MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit

Total Repeats: 905

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016012	TATAAA	2	12	2068	2079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541854
2	NC_016012	ATATAA	2	12	2157	2168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541854
3	NC_016012	ATATAA	2	12	3043	3054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541855
4	NC_016012	AAATTT	2	12	4112	4123	50 %	50 %	0 %	0 %	347541856
5	NC_016012	GAATAA	2	12	4759	4770	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347541857
6	NC_016012	CTGATG	2	12	5656	5667	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347541857
7	NC_016012	TAGAGT	2	12	7406	7417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541858
8	NC_016012	TGTTAT	2	12	9106	9117	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347541859
9	NC_016012	TTAATA	2	12	10749	10760	50 %	50 %	0 %	0 %	347541861
10	NC_016012	GTATAT	2	12	10818	10829	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541861
11	NC_016012	GAAATT	2	12	11973	11984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541861
12	NC_016012	CAAAAA	2	12	12980	12991	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	347541862
13	NC_016012	ATAGAT	2	12	13543	13554	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541862
14	NC_016012	TTATGA	2	12	13611	13622	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541862
15	NC_016012	GATATA	2	12	13715	13726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541862
16	NC_016012	TTTAAA	2	12	15295	15306	50 %	50 %	0 %	0 %	347541862
17	NC_016012	GAATTT	2	12	15400	15411	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541862
18	NC_016012	TATGAT	2	12	19068	19079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541863
19	NC_016012	TATCTG	2	12	19105	19116	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347541863
20	NC_016012	GAATTT	2	12	19440	19451	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541863
21	NC_016012	CTATAT	2	12	20691	20702	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347541864
22	NC_016012	ATATAA	2	12	20973	20984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541865
23	NC_016012	GTCATT	2	12	26215	26226	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347541869
24	NC_016012	ACGGGA	2	12	26582	26593	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347541869
25	NC_016012	AATGTA	2	12	27932	27943	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541871
26	NC_016012	GAAAAA	2	12	32052	32063	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016012	TGATAT	2	12	32867	32878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541874
28	NC_016012	GATTAT	2	12	33348	33359	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541874
29	NC_016012	ATAACT	2	12	34194	34205	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347541876
30	NC_016012	AAATCT	2	12	35370	35381	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347541877
31	NC_016012	TATAAA	2	12	36073	36084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541878
32	NC_016012	TAAAGT	2	12	36105	36116	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541878
33	NC_016012	TATTAA	2	12	36747	36758	50 %	50 %	0 %	0 %	347541878
34	NC_016012	GTGTAT	2	12	37406	37417	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347541879
35	NC_016012	TTTTCA	2	12	37793	37804	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347541879
36	NC_016012	ATAATT	2	12	40657	40668	50 %	50 %	0 %	0 %	347541882
37	NC_016012	AAATTA	2	12	41083	41094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016012	GAAATA	2	12	44821	44832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347541885
39	NC_016012	TTATTT	2	12	45255	45266	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016012	ATTAAA	2	12	51381	51392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541889
41	NC_016012	ATATTT	2	12	52512	52523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541889
42	NC_016012	GCATCA	2	12	62521	62532	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347541895
43	NC_016012	AGTATA	2	12	62758	62769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541895
44	NC_016012	AAAACA	2	12	63779	63790	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	347541896
45	NC_016012	TAAAAA	2	12	63905	63916	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016012	AATTTA	2	12	64036	64047	50 %	50 %	0 %	0 %	347541897
47	NC_016012	AGTAAT	2	12	66809	66820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541899
48	NC_016012	ATATTT	2	12	67781	67792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541900
49	NC_016012	GTTCAT	2	12	70561	70572	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347541902
50	NC_016012	ATGAAA	2	12	72230	72241	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347541904
51	NC_016012	ATTTAA	2	12	72381	72392	50 %	50 %	0 %	0 %	347541904
52	NC_016012	TTGTGG	2	12	78230	78241	0 %	50 %	50 %	0 %	347541910
53	NC_016012	TTTAAA	2	12	81020	81031	50 %	50 %	0 %	0 %	347541914
54	NC_016012	ATAATT	2	12	84674	84685	50 %	50 %	0 %	0 %	347541919
55	NC_016012	AACATT	2	12	94216	94227	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347541925
56	NC_016012	AATTTA	2	12	97378	97389	50 %	50 %	0 %	0 %	347541927
57	NC_016012	AGATGG	2	12	97752	97763	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347541927
58	NC_016012	AAAGAT	2	12	98007	98018	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347541928
59	NC_016012	AGATAA	2	12	98912	98923	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347541928
60	NC_016012	AATTGG	2	12	101491	101502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541930
61	NC_016012	GAGTAT	2	12	104282	104293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541933
62	NC_016012	TGATAT	2	12	105648	105659	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541934
63	NC_016012	TAAATT	2	12	106083	106094	50 %	50 %	0 %	0 %	347541934
64	NC_016012	TATTCT	2	12	107961	107972	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347541935
65	NC_016012	AGTTTA	2	12	114131	114142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016012	TTGAGG	2	12	115655	115666	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	347541940
67	NC_016012	AGATGA	2	12	116304	116315	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347541941
68	NC_016012	AAATTT	2	12	117919	117930	50 %	50 %	0 %	0 %	347541942
69	NC_016012	ATATGG	2	12	122229	122240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541945
70	NC_016012	GAAGAG	2	12	125201	125212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016012	TGGAAA	2	12	125359	125370	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347541948
72	NC_016012	TAAAAT	2	12	126297	126308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541948
73	NC_016012	TTTTTG	2	12	128210	128221	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347541951
74	NC_016012	ATTTTG	2	12	130329	130340	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347541954
