MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit

Total Repeats: 830

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016012	TATAAA	2	12	2068	2079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541854
2	NC_016012	ATATAA	2	12	2157	2168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541854
3	NC_016012	ATATAA	2	12	3043	3054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541855
4	NC_016012	AAATTT	2	12	4112	4123	50 %	50 %	0 %	0 %	347541856
5	NC_016012	GAATAA	2	12	4759	4770	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347541857
6	NC_016012	CTGATG	2	12	5656	5667	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347541857
7	NC_016012	TAGAGT	2	12	7406	7417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541858
8	NC_016012	TGTTAT	2	12	9106	9117	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347541859
9	NC_016012	TTAATA	2	12	10749	10760	50 %	50 %	0 %	0 %	347541861
10	NC_016012	GTATAT	2	12	10818	10829	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541861
11	NC_016012	GAAATT	2	12	11973	11984	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541861
12	NC_016012	CAAAAA	2	12	12980	12991	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	347541862
13	NC_016012	ATAGAT	2	12	13543	13554	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541862
14	NC_016012	TTATGA	2	12	13611	13622	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541862
15	NC_016012	GATATA	2	12	13715	13726	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541862
16	NC_016012	TTTAAA	2	12	15295	15306	50 %	50 %	0 %	0 %	347541862
17	NC_016012	GAATTT	2	12	15400	15411	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541862
18	NC_016012	TATGAT	2	12	19068	19079	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541863
19	NC_016012	TATCTG	2	12	19105	19116	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347541863
20	NC_016012	GAATTT	2	12	19440	19451	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541863
21	NC_016012	CTATAT	2	12	20691	20702	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347541864
22	NC_016012	ATATAA	2	12	20973	20984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541865
23	NC_016012	GTCATT	2	12	26215	26226	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347541869
24	NC_016012	ACGGGA	2	12	26582	26593	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347541869
25	NC_016012	AATGTA	2	12	27932	27943	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541871
26	NC_016012	TGATAT	2	12	32867	32878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541874
27	NC_016012	GATTAT	2	12	33348	33359	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541874
28	NC_016012	ATAACT	2	12	34194	34205	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347541876
29	NC_016012	AAATCT	2	12	35370	35381	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347541877
30	NC_016012	TATAAA	2	12	36073	36084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541878
31	NC_016012	TAAAGT	2	12	36105	36116	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541878
32	NC_016012	TATTAA	2	12	36747	36758	50 %	50 %	0 %	0 %	347541878
33	NC_016012	GTGTAT	2	12	37406	37417	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347541879
34	NC_016012	TTTTCA	2	12	37793	37804	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347541879
35	NC_016012	ATAATT	2	12	40657	40668	50 %	50 %	0 %	0 %	347541882
36	NC_016012	GAAATA	2	12	44821	44832	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347541885
37	NC_016012	ATTAAA	2	12	51381	51392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541889
38	NC_016012	ATATTT	2	12	52512	52523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541889
39	NC_016012	GCATCA	2	12	62521	62532	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347541895
40	NC_016012	AGTATA	2	12	62758	62769	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541895
41	NC_016012	AAAACA	2	12	63779	63790	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	347541896
42	NC_016012	AATTTA	2	12	64036	64047	50 %	50 %	0 %	0 %	347541897
43	NC_016012	AGTAAT	2	12	66809	66820	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541899
44	NC_016012	ATATTT	2	12	67781	67792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541900
45	NC_016012	GTTCAT	2	12	70561	70572	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347541902
46	NC_016012	ATGAAA	2	12	72230	72241	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347541904
47	NC_016012	ATTTAA	2	12	72381	72392	50 %	50 %	0 %	0 %	347541904
48	NC_016012	TTGTGG	2	12	78230	78241	0 %	50 %	50 %	0 %	347541910
49	NC_016012	TTTAAA	2	12	81020	81031	50 %	50 %	0 %	0 %	347541914
50	NC_016012	ATAATT	2	12	84674	84685	50 %	50 %	0 %	0 %	347541919
51	NC_016012	AACATT	2	12	94216	94227	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347541925
52	NC_016012	AATTTA	2	12	97378	97389	50 %	50 %	0 %	0 %	347541927
53	NC_016012	AGATGG	2	12	97752	97763	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347541927
54	NC_016012	AAAGAT	2	12	98007	98018	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347541928
55	NC_016012	AGATAA	2	12	98912	98923	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347541928
