MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 2

Total Repeats: 261

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016025	GT	3	6	4988	4993	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016025	CG	3	6	6264	6269	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016025	GC	3	6	17292	17297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016025	GC	3	6	17307	17312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016025	TG	3	6	17797	17802	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016025	TG	3	6	20865	20870	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016025	GC	3	6	25316	25321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016025	GC	3	6	27034	27039	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016025	TG	3	6	38162	38167	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016025	CG	3	6	38269	38274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016025	GT	3	6	38286	38291	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016025	CG	3	6	45740	45745	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016025	CG	3	6	54104	54109	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016025	GC	3	6	54197	54202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016025	TC	3	6	59020	59025	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016025	AG	3	6	61061	61066	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016025	TC	3	6	61142	61147	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016025	AC	3	6	65834	65839	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016025	GA	3	6	76716	76721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016025	GC	3	6	77209	77214	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016025	AC	4	8	77808	77815	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016025	GA	3	6	77868	77873	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016025	AT	4	8	78074	78081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016025	AT	3	6	78272	78277	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016025	AT	3	6	78282	78287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016025	GA	3	6	78324	78329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016025	CA	3	6	88130	88135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016025	CT	3	6	89507	89512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016025	GA	3	6	89529	89534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016025	AC	3	6	93744	93749	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016025	TG	3	6	95437	95442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016025	GC	3	6	103546	103551	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016025	CA	3	6	104903	104908	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016025	GC	3	6	114802	114807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016025	TG	3	6	118020	118025	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016025	GC	3	6	135306	135311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016025	TG	3	6	135922	135927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016025	GA	3	6	137110	137115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016025	GC	3	6	158292	158297	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016025	TC	3	6	158298	158303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016025	GT	3	6	159944	159949	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016025	CA	3	6	160972	160977	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016025	CA	3	6	161860	161865	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016025	GT	3	6	170748	170753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016025	CG	3	6	182889	182894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016025	AG	3	6	183241	183246	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016025	AC	3	6	183835	183840	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016025	GC	5	10	192868	192877	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016025	CG	3	6	193039	193044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016025	TG	3	6	193061	193066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016025	GC	3	6	193072	193077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016025	CG	3	6	194020	194025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016025	GC	4	8	194081	194088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016025	GC	3	6	194108	194113	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016025	GC	3	6	216475	216480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016025	CA	3	6	218516	218521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016025	GC	3	6	218529	218534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016025	GC	3	6	218551	218556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016025	GT	4	8	219177	219184	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016025	GA	3	6	224234	224239	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016025	GA	3	6	224735	224740	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016025	CT	3	6	231225	231230	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016025	TG	3	6	233922	233927	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016025	CG	3	6	246035	246040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016025	GT	3	6	248832	248837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016025	AC	3	6	281608	281613	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016025	TG	3	6	284734	284739	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016025	GC	3	6	297134	297139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016025	GT	3	6	303701	303706	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016025	GT	3	6	308256	308261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016025	CA	3	6	310380	310385	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016025	AC	3	6	316777	316782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016025	TG	3	6	349764	349769	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016025	CA	3	6	353178	353183	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016025	CT	4	8	353296	353303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016025	TC	3	6	353575	353580	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016025	TG	3	6	353838	353843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016025	AG	3	6	363979	363984	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016025	GC	3	6	364076	364081	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016025	CA	3	6	373486	373491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016025	AC	3	6	379260	379265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016025	CA	3	6	384413	384418	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016025	TG	3	6	389786	389791	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016025	TG	3	6	389881	389886	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016025	AG	3	6	390018	390023	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016025	CG	3	6	391932	391937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016025	GT	3	6	401517	401522	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016025	TG	3	6	403326	403331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016025	GC	3	6	403350	403355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_016025	AC	3	6	408440	408445	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016025	CA	3	6	422551	422556	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016025	CG	3	6	422701	422706	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016025	TG	3	6	423095	423100	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016025	CG	3	6	423370	423375	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016025	AC	3	6	423436	423441	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016025	AT	3	6	425153	425158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016025	GA	3	6	425789	425794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016025	GC	3	6	426011	426016	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016025	AC	3	6	426097	426102	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016025	CG	3	6	427962	427967	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016025	CT	3	6	428115	428120	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016025	GA	3	6	428174	428179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016025	GC	3	6	459398	459403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016025	GC	3	6	459439	459444	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016025	GC	3	6	463993	463998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016025	TC	3	6	464930	464935	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016025	TG	3	6	465138	465143	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016025	CA	3	6	470661	470666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016025	AC	3	6	472716	472721	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016025	CG	3	6	472830	472835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016025	AC	3	6	476139	476144	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016025	CG	3	6	476241	476246	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016025	GC	3	6	497451	497456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016025	CA	5	10	500207	500216	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016025	CG	3	6	501690	501695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016025	GC	3	6	505592	505597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016025	CA	3	6	511271	511276	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016025	CG	3	6	517460	517465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016025	CG	4	8	517571	517578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016025	GC	3	6	519140	519145	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016025	GC	3	6	521100	521105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016025	CG	3	6	521121	521126	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016025	CA	3	6	524076	524081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016025	TA	3	6	530344	530349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016025	CA	3	6	530486	530491	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016025	GA	3	6	530960	530965	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016025	CA	4	8	556571	556578	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016025	GC	3	6	557350	557355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016025	GT	3	6	559155	559160	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016025	AG	3	6	559848	559853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016025	GA	3	6	561049	561054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016025	AG	3	6	563277	563282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016025	TC	3	6	564765	564770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016025	AT	3	6	567080	567085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016025	CG	4	8	572355	572362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016025	GT	3	6	574632	574637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016025	CG	3	6	575678	575683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016025	CG	3	6	575695	575700	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016025	CT	3	6	578012	578017	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016025	TC	3	6	585033	585038	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016025	TG	3	6	585241	585246	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016025	CT	5	10	586397	586406	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016025	CT	3	6	587221	587226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_016025	GC	3	6	590611	590616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016025	GT	3	6	600094	600099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016025	GT	3	6	601847	601852	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016025	GA	3	6	602330	602335	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016025	TG	3	6	602396	602401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016025	GC	3	6	603340	603345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_016025	GT	3	6	604329	604334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016025	GC	3	6	608802	608807	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_016025	AC	3	6	611414	611419	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_016025	TC	3	6	611439	611444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_016025	CA	3	6	611968	611973	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.