MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 2

Total Repeats: 795

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016025	GGGTG	2	10	39	48	0 %	20 %	80 %	0 %	347755962
2	NC_016025	TGACC	2	10	249	258	20 %	20 %	20 %	40 %	347755962
3	NC_016025	CCGGC	2	10	319	328	0 %	0 %	40 %	60 %	347755962
4	NC_016025	CGGCG	2	10	1413	1422	0 %	0 %	60 %	40 %	347755964
5	NC_016025	GGCCG	2	10	1803	1812	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016025	GGCCG	2	10	6388	6397	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
7	NC_016025	GGCAG	2	10	9336	9345	20 %	0 %	60 %	20 %	347755969
8	NC_016025	CCCTG	2	10	9802	9811	0 %	20 %	20 %	60 %	347755969
9	NC_016025	AGGGC	2	10	10858	10867	20 %	0 %	60 %	20 %	347755969
10	NC_016025	TGGCC	2	10	11113	11122	0 %	20 %	40 %	40 %	347755969
11	NC_016025	TCGGT	2	10	12909	12918	0 %	40 %	40 %	20 %	347755969
12	NC_016025	GTGGC	2	10	15310	15319	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016025	ACTGC	2	10	15389	15398	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016025	GCCAG	2	10	17875	17884	20 %	0 %	40 %	40 %	347755972
15	NC_016025	TGGCG	2	10	19252	19261	0 %	20 %	60 %	20 %	347755974
16	NC_016025	TGGGA	2	10	20192	20201	20 %	20 %	60 %	0 %	347755975
17	NC_016025	TCCGT	2	10	20609	20618	0 %	40 %	20 %	40 %	347755975
18	NC_016025	GGCGC	2	10	22508	22517	0 %	0 %	60 %	40 %	347755976
19	NC_016025	CGGCG	2	10	24001	24010	0 %	0 %	60 %	40 %	347755978
20	NC_016025	CGACT	2	10	24784	24793	20 %	20 %	20 %	40 %	347755978
21	NC_016025	CGACA	2	10	25691	25700	40 %	0 %	20 %	40 %	347755979
22	NC_016025	CGCGG	2	10	26027	26036	0 %	0 %	60 %	40 %	347755979
23	NC_016025	AAGCC	2	10	27634	27643	40 %	0 %	20 %	40 %	347755981
24	NC_016025	GCTGG	2	10	29237	29246	0 %	20 %	60 %	20 %	347755982
25	NC_016025	GCCAG	2	10	29890	29899	20 %	0 %	40 %	40 %	347755983
26	NC_016025	CACGC	2	10	30513	30522	20 %	0 %	20 %	60 %	347755984
27	NC_016025	GCAAC	2	10	32245	32254	40 %	0 %	20 %	40 %	347755985
28	NC_016025	TCAGC	2	10	32964	32973	20 %	20 %	20 %	40 %	347755986
29	NC_016025	GGGCA	2	10	36888	36897	20 %	0 %	60 %	20 %	347755990
30	NC_016025	ATGGC	2	10	37094	37103	20 %	20 %	40 %	20 %	347755990
31	NC_016025	GTTTT	2	10	37836	37845	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016025	CGGCT	2	10	39112	39121	0 %	20 %	40 %	40 %	347755991
33	NC_016025	TGACC	2	10	40468	40477	20 %	20 %	20 %	40 %	347755991
34	NC_016025	ACGCC	2	10	42493	42502	20 %	0 %	20 %	60 %	347755992
35	NC_016025	CCGGC	2	10	43634	43643	0 %	0 %	40 %	60 %	347755993
36	NC_016025	CCTGG	2	10	44771	44780	0 %	20 %	40 %	40 %	347755993
37	NC_016025	AGCGC	2	10	52142	52151	20 %	0 %	40 %	40 %	347755998
38	NC_016025	GCCAT	2	10	52351	52360	20 %	20 %	20 %	40 %	347755998
39	NC_016025	GCGCG	2	10	53809	53818	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_016025	GACGG	2	10	53931	53940	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016025	CCGTC	2	10	54625	54634	0 %	20 %	20 %	60 %	347756000
42	NC_016025	CTGCG	2	10	55850	55859	0 %	20 %	40 %	40 %	347756000
43	NC_016025	TGGGC	2	10	57624	57633	0 %	20 %	60 %	20 %	347756000
44	NC_016025	GGAAG	2	10	57718	57727	40 %	0 %	60 %	0 %	347756000
45	NC_016025	GCCGG	2	10	58823	58832	0 %	0 %	60 %	40 %	347756000
46	NC_016025	CCTTC	2	10	60440	60449	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
