MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY020

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016021	ATAA	2	8	1369	1376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016021	GGGC	2	8	2134	2141	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016021	CAAA	2	8	2704	2711	75 %	0 %	0 %	25 %	347626460
4	NC_016021	ATTT	2	8	2933	2940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016021	GTTT	2	8	3305	3312	0 %	75 %	25 %	0 %	347626461
6	NC_016021	TCCT	2	8	3668	3675	0 %	50 %	0 %	50 %	347626461
7	NC_016021	GCCG	2	8	4300	4307	0 %	0 %	50 %	50 %	347626461
8	NC_016021	GTTT	2	8	5489	5496	0 %	75 %	25 %	0 %	347626463
9	NC_016021	GGGT	2	8	5570	5577	0 %	25 %	75 %	0 %	347626463
10	NC_016021	GTTC	2	8	5836	5843	0 %	50 %	25 %	25 %	347626463
11	NC_016021	AGTC	2	8	5953	5960	25 %	25 %	25 %	25 %	347626463
12	NC_016021	CCAG	2	8	6044	6051	25 %	0 %	25 %	50 %	347626463
13	NC_016021	GAAT	2	8	6090	6097	50 %	25 %	25 %	0 %	347626463
14	NC_016021	TGCT	2	8	6309	6316	0 %	50 %	25 %	25 %	347626463
15	NC_016021	CGGA	2	8	6385	6392	25 %	0 %	50 %	25 %	347626463
16	NC_016021	CATT	2	8	6488	6495	25 %	50 %	0 %	25 %	347626463
17	NC_016021	GAGG	2	8	7531	7538	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016021	ATCA	2	8	7670	7677	50 %	25 %	0 %	25 %	347626464
19	NC_016021	GTCA	2	8	7854	7861	25 %	25 %	25 %	25 %	347626464
20	NC_016021	CAGC	2	8	8470	8477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_016021	AATA	2	8	9594	9601	75 %	25 %	0 %	0 %	347626465
22	NC_016021	CCCG	2	8	9828	9835	0 %	0 %	25 %	75 %	347626466
23	NC_016021	CGGA	2	8	10034	10041	25 %	0 %	50 %	25 %	347626466
24	NC_016021	GTCT	2	8	10292	10299	0 %	50 %	25 %	25 %	347626466
25	NC_016021	GGAG	2	8	10356	10363	25 %	0 %	75 %	0 %	347626466
26	NC_016021	AGTG	2	8	10706	10713	25 %	25 %	50 %	0 %	347626467
27	NC_016021	TCGC	2	8	10866	10873	0 %	25 %	25 %	50 %	347626467
28	NC_016021	GACG	2	8	10880	10887	25 %	0 %	50 %	25 %	347626467
29	NC_016021	TGGG	2	8	11243	11250	0 %	25 %	75 %	0 %	347626467
30	NC_016021	GCAA	2	8	11716	11723	50 %	0 %	25 %	25 %	347626468
31	NC_016021	CCGG	2	8	11855	11862	0 %	0 %	50 %	50 %	347626468
32	NC_016021	ATTC	2	8	12369	12376	25 %	50 %	0 %	25 %	347626468
33	NC_016021	CAAC	2	8	12431	12438	50 %	0 %	0 %	50 %	347626468
34	NC_016021	GGTA	2	8	12523	12530	25 %	25 %	50 %	0 %	347626468
35	NC_016021	GGCT	2	8	12585	12592	0 %	25 %	50 %	25 %	347626469
36	NC_016021	TGGC	2	8	13512	13519	0 %	25 %	50 %	25 %	347626469
37	NC_016021	TTCG	2	8	14348	14355	0 %	50 %	25 %	25 %	347626470
38	NC_016021	CGGC	2	8	14624	14631	0 %	0 %	50 %	50 %	347626470
39	NC_016021	GATG	2	8	14772	14779	25 %	25 %	50 %	0 %	347626470
40	NC_016021	CTTC	2	8	14898	14905	0 %	50 %	0 %	50 %	347626470
41	NC_016021	GTCG	2	8	15000	15007	0 %	25 %	50 %	25 %	347626470
42	NC_016021	CTAT	2	8	15338	15345	25 %	50 %	0 %	25 %	347626470
43	NC_016021	GCGG	2	8	15587	15594	0 %	0 %	75 %	25 %	347626471
44	NC_016021	GCTG	2	8	15662	15669	0 %	25 %	50 %	25 %	347626472
45	NC_016021	CCGT	2	8	17072	17079	0 %	25 %	25 %	50 %	347626474
46	NC_016021	CTCA	2	8	17552	17559	25 %	25 %	0 %	50 %	347626475
47	NC_016021	GCCT	2	8	17930	17937	0 %	25 %	25 %	50 %	347626475
48	NC_016021	GGGT	2	8	18924	18931	0 %	25 %	75 %	0 %	347626476
49	NC_016021	CGAA	2	8	19548	19555	50 %	0 %	25 %	25 %	347626477
50	NC_016021	GGAC	2	8	19820	19827	25 %	0 %	50 %	25 %	347626477
51	NC_016021	CGTA	2	8	19967	19974	25 %	25 %	25 %	25 %	347626477
