MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacillus coagulans 36D1 chromosome

Total Repeats: 35975

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016023	TTC	2	6	1190	1195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750443
2	NC_016023	GCC	2	6	1262	1267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750443
3	NC_016023	CAA	2	6	1636	1641	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750443
4	NC_016023	TCG	2	6	1651	1656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750443
5	NC_016023	GAT	2	6	1673	1678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750443
6	NC_016023	TCT	2	6	1698	1703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750443
7	NC_016023	CTT	2	6	1873	1878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750443
8	NC_016023	TTC	2	6	1889	1894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750443
9	NC_016023	CGG	2	6	1918	1923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750443
10	NC_016023	CAG	2	6	1937	1942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750443
11	NC_016023	ACA	2	6	2019	2024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750443
12	NC_016023	CCA	2	6	2259	2264	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347750444
13	NC_016023	TTG	2	6	2276	2281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750444
14	NC_016023	GTC	2	6	2287	2292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750444
15	NC_016023	CAT	2	6	2367	2372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750444
16	NC_016023	GCC	2	6	2423	2428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750444
17	NC_016023	CAA	2	6	2541	2546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750444
18	NC_016023	CGT	2	6	2623	2628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750444
19	NC_016023	TCT	2	6	2791	2796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750445
20	NC_016023	CAT	2	6	3234	3239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750445
21	NC_016023	GGC	3	9	3308	3316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750445
22	NC_016023	GGC	2	6	3379	3384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750445
23	NC_016023	CTT	2	6	3416	3421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750445
24	NC_016023	ATG	2	6	3634	3639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750445
25	NC_016023	CAA	2	6	3657	3662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750445
26	NC_016023	CTT	2	6	3672	3677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750445
27	NC_016023	GGC	2	6	3711	3716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750445
28	NC_016023	ATC	2	6	3816	3821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750446
29	NC_016023	GAT	2	6	3902	3907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750446
30	NC_016023	TCA	2	6	3933	3938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750446
31	NC_016023	TCA	2	6	4221	4226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750447
32	NC_016023	CTT	2	6	4238	4243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750447
33	NC_016023	TAA	2	6	4244	4249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347750447
34	NC_016023	CTT	2	6	4342	4347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750447
35	NC_016023	CCG	2	6	4431	4436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750447
36	NC_016023	TGC	2	6	4540	4545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750447
37	NC_016023	TTC	2	6	4599	4604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750447
38	NC_016023	CGC	2	6	4684	4689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750447
39	NC_016023	AAC	2	6	4722	4727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750447
40	NC_016023	GCA	2	6	4753	4758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750447
41	NC_016023	GAC	2	6	4775	4780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750447
42	NC_016023	TCG	2	6	4824	4829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750447
43	NC_016023	TTC	2	6	4850	4855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750447
44	NC_016023	TTC	2	6	4955	4960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750447
45	NC_016023	TCT	2	6	4992	4997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750447
46	NC_016023	GCC	2	6	5114	5119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750447
47	NC_016023	TTC	2	6	5282	5287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750447
48	NC_016023	TGT	2	6	5332	5337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750447
49	NC_016023	TTC	2	6	5720	5725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750448
50	NC_016023	CGC	2	6	5836	5841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750448
51	NC_016023	GAT	2	6	5911	5916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750448
52	NC_016023	TCG	2	6	6081	6086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750448
53	NC_016023	AAG	2	6	6115	6120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347750448
54	NC_016023	CGG	2	6	6191	6196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750448
55	NC_016023	GGC	2	6	6260	6265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750448
56	NC_016023	CTT	2	6	6377	6382	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750448
57	NC_016023	TCA	2	6	6460	6465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750448
58	NC_016023	GCT	2	6	6486	6491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750449
59	NC_016023	ACA	2	6	6578	6583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750449
60	NC_016023	TTC	2	6	6604	6609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
61	NC_016023	TTC	2	6	6746	6751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
62	NC_016023	TGT	2	6	6756	6761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750449
63	NC_016023	GAA	2	6	6779	6784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347750449
64	NC_016023	TCG	2	6	6954	6959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750449
65	NC_016023	CAT	2	6	6961	6966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750449
66	NC_016023	CTG	2	6	7000	7005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750449
67	NC_016023	CTT	2	6	7011	7016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
68	NC_016023	CGG	2	6	7379	7384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750449
69	NC_016023	AAC	2	6	7547	7552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750449
70	NC_016023	GGA	2	6	7588	7593	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347750449
71	NC_016023	CTT	3	9	7662	7670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
72	NC_016023	TTC	2	6	7711	7716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
73	NC_016023	CTT	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
74	NC_016023	CTT	2	6	7773	7778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
75	NC_016023	TCT	2	6	7788	7793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
76	NC_016023	CCA	2	6	7848	7853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347750449
77	NC_016023	TTC	2	6	7855	7860	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
78	NC_016023	CTT	2	6	7980	7985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
79	NC_016023	CTT	2	6	7992	7997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750449
80	NC_016023	TGA	2	6	8088	8093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750449
81	NC_016023	CGA	2	6	8115	8120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750449
82	NC_016023	GCC	2	6	8350	8355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750449
83	NC_016023	GCA	2	6	8483	8488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750449
84	NC_016023	CAA	2	6	8877	8882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750450
