MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit

Total Repeats: 75

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016012	GAAAAA	2	12	32052	32063	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016012	AAATTA	2	12	41083	41094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016012	TTATTT	2	12	45255	45266	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016012	TAAAAA	2	12	63905	63916	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016012	AGTTTA	2	12	114131	114142	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016012	GAAGAG	2	12	125201	125212	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016012	ATATTT	2	12	179311	179322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016012	AAATTA	2	12	188839	188850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016012	ATTAAA	2	12	199110	199121	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016012	TATTTT	2	12	214202	214213	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016012	TTTTAA	2	12	232814	232825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016012	TTATAA	2	12	257213	257224	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016012	TAATAT	2	12	279089	279100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016012	TTTTTA	2	12	295923	295934	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016012	TATTTT	2	12	310828	310839	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016012	AATATT	2	12	328188	328199	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016012	TTAATT	2	12	345172	345183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016012	AATTAA	2	12	371966	371977	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016012	ATTTTT	2	12	384155	384166	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016012	TTTAAT	2	12	414118	414129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016012	TTAATT	2	12	431132	431143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016012	TACAAA	2	12	447504	447515	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016012	AGATTA	2	12	448188	448199	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016012	TAAATA	2	12	449253	449264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016012	TAAATT	2	12	454612	454623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016012	TTAATT	2	12	536957	536968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016012	ATAAAG	2	12	557033	557044	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016012	GGAATT	2	12	584300	584311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016012	TAATTG	2	12	596948	596959	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016012	ATAGTA	2	12	596965	596976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016012	AATTAA	2	12	616778	616789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016012	TATTGG	2	12	623061	623072	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016012	ATTGAA	2	12	670847	670858	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016012	ACAACC	2	12	671661	671672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016012	AGTTTA	2	12	739421	739432	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016012	TAAATC	2	12	779439	779450	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016012	AAATTT	2	12	793846	793857	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016012	CAAAAA	2	12	797179	797190	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016012	ATAAAA	2	12	811122	811133	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016012	AACTAA	2	12	857478	857489	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016012	AAATTT	2	12	877161	877172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016012	CTTAAT	2	12	881715	881726	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016012	TTAAAA	2	12	882102	882113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016012	TTTTTA	2	12	907182	907193	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016012	ATTTTT	2	12	966552	966563	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016012	TGCTTT	2	12	967619	967630	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016012	AAATTA	2	12	968607	968618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016012	CATATT	2	12	983078	983089	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016012	TATTCA	2	12	1047665	1047676	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016012	TATCTA	2	12	1065397	1065408	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016012	TAATTA	2	12	1075778	1075789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016012	TAAAAA	2	12	1082688	1082699	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016012	TTCAAA	2	12	1120142	1120153	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016012	TCCAAT	2	12	1142892	1142903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016012	TTAATT	2	12	1153228	1153239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016012	CATAAT	2	12	1153844	1153855	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_016012	TAAAAA	2	12	1155269	1155280	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016012	TTTATA	2	12	1160766	1160777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016012	TCTTAT	2	12	1227243	1227254	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016012	ATTTTT	2	12	1232382	1232393	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016012	TTATTT	2	12	1232409	1232420	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016012	ATTGTT	2	12	1251767	1251778	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016012	ATTAAA	2	12	1260248	1260259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016012	TTTATT	2	12	1270290	1270301	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016012	TAAAAA	2	12	1295507	1295518	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016012	ATATAA	2	12	1340039	1340050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016012	ATTTTT	2	12	1344727	1344738	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016012	TATAAA	2	12	1347198	1347209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016012	CATTAT	2	12	1374911	1374922	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016012	TTTCTC	2	12	1452713	1452724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016012	AAATTG	2	12	1453482	1453493	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016012	TAATAT	2	12	1454661	1454672	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016012	TAAAAA	2	12	1459046	1459057	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016012	ATTTTT	2	12	1482116	1482127	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016012	TTAAAT	2	12	1487091	1487102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.