52	NC_016021	GGGC	2	8	20197	20204	0 %	0 %	75 %	25 %	347626477
53	NC_016021	CGAC	2	8	20299	20306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016021	TTAA	2	8	20448	20455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016021	ACGA	2	8	20625	20632	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016021	GCTG	2	8	20842	20849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016021	ACCG	2	8	20881	20888	25 %	0 %	25 %	50 %	347626478
58	NC_016021	GACC	2	8	21679	21686	25 %	0 %	25 %	50 %	347626479
59	NC_016021	GAGC	2	8	22563	22570	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016021	CGTC	2	8	23565	23572	0 %	25 %	25 %	50 %	347626480
61	NC_016021	GCGT	2	8	23729	23736	0 %	25 %	50 %	25 %	347626480
62	NC_016021	CTTC	2	8	23774	23781	0 %	50 %	0 %	50 %	347626480
63	NC_016021	GGCG	2	8	24104	24111	0 %	0 %	75 %	25 %	347626481
64	NC_016021	TCAG	2	8	24140	24147	25 %	25 %	25 %	25 %	347626481
65	NC_016021	GAAG	2	8	24222	24229	50 %	0 %	50 %	0 %	347626481
66	NC_016021	CCGT	2	8	24315	24322	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016021	CCAG	2	8	24468	24475	25 %	0 %	25 %	50 %	347626482
68	NC_016021	CGCT	2	8	25223	25230	0 %	25 %	25 %	50 %	347626482
69	NC_016021	GATG	2	8	25951	25958	25 %	25 %	50 %	0 %	347626484
70	NC_016021	GTCA	2	8	26126	26133	25 %	25 %	25 %	25 %	347626484
71	NC_016021	GCCT	2	8	26958	26965	0 %	25 %	25 %	50 %	347626485
72	NC_016021	TCAT	2	8	27193	27200	25 %	50 %	0 %	25 %	347626485
73	NC_016021	TTCT	2	8	27459	27466	0 %	75 %	0 %	25 %	347626485
74	NC_016021	GCCA	2	8	27528	27535	25 %	0 %	25 %	50 %	347626485
75	NC_016021	CATA	2	8	27608	27615	50 %	25 %	0 %	25 %	347626485
76	NC_016021	CCTC	2	8	28022	28029	0 %	25 %	0 %	75 %	347626485
77	NC_016021	GTTC	2	8	28362	28369	0 %	50 %	25 %	25 %	347626485
78	NC_016021	TCGA	2	8	28462	28469	25 %	25 %	25 %	25 %	347626485
79	NC_016021	CCAG	2	8	28663	28670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016021	CGGG	2	8	28690	28697	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016021	CCGT	2	8	29774	29781	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016021	GCCA	2	8	30163	30170	25 %	0 %	25 %	50 %	347626488
83	NC_016021	TTTC	2	8	31078	31085	0 %	75 %	0 %	25 %	347626488
84	NC_016021	CTGT	2	8	31305	31312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016021	GACG	2	8	31409	31416	25 %	0 %	50 %	25 %	347626489
86	NC_016021	CTTC	2	8	32048	32055	0 %	50 %	0 %	50 %	347626489
87	NC_016021	CGGG	2	8	32218	32225	0 %	0 %	75 %	25 %	347626489
88	NC_016021	CTGC	2	8	32309	32316	0 %	25 %	25 %	50 %	347626489
89	NC_016021	GCCA	2	8	32352	32359	25 %	0 %	25 %	50 %	347626489
90	NC_016021	TCTG	2	8	32692	32699	0 %	50 %	25 %	25 %	347626489
91	NC_016021	CGTC	2	8	33443	33450	0 %	25 %	25 %	50 %	347626490
92	NC_016021	GCGT	2	8	33607	33614	0 %	25 %	50 %	25 %	347626490
93	NC_016021	CTTC	2	8	33652	33659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016021	GTAG	2	8	33722	33729	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016021	ACGA	2	8	34014	34021	50 %	0 %	25 %	25 %	347626491
96	NC_016021	GGAC	2	8	34142	34149	25 %	0 %	50 %	25 %	347626491
97	NC_016021	GGTC	2	8	35129	35136	0 %	25 %	50 %	25 %	347626492
98	NC_016021	GAAA	2	8	35767	35774	75 %	0 %	25 %	0 %	347626492
99	NC_016021	CTGG	2	8	35947	35954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016021	ATCG	2	8	36660	36667	25 %	25 %	25 %	25 %	347626493
