MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Candidatus Arthromitus sp. SFB-rat-Yit

Total Repeats: 20843

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016012	TAA	2	6	138	143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541853
2	NC_016012	AAT	2	6	195	200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541853
3	NC_016012	ATA	2	6	302	307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541853
4	NC_016012	CTT	2	6	323	328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347541853
5	NC_016012	TGT	2	6	369	374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347541853
6	NC_016012	TGC	2	6	399	404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347541853
7	NC_016012	ATT	2	6	447	452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541853
8	NC_016012	AAT	2	6	520	525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541853
9	NC_016012	GTT	2	6	538	543	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347541853
10	NC_016012	TTA	2	6	563	568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541853
11	NC_016012	TGA	2	6	648	653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541853
12	NC_016012	AAG	2	6	686	691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347541853
13	NC_016012	TAA	2	6	726	731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541853
14	NC_016012	GAA	2	6	781	786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347541853
15	NC_016012	CAA	2	6	923	928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347541853
16	NC_016012	AGT	2	6	972	977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541853
17	NC_016012	AAG	2	6	1025	1030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347541853
18	NC_016012	TAA	2	6	1043	1048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541853
19	NC_016012	TAA	2	6	1053	1058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541853
20	NC_016012	AAT	2	6	1065	1070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541853
21	NC_016012	ACT	2	6	1103	1108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347541853
22	NC_016012	AGA	2	6	1141	1146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347541853
23	NC_016012	TGG	2	6	1236	1241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347541853
24	NC_016012	TAC	2	6	1251	1256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347541853
25	NC_016012	TAA	2	6	1311	1316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541853
26	NC_016012	TAA	3	9	1347	1355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541853
27	NC_016012	ATA	2	6	1356	1361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541853
28	NC_016012	GTA	2	6	1680	1685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541854
29	NC_016012	GAT	2	6	1700	1705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541854
30	NC_016012	AAT	2	6	1706	1711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541854
31	NC_016012	ATT	2	6	1786	1791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541854
32	NC_016012	ATA	2	6	1817	1822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541854
33	NC_016012	ATT	2	6	1883	1888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541854
34	NC_016012	TCA	2	6	1889	1894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347541854
35	NC_016012	ATT	2	6	1975	1980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541854
36	NC_016012	TGA	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541854
37	NC_016012	AAT	2	6	2081	2086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541854
38	NC_016012	ATA	2	6	2145	2150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541854
39	NC_016012	GAT	2	6	2219	2224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541854
40	NC_016012	AAT	2	6	2246	2251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541854
41	NC_016012	AAT	2	6	2270	2275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541854
42	NC_016012	AAT	2	6	2326	2331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541854
43	NC_016012	ATT	2	6	2401	2406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541854
44	NC_016012	ACA	2	6	2421	2426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347541854
45	NC_016012	AGA	2	6	2449	2454	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347541854
46	NC_016012	TTC	2	6	2476	2481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347541854
47	NC_016012	AGG	2	6	2496	2501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347541854
48	NC_016012	TAA	2	6	2508	2513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541854
49	NC_016012	TTG	2	6	2559	2564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347541854
50	NC_016012	TAA	3	9	2608	2616	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541854
51	NC_016012	TAA	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541854
52	NC_016012	TAG	2	6	2842	2847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541855
53	NC_016012	TAA	2	6	2849	2854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541855
54	NC_016012	AAC	2	6	2918	2923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347541855
55	NC_016012	GAT	2	6	2988	2993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541855
56	NC_016012	TAG	2	6	3004	3009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541855
57	NC_016012	TAG	2	6	3068	3073	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541855
58	NC_016012	TTA	2	6	3103	3108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541855
59	NC_016012	AAT	2	6	3131	3136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541855
60	NC_016012	AGA	2	6	3156	3161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347541855
61	NC_016012	TAT	2	6	3212	3217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541855
62	NC_016012	TAA	2	6	3224	3229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541855
63	NC_016012	ATG	2	6	3295	3300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541855
64	NC_016012	TAA	2	6	3401	3406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541855
65	NC_016012	ATA	2	6	3414	3419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541855
66	NC_016012	ATA	2	6	3460	3465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541855
67	NC_016012	GAT	2	6	3555	3560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541855
68	NC_016012	AAG	2	6	3583	3588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347541855
69	NC_016012	ATT	2	6	3595	3600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541855
70	NC_016012	CAA	2	6	3612	3617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347541855
71	NC_016012	ATA	2	6	3657	3662	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541855
72	NC_016012	GAT	2	6	3699	3704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541855
73	NC_016012	TAT	2	6	3706	3711	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541855
74	NC_016012	AGG	2	6	3729	3734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347541855
75	NC_016012	TGA	2	6	3975	3980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541856
76	NC_016012	ATT	2	6	4007	4012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541856
77	NC_016012	TGT	2	6	4023	4028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347541856
