MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Gluconacetobacter xylinus NBRC 3288 plasmid pGXY020

Total Repeats: 169

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016021	CAAA	2	8	2704	2711	75 %	0 %	0 %	25 %	347626460
2	NC_016021	GTTT	2	8	3305	3312	0 %	75 %	25 %	0 %	347626461
3	NC_016021	TCCT	2	8	3668	3675	0 %	50 %	0 %	50 %	347626461
4	NC_016021	GCCG	2	8	4300	4307	0 %	0 %	50 %	50 %	347626461
5	NC_016021	GTTT	2	8	5489	5496	0 %	75 %	25 %	0 %	347626463
6	NC_016021	GGGT	2	8	5570	5577	0 %	25 %	75 %	0 %	347626463
7	NC_016021	GTTC	2	8	5836	5843	0 %	50 %	25 %	25 %	347626463
8	NC_016021	AGTC	2	8	5953	5960	25 %	25 %	25 %	25 %	347626463
9	NC_016021	CCAG	2	8	6044	6051	25 %	0 %	25 %	50 %	347626463
10	NC_016021	GAAT	2	8	6090	6097	50 %	25 %	25 %	0 %	347626463
11	NC_016021	TGCT	2	8	6309	6316	0 %	50 %	25 %	25 %	347626463
12	NC_016021	CGGA	2	8	6385	6392	25 %	0 %	50 %	25 %	347626463
13	NC_016021	CATT	2	8	6488	6495	25 %	50 %	0 %	25 %	347626463
14	NC_016021	ATCA	2	8	7670	7677	50 %	25 %	0 %	25 %	347626464
15	NC_016021	GTCA	2	8	7854	7861	25 %	25 %	25 %	25 %	347626464
16	NC_016021	AATA	2	8	9594	9601	75 %	25 %	0 %	0 %	347626465
17	NC_016021	CCCG	2	8	9828	9835	0 %	0 %	25 %	75 %	347626466
18	NC_016021	CGGA	2	8	10034	10041	25 %	0 %	50 %	25 %	347626466
19	NC_016021	GTCT	2	8	10292	10299	0 %	50 %	25 %	25 %	347626466
20	NC_016021	GGAG	2	8	10356	10363	25 %	0 %	75 %	0 %	347626466
21	NC_016021	AGTG	2	8	10706	10713	25 %	25 %	50 %	0 %	347626467
22	NC_016021	TCGC	2	8	10866	10873	0 %	25 %	25 %	50 %	347626467
23	NC_016021	GACG	2	8	10880	10887	25 %	0 %	50 %	25 %	347626467
24	NC_016021	TGGG	2	8	11243	11250	0 %	25 %	75 %	0 %	347626467
25	NC_016021	GCAA	2	8	11716	11723	50 %	0 %	25 %	25 %	347626468
26	NC_016021	CCGG	2	8	11855	11862	0 %	0 %	50 %	50 %	347626468
27	NC_016021	ATTC	2	8	12369	12376	25 %	50 %	0 %	25 %	347626468
28	NC_016021	CAAC	2	8	12431	12438	50 %	0 %	0 %	50 %	347626468
29	NC_016021	GGTA	2	8	12523	12530	25 %	25 %	50 %	0 %	347626468
30	NC_016021	GGCT	2	8	12585	12592	0 %	25 %	50 %	25 %	347626469
31	NC_016021	TGGC	2	8	13512	13519	0 %	25 %	50 %	25 %	347626469
32	NC_016021	TTCG	2	8	14348	14355	0 %	50 %	25 %	25 %	347626470
33	NC_016021	CGGC	2	8	14624	14631	0 %	0 %	50 %	50 %	347626470
34	NC_016021	GATG	2	8	14772	14779	25 %	25 %	50 %	0 %	347626470
35	NC_016021	CTTC	2	8	14898	14905	0 %	50 %	0 %	50 %	347626470
36	NC_016021	GTCG	2	8	15000	15007	0 %	25 %	50 %	25 %	347626470
37	NC_016021	CTAT	2	8	15338	15345	25 %	50 %	0 %	25 %	347626470
38	NC_016021	GCGG	2	8	15587	15594	0 %	0 %	75 %	25 %	347626471
39	NC_016021	GCTG	2	8	15662	15669	0 %	25 %	50 %	25 %	347626472
40	NC_016021	CCGT	2	8	17072	17079	0 %	25 %	25 %	50 %	347626474
41	NC_016021	CTCA	2	8	17552	17559	25 %	25 %	0 %	50 %	347626475
42	NC_016021	GCCT	2	8	17930	17937	0 %	25 %	25 %	50 %	347626475
43	NC_016021	GGGT	2	8	18924	18931	0 %	25 %	75 %	0 %	347626476
44	NC_016021	CGAA	2	8	19548	19555	50 %	0 %	25 %	25 %	347626477
45	NC_016021	GGAC	2	8	19820	19827	25 %	0 %	50 %	25 %	347626477
46	NC_016021	CGTA	2	8	19967	19974	25 %	25 %	25 %	25 %	347626477
47	NC_016021	GGGC	2	8	20197	20204	0 %	0 %	75 %	25 %	347626477
