MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus coagulans 36D1 chromosome

Total Repeats: 2221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016023	GGAT	2	8	86	93	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016023	GCAT	2	8	674	681	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016023	ATAA	2	8	764	771	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016023	GCCG	2	8	802	809	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016023	GCCG	2	8	836	843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016023	TTTC	2	8	946	953	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016023	TGGA	2	8	1043	1050	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016023	CTTT	2	8	8593	8600	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016023	TATG	2	8	8672	8679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016023	CCTT	2	8	10192	10199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016023	ATCT	2	8	21219	21226	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016023	CCGG	2	8	21359	21366	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016023	CCGG	2	8	30283	30290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016023	CATG	2	8	36983	36990	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016023	ACCC	2	8	47051	47058	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_016023	TACA	2	8	47067	47074	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016023	CTGC	2	8	47090	47097	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016023	ATGG	2	8	51882	51889	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016023	GATT	2	8	60174	60181	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016023	CAAA	2	8	65937	65944	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016023	TGAA	2	8	68123	68130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016023	TTTC	2	8	71063	71070	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016023	AACG	2	8	72778	72785	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016023	TTAT	2	8	73446	73453	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016023	ATGT	2	8	75742	75749	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016023	CCCT	2	8	75766	75773	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_016023	CAGG	2	8	83901	83908	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016023	TAAT	2	8	84251	84258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016023	GAAA	2	8	87748	87755	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016023	GCAC	2	8	90786	90793	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016023	AAAG	2	8	90813	90820	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016023	CGGC	2	8	91644	91651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016023	GCAA	2	8	91788	91795	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016023	ATGT	2	8	94527	94534	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016023	ATGC	2	8	111543	111550	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016023	AGGA	2	8	114603	114610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016023	TGCT	2	8	114620	114627	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016023	GAAG	2	8	114653	114660	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016023	GAAG	2	8	114705	114712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016023	TGCT	2	8	114724	114731	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016023	CTTA	2	8	114834	114841	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016023	AAGG	2	8	114862	114869	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016023	TGCT	2	8	114880	114887	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016023	AAGG	2	8	114914	114921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016023	CTTT	2	8	114923	114930	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016023	TGAA	2	8	114951	114958	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016023	TTTC	2	8	117552	117559	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016023	TGTT	2	8	117589	117596	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016023	AAGC	2	8	119220	119227	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016023	TGGC	2	8	119332	119339	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016023	CCCT	2	8	119518	119525	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_016023	TCCT	2	8	122759	122766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016023	TACC	2	8	124738	124745	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016023	TACA	2	8	124862	124869	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016023	GTTT	2	8	125184	125191	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016023	TCAA	2	8	125323	125330	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016023	CCTT	2	8	131278	131285	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016023	CGGC	2	8	148190	148197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016023	GCTT	2	8	148319	148326	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016023	TTCT	2	8	150487	150494	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016023	ACGG	2	8	150528	150535	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016023	TTTC	2	8	150628	150635	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016023	GTTT	2	8	156428	156435	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016023	TTTA	2	8	158035	158042	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016023	CCCG	2	8	160454	160461	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_016023	CTTG	2	8	161427	161434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016023	TGAA	2	8	164151	164158	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016023	TCCG	2	8	167135	167142	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016023	CATT	2	8	169301	169308	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016023	TGCA	2	8	175040	175047	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016023	TGCT	2	8	177222	177229	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016023	CTCC	2	8	179760	179767	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
73	NC_016023	TGCC	2	8	181299	181306	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016023	GCCG	2	8	181486	181493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016023	GCCT	2	8	183199	183206	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016023	GCCC	2	8	184157	184164	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
77	NC_016023	TTTC	2	8	184253	184260	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016023	TTGT	2	8	184271	184278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016023	CAGA	2	8	185560	185567	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016023	AATA	2	8	191454	191461	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016023	CCGC	2	8	191659	191666	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_016023	CCGG	2	8	192767	192774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016023	GCCG	2	8	193025	193032	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016023	TTTG	2	8	193105	193112	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016023	GCCT	2	8	196324	196331	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016023	CGTC	2	8	199112	199119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016023	CCGG	2	8	199139	199146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016023	TCAG	2	8	199284	199291	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016023	AAGA	2	8	203354	203361	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016023	TGTA	2	8	204440	204447	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016023	AAAT	2	8	204599	204606	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016023	GCCG	2	8	207189	207196	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016023	GAGG	2	8	212213	212220	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016023	GATG	2	8	213759	213766	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016023	TTTC	2	8	214543	214550	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_016023	AGCA	2	8	215129	215136	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016023	GCCG	2	8	216700	216707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016023	GCAT	2	8	216721	216728	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016023	TGCC	2	8	217311	217318	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016023	CTTT	2	8	222383	222390	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016023	AAAT	2	8	222871	222878	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016023	TAAA	2	8	225099	225106	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016023	CCGG	2	8	225199	225206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016023	ATCC	2	8	225236	225243	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016023	GATG	2	8	225441	225448	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016023	TCCT	2	8	226750	226757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016023	ACAG	2	8	228442	228449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016023	TTGA	2	8	229107	229114	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016023	GAAA	2	8	229116	229123	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016023	AACG	2	8	229423	229430	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016023	ATGA	2	8	231459	231466	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016023	CATT	2	8	231472	231479	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016023	CGGA	2	8	231945	231952	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016023	TGCT	2	8	233663	233670	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016023	GGCC	2	8	233799	233806	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016023	AAAC	2	8	237059	237066	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016023	CTTT	2	8	237107	237114	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016023	CCCG	2	8	237710	237717	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