56	NC_016012	AATTGG	2	12	101491	101502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541930
57	NC_016012	GAGTAT	2	12	104282	104293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541933
58	NC_016012	TGATAT	2	12	105648	105659	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541934
59	NC_016012	TAAATT	2	12	106083	106094	50 %	50 %	0 %	0 %	347541934
60	NC_016012	TATTCT	2	12	107961	107972	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347541935
61	NC_016012	TTGAGG	2	12	115655	115666	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	347541940
62	NC_016012	AGATGA	2	12	116304	116315	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347541941
63	NC_016012	AAATTT	2	12	117919	117930	50 %	50 %	0 %	0 %	347541942
64	NC_016012	ATATGG	2	12	122229	122240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541945
65	NC_016012	TGGAAA	2	12	125359	125370	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347541948
66	NC_016012	TAAAAT	2	12	126297	126308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541948
67	NC_016012	TTTTTG	2	12	128210	128221	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347541951
68	NC_016012	ATTTTG	2	12	130329	130340	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347541954
69	NC_016012	AGTTTG	2	12	130909	130920	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347541955
70	NC_016012	TATAGT	2	12	131867	131878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541956
71	NC_016012	CTTACA	2	12	133101	133112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347541957
72	NC_016012	AGATAT	2	12	133675	133686	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541958
73	NC_016012	TTTAAT	2	12	134180	134191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541958
74	NC_016012	TTTTAT	2	12	136834	136845	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347541961
75	NC_016012	TTGATT	2	12	137815	137826	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347541961
76	NC_016012	AAAGGT	2	12	138059	138070	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347541961
77	NC_016012	ATAAAT	2	12	138477	138488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541962
78	NC_016012	GAATTT	2	12	140615	140626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541965
79	NC_016012	ATTTTT	2	12	141943	141954	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347541966
80	NC_016012	TTTAAT	2	12	147253	147264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541967
81	NC_016012	TATTAA	2	12	147323	147334	50 %	50 %	0 %	0 %	347541967
82	NC_016012	TAATTA	2	12	147923	147934	50 %	50 %	0 %	0 %	347541967
83	NC_016012	TAAAGT	2	12	149127	149138	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541968
84	NC_016012	GAAGGG	2	12	157600	157611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347541975
85	NC_016012	GTAAAT	2	12	158530	158541	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347541975
86	NC_016012	AGATCA	2	12	161186	161197	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347541977
87	NC_016012	AATTTA	2	12	161884	161895	50 %	50 %	0 %	0 %	347541978
88	NC_016012	TATGAG	2	12	162173	162184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541978
89	NC_016012	ATTGTA	2	12	163696	163707	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347541979
90	NC_016012	TCCAAC	2	12	166898	166909	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	347541982
91	NC_016012	CAGCTG	2	12	168341	168352	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347541983
92	NC_016012	TAAAGA	2	12	169983	169994	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347541985
93	NC_016012	ATTTCT	2	12	173285	173296	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347541988
94	NC_016012	GCCTAT	2	12	178206	178217	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347541993
95	NC_016012	TAAAAC	2	12	184211	184222	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	347541997
96	NC_016012	CAGAAG	2	12	184594	184605	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347541997
97	NC_016012	TTTATA	2	12	188463	188474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541998
98	NC_016012	ATTTTA	2	12	189524	189535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347542000
99	NC_016012	AATGGT	2	12	190064	190075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542000
100	NC_016012	AGTTTT	2	12	191208	191219	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347542001
101	NC_016012	AAGATA	2	12	192241	192252	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347542002
102	NC_016012	AATAAA	2	12	193783	193794	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347542002
103	NC_016012	GTATAG	2	12	196452	196463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542005
104	NC_016012	TATATT	2	12	197002	197013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347542005
105	NC_016012	TTACAT	2	12	198906	198917	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347542007
106	NC_016012	ACTATA	2	12	202184	202195	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347542010
107	NC_016012	GAAGAT	2	12	206545	206556	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347542015
