MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 2

Total Repeats: 2833

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016025	GCTG	2	8	330	337	0 %	25 %	50 %	25 %	347755962
2	NC_016025	AAGC	2	8	814	821	50 %	0 %	25 %	25 %	347755964
3	NC_016025	CGCC	3	12	846	857	0 %	0 %	25 %	75 %	347755964
4	NC_016025	GGCC	2	8	1464	1471	0 %	0 %	50 %	50 %	347755964
5	NC_016025	GAGG	2	8	1499	1506	25 %	0 %	75 %	0 %	347755964
6	NC_016025	GCCG	2	8	1543	1550	0 %	0 %	50 %	50 %	347755964
7	NC_016025	GCGG	2	8	1657	1664	0 %	0 %	75 %	25 %	347755964
8	NC_016025	GCCG	2	8	1919	1926	0 %	0 %	50 %	50 %	347755965
9	NC_016025	GCCG	2	8	2119	2126	0 %	0 %	50 %	50 %	347755965
10	NC_016025	GGCC	2	8	2339	2346	0 %	0 %	50 %	50 %	347755965
11	NC_016025	CGAG	2	8	2491	2498	25 %	0 %	50 %	25 %	347755965
12	NC_016025	CCGT	2	8	2553	2560	0 %	25 %	25 %	50 %	347755965
13	NC_016025	CTGG	2	8	2719	2726	0 %	25 %	50 %	25 %	347755965
14	NC_016025	TGGA	2	8	2859	2866	25 %	25 %	50 %	0 %	347755965
15	NC_016025	GAAG	2	8	3800	3807	50 %	0 %	50 %	0 %	347755965
16	NC_016025	CGTC	2	8	4714	4721	0 %	25 %	25 %	50 %	347755965
17	NC_016025	CTGG	2	8	4748	4755	0 %	25 %	50 %	25 %	347755965
18	NC_016025	GCCT	2	8	5263	5270	0 %	25 %	25 %	50 %	347755966
19	NC_016025	TCGT	2	8	5664	5671	0 %	50 %	25 %	25 %	347755966
20	NC_016025	CTGA	2	8	5708	5715	25 %	25 %	25 %	25 %	347755966
21	NC_016025	CTGC	2	8	6141	6148	0 %	25 %	25 %	50 %	347755966
22	NC_016025	CCGT	2	8	6315	6322	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016025	TGCG	2	8	6805	6812	0 %	25 %	50 %	25 %	347755967
24	NC_016025	GGGC	2	8	7185	7192	0 %	0 %	75 %	25 %	347755967
25	NC_016025	TGCC	2	8	7591	7598	0 %	25 %	25 %	50 %	347755968
26	NC_016025	CGGT	2	8	8587	8594	0 %	25 %	50 %	25 %	347755968
27	NC_016025	GCTT	2	8	8660	8667	0 %	50 %	25 %	25 %	347755968
28	NC_016025	TGAA	2	8	8710	8717	50 %	25 %	25 %	0 %	347755968
29	NC_016025	CCGG	2	8	8946	8953	0 %	0 %	50 %	50 %	347755968
30	NC_016025	TGCG	2	8	9459	9466	0 %	25 %	50 %	25 %	347755969
31	NC_016025	GCCG	2	8	9545	9552	0 %	0 %	50 %	50 %	347755969
32	NC_016025	GCCG	2	8	9740	9747	0 %	0 %	50 %	50 %	347755969
33	NC_016025	CCAG	2	8	10060	10067	25 %	0 %	25 %	50 %	347755969
34	NC_016025	GTCC	2	8	10151	10158	0 %	25 %	25 %	50 %	347755969
35	NC_016025	CGGT	2	8	10575	10582	0 %	25 %	50 %	25 %	347755969
36	NC_016025	GGAA	2	8	10803	10810	50 %	0 %	50 %	0 %	347755969
37	NC_016025	CGGT	2	8	11217	11224	0 %	25 %	50 %	25 %	347755969
38	NC_016025	CGGC	2	8	11860	11867	0 %	0 %	50 %	50 %	347755969
39	NC_016025	CGGT	2	8	12060	12067	0 %	25 %	50 %	25 %	347755969
40	NC_016025	GTCT	2	8	12401	12408	0 %	50 %	25 %	25 %	347755969
41	NC_016025	ACGG	2	8	12925	12932	25 %	0 %	50 %	25 %	347755969
42	NC_016025	GCCG	2	8	13313	13320	0 %	0 %	50 %	50 %	347755969
43	NC_016025	GGCG	2	8	13348	13355	0 %	0 %	75 %	25 %	347755969
44	NC_016025	CGGT	2	8	13398	13405	0 %	25 %	50 %	25 %	347755969
45	NC_016025	CTGG	2	8	14588	14595	0 %	25 %	50 %	25 %	347755969
46	NC_016025	GGCG	2	8	14734	14741	0 %	0 %	75 %	25 %	347755969
47	NC_016025	GCCG	2	8	15074	15081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016025	CAAA	2	8	15176	15183	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016025	CATC	2	8	15733	15740	25 %	25 %	0 %	50 %	347755970
