MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Chloracidobacterium thermophilum B chromosome chromosome 1

Total Repeats: 1734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016024	GTCGC	2	10	5383	5392	0 %	20 %	40 %	40 %	347753736
2	NC_016024	CAACC	2	10	7757	7766	40 %	0 %	0 %	60 %	347753739
3	NC_016024	CGGCC	2	10	11454	11463	0 %	0 %	40 %	60 %	347753743
4	NC_016024	TGCTT	2	10	12396	12405	0 %	60 %	20 %	20 %	347753744
5	NC_016024	CCACG	2	10	13148	13157	20 %	0 %	20 %	60 %	347753744
6	NC_016024	TCATT	2	10	13931	13940	20 %	60 %	0 %	20 %	347753745
7	NC_016024	TTCCG	2	10	15201	15210	0 %	40 %	20 %	40 %	347753747
8	NC_016024	GGCGC	2	10	18048	18057	0 %	0 %	60 %	40 %	347753748
9	NC_016024	ATGTC	2	10	18955	18964	20 %	40 %	20 %	20 %	347753748
10	NC_016024	CTGGC	2	10	21129	21138	0 %	20 %	40 %	40 %	347753752
11	NC_016024	CTCGG	2	10	22995	23004	0 %	20 %	40 %	40 %	347753753
12	NC_016024	TGCCC	2	10	24627	24636	0 %	20 %	20 %	60 %	347753754
13	NC_016024	CGACC	2	10	26449	26458	20 %	0 %	20 %	60 %	347753756
14	NC_016024	GCCCG	2	10	29743	29752	0 %	0 %	40 %	60 %	347753758
15	NC_016024	GCAGC	2	10	30172	30181	20 %	0 %	40 %	40 %	347753758
16	NC_016024	TGGAC	2	10	32281	32290	20 %	20 %	40 %	20 %	347753760
17	NC_016024	CGGTG	2	10	33039	33048	0 %	20 %	60 %	20 %	347753761
18	NC_016024	GGTGT	2	10	34270	34279	0 %	40 %	60 %	0 %	347753761
19	NC_016024	GTTGG	2	10	35325	35334	0 %	40 %	60 %	0 %	347753763
20	NC_016024	TTGGA	2	10	37030	37039	20 %	40 %	40 %	0 %	347753763
21	NC_016024	TTGCC	2	10	37828	37837	0 %	40 %	20 %	40 %	347753765
22	NC_016024	ACTGC	2	10	39157	39166	20 %	20 %	20 %	40 %	347753766
23	NC_016024	GCCTC	2	10	41396	41405	0 %	20 %	20 %	60 %	347753766
24	NC_016024	CGGGC	2	10	41565	41574	0 %	0 %	60 %	40 %	347753766
25	NC_016024	CCACA	2	10	45040	45049	40 %	0 %	0 %	60 %	347753768
26	NC_016024	CGCGG	2	10	51558	51567	0 %	0 %	60 %	40 %	347753773
27	NC_016024	GCCTT	2	10	54050	54059	0 %	40 %	20 %	40 %	347753776
28	NC_016024	GGTCG	2	10	55827	55836	0 %	20 %	60 %	20 %	347753777
29	NC_016024	ACCAT	2	10	56722	56731	40 %	20 %	0 %	40 %	347753778
30	NC_016024	GGGAA	2	10	58832	58841	40 %	0 %	60 %	0 %	347753778
31	NC_016024	GCGCC	2	10	60922	60931	0 %	0 %	40 %	60 %	347753781
32	NC_016024	ATGGA	2	10	62558	62567	40 %	20 %	40 %	0 %	347753782
33	NC_016024	GAAGA	2	10	63433	63442	60 %	0 %	40 %	0 %	347753782
34	NC_016024	CAAGC	2	10	63683	63692	40 %	0 %	20 %	40 %	347753783
35	NC_016024	GGGAC	2	10	72743	72752	20 %	0 %	60 %	20 %	347753789
36	NC_016024	GTCAT	2	10	72780	72789	20 %	40 %	20 %	20 %	347753789
37	NC_016024	CGGGC	2	10	73294	73303	0 %	0 %	60 %	40 %	347753789
38	NC_016024	TGCTT	2	10	74954	74963	0 %	60 %	20 %	20 %	347753790
39	NC_016024	GAAGC	2	10	75670	75679	40 %	0 %	40 %	20 %	347753792
40	NC_016024	CATTC	2	10	76131	76140	20 %	40 %	0 %	40 %	347753792
41	NC_016024	GGTCG	2	10	76782	76791	0 %	20 %	60 %	20 %	347753793
42	NC_016024	CGGGA	2	10	77730	77739	20 %	0 %	60 %	20 %	347753794