108	NC_016012	AAGTGT	2	12	213428	213439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542019
109	NC_016012	TATTGA	2	12	214666	214677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347542021
110	NC_016012	TTTATA	2	12	215798	215809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347542022
111	NC_016012	ATGGAT	2	12	216775	216786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542022
112	NC_016012	GATAAA	2	12	216865	216876	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347542022
113	NC_016012	ATTGCT	2	12	218820	218831	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347542025
114	NC_016012	AGTGGA	2	12	222477	222488	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347542028
115	NC_016012	TGAGGT	2	12	227581	227592	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	347542032
116	NC_016012	TTGAAA	2	12	233132	233143	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347542036
117	NC_016012	TTAAAT	2	12	235900	235911	50 %	50 %	0 %	0 %	347542036
118	NC_016012	ATTATG	2	12	238511	238522	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347542040
119	NC_016012	ATTTTG	2	12	239772	239783	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347542041
120	NC_016012	CCTATA	2	12	242039	242050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347542043
121	NC_016012	ATTTTT	2	12	242215	242226	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347542044
122	NC_016012	GAGTTT	2	12	242383	242394	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347542044
123	NC_016012	GAGTTT	2	12	242527	242538	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347542044
124	NC_016012	ATATGG	2	12	244648	244659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542046
125	NC_016012	ATTTAA	2	12	246192	246203	50 %	50 %	0 %	0 %	347542047
126	NC_016012	GATGTA	2	12	247257	247268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542048
127	NC_016012	ATTTTG	2	12	249492	249503	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347542050
128	NC_016012	GATTTG	2	12	250625	250636	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347542051
129	NC_016012	GATATA	2	12	251129	251140	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347542051
130	NC_016012	ATAGCA	2	12	253447	253458	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347542053
131	NC_016012	TAAGAA	2	12	254534	254545	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347542053
132	NC_016012	ATTTTA	2	12	257009	257020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347542055
133	NC_016012	AAATGG	2	12	258092	258103	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347542056
134	NC_016012	TTAAAT	2	12	261629	261640	50 %	50 %	0 %	0 %	347542058
135	NC_016012	AAAATA	2	12	273227	273238	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347542060
136	NC_016012	TTTAGA	2	12	275056	275067	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347542062
137	NC_016012	AGTTTG	2	12	278451	278462	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347542065
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139	NC_016012	TATATC	2	12	278623	278634	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	347542065
140	NC_016012	AGTTGA	2	12	282240	282251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542068
141	NC_016012	TTATTT	2	12	283175	283186	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347542069
142	NC_016012	TTTTAT	2	12	284187	284198	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347542069
143	NC_016012	TAATTT	2	12	286746	286757	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347542072
144	NC_016012	ATTTAT	2	12	286774	286785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347542072
145	NC_016012	GTTGAT	2	12	287973	287984	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347542073
146	NC_016012	TTTTAG	2	12	292428	292439	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347542079
147	NC_016012	AATGGA	2	12	292564	292575	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347542079
148	NC_016012	GAAAAT	2	12	293792	293803	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347542081
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150	NC_016012	AATAAA	2	12	296615	296626	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347542084
151	NC_016012	GTAAAA	2	12	299578	299589	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347542086
152	NC_016012	AGATAT	2	12	300581	300592	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347542087
153	NC_016012	ACCTAA	2	12	300974	300985	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	347542088
154	NC_016012	TATCTT	2	12	306603	306614	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347542095
155	NC_016012	TATAAA	2	12	307831	307842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347542095
156	NC_016012	ATAGAA	2	12	311604	311615	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347542100
157	NC_016012	CCATTT	2	12	313092	313103	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	347542100
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160	NC_016012	GGTAAA	2	12	318581	318592	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347542106
161	NC_016012	ACTATA	2	12	319903	319914	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347542108
