MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55

Total Repeats: 172

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016011	CTATTA	2	12	1786	1797	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016011	GCGTAA	2	12	22881	22892	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016011	AATATA	2	12	30154	30165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016011	AACAGA	2	12	64248	64259	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016011	GATTGG	2	12	65617	65628	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016011	TCGCTT	2	12	75826	75837	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016011	AAAGCA	2	12	101678	101689	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016011	ACTTAA	2	12	185651	185662	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016011	TTTGGG	2	12	187434	187445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016011	ATGGAG	2	12	190829	190840	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016011	ATGAGT	2	12	191102	191113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016011	AATAGT	2	12	195927	195938	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016011	ATTCAA	2	12	221535	221546	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016011	AAGGAA	2	12	223106	223117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016011	TAGGCG	2	12	224761	224772	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016011	ATTCAA	2	12	227555	227566	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_016011	AAGGAA	2	12	229126	229137	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016011	TAGGCG	2	12	230781	230792	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_016011	TATAAA	2	12	238764	238775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016011	TTGGTT	2	12	245372	245383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016011	TTATAT	2	12	254836	254847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016011	ATCAAT	2	12	288009	288020	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016011	TTTTAT	2	12	289610	289621	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016011	CTTTTA	2	12	290168	290179	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016011	GATATA	2	12	309916	309927	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016011	CTATTG	2	12	322124	322135	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016011	TCTCCC	2	12	375335	375346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_016011	AAGATA	2	12	389967	389978	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016011	AGCAAC	2	12	393455	393466	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_016011	TAGCCA	2	12	416922	416933	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016011	GATATA	2	12	423927	423938	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016011	AAATGT	2	12	451509	451520	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016011	TTACTT	2	12	454193	454204	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016011	AAATGT	2	12	470239	470250	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016011	GGAAAA	2	12	493704	493715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016011	TCGAAA	2	12	493871	493882	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016011	ATTTTT	2	12	513725	513736	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016011	GAATTT	2	12	531566	531577	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016011	AAAAAT	2	12	541871	541882	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016011	TTATTT	2	12	567806	567817	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016011	ATCATT	2	12	574356	574367	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016011	AGAGGA	2	12	615217	615228	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016011	AAAGAG	2	12	708536	708547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016011	TACAAA	2	12	739705	739716	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016011	ATTTTT	2	12	810907	810918	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016011	ATCAAA	2	12	812155	812166	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016011	CAAAAG	2	12	812417	812428	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016011	GTAATC	2	12	854960	854971	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_016011	TTACAA	2	12	854978	854989	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016011	ATGAAA	2	12	863586	863597	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016011	AGTCTA	2	12	872926	872937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016011	CGCCCC	2	12	884518	884529	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
53	NC_016011	ACCTAT	2	12	907944	907955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016011	AAACAA	2	12	931661	931672	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016011	ATTTTA	2	12	937534	937545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016011	ATCGAA	2	12	948310	948321	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_016011	GTATTG	2	12	966790	966801	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016011	TTGACT	2	12	997627	997638	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016011	GAGGAA	2	12	1007850	1007861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016011	GATTTT	2	12	1066876	1066887	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016011	ATAAAA	2	12	1078090	1078101	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016011	TTTATG	2	12	1104091	1104102	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016011	TGAAAA	2	12	1123862	1123873	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016011	ACAAAA	2	12	1125644	1125655	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016011	CTTTTT	2	12	1157933	1157944	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016011	AATAAA	2	12	1189423	1189434	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016011	CAAAAA	2	12	1191063	1191074	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_016011	TCTTTT	2	12	1192926	1192937	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016011	TTTAAA	2	12	1221986	1221997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016011	GAAAAA	2	12	1227117	1227128	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016011	ATAAAA	2	12	1232071	1232082	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016011	AAAATG	2	12	1253581	1253592	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016011	TTAATT	2	12	1256519	1256530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016011	AATTTA	2	12	1269217	1269228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016011	AAAAAT	2	12	1297300	1297311	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016011	GTACAA	2	12	1388896	1388907	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_016011	AAATCA	2	12	1422444	1422455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016011	ACTGAA	2	12	1423617	1423628	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016011	TACAGT	2	12	1431337	1431348	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016011	TAGTTG	2	12	1431478	1431489	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016011	CAACTG	2	12	1432513	1432524	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016011	TACCAA	2	12	1450799	1450810	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016011	TTTCAT	2	12	1474847	1474858	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_016011	AAAGCC	2	12	1493657	1493668	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016011	TTTCTC	2	12	1502914	1502925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016011	TTTCTC	2	12	1504905	1504916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016011	TAAAAA	2	12	1505028	1505039	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016011	