47	NC_016025	TTGAA	2	10	60594	60603	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016025	CGGAA	2	10	61513	61522	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016025	TCACG	2	10	62335	62344	20 %	20 %	20 %	40 %	347756004
50	NC_016025	CGGCG	2	10	68280	68289	0 %	0 %	60 %	40 %	347756007
51	NC_016025	GTGAT	2	10	69815	69824	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016025	ATTCT	2	10	72201	72210	20 %	60 %	0 %	20 %	347756010
53	NC_016025	TCTTT	2	10	74021	74030	0 %	80 %	0 %	20 %	347756012
54	NC_016025	CTGCT	2	10	74705	74714	0 %	40 %	20 %	40 %	347756012
55	NC_016025	GTACA	2	10	75069	75078	40 %	20 %	20 %	20 %	347756013
56	NC_016025	GCCGT	2	10	76127	76136	0 %	20 %	40 %	40 %	347756013
57	NC_016025	GGCGT	2	10	76335	76344	0 %	20 %	60 %	20 %	347756013
58	NC_016025	TGGGG	2	10	77261	77270	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016025	GCGGG	2	10	80206	80215	0 %	0 %	80 %	20 %	347756016
60	NC_016025	CGCCA	2	10	82054	82063	20 %	0 %	20 %	60 %	347756018
61	NC_016025	AGCGC	2	10	82958	82967	20 %	0 %	40 %	40 %	347756018
62	NC_016025	GCCCG	2	10	83772	83781	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
63	NC_016025	GCCCC	2	10	84010	84019	0 %	0 %	20 %	80 %	347756020
64	NC_016025	CGGGA	2	10	84242	84251	20 %	0 %	60 %	20 %	347756020
65	NC_016025	GGTAA	2	10	84802	84811	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016025	TTGGG	2	10	85967	85976	0 %	40 %	60 %	0 %	347756022
67	NC_016025	CCGGG	2	10	87685	87694	0 %	0 %	60 %	40 %	347756024
68	NC_016025	CGGCG	2	10	88969	88978	0 %	0 %	60 %	40 %	347756025
69	NC_016025	CAACC	2	10	90682	90691	40 %	0 %	0 %	60 %	347756026
70	NC_016025	GGCTG	2	10	92994	93003	0 %	20 %	60 %	20 %	347756030
71	NC_016025	CGGCG	2	10	93255	93264	0 %	0 %	60 %	40 %	347756030
72	NC_016025	TGGGC	2	10	93606	93615	0 %	20 %	60 %	20 %	347756030
73	NC_016025	GCCGG	2	10	93750	93759	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
74	NC_016025	CCCCG	2	10	94659	94668	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
75	NC_016025	CTGCG	2	10	97079	97088	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
76	NC_016025	CAGCC	2	10	97741	97750	20 %	0 %	20 %	60 %	347756036
77	NC_016025	GGACG	2	10	98441	98450	20 %	0 %	60 %	20 %	347756036
78	NC_016025	GGTTG	2	10	99116	99125	0 %	40 %	60 %	0 %	347756036
79	NC_016025	AGGTG	2	10	102567	102576	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016025	CGCCA	2	10	102979	102988	20 %	0 %	20 %	60 %	347756038
81	NC_016025	GACCG	2	10	103160	103169	20 %	0 %	40 %	40 %	347756038
82	NC_016025	ATGAG	2	10	106163	106172	40 %	20 %	40 %	0 %	347756041
83	NC_016025	AGCTG	2	10	108523	108532	20 %	20 %	40 %	20 %	347756043
84	NC_016025	GTTCC	2	10	109716	109725	0 %	40 %	20 %	40 %	347756044
85	NC_016025	GCGCG	2	10	109918	109927	0 %	0 %	60 %	40 %	347756045
86	NC_016025	AGTCG	2	10	110854	110863	20 %	20 %	40 %	20 %	347756046
87	NC_016025	CGGCG	2	10	112603	112612	0 %	0 %	60 %	40 %	347756049
88	NC_016025	GTTTT	2	10	112698	112707	0 %	80 %	20 %	0 %	347756049
89	NC_016025	GCCGC	2	10	113970	113979	0 %	0 %	40 %	60 %	347756050
90	NC_016025	GTGCA	2	10	116784	116793	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_016025	TTGGA	2	10	116796	116805	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016025	GGTAA	2	10	118006	118015	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016025	CGGGC	2	10	118930	118939	0 %	0 %	60 %	40 %	347756054