50	NC_016025	GACG	2	8	16048	16055	25 %	0 %	50 %	25 %	347755970
51	NC_016025	ATCC	2	8	16212	16219	25 %	25 %	0 %	50 %	347755970
52	NC_016025	AGCC	2	8	16589	16596	25 %	0 %	25 %	50 %	347755970
53	NC_016025	CATC	2	8	17428	17435	25 %	25 %	0 %	50 %	347755971
54	NC_016025	TCAT	2	8	17845	17852	25 %	50 %	0 %	25 %	347755972
55	NC_016025	CTTT	2	8	18790	18797	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016025	CGTG	2	8	19617	19624	0 %	25 %	50 %	25 %	347755975
57	NC_016025	GGTG	2	8	19626	19633	0 %	25 %	75 %	0 %	347755975
58	NC_016025	GCTG	2	8	20514	20521	0 %	25 %	50 %	25 %	347755975
59	NC_016025	CTGA	2	8	20935	20942	25 %	25 %	25 %	25 %	347755976
60	NC_016025	GATG	2	8	21453	21460	25 %	25 %	50 %	0 %	347755976
61	NC_016025	GCTG	2	8	21840	21847	0 %	25 %	50 %	25 %	347755976
62	NC_016025	CCGG	2	8	22084	22091	0 %	0 %	50 %	50 %	347755976
63	NC_016025	GCGG	2	8	22869	22876	0 %	0 %	75 %	25 %	347755976
64	NC_016025	TGGG	2	8	23080	23087	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016025	GCGG	2	8	23107	23114	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016025	GAAG	2	8	23371	23378	50 %	0 %	50 %	0 %	347755977
67	NC_016025	TGAA	2	8	23879	23886	50 %	25 %	25 %	0 %	347755977
68	NC_016025	GCCT	2	8	24667	24674	0 %	25 %	25 %	50 %	347755978
69	NC_016025	GTCC	2	8	25129	25136	0 %	25 %	25 %	50 %	347755978
70	NC_016025	GGCG	2	8	25299	25306	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016025	CCGG	2	8	25587	25594	0 %	0 %	50 %	50 %	347755979
72	NC_016025	AGCC	2	8	25893	25900	25 %	0 %	25 %	50 %	347755979
73	NC_016025	GCCC	2	8	25990	25997	0 %	0 %	25 %	75 %	347755979
74	NC_016025	CGTC	2	8	26331	26338	0 %	25 %	25 %	50 %	347755979
75	NC_016025	CGCC	2	8	26426	26433	0 %	0 %	25 %	75 %	347755980
76	NC_016025	CCCT	2	8	26833	26840	0 %	25 %	0 %	75 %	347755980
77	NC_016025	GGCC	2	8	27809	27816	0 %	0 %	50 %	50 %	347755981
78	NC_016025	CCGC	2	8	28259	28266	0 %	0 %	25 %	75 %	347755981
79	NC_016025	CCGG	2	8	28458	28465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016025	CTGG	2	8	28661	28668	0 %	25 %	50 %	25 %	347755982
81	NC_016025	GCCG	2	8	29267	29274	0 %	0 %	50 %	50 %	347755982
82	NC_016025	ATGC	2	8	30108	30115	25 %	25 %	25 %	25 %	347755983
83	NC_016025	TGAA	2	8	30149	30156	50 %	25 %	25 %	0 %	347755983
84	NC_016025	GCCA	2	8	30316	30323	25 %	0 %	25 %	50 %	347755984
85	NC_016025	CCTG	2	8	30325	30332	0 %	25 %	25 %	50 %	347755984
86	NC_016025	ACCA	2	8	30479	30486	50 %	0 %	0 %	50 %	347755984
87	NC_016025	CGGC	2	8	30528	30535	0 %	0 %	50 %	50 %	347755984
88	NC_016025	CCGG	2	8	30788	30795	0 %	0 %	50 %	50 %	347755984
89	NC_016025	CGTA	2	8	30961	30968	25 %	25 %	25 %	25 %	347755984
90	NC_016025	TGGG	2	8	31185	31192	0 %	25 %	75 %	0 %	347755985
91	NC_016025	CCTG	2	8	31209	31216	0 %	25 %	25 %	50 %	347755985
92	NC_016025	GCCG	2	8	31261	31268	0 %	0 %	50 %	50 %	347755985
93	NC_016025	CACC	2	8	31293	31300	25 %	0 %	0 %	75 %	347755985
94	NC_016025	AGCC	2	8	31371	31378	25 %	0 %	25 %	50 %	347755985
95	NC_016025	GCCG	2	8	31909	31916	0 %	0 %	50 %	50 %	347755985
96	NC_016025	CAGC	2	8	32640	32647	25 %	0 %	25 %	50 %	347755986