AAAAAG	2	12	1505067	1505078	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016011	TTTTAG	2	12	1558520	1558531	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016011	CTCTTC	2	12	1576728	1576739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016011	GATAAC	2	12	1597661	1597672	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016011	CTCTTC	2	12	1630477	1630488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016011	TTTTTA	2	12	1632493	1632504	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016011	AAGAAT	2	12	1632704	1632715	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016011	GTTTTT	2	12	1653826	1653837	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016011	TGGCTT	2	12	1661081	1661092	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016011	GACTTT	2	12	1662397	1662408	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016011	AAATAA	2	12	1702600	1702611	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016011	GAAAAA	2	12	1704484	1704495	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016011	TGTTTT	2	12	1704774	1704785	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016011	ATTTTA	2	12	1713258	1713269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016011	CGCCTA	2	12	1749808	1749819	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016011	TTTCCT	2	12	1751462	1751473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016011	TTGAAT	2	12	1753034	1753045	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016011	ATATAG	2	12	1764481	1764492	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016011	TATATT	2	12	1784743	1784754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016011	TGGTTT	2	12	1790190	1790201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016011	CGCCTA	2	12	1860177	1860188	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016011	TTTCCT	2	12	1861831	1861842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016011	TTGAAT	2	12	1863403	1863414	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016011	AAATGG	2	12	1864385	1864396	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016011	GTTTTT	2	12	1868853	1868864	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016011	AAAAAT	2	12	1954473	1954484	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016011	CTCTAT	2	12	1972407	1972418	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016011	TCATTT	2	12	1973606	1973617	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016011	ATTGTA	2	12	1981631	1981642	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016011	GTTTTC	2	12	2003626	2003637	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_016011	CAAAAA	2	12	2021613	2021624	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_016011	AGAAAA	2	12	2032314	2032325	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016011	CTTTTT	2	12	2088911	2088922	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016011	GAAGTT	2	12	2144595	2144606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016011	AAAGGA	2	12	2162826	2162837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016011	CTGTTG	2	12	2183566	2183577	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_016011	GATAAT	2	12	2205283	2205294	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016011	TCCACT	2	12	2213967	2213978	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016011	CTTTTT	2	12	2265992	2266003	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_016011	TTTCTT	2	12	2281448	2281459	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_016011	ATCTGT	2	12	2282830	2282841	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_016011	ACTTTT	2	12	2282852	2282863	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_016011	AATTCA	2	12	2283719	2283730	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_016011	GTTCCA	2	12	2286863	2286874	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016011	AAATTG	2	12	2315767	2315778	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016011	CTCTGT	2	12	2322606	2322617	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016011	ACTTCT	2	12	2381468	2381479	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016011	TTTCAT	2	12	2381592	2381603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
136	NC_016011	CGCCTA	2	12	2418824	2418835	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016011	TTTCCT	2	12	2420724	2420735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016011	TTGAAT	2	12	2422296	2422307	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016011	TTTAAA	2	12	2430112	2430123	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016011	CGAGAA	2	12	2430232	2430243	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_016011	AGCTAA	2	12	2447859	2447870	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
142	NC_016011	CGTCAT	2	12	2487774	2487785	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_016011	TAAAAT	2	12	2494708	2494719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016011	TGTGTA	2	12	2518981	2518992	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016011	TATCCT	2	12	2533144	2533155	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_016011	TTAAAA	2	12	2533282	2533293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016011	TTATCT	2	12	2534426	2534437	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
148	NC_016011	AAATTT	2	12	2583806	2583817	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016011	CTAATA	2	12	2591399	2591410	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
150	NC_016011	AACATA	2	12	2605976	2605987	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
151	NC_016011	AGCTAT	2	12	2614200	2614211	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
152	NC_016011	GCCTAA	2	12	2645587	2645598	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_016011	CGCCTA	2	12	2648800	2648811	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
154	NC_016011	TTTCCT	2	12	2650700	2650711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_016011	TTGAAT	2	12	2652272	2652283	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
156	NC_016011	CCAAGA	2	12	2654702	2654713	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
157	NC_016011	GATAAT	2	12	2655460	2655471	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016011	CCTCTT	2	12	2696493	2696504	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
159	NC_016011	TATTTT	2	12	2700915	2700926	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_016011	CATTGG	2	12	2731965	2731976	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
161	NC_016011	GAAGTG	2	12	2749942	2749953	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016011	TCCTAA	2	12	2751816	2751827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_016011	TATCTA	2	12	2761183	2761194	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
164	NC_016011	CATTAC	2	12	2782849	2782860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_016011	ACTAAA	2	12	2784725	2784736	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
166	NC_016011	CATAAT	2	12	2792174	2792185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
167	NC_016011	TAATCA	2	12	2806861	2806872	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
168	NC_016011	AGGAGT	2	12	2823346	2823357	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
169	NC_016011	TGATTT	2	12	2849469	2849480	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
170	NC_016011	CAGCCT	2	12	2852279	2852290	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
171	NC_016011	GTTTTT	2	12	2853150	2853161	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
172	NC_016011	TAAATT	2	12	2872905	2872916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.