43	NC_016024	GCCGC	2	10	79041	79050	0 %	0 %	40 %	60 %	347753794
44	NC_016024	CAGCC	2	10	81360	81369	20 %	0 %	20 %	60 %	347753797
45	NC_016024	GCAGC	2	10	82497	82506	20 %	0 %	40 %	40 %	347753798
46	NC_016024	GTCGG	2	10	84833	84842	0 %	20 %	60 %	20 %	347753800
47	NC_016024	ATCGC	2	10	85218	85227	20 %	20 %	20 %	40 %	347753801
48	NC_016024	CCGCG	2	10	85864	85873	0 %	0 %	40 %	60 %	347753801
49	NC_016024	AGGGA	2	10	87492	87501	40 %	0 %	60 %	0 %	347753803
50	NC_016024	CAAGC	2	10	88004	88013	40 %	0 %	20 %	40 %	347753803
51	NC_016024	GTCGG	2	10	89151	89160	0 %	20 %	60 %	20 %	347753805
52	NC_016024	CCAGA	2	10	92927	92936	40 %	0 %	20 %	40 %	347753808
53	NC_016024	TGACC	2	10	96060	96069	20 %	20 %	20 %	40 %	347753810
54	NC_016024	CTCAT	2	10	98151	98160	20 %	40 %	0 %	40 %	347753811
55	NC_016024	GGAGG	2	10	98402	98411	20 %	0 %	80 %	0 %	347753811
56	NC_016024	GTGGG	2	10	98432	98441	0 %	20 %	80 %	0 %	347753811
57	NC_016024	TCGGC	2	10	98644	98653	0 %	20 %	40 %	40 %	347753811
58	NC_016024	CTCAT	2	10	99958	99967	20 %	40 %	0 %	40 %	347753812
59	NC_016024	GGAGG	2	10	100209	100218	20 %	0 %	80 %	0 %	347753812
60	NC_016024	GTGGG	2	10	100239	100248	0 %	20 %	80 %	0 %	347753812
61	NC_016024	GTGGC	2	10	101435	101444	0 %	20 %	60 %	20 %	347753813
62	NC_016024	GGATG	2	10	111058	111067	20 %	20 %	60 %	0 %	347753817
63	NC_016024	GAGAT	2	10	113163	113172	40 %	20 %	40 %	0 %	347753819
64	NC_016024	CGGCG	2	10	114296	114305	0 %	0 %	60 %	40 %	347753820
65	NC_016024	CGACA	2	10	114774	114783	40 %	0 %	20 %	40 %	347753820
66	NC_016024	TGGTC	2	10	116210	116219	0 %	40 %	40 %	20 %	347753821
67	NC_016024	CGGCC	2	10	120105	120114	0 %	0 %	40 %	60 %	347753823
68	NC_016024	GAAGA	2	10	120453	120462	60 %	0 %	40 %	0 %	347753823
69	NC_016024	GGCCT	2	10	121267	121276	0 %	20 %	40 %	40 %	347753824
70	NC_016024	CACGC	2	10	124003	124012	20 %	0 %	20 %	60 %	347753826
71	NC_016024	GCAAA	2	10	124597	124606	60 %	0 %	20 %	20 %	347753826
72	NC_016024	TGGTG	2	10	124934	124943	0 %	40 %	60 %	0 %	347753826
73	NC_016024	CCTTC	2	10	126259	126268	0 %	40 %	0 %	60 %	347753827
74	NC_016024	GTTCA	2	10	128018	128027	20 %	40 %	20 %	20 %	347753828
75	NC_016024	TTCGA	2	10	130745	130754	20 %	40 %	20 %	20 %	347753831
76	NC_016024	ACACC	2	10	132337	132346	40 %	0 %	0 %	60 %	347753833
77	NC_016024	TCGGT	2	10	132772	132781	0 %	40 %	40 %	20 %	347753833
78	NC_016024	GCCCG	2	10	134108	134117	0 %	0 %	40 %	60 %	347753834
79	NC_016024	CATGC	2	10	135112	135121	20 %	20 %	20 %	40 %	347753835
80	NC_016024	GCCGC	2	10	138818	138827	0 %	0 %	40 %	60 %	347753838
81	NC_016024	GTCAG	2	10	142597	142606	20 %	20 %	40 %	20 %	347753841
82	NC_016024	CCTGG	2	10	146251	146260	0 %	20 %	40 %	40 %	347753844
83	NC_016024	GATTC	2	10	157255	157264	20 %	40 %	20 %	20 %	347753852
84	NC_016024	CGGTG	2	10	157404	157413	0 %	20 %	60 %	20 %	347753852
85	NC_016024	GTGAT	2	10	161008	161017	20 %	40 %	40 %	0 %	347753855
86	NC_016024	CGCGC	2	10	163755	163764	0 %	0 %	40 %	60 %	347753859
