MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus coagulans 36D1 chromosome

Total Repeats: 6989

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016023	TCG	2	6	20	25	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016023	ATG	2	6	188	193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016023	GCA	2	6	236	241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016023	ACG	2	6	326	331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016023	ACA	2	6	332	337	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016023	GAT	2	6	496	501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016023	ACA	2	6	513	518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_016023	GCC	2	6	556	561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_016023	ACG	2	6	620	625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016023	ACC	2	6	629	634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016023	CTT	2	6	642	647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016023	ATG	2	6	664	669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016023	CAT	2	6	687	692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016023	GCC	2	6	709	714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016023	GAA	2	6	740	745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016023	AAC	2	6	1084	1089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016023	TAT	2	6	2100	2105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016023	CTT	2	6	3769	3774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016023	CTT	2	6	4035	4040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016023	CCT	2	6	5339	5344	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016023	CGG	2	6	8710	8715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016023	CCT	2	6	9086	9091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_016023	TAC	2	6	9169	9174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016023	AGC	2	6	10184	10189	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016023	GTC	2	6	14382	14387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016023	ATG	2	6	16238	16243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016023	CCT	2	6	16722	16727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_016023	GTA	2	6	16795	16800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016023	AGA	2	6	21347	21352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016023	TAT	2	6	23115	23120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016023	ACC	2	6	24692	24697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_016023	TAT	2	6	27627	27632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016023	ATA	2	6	27817	27822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016023	CTT	2	6	29241	29246	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016023	TCC	2	6	30174	30179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016023	CTT	2	6	30226	30231	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016023	TCC	2	6	31061	31066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
38	NC_016023	AGC	2	6	31117	31122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016023	TTG	2	6	32541	32546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016023	GGC	2	6	32572	32577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016023	GGC	2	6	34186	34191	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016023	TGC	2	6	47114	47119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016023	GGC	2	6	47143	47148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016023	CTC	2	6	47586	47591	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_016023	TTC	2	6	47600	47605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016023	GAT	2	6	47697	47702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016023	CCT	2	6	51866	51871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_016023	TCA	2	6	57684	57689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016023	CCT	2	6	58122	58127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_016023	ATT	2	6	59065	59070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016023	TAG	2	6	59124	59129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016023	TCC	2	6	60166	60171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_016023	CCT	2	6	62290	62295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016023	TCC	2	6	65884	65889	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_016023	GCA	2	6	65914	65919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016023	ATG	2	6	65999	66004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016023	GCC	2	6	67163	67168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_016023	CTT	2	6	68088	68093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016023	GCT	2	6	68133	68138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016023	TCC	2	6	69307	69312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_016023	TAA	2	6	69350	69355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016023	TAT	3	9	69395	69403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016023	GAA	2	6	73464	73469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016023	GCA	2	6	73505	73510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016023	CAA	2	6	73874	73879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016023	CGG	2	6	73927	73932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016023	ATG	2	6	76380	76385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016023	CTT	2	6	78103	78108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016023	CGG	2	6	78214	78219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_016023	CGC	2	6	79344	79349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_016023	CTT	2	6	79390	79395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016023	CTG	2	6	83815	83820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016023	TAT	2	6	84232	84237	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016023	TCC	3	9	85044	85052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016023	TCC	2	6	85999	86004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_016023	GTA	2	6	87738	87743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016023	CCT	2	6	90742	90747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016023	TGC	2	6	90758	90763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016023	AGC	2	6	90833	90838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016023	ATT	2	6	91536	91541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016023	TGG	2	6	91565	91570	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016023	GCT	2	6	91605	91610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016023	CAG	2	6	91733	91738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016023	TCC	2	6	93490	93495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016023	ATT	2	6	94043	94048	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016023	AGG	3	9	94115	94123	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016023	ACC	2	6	94424	94429	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_016023	ACG	2	6	95300	95305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016023	TGT	2	6	95379	95384	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016023	ACG	2	6	97047	97052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016023	ATC	2	6	99973	99978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016023	TCT	2	6	108546	108551	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016023	ATA	2	6	108616	108621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016023	ATT	2	6	111461	111466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016023	ATG	2	6	114503	114508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016023	CAA	2	6	114520	114525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016023	AAG	2	6	114550	114555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016023	GAA	2	6	114809	114814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016023	TAA	2	6	115023	115028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016023	TAT	2	6	116285	116290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016023	CTT	3	9	116330	116338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016023	TGC	2	6	116448	116453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016023	ATC	2	6	116540	116545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016023	ACA	2	6	116803	116808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016023	GGC	2	6	117443	117448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016023	TTG	2	6	117619	117624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016023	CCT	2	6	119051	119056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_016023	ATT	2	6	119120	119125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016023	TTG	2	6	119180	119185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016023	CGC	2	6	119325	119330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_016023	GCT	2	6	119440	119445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016023	AAC	2	6	119562	119567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016023	TTA	2	6	119576	119581	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016023	ATC	2	6	119585	119590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016023	GAT	2	6	121522	121527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016023	AGC	2	6	121606	121611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_016023	CTG	2	6	121620	121625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_016023	GTG	2	6	121648	121653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016023	GCA	2	6	121854	121859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016023	GTT	2	6	122767	122772	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016023	ATT	2	6	122800	122805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016023	CGT	2	6	123979	123984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016023	ATA	2	6	124061	124066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016023	AAT	2	6	124774	124779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016023	AGC	2	6	124841	124846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016023	AAT	2	6	124920	124925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016023	TTA	2	6	124991	124996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016023	TCA	2	6	125167	125172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016023	TTA	2	6	125234	125239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016023	GAA	2	6	125243	125248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016023	TGG	2	6	129689	129694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016023	TAC	2	6	130155	130160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016023	ATA	2	6	130170	130175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016023	TGA	2	6	130176	130181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016023	CAT	2	6	134071	134076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016023	CTT	2	6	134080	134085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016023	ATT	2	6	134163	134168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016023	AGA	2	6	135134	135139	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016023	TAT	2	6	136415	136420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016023	TGA	2	6	137383	137388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_016023	TCC	2	6	148109	148114	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_016023	CCT	2	6	148297	148302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
145	NC_016023	TCC	2	6	148883	148888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
146	NC_016023	TCC	2	6	150434	150439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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431	NC_016023	ACA	2	6	285038	285043	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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