94	NC_016025	CCGTG	2	10	120714	120723	0 %	20 %	40 %	40 %	347756054
95	NC_016025	CGATC	2	10	120927	120936	20 %	20 %	20 %	40 %	347756054
96	NC_016025	TTTGC	2	10	121264	121273	0 %	60 %	20 %	20 %	347756054
97	NC_016025	GTCAC	2	10	123024	123033	20 %	20 %	20 %	40 %	347756055
98	NC_016025	GTTGG	2	10	123158	123167	0 %	40 %	60 %	0 %	347756056
99	NC_016025	CATCG	2	10	127266	127275	20 %	20 %	20 %	40 %	347756058
100	NC_016025	CGAAA	2	10	127610	127619	60 %	0 %	20 %	20 %	347756058
101	NC_016025	TTCCT	2	10	127716	127725	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
102	NC_016025	GTCTT	2	10	129124	129133	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
103	NC_016025	AAGCC	2	10	134266	134275	40 %	0 %	20 %	40 %	347756067
104	NC_016025	CGGCG	2	10	138093	138102	0 %	0 %	60 %	40 %	347756071
105	NC_016025	AAGCC	2	10	138618	138627	40 %	0 %	20 %	40 %	347756072
106	NC_016025	CGGGC	2	10	142360	142369	0 %	0 %	60 %	40 %	347756074
107	NC_016025	GGACA	2	10	142759	142768	40 %	0 %	40 %	20 %	347756074
108	NC_016025	TTTCA	2	10	143620	143629	20 %	60 %	0 %	20 %	347756075
109	NC_016025	CGCCA	2	10	144040	144049	20 %	0 %	20 %	60 %	347756076
110	NC_016025	ACCTC	2	10	146048	146057	20 %	20 %	0 %	60 %	347756078
111	NC_016025	CGGCA	2	10	146686	146695	20 %	0 %	40 %	40 %	347756079
112	NC_016025	TACGG	2	10	152755	152764	20 %	20 %	40 %	20 %	347756086
113	NC_016025	TTCGG	2	10	155048	155057	0 %	40 %	40 %	20 %	347756088
114	NC_016025	GGTCG	2	10	155207	155216	0 %	20 %	60 %	20 %	347756088
115	NC_016025	CAGTT	2	10	158315	158324	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_016025	CGGCT	2	10	158661	158670	0 %	20 %	40 %	40 %	347756089
117	NC_016025	AGAAC	2	10	159452	159461	60 %	0 %	20 %	20 %	347756089
118	NC_016025	AGGCA	2	10	159924	159933	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_016025	CGGCT	2	10	162067	162076	0 %	20 %	40 %	40 %	347756093
120	NC_016025	GTCCA	2	10	166304	166313	20 %	20 %	20 %	40 %	347756095
121	NC_016025	CGGCT	2	10	167369	167378	0 %	20 %	40 %	40 %	347756097
122	NC_016025	AGAGC	2	10	168916	168925	40 %	0 %	40 %	20 %	347756097
123	NC_016025	AGGCA	2	10	170728	170737	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
124	NC_016025	GTCCA	2	10	170944	170953	20 %	20 %	20 %	40 %	347756099
125	NC_016025	TCCAG	2	10	172451	172460	20 %	20 %	20 %	40 %	347756101
126	NC_016025	GGCAA	2	10	176319	176328	40 %	0 %	40 %	20 %	347756103
127	NC_016025	GAGCT	2	10	176433	176442	20 %	20 %	40 %	20 %	347756103
128	NC_016025	GAGCA	2	10	180109	180118	40 %	0 %	40 %	20 %	347756105
129	NC_016025	ACCTG	2	10	180821	180830	20 %	20 %	20 %	40 %	347756105
130	NC_016025	GAAGC	2	10	180892	180901	40 %	0 %	40 %	20 %	347756105
131	NC_016025	GCCAA	2	10	182097	182106	40 %	0 %	20 %	40 %	347756106
132	NC_016025	AGGGA	2	10	182542	182551	40 %	0 %	60 %	0 %	347756106
133	NC_016025	GGCTT	2	10	182716	182725	0 %	40 %	40 %	20 %	347756106
134	NC_016025	GGGAA	2	10	184089	184098	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016025	GCCGC	2	10	184861	184870	0 %	0 %	40 %	60 %	347756109
136	NC_016025	AGCAC	2	10	186072	186081	40 %	0 %	20 %	40 %	347756110
137	NC_016025	GGACA	2	10	187666	187675	40 %	0 %	40 %	20 %	347756110
138	NC_016025	CTGGC	2	10	187717	187726	0 %	20 %	40 %	40 %	347756110
139	NC_016025	CCGAA	2	10	187922	187931	40 %	0 %	20 %	40 %	347756110
