MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY020

Total Repeats: 28

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016021	CGGTG	2	10	1055	1064	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016021	CGGCG	2	10	1568	1577	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3	NC_016021	GTTTT	2	10	5045	5054	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016021	GGGGC	2	10	5091	5100	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016021	TAAGT	2	10	9604	9613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016021	TCTGA	2	10	16308	16317	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016021	AGCTC	2	10	22553	22562	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
8	NC_016021	CCAGC	2	10	24252	24261	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_016021	GAGAT	2	10	26569	26578	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016021	TTTCT	2	10	32728	32737	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016021	ACCTT	2	10	45719	45728	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
12	NC_016021	CGCGT	2	10	45753	45762	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016021	CCGGG	2	10	45929	45938	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016021	CGGGG	2	10	46098	46107	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016021	TTGCC	2	10	56328	56337	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016021	CTCCC	2	10	59232	59241	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
17	NC_016021	GCAGC	2	10	60098	60107	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016021	CGCAG	2	10	60146	60155	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_016021	CGCAG	3	15	60345	60359	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016021	GCAGC	2	10	64282	64291	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016021	CGCAG	2	10	64330	64339	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016021	CGCAG	3	15	64528	64542	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_016021	GCAGC	2	10	66310	66319	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016021	CGCAG	2	10	66358	66367	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_016021	CGTAG	2	10	66557	66566	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016021	TATTC	2	10	67903	67912	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016021	GCAGC	2	10	71842	71851	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_016021	CGCAG	2	10	71890	71899	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.