MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus coagulans 36D1 chromosome

Total Repeats: 177

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016023	TTCCAA	2	12	2067	2078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016023	GAAAAA	2	12	67057	67068	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016023	TCACCC	2	12	157940	157951	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_016023	CCGGAA	2	12	209846	209857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016023	GCCCGG	2	12	225370	225381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016023	GGCGGA	2	12	273265	273276	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016023	ACTTTA	2	12	276827	276838	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016023	AGAACA	2	12	277462	277473	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016023	ACGGTT	2	12	293892	293903	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_016023	TATCCG	2	12	322270	322281	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016023	AAATTT	2	12	337844	337855	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016023	TTTCAT	2	12	393278	393289	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016023	CATGTC	2	12	411544	411555	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016023	AGAAAA	2	12	444658	444669	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016023	AATTAT	2	12	493605	493616	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016023	TTTTCT	2	12	500909	500920	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016023	TGTTTT	2	12	503961	503972	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016023	ACAAAA	2	12	506041	506052	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016023	TTGGAA	2	12	512502	512513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016023	TATTTT	2	12	535469	535480	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016023	ATTTTT	2	12	564105	564116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016023	GGATGC	2	12	599585	599596	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016023	CCTTTT	2	12	607567	607578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016023	GGATTC	2	12	635189	635200	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016023	ATAAAA	2	12	654560	654571	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016023	TTTTTC	2	12	688212	688223	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016023	AGGAAA	2	12	789185	789196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016023	TCTTTT	2	12	802928	802939	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_016023	AAAATG	2	12	831575	831586	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016023	CAAATT	2	12	866906	866917	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016023	AAAGGA	2	12	887158	887169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016023	TTTTAT	2	12	887569	887580	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016023	ACTTTT	2	12	922118	922129	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016023	TATTTT	2	12	924146	924157	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016023	AGCTAT	2	12	924997	925008	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016023	TCATTT	2	12	966154	966165	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016023	TATCTT	2	12	975828	975839	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016023	CAAAGT	2	12	991685	991696	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016023	GAACAG	2	12	1039759	1039770	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016023	TCCTTA	2	12	1044039	1044050	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016023	AGCTTC	2	12	1082145	1082156	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016023	AAAATA	2	12	1090964	1090975	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016023	AAATGA	2	12	1111454	1111465	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016023	AATGAT	2	12	1112760	1112771	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016023	GAAAAC	2	12	1132806	1132817	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016023	ACTTCC	2	12	1154780	1154791	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016023	TCCCTC	2	12	1165615	1165626	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_016023	AAAGAA	2	12	1180230	1180241	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016023	AGCTTG	2	12	1195612	1195623	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016023	TCTCCC	2	12	1225087	1225098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_016023	TTGTTT	2	12	1241501	1241512	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016023	AACAGA	2	12	1264078	1264089	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016023	AAAAAG	2	12	1267782	1267793	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016023	CTTCTC	2	12	1277501	1277512	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016023	TTTGAC	2	12	1288427	1288438	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016023	AGCTGA	2	12	1303802	1303813	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_016023	AAAAAG	2	12	1339602	1339613	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016023	ATACTT	2	12	1389785	1389796	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016023	GACAGT	2	12	1405974	1405985	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016023	CTTTTC	2	12	1416077	1416088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016023	TCTGGT	2	12	1466946	1466957	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016023	ACTTTA	2	12	1489550	1489561	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016023	CGCATT	2	12	1493575	1493586	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_016023	AATAAA	2	12	1511431	1511442	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016023	CCATAA	2	12	1512489	1512500	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016023	GTGTTT	2	12	1523786	1523797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016023	ATGATT	2	12	1561111	1561122	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016023	TATCAA	2	12	1561426	1561437	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016023	AACCGC	2	12	1627218	1627229	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016023	GCTGGA	2	12	1645829	1645840	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016023	AATGGC	2	12	1652333	1652344	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016023	TCATTA	2	12	1670672	1670683	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_016023	CAACAT	2	12	1681818	1681829	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016023	TCCACT	2	12	1708881	1708892	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016023	TTCCCA	2	12	1710338	1710349	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016023	TTGAAA	2	12	1725226	1725237	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016023	AAGGCA	2	12	1770811	1770822	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016023	TAAATA	2	12	1781464	1781475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016023	TTTTTA	2	12	1784100	1784111	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016023	ATTTAC	2	12	1792924	1792935	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_016023	GAAAAT	2	12	1802041	1802052	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016023	AAAAAG	2	12	1844685	1844696	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016023	GAAAAT	2	12	1853973	1853984	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016023	ACTTTA	2	12	1865521	1865532	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016023	ATTTTA	2	12	1881580	1881591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016023	ATAAAA	2	12	1909738	1909749	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016023	ACAATA	2	12	1938717	1938728	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016023	GTTAAA	2	12	1948292	1948303	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016023	TTAGAC	2	12	1966163	1966174	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_016023	AAAAAC	2	12	1985956	1985967	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_016023	AAGAAC	2	12	1997808	1997819	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016023	GCATAA	2	12	2002678	2002689	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016023	CCCTGC	2	12	2006526	2006537	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
94	NC_016023	CCGTTT	2	12	2006576	2006587	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016023	CTTTTT	2	12	2006614	2006625	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016023	ATATAC	2	12	2024806	2024817	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016023	TGTATA	2	12	2024821	2024832	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016023	CTGAAA	2	12	2047343	2047354	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_016023	GAATCG	2	12	2075516	2075527	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016023	CGAAAC	2	12	2082913	2082924	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016023	GCATTT	2	12	2106060	2106071	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016023	AAAATA	2	12	2121857	2121868	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016023	AAAACA	2	12	2123971	2123982	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_016023	ATTTCC	2	12	2128735	2128746	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016023	GTTTAA	2	12	2139356	2139367	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016023	CTTTTG	2	12	2163128	2163139	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_016023	CAAATT	2	12	2186815	2186826	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_016023	CTTTTT	2	12	2186859	2186870	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_016023	ATTTAT	2	12	2186877	2186888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016023	ATTTTT	2	12	2194227	2194238	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016023	TATTTT	2	12	2197550	2197561	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016023	GCCGGC	2	12	2224498	2224509	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016023	AAGCAA	2	12	2228321	2228332	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016023	CTTAAA	2	12	2245912	2245923	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_016023	TAAAAT	2	12	2258383	2258394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016023	ATTGGC	2	12	2324773	2324784	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_016023	CGTTTT	2	12	2335909	2335920	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_016023	ACTTTA	2	12	2355103	2355114	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_016023	ACAAAC	2	12	2371465	2371476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016023	GCCCAA	2	12	2403966	2403977	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016023	GAGAAG	2	12	2460469	2460480	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016023	ATTTTC	2	12	2465242	2465253	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_016023	GCCGGA	2	12	2482054	2482065	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016023	GCATAA	2	12	2491529	2491540	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_016023	GTAAAA	2	12	2502695	2502706	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016023	ATACAC	2	12	2519892	2519903	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016023	TGCATT	2	12	2535711	2535722	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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176	NC_016023	CCGGAA	2	12	3548511	3548522	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
177	NC_016023	CGTTTC	2	12	3551737	3551748	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.