87	NC_016024	ACCGG	2	10	166851	166860	20 %	0 %	40 %	40 %	347753863
88	NC_016024	TCCGC	2	10	167108	167117	0 %	20 %	20 %	60 %	347753863
89	NC_016024	TGGTG	2	10	169604	169613	0 %	40 %	60 %	0 %	347753864
90	NC_016024	GTTCG	2	10	174914	174923	0 %	40 %	40 %	20 %	347753869
91	NC_016024	AGGCG	2	10	176046	176055	20 %	0 %	60 %	20 %	347753870
92	NC_016024	GGCTG	2	10	177064	177073	0 %	20 %	60 %	20 %	347753871
93	NC_016024	CGGCG	2	10	177758	177767	0 %	0 %	60 %	40 %	347753872
94	NC_016024	AATGG	2	10	179182	179191	40 %	20 %	40 %	0 %	347753873
95	NC_016024	ATGGC	2	10	181218	181227	20 %	20 %	40 %	20 %	347753874
96	NC_016024	GGGCT	2	10	181787	181796	0 %	20 %	60 %	20 %	347753874
97	NC_016024	GCCGG	2	10	182191	182200	0 %	0 %	60 %	40 %	347753874
98	NC_016024	GCAAT	2	10	184329	184338	40 %	20 %	20 %	20 %	347753876
99	NC_016024	AGGGC	2	10	186917	186926	20 %	0 %	60 %	20 %	347753880
100	NC_016024	CAGCG	2	10	187095	187104	20 %	0 %	40 %	40 %	347753880
101	NC_016024	CACCT	2	10	187299	187308	20 %	20 %	0 %	60 %	347753880
102	NC_016024	CGCGC	2	10	187390	187399	0 %	0 %	40 %	60 %	347753880
103	NC_016024	GCCGG	2	10	188162	188171	0 %	0 %	60 %	40 %	347753880
104	NC_016024	CGCAA	2	10	188514	188523	40 %	0 %	20 %	40 %	347753881
105	NC_016024	GACGC	2	10	188849	188858	20 %	0 %	40 %	40 %	347753881
106	NC_016024	CAGGA	2	10	190738	190747	40 %	0 %	40 %	20 %	347753882
107	NC_016024	GCGGA	2	10	192000	192009	20 %	0 %	60 %	20 %	347753883
108	NC_016024	GCGAA	2	10	193402	193411	40 %	0 %	40 %	20 %	347753883
109	NC_016024	ACCCA	2	10	193782	193791	40 %	0 %	0 %	60 %	347753883
110	NC_016024	GAACG	2	10	194117	194126	40 %	0 %	40 %	20 %	347753884
111	NC_016024	TGGTT	2	10	195555	195564	0 %	60 %	40 %	0 %	347753886
112	NC_016024	CGGCG	2	10	198092	198101	0 %	0 %	60 %	40 %	347753888
113	NC_016024	GAGGC	2	10	200618	200627	20 %	0 %	60 %	20 %	347753890
114	NC_016024	CGGCC	2	10	201322	201331	0 %	0 %	40 %	60 %	347753892
115	NC_016024	GCCGT	2	10	201961	201970	0 %	20 %	40 %	40 %	347753892
116	NC_016024	CAGCA	2	10	203714	203723	40 %	0 %	20 %	40 %	347753894
117	NC_016024	GCGAC	2	10	204260	204269	20 %	0 %	40 %	40 %	347753894
118	NC_016024	GCCGG	2	10	204798	204807	0 %	0 %	60 %	40 %	347753895
119	NC_016024	CAGTC	2	10	204890	204899	20 %	20 %	20 %	40 %	347753895
120	NC_016024	GCCGG	2	10	204901	204910	0 %	0 %	60 %	40 %	347753895
121	NC_016024	TTGCC	2	10	207220	207229	0 %	40 %	20 %	40 %	347753898
122	NC_016024	GGTCT	2	10	208002	208011	0 %	40 %	40 %	20 %	347753898
123	NC_016024	CCAGA	2	10	208931	208940	40 %	0 %	20 %	40 %	347753899
124	NC_016024	CGGCG	2	10	209661	209670	0 %	0 %	60 %	40 %	347753900
125	NC_016024	GGCCC	2	10	209974	209983	0 %	0 %	40 %	60 %	347753900
126	NC_016024	CGTGA	2	10	212073	212082	20 %	20 %	40 %	20 %	347753901
127	NC_016024	ACGCT	2	10	213667	213676	20 %	20 %	20 %	40 %	347753902
128	NC_016024	CTGGG	2	10	214607	214616	0 %	20 %	60 %	20 %	347753902
129	NC_016024	GGAAT	2	10	215029	215038	40 %	20 %	40 %	0 %	347753903