85	NC_016023	TCA	2	6	8906	8911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750450
86	NC_016023	TGG	2	6	8926	8931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347750450
87	NC_016023	TTG	2	6	8965	8970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750450
88	NC_016023	TCT	2	6	8974	8979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750450
89	NC_016023	TGA	2	6	9041	9046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750450
90	NC_016023	TGC	2	6	9226	9231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750451
91	NC_016023	TCC	2	6	9263	9268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347750451
92	NC_016023	CTT	2	6	9321	9326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750451
93	NC_016023	TTC	2	6	9382	9387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750451
94	NC_016023	TGC	2	6	9417	9422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750451
95	NC_016023	GGC	2	6	9479	9484	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750451
96	NC_016023	ACG	2	6	9492	9497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750451
97	NC_016023	GTC	2	6	9534	9539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750451
98	NC_016023	GAC	2	6	9556	9561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750451
99	NC_016023	AGC	2	6	9590	9595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750451
100	NC_016023	CAA	2	6	9780	9785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347750451
101	NC_016023	TGC	2	6	9827	9832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750451
102	NC_016023	GAC	2	6	9865	9870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750451
103	NC_016023	GCG	2	6	10095	10100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750451
104	NC_016023	GAT	2	6	10128	10133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750451
105	NC_016023	TGC	2	6	10604	10609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750452
106	NC_016023	CTT	2	6	10744	10749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750452
107	NC_016023	CGG	2	6	10763	10768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750452
108	NC_016023	CGG	2	6	10776	10781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750452
109	NC_016023	TTC	2	6	10827	10832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750452
110	NC_016023	TCT	2	6	10885	10890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750452
111	NC_016023	GTC	2	6	10891	10896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750452
112	NC_016023	GGA	2	6	10988	10993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347750452
113	NC_016023	CCG	2	6	11090	11095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750452
114	NC_016023	CTG	2	6	11429	11434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750453
115	NC_016023	TCA	2	6	11560	11565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750453
116	NC_016023	GCC	3	9	11663	11671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750454
117	NC_016023	GCA	2	6	11784	11789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750454
118	NC_016023	CAT	2	6	11817	11822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750454
119	NC_016023	TCC	2	6	11869	11874	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347750455
120	NC_016023	CTT	2	6	11900	11905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750455
121	NC_016023	CTT	2	6	11957	11962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750455
122	NC_016023	CAT	2	6	11966	11971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750455
123	NC_016023	CGC	2	6	12038	12043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750455
124	NC_016023	GCC	2	6	12075	12080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750455
125	NC_016023	GAT	2	6	12135	12140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750455
126	NC_016023	TTC	2	6	12189	12194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750455
127	NC_016023	TTA	2	6	12262	12267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347750455
128	NC_016023	AAT	3	9	12288	12296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347750455
129	NC_016023	GCG	2	6	12400	12405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750455
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135	NC_016023	GCG	2	6	12828	12833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347750455
136	NC_016023	TTC	2	6	12852	12857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750455
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153	NC_016023	GTT	2	6	13827	13832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750455
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162	NC_016023	CTG	2	6	14214	14219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347750455
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253	NC_016023	TCA	2	6	22230	22235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750461
254	NC_016023	CCG	2	6	22482	22487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750461
255	NC_016023	TCA	2	6	22578	22583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750461
256	NC_016023	TTG	2	6	22593	22598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347750461
257	NC_016023	ATG	2	6	22623	22628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750461
258	NC_016023	GCA	2	6	22642	22647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750461
259	NC_016023	CTT	2	6	22756	22761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750461
260	NC_016023	CCG	2	6	22861	22866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750461
261	NC_016023	TTC	2	6	22913	22918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750461
262	NC_016023	AGC	3	9	23013	23021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750461
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264	NC_016023	CTT	2	6	23512	23517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750462
265	NC_016023	CAG	2	6	23564	23569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750462
266	NC_016023	GCC	2	6	23573	23578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750462
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269	NC_016023	GCA	2	6	24048	24053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750462
270	NC_016023	CAC	2	6	24104	24109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347750462
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272	NC_016023	CTT	2	6	24301	24306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347750462
273	NC_016023	CAC	2	6	24392	24397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347750462
274	NC_016023	AGC	2	6	24429	24434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347750462
275	NC_016023	CCG	2	6	24498	24503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750462
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278	NC_016023	CCG	2	6	24945	24950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750463
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282	NC_016023	GAT	2	6	25166	25171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347750463
283	NC_016023	TCA	2	6	25255	25260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347750463
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285	NC_016023	GGT	2	6	25306	25311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347750463
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290	NC_016023	CCG	2	6	25636	25641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750463
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369	NC_016023	CCG	2	6	31504	31509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347750470
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