48	NC_016021	ACCG	2	8	20881	20888	25 %	0 %	25 %	50 %	347626478
49	NC_016021	GACC	2	8	21679	21686	25 %	0 %	25 %	50 %	347626479
50	NC_016021	CGTC	2	8	23565	23572	0 %	25 %	25 %	50 %	347626480
51	NC_016021	GCGT	2	8	23729	23736	0 %	25 %	50 %	25 %	347626480
52	NC_016021	CTTC	2	8	23774	23781	0 %	50 %	0 %	50 %	347626480
53	NC_016021	GGCG	2	8	24104	24111	0 %	0 %	75 %	25 %	347626481
54	NC_016021	TCAG	2	8	24140	24147	25 %	25 %	25 %	25 %	347626481
55	NC_016021	GAAG	2	8	24222	24229	50 %	0 %	50 %	0 %	347626481
56	NC_016021	CCAG	2	8	24468	24475	25 %	0 %	25 %	50 %	347626482
57	NC_016021	CGCT	2	8	25223	25230	0 %	25 %	25 %	50 %	347626482
58	NC_016021	GATG	2	8	25951	25958	25 %	25 %	50 %	0 %	347626484
59	NC_016021	GTCA	2	8	26126	26133	25 %	25 %	25 %	25 %	347626484
60	NC_016021	GCCT	2	8	26958	26965	0 %	25 %	25 %	50 %	347626485
61	NC_016021	TCAT	2	8	27193	27200	25 %	50 %	0 %	25 %	347626485
62	NC_016021	TTCT	2	8	27459	27466	0 %	75 %	0 %	25 %	347626485
63	NC_016021	GCCA	2	8	27528	27535	25 %	0 %	25 %	50 %	347626485
64	NC_016021	CATA	2	8	27608	27615	50 %	25 %	0 %	25 %	347626485
65	NC_016021	CCTC	2	8	28022	28029	0 %	25 %	0 %	75 %	347626485
66	NC_016021	GTTC	2	8	28362	28369	0 %	50 %	25 %	25 %	347626485
67	NC_016021	TCGA	2	8	28462	28469	25 %	25 %	25 %	25 %	347626485
68	NC_016021	GCCA	2	8	30163	30170	25 %	0 %	25 %	50 %	347626488
69	NC_016021	TTTC	2	8	31078	31085	0 %	75 %	0 %	25 %	347626488
70	NC_016021	GACG	2	8	31409	31416	25 %	0 %	50 %	25 %	347626489
71	NC_016021	CTTC	2	8	32048	32055	0 %	50 %	0 %	50 %	347626489
72	NC_016021	CGGG	2	8	32218	32225	0 %	0 %	75 %	25 %	347626489
73	NC_016021	CTGC	2	8	32309	32316	0 %	25 %	25 %	50 %	347626489
74	NC_016021	GCCA	2	8	32352	32359	25 %	0 %	25 %	50 %	347626489
75	NC_016021	TCTG	2	8	32692	32699	0 %	50 %	25 %	25 %	347626489
76	NC_016021	CGTC	2	8	33443	33450	0 %	25 %	25 %	50 %	347626490
77	NC_016021	GCGT	2	8	33607	33614	0 %	25 %	50 %	25 %	347626490
78	NC_016021	ACGA	2	8	34014	34021	50 %	0 %	25 %	25 %	347626491
79	NC_016021	GGAC	2	8	34142	34149	25 %	0 %	50 %	25 %	347626491
80	NC_016021	GGTC	2	8	35129	35136	0 %	25 %	50 %	25 %	347626492
81	NC_016021	GAAA	2	8	35767	35774	75 %	0 %	25 %	0 %	347626492
82	NC_016021	ATCG	2	8	36660	36667	25 %	25 %	25 %	25 %	347626493
83	NC_016021	CCAT	2	8	36900	36907	25 %	25 %	0 %	50 %	347626493
84	NC_016021	ACGC	2	8	37377	37384	25 %	0 %	25 %	50 %	347626493
85	NC_016021	GCTG	2	8	37434	37441	0 %	25 %	50 %	25 %	347626493
86	NC_016021	TGCC	2	8	37447	37454	0 %	25 %	25 %	50 %	347626493
87	NC_016021	CCTT	2	8	37802	37809	0 %	50 %	0 %	50 %	347626493
88	NC_016021	CCTT	2	8	38542	38549	0 %	50 %	0 %	50 %	347626494
89	NC_016021	CAGG	2	8	38897	38904	25 %	0 %	50 %	25 %	347626494
90	NC_016021	TGTT	2	8	39727	39734	0 %	75 %	25 %	0 %	347626494
91	NC_016021	TTTC	2	8	40051	40058	0 %	75 %	0 %	25 %	347626495
92	NC_016021	GCGG	2	8	40126	40133	0 %	0 %	75 %	25 %	347626495
93	NC_016021	GGTT	2	8	40161	40168	0 %	50 %	50 %	0 %	347626495
94	NC_016021	TGGA	2	8	41013	41020	25 %	25 %	50 %	0 %	347626496
95	NC_016021	CTCC	2	8	42024	42031	0 %	25 %	0 %	75 %	347626496
96	NC_016021	AGAA	2	8	42488	42495	75 %	0 %	25 %	0 %	347626496
