MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55

Total Repeats: 977

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016011	AACAAA	2	12	1030	1041	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	347547511
2	NC_016011	GAAATT	2	12	6226	6237	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347547515
3	NC_016011	GGCGGA	2	12	6367	6378	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	347547515
4	NC_016011	TTTGAT	2	12	6598	6609	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347547515
5	NC_016011	TCGTAC	2	12	6615	6626	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347547515
6	NC_016011	TTATAT	2	12	7632	7643	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547515
7	NC_016011	AGAAAA	2	12	11000	11011	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347547517
8	NC_016011	AACATC	2	12	21274	21285	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	347547526
9	NC_016011	AAGTTA	2	12	25348	25359	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347547529
10	NC_016011	TTTAGT	2	12	26762	26773	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347547530
11	NC_016011	GAAGTG	2	12	27514	27525	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347547532
12	NC_016011	GTTTAA	2	12	29980	29991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347547535
13	NC_016011	TAAAAT	2	12	30639	30650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547536
14	NC_016011	TATACG	2	12	38369	38380	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347547542
15	NC_016011	TTATGT	2	12	40750	40761	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347547544
16	NC_016011	ATCGTT	2	12	41724	41735	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347547545
17	NC_016011	GTGGCG	2	12	42966	42977	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	347547546
18	NC_016011	AAAGAT	2	12	44406	44417	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347547547
19	NC_016011	TGAAAT	2	12	45244	45255	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347547548
20	NC_016011	TGGCGG	2	12	48377	48388	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	347547552
21	NC_016011	TCAAAA	2	12	48503	48514	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	347547552
22	NC_016011	AGGTAA	2	12	54962	54973	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347547560
23	NC_016011	GCAGAG	2	12	59484	59495	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347547564
24	NC_016011	ATTGTG	2	12	62184	62195	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347547564
25	NC_016011	TTTTGC	2	12	62328	62339	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	347547565
26	NC_016011	CCAAAG	2	12	71630	71641	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	347547571
27	NC_016011	ATATAA	2	12	72152	72163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547571
28	NC_016011	TTTGAA	2	12	76719	76730	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347547576
29	NC_016011	GCAATG	2	12	90532	90543	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347547586
30	NC_016011	TTAATA	2	12	91823	91834	50 %	50 %	0 %	0 %	347547588
31	NC_016011	AATACC	2	12	95288	95299	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	347547591
32	NC_016011	TAGCAG	2	12	99245	99256	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347547595
33	NC_016011	GGCGGA	2	12	99691	99702	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	347547595
34	NC_016011	TAATAT	2	12	104423	104434	50 %	50 %	0 %	0 %	347547601
35	NC_016011	TCAGCA	2	12	112373	112384	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347547608
36	NC_016011	CTCCAA	2	12	117307	117318	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	347547612
37	NC_016011	AGTTGT	2	12	120986	120997	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347547618
38	NC_016011	TCGATT	2	12	123624	123635	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347547619
39	NC_016011	ATAAAA	2	12	127291	127302	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347547623
40	NC_016011	AGTAAA	2	12	132893	132904	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347547626
41	NC_016011	GTTTTA	2	12	133211	133222	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347547627
42	NC_016011	TACTTC	2	12	136194	136205	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	347547630
43	NC_016011	AAAACT	2	12	138107	138118	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	347547631
44	NC_016011	GGTCAA	2	12	141007	141018	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347547633
45	NC_016011	GAAAAA	2	12	145907	145918	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347547639
46	NC_016011	GGATTA	2	12	148748	148759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547640
47	NC_016011	GTTTTC	2	12	149601	149612	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	347547641
48	NC_016011	AAAATG	2	12	152602	152613	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347547645
49	NC_016011	TTTTTA	2	12	154658	154669	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347547649
50	NC_016011	AAGCAA	2	12	156094	156105	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	347547650
51	NC_016011	CAGCAC	2	12	159429	159440	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	347547652
52	NC_016011	ATTATG	2	12	162168	162179	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347547655
53	NC_016011	CACCAT	2	12	163687	163698	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	347547656
54	NC_016011	AAAAGA	2	12	165189	165200	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347547657
55	NC_016011	AAAGAA	2	12	168456	168467	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347547658
56	NC_016011	ACTGTA	2	12	173928	173939	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347547661
57	NC_016011	CATTGA	2	12	175688	175699	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347547664
58	NC_016011	AGTGGT	2	12	176761	176772	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	347547665
59	NC_016011	AGTGAA	2	12	176872	176883	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347547665
60	NC_016011	ATTGTT	2	12	178825	178836	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347547668
61	NC_016011	CGTCCA	2	12	185271	185282	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	347547674
62	NC_016011	CTTTTT	2	12	185846	185857	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	347547675
63	NC_016011	GAAAAA	2	12	188240	188251	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347547676