78	NC_016012	TAA	2	6	4088	4093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541856
79	NC_016012	AAT	2	6	4161	4166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541857
80	NC_016012	ATG	2	6	4177	4182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541857
81	NC_016012	TCA	2	6	4268	4273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347541857
82	NC_016012	TAG	2	6	4288	4293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541857
83	NC_016012	ATA	2	6	4294	4299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541857
84	NC_016012	TGA	2	6	4304	4309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541857
85	NC_016012	TTA	2	6	4438	4443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541857
86	NC_016012	TAC	2	6	4450	4455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347541857
87	NC_016012	TGG	2	6	4460	4465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347541857
88	NC_016012	GGA	2	6	4497	4502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347541857
89	NC_016012	GTT	2	6	4524	4529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347541857
90	NC_016012	TAG	2	6	4595	4600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541857
91	NC_016012	GAT	2	6	4614	4619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541857
92	NC_016012	AAC	2	6	4637	4642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347541857
93	NC_016012	GGC	2	6	4818	4823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347541857
94	NC_016012	TGA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541857
95	NC_016012	CTT	2	6	5020	5025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347541857
96	NC_016012	ATA	2	6	5077	5082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541857
97	NC_016012	TAT	2	6	5297	5302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541857
98	NC_016012	GCT	2	6	5304	5309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347541857
99	NC_016012	ACT	2	6	5343	5348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347541857
100	NC_016012	CAT	2	6	5371	5376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347541857
101	NC_016012	TTG	2	6	5434	5439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347541857
102	NC_016012	ATC	2	6	5555	5560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347541857
103	NC_016012	TTA	2	6	5694	5699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541857
104	NC_016012	CCT	2	6	5760	5765	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347541857
105	NC_016012	GAA	3	9	5811	5819	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347541857
106	NC_016012	TAA	2	6	5857	5862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541857
107	NC_016012	ACT	2	6	5913	5918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347541857
108	NC_016012	AGA	2	6	6018	6023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347541857
109	NC_016012	AAT	2	6	6036	6041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541857
110	NC_016012	TAA	2	6	6173	6178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541858
111	NC_016012	AGA	2	6	6226	6231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347541858
112	NC_016012	TTG	2	6	6296	6301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347541858
113	NC_016012	ATG	2	6	6347	6352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541858
114	NC_016012	ATG	2	6	6536	6541	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541858
115	NC_016012	TTA	2	6	6590	6595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541858
116	NC_016012	ATC	2	6	6600	6605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347541858
117	NC_016012	CCT	2	6	6637	6642	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347541858
118	NC_016012	ATA	2	6	6670	6675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541858
119	NC_016012	TGA	2	6	6684	6689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541858
120	NC_016012	GGT	2	6	6751	6756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347541858
121	NC_016012	TAA	2	6	6863	6868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541858
122	NC_016012	TAA	2	6	6891	6896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541858
123	NC_016012	ATA	2	6	7030	7035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541858
124	NC_016012	TTA	2	6	7082	7087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541858
125	NC_016012	AGA	2	6	7177	7182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347541858
126	NC_016012	ATA	2	6	7250	7255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541858
127	NC_016012	ATT	2	6	7264	7269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541858
128	NC_016012	TAA	2	6	7274	7279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541858
129	NC_016012	AAT	2	6	7291	7296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541858
130	NC_016012	TAA	2	6	7316	7321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541858
131	NC_016012	TAA	2	6	7436	7441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541858
132	NC_016012	AGA	2	6	7534	7539	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347541858
133	NC_016012	GTT	2	6	7609	7614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347541858
134	NC_016012	GAG	2	6	7676	7681	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347541858
135	NC_016012	TCA	2	6	7819	7824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347541858
136	NC_016012	TAA	2	6	7856	7861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347541858
137	NC_016012	GTT	2	6	7888	7893	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347541858
138	NC_016012	GAT	2	6	7912	7917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541858
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140	NC_016012	TTA	2	6	7952	7957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541858
141	NC_016012	ATG	2	6	8027	8032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541858
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143	NC_016012	TGT	2	6	8352	8357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347541858
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162	NC_016012	TGA	2	6	9735	9740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541860
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165	NC_016012	ATT	2	6	9988	9993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541860
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258	NC_016012	TAT	2	6	15615	15620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541862
259	NC_016012	AAG	2	6	15706	15711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347541862
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261	NC_016012	TAT	2	6	15742	15747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541862
262	NC_016012	TGA	2	6	15768	15773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347541862
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380	NC_016012	ATT	2	6	25403	25408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347541868
381	NC_016012	CTA	2	6	25498	25503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347541868
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