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152	NC_016025	CTGAC	2	10	213718	213727	20 %	20 %	20 %	40 %	347756122
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159	NC_016025	GCTCT	2	10	224764	224773	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
160	NC_016025	GTGGA	2	10	225245	225254	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016025	TGGCA	2	10	225313	225322	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
162	NC_016025	TGCTT	2	10	225589	225598	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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233	NC_016025	GCGGT	2	10	324637	324646	0 %	20 %	60 %	20 %	347756220
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241	NC_016025	TAGGT	3	15	334021	334035	20 %	40 %	40 %	0 %	347756228
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243	NC_016025	CAGCC	2	10	335747	335756	20 %	0 %	20 %	60 %	347756230
244	NC_016025	CCGCC	2	10	337178	337187	0 %	0 %	20 %	80 %	347756233
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249	NC_016025	GCCAC	2	10	340288	340297	20 %	0 %	20 %	60 %	347756236
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251	NC_016025	CAGAA	2	10	342357	342366	60 %	0 %	20 %	20 %	347756237
252	NC_016025	GCACG	2	10	342679	342688	20 %	0 %	40 %	40 %	347756237
253	NC_016025	ACGCA	2	10	343448	343457	40 %	0 %	20 %	40 %	347756237
254	NC_016025	CGGGC	2	10	345360	345369	0 %	0 %	60 %	40 %	347756238
255	NC_016025	CCGGG	2	10	345380	345389	0 %	0 %	60 %	40 %	347756238
256	NC_016025	AAGGG	2	10	345765	345774	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
257	NC_016025	CCGCG	2	10	346093	346102	0 %	0 %	40 %	60 %	347756239
258	NC_016025	CTGGT	2	10	346560	346569	0 %	40 %	40 %	20 %	347756240
259	NC_016025	CCAAA	2	10	346645	346654	60 %	0 %	0 %	40 %	347756240
260	NC_016025	CGGCA	2	10	347622	347631	20 %	0 %	40 %	40 %	347756241
261	NC_016025	GTTTT	2	10	350026	350035	0 %	80 %	20 %	0 %	347756244
262	NC_016025	GCCGG	2	10	350218	350227	0 %	0 %	60 %	40 %	347756244
263	NC_016025	GCTGG	2	10	350732	350741	0 %	20 %	60 %	20 %	347756244
264	NC_016025	GCCTT	2	10	351274	351283	0 %	40 %	20 %	40 %	347756246
265	NC_016025	GCCCC	2	10	353137	353146	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
266	NC_016025	AAAGC	2	10	353380	353389	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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397	NC_016025	GTTGG	2	10	514686	514695	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_016025	GAAGC	2	10	516752	516761	40 %	0 %	40 %	20 %	347756383
400	NC_016025	CCTGA	2	10	517561	517570	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
401	NC_016025	GGACG	2	10	521176	521185	20 %	0 %	60 %	20 %	347756387
402	NC_016025	GTCAG	2	10	521371	521380	20 %	20 %	40 %	20 %	347756387
403	NC_016025	TAACG	2	10	522884	522893	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
404	NC_016025	GGCCG	2	10	522901	522910	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
405	NC_016025	CGAAG	2	10	524106	524115	40 %	0 %	40 %	20 %	347756390
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430	NC_016025	CCGGG	2	10	564674	564683	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
431	NC_016025	GCCCA	2	10	565480	565489	20 %	0 %	20 %	60 %	347756418
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