64	NC_016011	TGTTAA	2	12	188705	188716	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347547676
65	NC_016011	AATATT	2	12	189360	189371	50 %	50 %	0 %	0 %	347547676
66	NC_016011	TTCTTT	2	12	198020	198031	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	347547682
67	NC_016011	CAATTA	2	12	200029	200040	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347547684
68	NC_016011	GAAAAA	2	12	201337	201348	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347547686
69	NC_016011	AAAAGA	2	12	202032	202043	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347547686
70	NC_016011	AAGTAG	2	12	207160	207171	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347547689
71	NC_016011	GGCGGT	2	12	210769	210780	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	347547691
72	NC_016011	AGTAGG	2	12	213771	213782	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347547693
73	NC_016011	AGCAGA	2	12	214098	214109	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347547693
74	NC_016011	ATCCCC	2	12	214936	214947	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	347547694
75	NC_016011	GATTTG	2	12	217280	217291	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347547695
76	NC_016011	CCAGAA	2	12	219250	219261	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	347547698
77	NC_016011	TAGGAA	2	12	221015	221026	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347547699
78	NC_016011	ACGTGT	2	12	240647	240658	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347547707
79	NC_016011	GCAGTA	2	12	241233	241244	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347547707
80	NC_016011	TGCGGA	2	12	241802	241813	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347547707
81	NC_016011	TTGGTT	2	12	249425	249436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547712
82	NC_016011	ACAGTA	2	12	255165	255176	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347547721
83	NC_016011	CTGTAG	2	12	258666	258677	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347547727
84	NC_016011	GACAAT	2	12	260188	260199	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347547729
85	NC_016011	GTGAGC	2	12	260643	260654	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347547729
86	NC_016011	ATTGAT	2	12	260837	260848	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347547729
87	NC_016011	TAAAAA	2	12	261907	261918	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347547730
88	NC_016011	TGAATC	2	12	262692	262703	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347547731
89	NC_016011	GCTACT	2	12	264384	264395	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347547732
90	NC_016011	TTCTGA	2	12	267458	267469	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347547734
91	NC_016011	AAGAAA	2	12	270673	270684	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347547736
92	NC_016011	CTGGTA	2	12	276843	276854	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347547737
93	NC_016011	TACGAG	2	12	282110	282121	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347547743
94	NC_016011	TGCAGA	2	12	286619	286630	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347547746
95	NC_016011	AAAAGA	2	12	291842	291853	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	347547750
96	NC_016011	ACGTTG	2	12	293068	293079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347547751
97	NC_016011	TTAAAA	2	12	298667	298678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547756
98	NC_016011	TTTTGA	2	12	300444	300455	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347547758
99	NC_016011	GTTGCA	2	12	302062	302073	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	347547759
100	NC_016011	TGAATT	2	12	302901	302912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347547760
101	NC_016011	ATGAAA	2	12	304883	304894	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347547761
102	NC_016011	GAGAAA	2	12	308352	308363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547764
103	NC_016011	CAGAAG	2	12	311672	311683	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347547766
104	NC_016011	GATAAA	2	12	313243	313254	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347547768
105	NC_016011	TTACGA	2	12	314426	314437	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347547768
106	NC_016011	TTTATT	2	12	317849	317860	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	347547772
107	NC_016011	CAGAAG	2	12	320813	320824	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347547776
108	NC_016011	GACGAA	2	12	322540	322551	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347547778
109	NC_016011	TAATAC	2	12	328224	328235	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	347547781
110	NC_016011	ATTAGC	2	12	331261	331272	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347547784
111	NC_016011	TCATTT	2	12	333459	333470	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347547787
112	NC_016011	TAAAAG	2	12	336598	336609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	347547790
113	NC_016011	TATAAA	2	12	341015	341026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547795
114	NC_016011	CCCAAC	2	12	351165	351176	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547807
115	NC_016011	TAAAGT	2	12	352544	352555	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347547808
116	NC_016011	GCAGAA	2	12	354305	354316	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	347547810
117	NC_016011	CTTTTT	2	12	357386	357397	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	347547815
118	NC_016011	TGTTTT	2	12	357537	357548	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	347547815
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231	NC_016011	TTACTT	2	12	681600	681611	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	347548108
232	NC_016011	TATGAA	2	12	684669	684680	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	347548113
233	NC_016011	TAGAAG	2	12	687619	687630	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	347548116
234	NC_016011	TCGAAG	2	12	693698	693709	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347548122
235	NC_016011	GCCAAT	2	12	696121	696132	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	347548126
236	NC_016011	CAAATG	2	12	696706	696717	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347548127
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342	NC_016011	GAATCA	2	12	1058746	1058757	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347548464
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