97	NC_016021	CGTC	2	8	43054	43061	0 %	25 %	25 %	50 %	347626496
98	NC_016021	ATGG	2	8	43490	43497	25 %	25 %	50 %	0 %	347626497
99	NC_016021	ACTT	2	8	44435	44442	25 %	50 %	0 %	25 %	347626498
100	NC_016021	CAAC	2	8	44464	44471	50 %	0 %	0 %	50 %	347626498
101	NC_016021	CAGA	2	8	44631	44638	50 %	0 %	25 %	25 %	347626498
102	NC_016021	CCCT	2	8	45189	45196	0 %	25 %	0 %	75 %	347626499
103	NC_016021	GCCA	2	8	45225	45232	25 %	0 %	25 %	50 %	347626499
104	NC_016021	GCGA	2	8	45400	45407	25 %	0 %	50 %	25 %	347626499
105	NC_016021	AGGC	2	8	46561	46568	25 %	0 %	50 %	25 %	347626500
106	NC_016021	TGGC	2	8	47156	47163	0 %	25 %	50 %	25 %	347626500
107	NC_016021	ATGA	2	8	47936	47943	50 %	25 %	25 %	0 %	347626500
108	NC_016021	CGCC	2	8	48093	48100	0 %	0 %	25 %	75 %	347626500
109	NC_016021	TTGC	2	8	49379	49386	0 %	50 %	25 %	25 %	347626502
110	NC_016021	CGGC	2	8	49575	49582	0 %	0 %	50 %	50 %	347626502
111	NC_016021	CCGG	2	8	49683	49690	0 %	0 %	50 %	50 %	347626502
112	NC_016021	CTGG	2	8	49724	49731	0 %	25 %	50 %	25 %	347626502
113	NC_016021	ACCG	2	8	49768	49775	25 %	0 %	25 %	50 %	347626502
114	NC_016021	CGCC	2	8	50374	50381	0 %	0 %	25 %	75 %	347626502
115	NC_016021	AGGA	2	8	50550	50557	50 %	0 %	50 %	0 %	347626502
116	NC_016021	CAGA	2	8	50596	50603	50 %	0 %	25 %	25 %	347626502
117	NC_016021	CTTG	2	8	51313	51320	0 %	50 %	25 %	25 %	347626502
118	NC_016021	TCCG	2	8	51468	51475	0 %	25 %	25 %	50 %	347626502
119	NC_016021	CCCT	2	8	51668	51675	0 %	25 %	0 %	75 %	347626502
120	NC_016021	GATG	2	8	51776	51783	25 %	25 %	50 %	0 %	347626502
121	NC_016021	CATC	2	8	52219	52226	25 %	25 %	0 %	50 %	347626502
122	NC_016021	CATC	2	8	52630	52637	25 %	25 %	0 %	50 %	347626502
123	NC_016021	GCTC	2	8	52759	52766	0 %	25 %	25 %	50 %	347626502
124	NC_016021	TCAT	2	8	52877	52884	25 %	50 %	0 %	25 %	347626503
125	NC_016021	ACAG	2	8	53459	53466	50 %	0 %	25 %	25 %	347626504
126	NC_016021	CTAA	2	8	54007	54014	50 %	25 %	0 %	25 %	347626504
127	NC_016021	ACGG	2	8	54747	54754	25 %	0 %	50 %	25 %	347626505
128	NC_016021	GGCG	2	8	55294	55301	0 %	0 %	75 %	25 %	347626506
129	NC_016021	GGGC	2	8	55513	55520	0 %	0 %	75 %	25 %	347626506
130	NC_016021	TTCA	2	8	55732	55739	25 %	50 %	0 %	25 %	347626507
131	NC_016021	CCGG	2	8	56159	56166	0 %	0 %	50 %	50 %	347626508
132	NC_016021	GTGA	2	8	57345	57352	25 %	25 %	50 %	0 %	347626510
133	NC_016021	CCTG	2	8	57353	57360	0 %	25 %	25 %	50 %	347626510
134	NC_016021	CAGA	2	8	57577	57584	50 %	0 %	25 %	25 %	347626511
135	NC_016021	TTAC	2	8	57882	57889	25 %	50 %	0 %	25 %	347626511
136	NC_016021	CCGG	2	8	58638	58645	0 %	0 %	50 %	50 %	347626512
137	NC_016021	CGTT	2	8	58902	58909	0 %	50 %	25 %	25 %	347626513
138	NC_016021	CGCT	2	8	59041	59048	0 %	25 %	25 %	50 %	347626513
139	NC_016021	GATG	2	8	59651	59658	25 %	25 %	50 %	0 %	347626514
140	NC_016021	TGAT	2	8	59682	59689	25 %	50 %	25 %	0 %	347626515
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147	NC_016021	TCTG	2	8	62864	62871	0 %	50 %	25 %	25 %	347626520
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169	NC_016021	GAAA	2	8	75821	75828	75 %	0 %	25 %	0 %	347626536

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.