97	NC_016025	GTTG	2	8	33542	33549	0 %	50 %	50 %	0 %	347755987
98	NC_016025	TGGT	2	8	34118	34125	0 %	50 %	50 %	0 %	347755987
99	NC_016025	GTTC	2	8	34130	34137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016025	CCGG	2	8	34430	34437	0 %	0 %	50 %	50 %	347755988
101	NC_016025	GAAA	2	8	34525	34532	75 %	0 %	25 %	0 %	347755988
102	NC_016025	ACGT	2	8	34552	34559	25 %	25 %	25 %	25 %	347755988
103	NC_016025	GCGG	2	8	34583	34590	0 %	0 %	75 %	25 %	347755988
104	NC_016025	CGGG	2	8	34827	34834	0 %	0 %	75 %	25 %	347755988
105	NC_016025	GGCA	2	8	34889	34896	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016025	CCAG	2	8	35295	35302	25 %	0 %	25 %	50 %	347755989
107	NC_016025	AAAC	2	8	35616	35623	75 %	0 %	0 %	25 %	347755989
108	NC_016025	AAGC	2	8	36377	36384	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016025	GCCG	2	8	36540	36547	0 %	0 %	50 %	50 %	347755990
110	NC_016025	CCAG	2	8	37049	37056	25 %	0 %	25 %	50 %	347755990
111	NC_016025	AGCC	2	8	37074	37081	25 %	0 %	25 %	50 %	347755990
112	NC_016025	GCCA	2	8	37648	37655	25 %	0 %	25 %	50 %	347755990
113	NC_016025	TCAG	2	8	37963	37970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016025	AGCC	2	8	38096	38103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016025	CCCG	2	8	38598	38605	0 %	0 %	25 %	75 %	347755991
116	NC_016025	CGGC	2	8	38688	38695	0 %	0 %	50 %	50 %	347755991
117	NC_016025	CCGG	2	8	38742	38749	0 %	0 %	50 %	50 %	347755991
118	NC_016025	ACCG	2	8	40427	40434	25 %	0 %	25 %	50 %	347755991
119	NC_016025	CAAC	2	8	40921	40928	50 %	0 %	0 %	50 %	347755991
120	NC_016025	CGGG	2	8	41010	41017	0 %	0 %	75 %	25 %	347755991
121	NC_016025	GCCG	2	8	41018	41025	0 %	0 %	50 %	50 %	347755991
122	NC_016025	TCCG	2	8	41329	41336	0 %	25 %	25 %	50 %	347755991
123	NC_016025	ACTC	2	8	41593	41600	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016025	GCTG	2	8	41682	41689	0 %	25 %	50 %	25 %	347755992
125	NC_016025	TCCG	2	8	41767	41774	0 %	25 %	25 %	50 %	347755992
126	NC_016025	GGCG	2	8	42774	42781	0 %	0 %	75 %	25 %	347755992
127	NC_016025	GATG	2	8	43073	43080	25 %	25 %	50 %	0 %	347755992
128	NC_016025	CGGG	2	8	43154	43161	0 %	0 %	75 %	25 %	347755992
129	NC_016025	CAAC	2	8	44101	44108	50 %	0 %	0 %	50 %	347755993
130	NC_016025	GACG	2	8	44205	44212	25 %	0 %	50 %	25 %	347755993
131	NC_016025	GGAC	2	8	44216	44223	25 %	0 %	50 %	25 %	347755993
132	NC_016025	CTGG	2	8	44612	44619	0 %	25 %	50 %	25 %	347755993
133	NC_016025	GCTG	2	8	44707	44714	0 %	25 %	50 %	25 %	347755993
134	NC_016025	CCGG	2	8	44822	44829	0 %	0 %	50 %	50 %	347755993
135	NC_016025	GCCG	2	8	45629	45636	0 %	0 %	50 %	50 %	347755993
136	NC_016025	TGCC	2	8	45693	45700	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016025	CGGC	2	8	46087	46094	0 %	0 %	50 %	50 %	347755994
138	NC_016025	TTCA	2	8	46295	46302	25 %	50 %	0 %	25 %	347755994
139	NC_016025	CTCC	2	8	46513	46520	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_016025	GGCC	2	8	47497	47504	0 %	0 %	50 %	50 %	347755995
141	NC_016025	GGGT	2	8	47732	47739	0 %	25 %	75 %	0 %	347755995
142	NC_016025	AGGT	2	8	48386	48393	25 %	25 %	50 %	0 %	347755995
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