162	NC_016012	TGGATA	2	12	320717	320728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542109
163	NC_016012	TAAATT	2	12	323248	323259	50 %	50 %	0 %	0 %	347542111
164	NC_016012	TGGATA	2	12	324121	324132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542113
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180	NC_016012	TAGATA	2	12	349305	349316	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347542140
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187	NC_016012	ATGATA	2	12	355949	355960	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347542146
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225	NC_016012	ACTGAA	2	12	418344	418355	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347542206
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229	NC_016012	TTTAGG	2	12	423116	423127	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347542211
230	NC_016012	ATTGCT	2	12	423818	423829	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347542212
231	NC_016012	TGTTAT	2	12	423997	424008	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347542212
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233	NC_016012	GGATAT	2	12	426372	426383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347542214
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235	NC_016012	AAAGAT	2	12	435668	435679	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347542222
236	NC_016012	TAAATT	2	12	436553	436564	50 %	50 %	0 %	0 %	347542222
237	NC_016012	AAATGA	2	12	443096	443107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347542223
238	NC_016012	ATTGTT	2	12	446062	446073	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347542226
239	NC_016012	ATTTAA	2	12	447968	447979	50 %	50 %	0 %	0 %	347542227
240	NC_016012	GATATT	2	12	448382	448393	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347542228
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242	NC_016012	ATAAAT	2	12	455112	455123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347542233
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351	NC_016012	GGAAAA	2	12	656032	656043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347542415
352	NC_016012	TGAAAT	2	12	658943	658954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347542421
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464	NC_016012	TACAAA	2	12	864215	864226	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	347542607
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468	NC_016012	TTTAAA	2	12	870796	870807	50 %	50 %	0 %	0 %	347542612
469	NC_016012	TGATCT	2	12	871853	871864	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347542613
470	NC_016012	ATCACC	2	12	872436	872447	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	347542614
471	NC_016012	TTTCTA	2	12	873628	873639	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347542615
472	NC_016012	TTAGTA	2	12	875038	875049	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347542616
473	NC_016012	TTAGTT	2	12	875062	875073	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347542616
474	NC_016012	TTTTAC	2	12	875325	875336	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347542616
475	NC_016012	CCATTT	2	12	875981	875992	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	347542617
476	NC_016012	AAACAA	2	12	878110	878121	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	347542619
477	NC_016012	ATTTTT	2	12	887368	887379	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347542625
478	NC_016012	AATGAA	2	12	891754	891765	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347542629
479	NC_016012	GTGCCT	2	12	892009	892020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347542629
480	NC_016012	ATATTG	2	12	900882	900893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347542637
481	NC_016012	AAATGT	2	12	901010	901021	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347542638
482	NC_016012	TTTAAT	2	12	904318	904329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347542641
483	NC_016012	GTTAAT	2	12	909217	909228	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347542645
484	NC_016012	TCTGAA	2	12	909550	909561	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347542645
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490	NC_016012	CTAACT	2	12	920739	920750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347542655
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493	NC_016012	ATTTTA	2	12	923955	923966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347542659
494	NC_016012	AATTGA	2	12	924019	924030	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347542659
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497	NC_016012	CAAGCC	2	12	928055	928066	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	347542663
498	NC_016012	CAAACA	2	12	930531	930542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347542666
499	NC_016012	CATTCT	2	12	931707	931718	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	347542667
500	NC_016012	ATTAAC	2	12	932083	932094	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347542668

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