MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016024	GTGCTG	2	12	159534	159545	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016024	CGCCAG	2	12	166624	166635	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016024	ACCGGT	2	12	218921	218932	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016024	AACGTA	2	12	240808	240819	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016024	TTCTTG	2	12	256022	256033	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016024	CGGCTG	2	12	311554	311565	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016024	CAGCCA	2	12	313170	313181	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016024	AAGGTG	2	12	407890	407901	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016024	GCCGGC	2	12	446438	446449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016024	ATGCTC	2	12	476055	476066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016024	GGGAAC	2	12	549847	549858	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016024	GCCTAT	2	12	560504	560515	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016024	AAGGGC	2	12	733205	733216	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016024	ACTTCC	2	12	766241	766252	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016024	GAAAAA	2	12	815200	815211	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016024	GCTAAC	2	12	815244	815255	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016024	CTGGTT	2	12	875370	875381	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_016024	AGAAGC	2	12	876108	876119	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016024	TTTTGG	2	12	998987	998998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016024	TGTTTT	2	12	1021930	1021941	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016024	GCAATA	3	18	1106485	1106502	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016024	GGGAAA	2	12	1120899	1120910	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016024	GGTTGG	2	12	1169737	1169748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016024	GGGCCA	2	12	1240198	1240209	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016024	TTGCTG	2	12	1243927	1243938	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016024	TTTCAG	2	12	1271669	1271680	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016024	ACGCTC	2	12	1282487	1282498	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016024	GACGGT	2	12	1287387	1287398	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016024	GGTTCT	2	12	1295433	1295444	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016024	CCACTG	2	12	1311102	1311113	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016024	TTTTTG	2	12	1443223	1443234	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016024	AACCTG	2	12	1464697	1464708	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016024	TGGCTC	2	12	1470694	1470705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016024	CTGCCC	2	12	1600684	1600695	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_016024	AAATGA	2	12	1615819	1615830	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016024	GAACCA	2	12	1665976	1665987	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016024	TTCTTG	2	12	1667311	1667322	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016024	GGCAAC	2	12	1762446	1762457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016024	GGGCAG	2	12	1763691	1763702	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016024	CCAACA	2	12	1775232	1775243	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016024	TTTGAT	2	12	1775384	1775395	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016024	GCATCA	2	12	1778495	1778506	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016024	AGGCGA	2	12	1786804	1786815	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016024	TGCCTT	2	12	1786973	1786984	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016024	AAGGCA	2	12	1844887	1844898	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016024	TGACAC	2	12	1848684	1848695	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016024	CGCTAT	2	12	1906379	1906390	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016024	CAAAAT	2	12	1906407	1906418	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016024	GCCAGG	2	12	1919391	1919402	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016024	TCAACG	2	12	1959363	1959374	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016024	CTATAG	2	12	1984712	1984723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016024	CTTTTA	2	12	1984780	1984791	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016024	ACTTTC	2	12	2184482	2184493	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016024	CTCTGG	2	12	2222523	2222534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016024	GCAGCC	2	12	2234930	2234941	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016024	AAAGCC	2	12	2244774	2244785	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016024	TGACCA	2	12	2344891	2344902	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016024	CCTTTT	2	12	2427441	2427452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016024	CCACGG	2	12	2488146	2488157	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016024	GAATGC	2	12	2488871	2488882	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016024	GATGGC	2	12	2528932	2528943	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016024	CGGATG	2	12	2610010	2610021	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016024	TCTGCG	2	12	2644440	2644451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.