75	NC_016012	AGTTTG	2	12	130909	130920	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347541955
76	NC_016012	TATAGT	2	12	131867	131878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541956
77	NC_016012	CTTACA	2	12	133101	133112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347541957
78	NC_016012	AGATAT	2	12	133675	133686	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541958
79	NC_016012	TTTAAT	2	12	134180	134191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541958
80	NC_016012	TTTTAT	2	12	136834	136845	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347541961
81	NC_016012	TTGATT	2	12	137815	137826	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347541961
82	NC_016012	AAAGGT	2	12	138059	138070	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347541961
83	NC_016012	ATAAAT	2	12	138477	138488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541962
84	NC_016012	GAATTT	2	12	140615	140626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541965
85	NC_016012	ATTTTT	2	12	141943	141954	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347541966
86	NC_016012	TTTAAT	2	12	147253	147264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541967
87	NC_016012	TATTAA	2	12	147323	147334	50 %	50 %	0 %	0 %	347541967
88	NC_016012	TAATTA	2	12	147923	147934	50 %	50 %	0 %	0 %	347541967
89	NC_016012	TAAAGT	2	12	149127	149138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541968
90	NC_016012	GAAGGG	2	12	157600	157611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347541975
91	NC_016012	GTAAAT	2	12	158530	158541	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541975
92	NC_016012	AGATCA	2	12	161186	161197	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347541977
93	NC_016012	AATTTA	2	12	161884	161895	50 %	50 %	0 %	0 %	347541978
94	NC_016012	TATGAG	2	12	162173	162184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541978
95	NC_016012	ATTGTA	2	12	163696	163707	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541979
96	NC_016012	TCCAAC	2	12	166898	166909	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	347541982
97	NC_016012	CAGCTG	2	12	168341	168352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347541983
98	NC_016012	TAAAGA	2	12	169983	169994	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347541985
99	NC_016012	ATTTCT	2	12	173285	173296	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347541988
100	NC_016012	GCCTAT	2	12	178206	178217	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347541993
101	NC_016012	ATATTT	2	12	179311	179322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016012	TAAAAC	2	12	184211	184222	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	347541997
103	NC_016012	CAGAAG	2	12	184594	184605	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347541997
104	NC_016012	TTTATA	2	12	188463	188474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541998
105	NC_016012	AAATTA	2	12	188839	188850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016012	ATTTTA	2	12	189524	189535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347542000
107	NC_016012	AATGGT	2	12	190064	190075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542000
108	NC_016012	AGTTTT	2	12	191208	191219	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347542001
109	NC_016012	AAGATA	2	12	192241	192252	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347542002
110	NC_016012	AATAAA	2	12	193783	193794	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347542002
111	NC_016012	GTATAG	2	12	196452	196463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542005
112	NC_016012	TATATT	2	12	197002	197013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347542005
113	NC_016012	TTACAT	2	12	198906	198917	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347542007
114	NC_016012	ATTAAA	2	12	199110	199121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016012	ACTATA	2	12	202184	202195	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347542010
116	NC_016012	GAAGAT	2	12	206545	206556	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347542015
117	NC_016012	AAGTGT	2	12	213428	213439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542019
118	NC_016012	TATTTT	2	12	214202	214213	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016012	TATTGA	2	12	214666	214677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347542021
120	NC_016012	TTTATA	2	12	215798	215809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347542022
121	NC_016012	ATGGAT	2	12	216775	216786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542022
122	NC_016012	GATAAA	2	12	216865	216876	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347542022
123	NC_016012	ATTGCT	2	12	218820	218831	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347542025
124	NC_016012	AGTGGA	2	12	222477	222488	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347542028
125	NC_016012	TGAGGT	2	12	227581	227592	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	347542032
126	NC_016012	TTTTAA	2	12	232814	232825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016012	TTGAAA	2	12	233132	233143	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347542036
128	NC_016012	TTAAAT	2	12	235900	235911	50 %	50 %	0 %	0 %	347542036
129	NC_016012	ATTATG	2	12	238511	238522	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347542040
130	NC_016012	ATTTTG	2	12	239772	239783	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347542041
131	NC_016012	CCTATA	2	12	242039	242050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347542043
132	NC_016012	ATTTTT	2	12	242215	242226	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347542044
133	NC_016012	GAGTTT	2	12	242383	242394	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347542044
134	NC_016012	GAGTTT	2	12	242527	242538	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347542044
135	NC_016012	ATATGG	2	12	244648	244659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542046
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137	NC_016012	GATGTA	2	12	247257	247268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542048
138	NC_016012	ATTTTG	2	12	249492	249503	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347542050
139	NC_016012	GATTTG	2	12	250625	250636	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347542051
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141	NC_016012	ATAGCA	2	12	253447	253458	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347542053
142	NC_016012	TAAGAA	2	12	254534	254545	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347542053
143	NC_016012	ATTTTA	2	12	257009	257020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347542055
144	NC_016012	TTATAA	2	12	257213	257224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016012	AAATGG	2	12	258092	258103	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347542056
