MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY020

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016021	ATAA	2	8	1369	1376	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016021	GGGC	2	8	2134	2141	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016021	ATTT	2	8	2933	2940	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016021	GAGG	2	8	7531	7538	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016021	CAGC	2	8	8470	8477	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016021	CGAC	2	8	20299	20306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016021	TTAA	2	8	20448	20455	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016021	ACGA	2	8	20625	20632	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016021	GCTG	2	8	20842	20849	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016021	GAGC	2	8	22563	22570	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016021	CCGT	2	8	24315	24322	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016021	CCAG	2	8	28663	28670	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016021	CGGG	2	8	28690	28697	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016021	CCGT	2	8	29774	29781	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016021	CTGT	2	8	31305	31312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016021	CTTC	2	8	33652	33659	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016021	GTAG	2	8	33722	33729	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016021	CTGG	2	8	35947	35954	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016021	AAAT	2	8	44045	44052	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016021	TGAG	2	8	44890	44897	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016021	AATC	2	8	44899	44906	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016021	GACG	2	8	53410	53417	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016021	AGGG	2	8	55610	55617	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016021	CGGC	2	8	56295	56302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016021	CCCT	2	8	59896	59903	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
26	NC_016021	AGGG	2	8	59971	59978	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016021	TTCG	2	8	60067	60074	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016021	CGCA	2	8	60459	60466	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016021	GGGT	2	8	62145	62152	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016021	GACC	2	8	62198	62205	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016021	CCGG	2	8	62254	62261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016021	TGCT	2	8	62381	62388	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016021	GTTT	2	8	62956	62963	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016021	CCCG	2	8	64119	64126	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_016021	AGGG	2	8	64155	64162	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016021	TTCG	2	8	64251	64258	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016021	TTCG	2	8	66279	66286	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016021	CCCT	2	8	71633	71640	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
39	NC_016021	AGGA	2	8	71654	71661	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016021	CCCG	2	8	71679	71686	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
41	NC_016021	AGGG	2	8	71715	71722	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016021	TTCG	2	8	71811	71818	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016021	AGAA	2	8	72287	72294	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016021	CATT	2	8	74605	74612	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016021	GAGC	2	8	74613	74620	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016021	ACAA	2	8	76045	76052	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.