119	NC_016023	ACAT	2	8	238877	238884	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016023	TCCC	2	8	242128	242135	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
121	NC_016023	CCAT	2	8	242185	242192	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016023	GAAA	2	8	242336	242343	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016023	CTTC	2	8	242422	242429	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016023	ATGC	2	8	244829	244836	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016023	TTTG	2	8	245526	245533	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016023	CCGG	2	8	247449	247456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016023	TGCA	2	8	247750	247757	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016023	AATC	2	8	250181	250188	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016023	CAAA	2	8	250229	250236	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016023	GATG	2	8	253529	253536	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016023	TGCA	2	8	254000	254007	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016023	ATCC	2	8	255483	255490	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016023	ATTT	2	8	259107	259114	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016023	GAAG	2	8	261281	261288	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016023	CTTC	2	8	261306	261313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016023	CTTC	2	8	261358	261365	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016023	CTTC	2	8	261410	261417	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016023	CCTT	2	8	261461	261468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016023	CCTT	2	8	261513	261520	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016023	CTTC	2	8	261618	261625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016023	CTTC	2	8	261670	261677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016023	CCTT	2	8	261721	261728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016023	AGCA	2	8	261755	261762	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016023	CCTT	2	8	261773	261780	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016023	AGCA	2	8	261807	261814	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016023	CCTT	2	8	261825	261832	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016023	GTTG	3	12	263024	263035	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016023	TTTC	2	8	263205	263212	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016023	AAAT	2	8	265146	265153	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016023	AAGG	2	8	265221	265228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016023	GCTT	2	8	267077	267084	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_016023	AAAG	2	8	267213	267220	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016023	TGCT	2	8	267284	267291	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
154	NC_016023	GATA	2	8	267532	267539	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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164	NC_016023	CATT	2	8	274610	274617	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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169	NC_016023	TTTA	2	8	277652	277659	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_016023	TTTC	2	8	289098	289105	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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188	NC_016023	AAGC	2	8	305322	305329	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
189	NC_016023	CCTT	2	8	305341	305348	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
190	NC_016023	CCTT	2	8	305392	305399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
191	NC_016023	CCTT	2	8	305444	305451	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
192	NC_016023	CCTT	2	8	305496	305503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
193	NC_016023	CCTT	2	8	305548	305555	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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196	NC_016023	CCTT	2	8	305860	305867	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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263	NC_016023	CTTC	2	8	409321	409328	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
264	NC_016023	CAGA	2	8	409348	409355	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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449	NC_016023	CATG	2	8	683894	683901	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
450	NC_016023	TGCC	2	8	684007	684014	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
451	NC_016023	GCTT	2	8	686925	686932	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
452	NC_016023	TGAA	2	8	687005	687012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
453	NC_016023	ATGA	2	8	691679	691686	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
454	NC_016023	TTCC	2	8	691764	691771	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
455	NC_016023	ATCT	2	8	692023	692030	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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457	NC_016023	CTTC	2	8	694668	694675	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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459	NC_016023	CCTT	2	8	698564	698571	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
460	NC_016023	AGTA	2	8	701006	701013	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_016023	CGTT	2	8	711823	711830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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468	NC_016023	CTTT	2	8	721632	721639	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
469	NC_016023	GCCG	3	12	722808	722819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
470	NC_016023	CGGA	2	8	727329	727336	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
471	NC_016023	TCCC	2	8	734468	734475	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
472	NC_016023	CTTG	2	8	742559	742566	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
473	NC_016023	CCTT	2	8	742574	742581	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
474	NC_016023	TTAC	2	8	743512	743519	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
475	NC_016023	AGGG	2	8	747597	747604	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
476	NC_016023	TGAA	2	8	749298	749305	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
477	NC_016023	CAGG	2	8	752214	752221	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
478	NC_016023	ACGT	2	8	752949	752956	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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480	NC_016023	GGAT	2	8	756123	756130	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
481	NC_016023	ATAG	2	8	763544	763551	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
482	NC_016023	TCAT	2	8	763589	763596	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
483	NC_016023	GGGC	2	8	763711	763718	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
484	NC_016023	AGCG	2	8	763891	763898	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
485	NC_016023	GTTT	2	8	765197	765204	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
486	NC_016023	ACTA	2	8	768014	768021	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
487	NC_016023	CCAA	2	8	769457	769464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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489	NC_016023	ATGA	2	8	772709	772716	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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491	NC_016023	GCAG	2	8	778594	778601	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
492	NC_016023	CTTC	2	8	781258	781265	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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496	NC_016023	CAAC	2	8	788986	788993	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
497	NC_016023	AATG	2	8	793515	793522	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
498	NC_016023	GAAA	2	8	797074	797081	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
499	NC_016023	TGTT	2	8	798093	798100	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_016023	ATGC	2	8	802855	802862	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

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