146	NC_016012	TTAAAT	2	12	261629	261640	50 %	50 %	0 %	0 %	347542058
147	NC_016012	AAAATA	2	12	273227	273238	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347542060
148	NC_016012	TTTAGA	2	12	275056	275067	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347542062
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151	NC_016012	TATATC	2	12	278623	278634	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347542065
152	NC_016012	TAATAT	2	12	279089	279100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016012	AGTTGA	2	12	282240	282251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542068
154	NC_016012	TTATTT	2	12	283175	283186	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347542069
155	NC_016012	TTTTAT	2	12	284187	284198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347542069
156	NC_016012	TAATTT	2	12	286746	286757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347542072
157	NC_016012	ATTTAT	2	12	286774	286785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347542072
158	NC_016012	GTTGAT	2	12	287973	287984	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347542073
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163	NC_016012	TTTTTA	2	12	295923	295934	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_016012	AATAAA	2	12	296615	296626	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347542084
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169	NC_016012	TATAAA	2	12	307831	307842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347542095
170	NC_016012	TATTTT	2	12	310828	310839	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_016012	ATAGAA	2	12	311604	311615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347542100
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179	NC_016012	TGGATA	2	12	324121	324132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542113
180	NC_016012	TAAATA	2	12	324563	324574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347542113
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186	NC_016012	AATATT	2	12	328188	328199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_016012	AATATA	2	12	328589	328600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347542119
188	NC_016012	AAATTT	2	12	336013	336024	50 %	50 %	0 %	0 %	347542126
189	NC_016012	CATTTA	2	12	336165	336176	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347542126
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192	NC_016012	TAATAT	2	12	344346	344357	50 %	50 %	0 %	0 %	347542135
193	NC_016012	TTAATT	2	12	345172	345183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_016012	GTTTTT	2	12	346626	346637	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347542137
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197	NC_016012	TAGATA	2	12	349305	349316	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347542140
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227	NC_016012	TAGTAT	2	12	386759	386770	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347542173
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233	NC_016012	TAGATG	2	12	397463	397474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542184
234	NC_016012	ATAGGT	2	12	398694	398705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542186
235	NC_016012	AGCTTA	2	12	401722	401733	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347542191
236	NC_016012	GTATTG	2	12	401929	401940	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347542191
237	NC_016012	TGAATT	2	12	402533	402544	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347542191
238	NC_016012	AACTCT	2	12	405294	405305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347542195
239	NC_016012	TGGAGA	2	12	405883	405894	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347542196
240	NC_016012	TTGGAG	2	12	406998	407009	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	347542197
241	NC_016012	GCATCT	2	12	407180	407191	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347542197
242	NC_016012	ATGAAA	2	12	408136	408147	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347542198
243	NC_016012	ATTTTT	2	12	412026	412037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347542201
244	NC_016012	TTTAAT	2	12	414118	414129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_016012	ACTGAA	2	12	418344	418355	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347542206
246	NC_016012	GGAATG	2	12	418797	418808	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347542206
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254	NC_016012	TTAATT	2	12	431132	431143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_016012	TAAATT	2	12	436553	436564	50 %	50 %	0 %	0 %	347542222
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261	NC_016012	ATTTAA	2	12	447968	447979	50 %	50 %	0 %	0 %	347542227
262	NC_016012	AGATTA	2	12	448188	448199	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_016012	TTTAAA	2	12	453180	453191	50 %	50 %	0 %	0 %	347542232
266	NC_016012	TAAATT	2	12	454612	454623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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343	NC_016012	TTGGAT	2	12	580498	580509	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347542341
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345	NC_016012	ATTTTG	2	12	582518	582529	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347542342
346	NC_016012	GATAAA	2	12	583485	583496	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347542343
347	NC_016012	GGAATT	2	12	584300	584311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
348	NC_016012	TTTAAA	2	12	585034	585045	50 %	50 %	0 %	0 %	347542346
349	NC_016012	GATAAG	2	12	585589	585600	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347542347
350	NC_016012	TGGATT	2	12	588703	588714	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347542350
351	NC_016012	TTGAGG	2	12	595500	595511	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	347542356
352	NC_016012	TAATTG	2	12	596948	596959	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
353	NC_016012	ATAGTA	2	12	596965	596976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
354	NC_016012	TTAAAA	2	12	608515	608526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347542370
355	NC_016012	AAATAA	2	12	612298	612309	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347542373
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357	NC_016012	ATAAAA	2	12	613431	613442	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347542376
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359	NC_016012	AATTAA	2	12	616778	616789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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470	NC_016012	TCAACA	2	12	807253	807264	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	347542551
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