101	NC_016021	CCAT	2	8	36900	36907	25 %	25 %	0 %	50 %	347626493
102	NC_016021	ACGC	2	8	37377	37384	25 %	0 %	25 %	50 %	347626493
103	NC_016021	GCTG	2	8	37434	37441	0 %	25 %	50 %	25 %	347626493
104	NC_016021	TGCC	2	8	37447	37454	0 %	25 %	25 %	50 %	347626493
105	NC_016021	CCTT	2	8	37802	37809	0 %	50 %	0 %	50 %	347626493
106	NC_016021	CCTT	2	8	38542	38549	0 %	50 %	0 %	50 %	347626494
107	NC_016021	CAGG	2	8	38897	38904	25 %	0 %	50 %	25 %	347626494
108	NC_016021	TGTT	2	8	39727	39734	0 %	75 %	25 %	0 %	347626494
109	NC_016021	TTTC	2	8	40051	40058	0 %	75 %	0 %	25 %	347626495
110	NC_016021	GCGG	2	8	40126	40133	0 %	0 %	75 %	25 %	347626495
111	NC_016021	GGTT	2	8	40161	40168	0 %	50 %	50 %	0 %	347626495
112	NC_016021	TGGA	2	8	41013	41020	25 %	25 %	50 %	0 %	347626496
113	NC_016021	CTCC	2	8	42024	42031	0 %	25 %	0 %	75 %	347626496
114	NC_016021	AGAA	2	8	42488	42495	75 %	0 %	25 %	0 %	347626496
115	NC_016021	CGTC	2	8	43054	43061	0 %	25 %	25 %	50 %	347626496
116	NC_016021	ATGG	2	8	43490	43497	25 %	25 %	50 %	0 %	347626497
117	NC_016021	AAAT	2	8	44045	44052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016021	ACTT	2	8	44435	44442	25 %	50 %	0 %	25 %	347626498
119	NC_016021	CAAC	2	8	44464	44471	50 %	0 %	0 %	50 %	347626498
120	NC_016021	CAGA	2	8	44631	44638	50 %	0 %	25 %	25 %	347626498
121	NC_016021	TGAG	2	8	44890	44897	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016021	AATC	2	8	44899	44906	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016021	CCCT	2	8	45189	45196	0 %	25 %	0 %	75 %	347626499
124	NC_016021	GCCA	2	8	45225	45232	25 %	0 %	25 %	50 %	347626499
125	NC_016021	GCGA	2	8	45400	45407	25 %	0 %	50 %	25 %	347626499
126	NC_016021	AGGC	2	8	46561	46568	25 %	0 %	50 %	25 %	347626500
127	NC_016021	TGGC	2	8	47156	47163	0 %	25 %	50 %	25 %	347626500
128	NC_016021	ATGA	2	8	47936	47943	50 %	25 %	25 %	0 %	347626500
129	NC_016021	CGCC	2	8	48093	48100	0 %	0 %	25 %	75 %	347626500
130	NC_016021	TTGC	2	8	49379	49386	0 %	50 %	25 %	25 %	347626502
131	NC_016021	CGGC	2	8	49575	49582	0 %	0 %	50 %	50 %	347626502
132	NC_016021	CCGG	2	8	49683	49690	0 %	0 %	50 %	50 %	347626502
133	NC_016021	CTGG	2	8	49724	49731	0 %	25 %	50 %	25 %	347626502
134	NC_016021	ACCG	2	8	49768	49775	25 %	0 %	25 %	50 %	347626502
135	NC_016021	CGCC	2	8	50374	50381	0 %	0 %	25 %	75 %	347626502
136	NC_016021	AGGA	2	8	50550	50557	50 %	0 %	50 %	0 %	347626502
137	NC_016021	CAGA	2	8	50596	50603	50 %	0 %	25 %	25 %	347626502
138	NC_016021	CTTG	2	8	51313	51320	0 %	50 %	25 %	25 %	347626502
139	NC_016021	TCCG	2	8	51468	51475	0 %	25 %	25 %	50 %	347626502
140	NC_016021	CCCT	2	8	51668	51675	0 %	25 %	0 %	75 %	347626502
141	NC_016021	GATG	2	8	51776	51783	25 %	25 %	50 %	0 %	347626502
142	NC_016021	CATC	2	8	52219	52226	25 %	25 %	0 %	50 %	347626502
143	NC_016021	CATC	2	8	52630	52637	25 %	25 %	0 %	50 %	347626502
144	NC_016021	GCTC	2	8	52759	52766	0 %	25 %	25 %	50 %	347626502
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176	NC_016021	CCGG	2	8	62254	62261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
177	NC_016021	TGCT	2	8	62381	62388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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179	NC_016021	TCTG	2	8	62864	62871	0 %	50 %	25 %	25 %	347626520
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186	NC_016021	CCCT	2	8	64883	64890	0 %	25 %	0 %	75 %	347626523
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.