	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016026	AACTA	2	10	1312246	1312255	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016026	CTTTT	2	10	1319587	1319596	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016026	GCGGT	2	10	1365279	1365288	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
96	NC_016026	CGCAG	2	10	1375390	1375399	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
97	NC_016026	CTGTA	2	10	1377469	1377478	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_016026	CCGGA	2	10	1380887	1380896	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
99	NC_016026	AAAAG	2	10	1386818	1386827	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016026	CTTTT	2	10	1386846	1386855	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_016026	AAATA	2	10	1400875	1400884	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016026	TATGT	2	10	1431447	1431456	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016026	TTCAC	2	10	1444026	1444035	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_016026	CCGCA	2	10	1449641	1449650	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
105	NC_016026	TGGTG	2	10	1452155	1452164	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016026	TGGGC	2	10	1452284	1452293	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_016026	GTTTT	2	10	1465343	1465352	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016026	TATAA	2	10	1478209	1478218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016026	GCCCC	2	10	1483344	1483353	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
110	NC_016026	CGGTT	2	10	1486884	1486893	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016026	TAAGA	2	10	1494619	1494628	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016026	GTTTT	2	10	1495004	1495013	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016026	CGATC	2	10	1503869	1503878	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_016026	CCCCA	2	10	1507717	1507726	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
115	NC_016026	GAAAG	2	10	1511967	1511976	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016026	GGCCC	2	10	1518113	1518122	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_016026	CCGCC	2	10	1519353	1519362	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
118	NC_016026	ACTGC	2	10	1522450	1522459	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_016026	CATCC	2	10	1542266	1542275	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
120	NC_016026	ATACC	2	10	1546894	1546903	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_016026	TCCAC	2	10	1547989	1547998	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
122	NC_016026	AATCC	2	10	1548840	1548849	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
123	NC_016026	ATAAA	2	10	1565622	1565631	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016026	GTTTT	2	10	1571110	1571119	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016026	TTATT	2	10	1654768	1654777	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016026	CCCCT	2	10	1654788	1654797	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
127	NC_016026	TGCGT	2	10	1655982	1655991	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016026	ATTCA	2	10	1657730	1657739	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016026	CTGCC	2	10	1668235	1668244	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_016026	CCGGA	2	10	1669362	1669371	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_016026	GCCCG	2	10	1735378	1735387	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
132	NC_016026	TAAAT	2	10	1736367	1736376	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016026	CGGCC	2	10	1765772	1765781	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
134	NC_016026	AGGCA	2	10	1766773	1766782	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
135	NC_016026	CGTGG	2	10	1766805	1766814	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016026	CCAGC	2	10	1770845	1770854	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
137	NC_016026	GGCTT	2	10	1771566	1771575	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
138	NC_016026	GTCGG	2	10	1771742	1771751	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
139	NC_016026	ATGAG	2	10	1772791	1772800	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016026	CAACT	2	10	1786597	1786606	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
141	NC_016026	TGGGG	2	10	1818615	1818624	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016026	CCATC	2	10	1818651	1818660	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
143	NC_016026	GCGCG	2	10	1855659	1855668	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
144	NC_016026	GGCGC	2	10	1855729	1855738	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
145	NC_016026	AACGT	2	10	1856856	1856865	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_016026	GTGCG	2	10	1862447	1862456	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
147	NC_016026	TCGTA	2	10	1875110	1875119	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
148	NC_016026	GGCCC	2	10	1876218	1876227	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
149	NC_016026	CGCCC	2	10	1897795	1897804	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
150	NC_016026	CGGGC	2	10	1909254	1909263	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
151	NC_016026	TAATA	2	10	1915148	1915157	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016026	TGCCC	2	10	1917550	1917559	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
153	NC_016026	CATTT	2	10	1939690	1939699	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_016026	CACCC	2	10	1974942	1974951	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
155	NC_016026	CATAA	2	10	1974975	1974984	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_016026	ATCCA	2	10	1977364	1977373	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
157	NC_016026	TTGTA	2	10	1977501	1977510	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016026	AAAGA	2	10	1980188	1980197	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
159	NC_016026	TCCAT	2	10	1987670	1987679	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
160	NC_016026	GATTT	2	10	1992239	1992248	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016026	GCATC	2	10	2053266	2053275	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
162	NC_016026	CTGTC	2	10	2062331	2062340	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
163	NC_016026	GCGCG	2	10	2072509	2072518	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
164	NC_016026	CCACC	2	10	2072580	2072589	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
165	NC_016026	ATTTA	2	10	2073934	2073943	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_016026	ATAAA	2	10	2091488	2091497	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_016026	GTCTT	2	10	2096869	2096878	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
168	NC_016026	ATTTT	2	10	2099841	2099850	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_016026	CCTGT	2	10	2100453	2100462	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
170	NC_016026	GGACC	2	10	2127364	2127373	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
171	NC_016026	AACCG	2	10	2128213	2128222	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
172	NC_016026	TCCCG	2	10	2131117	2131126	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
173	NC_016026	GGGGC	2	10	2158238	2158247	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
174	NC_016026	ATAAG	2	10	2161127	2161136	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
175	NC_016026	CAAAA	2	10	2162298	2162307	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
176	NC_016026	CTGTT	2	10	2164194	2164203	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
177	NC_016026	GCCCC	2	10	2188833	2188842	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
178	NC_016026	ATATT	2	10	2201972	2201981	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_016026	GCCCG	2	10	2235652	2235661	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
180	NC_016026	GGGGA	2	10	2247332	2247341	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
181	NC_016026	GCCCC	2	10	2249120	2249129	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
182	NC_016026	AGAGT	2	10	2253152	2253161	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
183	NC_016026	CTTTT	2	10	2262257	2262266	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
184	NC_016026	ATAAA	2	10	2266301	2266310	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_016026	TTCCC	2	10	2288536	2288545	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
186	NC_016026	GAATA	2	10	2292003	2292012	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
187	NC_016026	CCATC	2	10	2295131	2295140	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
188	NC_016026	GAAGG	2	10	2319066	2319075	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
189	NC_016026	CATGG	2	10	2321779	2321788	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
190	NC_016026	CTTTT	2	10	2321843	2321852	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
191	NC_016026	CCCGC	2	10	2332782	2332791	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
192	NC_016026	GTTTT	2	10	2354070	2354079	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_016026	GAACG	2	10	2356606	2356615	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
194	NC_016026	GGGTG	2	10	2388450	2388459	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
195	NC_016026	CAAAG	2	10	2399430	2399439	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
196	NC_016026	GTTTT	2	10	2417692	2417701	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
197	NC_016026	GGGGA	2	10	2445753	2445762	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
198	NC_016026	GTGCA	2	10	2449437	2449446	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
199	NC_016026	GCATG	2	10	2451487	2451496	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
200	NC_016026	CCAGC	2	10	2453982	2453991	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
201	NC_016026	CGTAG	2	10	2454868	2454877	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
202	NC_016026	AGCGT	2	10	2454894	2454903	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
203	NC_016026	CACCC	2	10	2460843	2460852	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
204	NC_016026	GGAGC	2	10	2467446	2467455	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
205	NC_016026	TTTTC	2	10	2468715	2468724	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.