130	NC_016024	CGCTG	2	10	217328	217337	0 %	20 %	40 %	40 %	347753904
131	NC_016024	TTACG	2	10	218077	218086	20 %	40 %	20 %	20 %	347753904
132	NC_016024	ACCCG	2	10	218143	218152	20 %	0 %	20 %	60 %	347753904
133	NC_016024	GGCGC	2	10	218179	218188	0 %	0 %	60 %	40 %	347753904
134	NC_016024	CGCGC	2	10	223246	223255	0 %	0 %	40 %	60 %	347753908
135	NC_016024	GCGCG	2	10	226034	226043	0 %	0 %	60 %	40 %	347753911
136	NC_016024	CTGCG	2	10	229965	229974	0 %	20 %	40 %	40 %	347753914
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142	NC_016024	CTCTG	2	10	240122	240131	0 %	40 %	20 %	40 %	347753918
143	NC_016024	GCAAC	2	10	241179	241188	40 %	0 %	20 %	40 %	347753919
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149	NC_016024	GCCGC	2	10	250661	250670	0 %	0 %	40 %	60 %	347753927
150	NC_016024	AGCGC	2	10	252244	252253	20 %	0 %	40 %	40 %	347753929
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152	NC_016024	TGGGT	2	10	254265	254274	0 %	40 %	60 %	0 %	347753931
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155	NC_016024	CCGGT	2	10	258404	258413	0 %	20 %	40 %	40 %	347753935
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157	NC_016024	CGGTC	2	10	262419	262428	0 %	20 %	40 %	40 %	347753937
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161	NC_016024	TGGGT	2	10	267947	267956	0 %	40 %	60 %	0 %	347753942
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170	NC_016024	GCGTG	2	10	277962	277971	0 %	20 %	60 %	20 %	347753949
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248	NC_016024	TTCAC	2	10	392806	392815	20 %	40 %	0 %	40 %	347754043
249	NC_016024	GTGAG	2	10	393554	393563	20 %	20 %	60 %	0 %	347754044
250	NC_016024	TTTCG	2	10	395642	395651	0 %	60 %	20 %	20 %	347754046
251	NC_016024	ATCAC	2	10	396161	396170	40 %	20 %	0 %	40 %	347754047
252	NC_016024	CTGAC	2	10	398146	398155	20 %	20 %	20 %	40 %	347754049
253	NC_016024	GGCGC	2	10	398967	398976	0 %	0 %	60 %	40 %	347754050
254	NC_016024	CGTGG	2	10	400218	400227	0 %	20 %	60 %	20 %	347754051
255	NC_016024	AGGTC	2	10	400625	400634	20 %	20 %	40 %	20 %	347754051
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257	NC_016024	AGGGA	2	10	401808	401817	40 %	0 %	60 %	0 %	347754052
258	NC_016024	TGCGC	2	10	403383	403392	0 %	20 %	40 %	40 %	347754054
259	NC_016024	GGCAG	2	10	403799	403808	20 %	0 %	60 %	20 %	347754054
260	NC_016024	TGCCG	2	10	405333	405342	0 %	20 %	40 %	40 %	347754054
261	NC_016024	CCGCA	2	10	406422	406431	20 %	0 %	20 %	60 %	347754055
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263	NC_016024	GTTGG	2	10	406782	406791	0 %	40 %	60 %	0 %	347754055
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389	NC_016024	CGGTG	2	10	564794	564803	0 %	20 %	60 %	20 %	347754193
390	NC_016024	CGTGT	2	10	565206	565215	0 %	40 %	40 %	20 %	347754193
391	NC_016024	GCCCG	2	10	566349	566358	0 %	0 %	40 %	60 %	347754193
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