MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY020

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016021	CCCCAA	2	12	10233	10244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347626466
2	NC_016021	GACGGT	2	12	11827	11838	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347626468
3	NC_016021	ACAGTA	2	12	16258	16269	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016021	CTGTGG	2	12	17756	17767	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	347626475
5	NC_016021	AACCGC	2	12	18566	18577	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	347626476
6	NC_016021	GCTGAT	2	12	26804	26815	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347626485
7	NC_016021	GGATGG	2	12	29351	29362	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	347626486
8	NC_016021	CCAGCC	2	12	30314	30325	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	347626488
9	NC_016021	CGCGCC	2	12	30338	30349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347626488
10	NC_016021	CATCCA	2	12	32198	32209	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	347626489
11	NC_016021	CGTCAG	2	12	35469	35480	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347626492
12	NC_016021	TTCGGC	2	12	36021	36032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016021	CATTGC	2	12	36609	36620	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347626493
14	NC_016021	GCCGCA	2	12	49061	49072	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	347626501
15	NC_016021	CGGTGA	2	12	49708	49719	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347626502
16	NC_016021	GCGGTC	2	12	55957	55968	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347626508
17	NC_016021	GTCACG	2	12	56631	56642	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347626509
18	NC_016021	GGACAG	2	12	61708	61719	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347626518
19	NC_016021	GATAGT	2	12	68358	68369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347626527
20	NC_016021	GCTGGC	2	12	70383	70394	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347626531
21	NC_016021	GGCGTC	2	12	71545	71556	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	347626531

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.