MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus coagulans 36D1 chromosome

Total Repeats: 618

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016023	TTCCC	2	10	855	864	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2	NC_016023	GGAAA	2	10	869	878	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016023	TTTGG	2	10	27683	27692	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016023	TCATT	2	10	36960	36969	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016023	TAAAT	2	10	59306	59315	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016023	CGGAT	2	10	63494	63503	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016023	TCTTT	2	10	66045	66054	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016023	TCCCC	2	10	71854	71863	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
9	NC_016023	TGCCC	2	10	75646	75655	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_016023	TATCA	2	10	76363	76372	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016023	AACTT	2	10	83788	83797	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016023	AGCAG	2	10	93945	93954	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016023	GCTCT	2	10	97053	97062	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016023	CGCCC	2	10	108643	108652	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_016023	AGGAA	2	10	108657	108666	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016023	AGCAT	2	10	121570	121579	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016023	TTACC	2	10	148995	149004	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016023	TCCCC	2	10	159432	159441	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
19	NC_016023	GATTT	2	10	164245	164254	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016023	GAAAA	2	10	164390	164399	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016023	GAAAA	2	10	184209	184218	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016023	TCTCC	2	10	192914	192923	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_016023	TAGAA	2	10	193087	193096	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016023	TGCAT	2	10	197592	197601	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016023	AGATA	2	10	197616	197625	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016023	TATAT	2	10	204522	204531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016023	TTTTA	2	10	205820	205829	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016023	ACAAA	2	10	225286	225295	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016023	GAAAA	2	10	229664	229673	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016023	TACCA	2	10	231884	231893	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_016023	GAAAA	2	10	231916	231925	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016023	CTATA	2	10	247525	247534	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016023	AAAGA	2	10	247555	247564	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016023	GGAAA	2	10	264544	264553	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016023	AAATT	2	10	265249	265258	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016023	GCCGG	2	10	269116	269125	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
37	NC_016023	TTTTG	2	10	269196	269205	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016023	ATTTT	2	10	277012	277021	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016023	ATTTC	2	10	285093	285102	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016023	TCCCC	2	10	303292	303301	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
41	NC_016023	TCCGT	2	10	303390	303399	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016023	GGGCC	2	10	304837	304846	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016023	TTCTC	2	10	304968	304977	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_016023	CTTGC	2	10	312047	312056	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_016023	GAACA	2	10	312558	312567	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016023	TTATT	2	10	314777	314786	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016023	TCCAT	2	10	316760	316769	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016023	TTTAT	2	10	319383	319392	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016023	GCCAG	2	10	320459	320468	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_016023	ACAAA	2	10	321279	321288	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_016023	CGCAA	2	10	322327	322336	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_016023	GGAAC	2	10	326475	326484	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016023	TAAAC	2	10	330240	330249	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_016023	ATTTT	2	10	333086	333095	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016023	CCCCG	2	10	335952	335961	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
56	NC_016023	ATAAA	2	10	336125	336134	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016023	TTTTA	2	10	342683	342692	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016023	ATTTA	2	10	349725	349734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016023	TCTTT	2	10	349769	349778	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016023	GCTCT	2	10	352586	352595	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_016023	GGAAA	2	10	352613	352622	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016023	TTTAT	2	10	359279	359288	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016023	GTTTC	2	10	359549	359558	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_016023	AAGGA	2	10	362148	362157	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016023	GATAA	2	10	365199	365208	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016023	CGCGG	2	10	368112	368121	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016023	TTTTC	2	10	370375	370384	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016023	CCGTT	2	10	371446	371455	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_016023	CCCTT	2	10	372533	372542	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
70	NC_016023	CCCCT	2	10	386766	386775	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
71	NC_016023	CCCGT	2	10	387756	387765	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
72	NC_016023	CTTTT	2	10	387774	387783	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016023	CCTTT	2	10	401621	401630	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_016023	AGATG	2	10	416308	416317	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016023	TTTTA	2	10	417914	417923	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016023	GGCCG	2	10	431952	431961	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_016023	TTTTA	2	10	444873	444882	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016023	GAAGA	2	10	445025	445034	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016023	ACATC	2	10	449900	449909	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016023	TATAA	2	10	449916	449925	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016023	TTTGT	2	10	451566	451575	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016023	CATCG	2	10	451684	451693	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
83	NC_016023	TTTGT	2	10	451722	451731	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016023	CCGCA	2	10	451844	451853	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_016023	GGCAG	2	10	467943	467952	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016023	TTTTA	2	10	472951	472960	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016023	TTTTC	2	10	474328	474337	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016023	GGCAC	2	10	480085	480094	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_016023	GACAA	2	10	482456	482465	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_016023	GAATG	2	10	483535	483544	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016023	AACGC	2	10	489603	489612	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_016023	CCAAT	2	10	495873	495882	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
93	NC_016023	TCTTT	2	10	496035	496044	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016023	GCAAA	2	10	497982	497991	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016023	ATCCC	2	10	506537	506546	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
96	NC_016023	ATTTT	2	10	506677	506686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016023	TCCAT	2	10	509328	509337	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
98	NC_016023	TTTCT	2	10	512031	512040	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_016023	CATAT	2	10	519915	519924	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_016023	GTTAC	2	10	521816	521825	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_016023	CAAAT	2	10	525621	525630	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_016023	CTGCC	2	10	527307	527316	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_016023	ATTTT	2	10	556255	556264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016023	CTACT	2	10	557208	557217	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_016023	AATAG	2	10	563451	563460	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016023	CTCCC	2	10	571149	571158	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
107	NC_016023	TGGCA	2	10	576916	576925	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_016023	TGCCA	2	10	577015	577024	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
109	NC_016023	TTTAT	2	10	577764	577773	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016023	ATCTC	2	10	578043	578052	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
111	NC_016023	TTTAT	2	10	587007	587016	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016023	GAAAA	2	10	587028	587037	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016023	ACATC	2	10	597986	597995	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_016023	TATAA	2	10	598002	598011	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016023	CTGAC	2	10	599522	599531	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_016023	TAGTA	2	10	602193	602202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016023	AAATT	2	10	602955	602964	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016023	AAGTT	2	10	603043	603052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016023	GTTAT	2	10	604658	604667	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016023	CATTT	2	10	607516	607525	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016023	TTTTG	2	10	625921	625930	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016023	AATAG	2	10	628487	628496	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016023	AATGG	2	10	631963	631972	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016023	AATCA	2	10	632450	632459	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_016023	TGCTT	2	10	635225	635234	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016023	ATGAT	2	10	635603	635612	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016023	TGATT	2	10	644444	644453	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016023	ATTTT	2	10	644551	644560	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016023	GAAAA	2	10	649351	649360	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016023	CCTTA	2	10	650112	650121	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_016023	AAGTG	2	10	650133	650142	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016023	TTTCT	2	10	653026	653035	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_016023	ATTAT	2	10	654700	654709	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016023	CCGGG	2	10	654750	654759	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
135	NC_016023	TCCTT	2	10	656643	656652	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
136	NC_016023	TTCAT	2	10	656830	656839	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016023	TTCTT	2	10	676791	676800	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_016023	TTTAT	2	10	686842	686851	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016023	TTCTT	2	10	695466	695475	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_016023	ACAAT	2	10	705906	705915	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_016023	TAAAG	2	10	717068	717077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016023	AAGGA	2	10	722731	722740	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016023	TCCAA	2	10	742530	742539	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
144	NC_016023	CATTT	2	10	746745	746754	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_016023	ATGAT	2	10	751242	751251	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016023	GATTA	2	10	751255	751264	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016023	CGAAG	2	10	752677	752686	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
148	NC_016023	CGAAA	2	10	758104	758113	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
149	NC_016023	ATCGC	2	10	764187	764196	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
150	NC_016023	TTTCA	2	10	776597	776606	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_016023	CAATA	2	10	776615	776624	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
152	NC_016023	TGTAG	2	10	783292	783301	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016023	ATTTC	2	10	784989	784998	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_016023	ACGGC	2	10	789000	789009	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
155	NC_016023	ATGGC	2	10	797023	797032	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
156	NC_016023	GGCTT	2	10	814771	814780	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
157	NC_016023	AGGAT	2	10	817034	817043	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016023	CTTAT	2	10	828368	828377	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_016023	TTTTA	2	10	832878	832887	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_016023	CCTTT	2	10	832952	832961	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
161	NC_016023	CAAAC	2	10	835502	835511	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
162	NC_016023	TTCCC	2	10	847443	847452	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
163	NC_016023	CAAAC	2	10	861364	861373	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
164	NC_016023	CGCTT	2	10	878846	878855	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
165	NC_016023	CCAAC	2	10	885379	885388	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
166	NC_016023	CCCTT	2	10	906491	906500	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
167	NC_016023	GTTTT	2	10	906849	906858	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
168	NC_016023	CAAAT	2	10	907006	907015	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
169	NC_016023	ATTGA	2	10	924073	924082	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
170	NC_016023	ATTTT	2	10	927057	927066	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_016023	TTTAT	2	10	935369	935378	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_016023	CACAC	2	10	948720	948729	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
173	NC_016023	GAAAT	2	10	949709	949718	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
174	NC_016023	ATTTG	2	10	954015	954024	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
175	NC_016023	GTTAA	2	10	965326	965335	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_016023	GATTT	2	10	968280	968289	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_016023	GTCTG	2	10	1004822	1004831	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_016023	TGTTT	2	10	1031279	1031288	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_016023	GTTTT	2	10	1039220	1039229	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_016023	CTTTG	2	10	1043635	1043644	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_016023	TTCAA	2	10	1091057	1091066	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
193	NC_016023	ATCAT	2	10	1094821	1094830	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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195	NC_016023	GCTCT	2	10	1108099	1108108	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
196	NC_016023	TTTTC	2	10	1108697	1108706	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
197	NC_016023	GATCC	2	10	1132673	1132682	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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241	NC_016023	TTCAG	2	10	1319345	1319354	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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274	NC_016023	CGGGC	2	10	1465269	1465278	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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428	NC_016023	CTGAA	2	10	2337944	2337953	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
429	NC_016023	ATTAT	2	10	2340603	2340612	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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462	NC_016023	GGAAA	2	10	2485441	2485450	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_016023	GCCGG	2	10	2500343	2500352	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
467	NC_016023	AAGGA	2	10	2501339	2501348	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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469	NC_016023	GGGAA	2	10	2502123	2502132	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
470	NC_016023	AGGAG	2	10	2514927	2514936	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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475	NC_016023	TCCGG	2	10	2527434	2527443	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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477	NC_016023	TTTAT	2	10	2531778	2531787	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_016023	GCATG	2	10	2537012	2537021	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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486	NC_016023	TTATT	2	10	2581115	2581124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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488	NC_016023	TAAAA	2	10	2602712	2602721	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_016023	GGGAG	2	10	2610495	2610504	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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493	NC_016023	CTGAA	2	10	2611876	2611885	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
494	NC_016023	TACCG	2	10	2613712	2613721	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
495	NC_016023	CCTGT	2	10	2621676	2621685	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
496	NC_016023	GAAGA	2	10	2631169	2631178	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
497	NC_016023	GTTTA	2	10	2635438	2635447	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_016023	ATGAA	2	10	2638417	2638426	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
500	NC_016023	TCTTT	2	10	2642733	2642742	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding

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