MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55

Total Repeats: 467

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016011	TACAT	2	10	291	300	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016011	TATTT	2	10	4222	4231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016011	ATTTT	2	10	4493	4502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016011	AGAGA	2	10	15936	15945	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016011	TTTGG	2	10	32727	32736	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016011	TAAAA	2	10	50684	50693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016011	TTATG	2	10	52891	52900	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016011	ATATT	2	10	58590	58599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016011	AACAA	2	10	64128	64137	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016011	AATTA	2	10	72820	72829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016011	TATCA	2	10	77092	77101	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016011	TTTGT	2	10	80010	80019	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016011	AAAGA	2	10	96453	96462	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016011	ACCTT	2	10	102733	102742	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016011	TATCA	2	10	106061	106070	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016011	AGGAT	2	10	110157	110166	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016011	TATCC	2	10	110191	110200	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_016011	GAGAA	2	10	116011	116020	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016011	ATTTA	2	10	118486	118495	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016011	ACTGA	2	10	120175	120184	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016011	GATAA	2	10	132997	133006	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016011	ATAGT	2	10	133116	133125	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016011	TTCGA	2	10	139775	139784	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016011	AACCG	2	10	175902	175911	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_016011	ATAGA	2	10	175985	175994	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016011	TTGTC	2	10	181509	181518	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_016011	TGAAT	2	10	181563	181572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016011	ATTAA	2	10	181574	181583	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016011	GTATC	2	10	187393	187402	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016011	ATATT	2	10	187859	187868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016011	ATATA	2	10	189664	189673	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016011	GAAAA	2	10	189846	189855	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016011	AAAAG	2	10	189927	189936	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016011	AAAAT	2	10	190139	190148	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016011	TTTGA	2	10	190585	190594	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016011	TTATT	2	10	190983	190992	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016011	CTTTG	2	10	194565	194574	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016011	GAGTG	2	10	199170	199179	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016011	CAAAT	2	10	200498	200507	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016011	GCAAA	2	10	209788	209797	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016011	ATGAT	2	10	212456	212465	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016011	GAAAA	2	10	215485	215494	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016011	GAAAA	2	10	215690	215699	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016011	AAACA	2	10	215783	215792	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016011	GAAAA	2	10	215894	215903	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016011	GAAAA	2	10	216100	216109	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016011	GAAAA	2	10	216304	216313	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016011	GAAAA	2	10	216504	216513	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016011	GAATA	2	10	219590	219599	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016011	ATTTT	2	10	221142	221151	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016011	TAATT	2	10	221473	221482	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016011	TCGTG	2	10	222632	222641	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_016011	AAGGT	2	10	224101	224110	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016011	TAATT	2	10	227493	227502	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016011	TCGTG	2	10	228652	228661	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016011	AAGGT	2	10	230121	230130	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016011	TAAAT	2	10	242252	242261	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016011	TGTGG	2	10	243204	243213	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016011	TGCTT	2	10	245904	245913	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_016011	GGCAT	2	10	254870	254879	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016011	AGTGA	2	10	276996	277005	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016011	AACTA	2	10	280455	280464	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016011	AAAGA	2	10	288156	288165	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016011	AGAAA	2	10	290923	290932	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016011	AAACT	2	10	302351	302360	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016011	AAACG	2	10	308083	308092	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016011	ATAAA	2	10	318500	318509	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016011	AATTT	2	10	319353	319362	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016011	AAATA	2	10	320322	320331	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016011	AAAGA	2	10	320341	320350	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016011	AAGCC	2	10	321058	321067	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_016011	AGTCG	2	10	323374	323383	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016011	GGGAA	2	10	326844	326853	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016011	TAAGA	2	10	369140	369149	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016011	TTTTA	2	10	369159	369168	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016011	ATGTA	2	10	374309	374318	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016011	TTATG	2	10	376901	376910	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016011	AGGTG	2	10	376936	376945	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016011	AAAAT	2	10	383735	383744	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016011	AAGAA	2	10	387137	387146	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016011	TGAAT	2	10	406837	406846	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016011	TTAAT	2	10	406960	406969	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016011	TAATT	2	10	421985	421994	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016011	AATAT	2	10	422542	422551	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016011	TAATA	2	10	422753	422762	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016011	ATACA	2	10	423317	423326	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_016011	AATCA	2	10	441254	441263	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_016011	AGTAG	2	10	461202	461211	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016011	TTAAA	2	10	461480	461489	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016011	AATTC	2	10	469858	469867	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_016011	TATAG	2	10	486128	486137	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016011	ATAAA	2	10	486232	486241	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016011	TCTAT	2	10	489331	489340	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_016011	TGACG	2	10	490162	490171	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016011	AATTT	2	10	502710	502719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016011	TAAAA	2	10	513591	513600	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016011	TTTTA	2	10	513616	513625	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016011	TTTAA	2	10	519517	519526	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016011	CTATG	2	10	521436	521445	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_016011	ATTTT	2	10	525860	525869	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016011	TAATT	2	10	528671	528680	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016011	ATAAA	2	10	543519	543528	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016011	AAAAT	2	10	557935	557944	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016011	ATTGT	2	10	558030	558039	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016011	ATTAA	2	10	571364	571373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016011	TGAAA	2	10	571581	571590	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016011	CTTAT	2	10	590050	590059	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_016011	TAAAC	2	10	590730	590739	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_016011	TTTTA	2	10	591291	591300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016011	CTTGA	2	10	595526	595535	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_016011	TTTCA	2	10	605230	605239	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_016011	CTTCA	2	10	614849	614858	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_016011	GTTTT	2	10	618212	618221	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016011	ATCGC	2	10	619022	619031	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
115	NC_016011	TCAAT	2	10	619057	619066	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_016011	TTTCC	2	10	619377	619386	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_016011	TTTGT	2	10	620500	620509	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016011	TAAAA	2	10	626656	626665	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016011	TTGGG	2	10	655168	655177	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016011	TTACT	2	10	658597	658606	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_016011	TGGAT	2	10	658651	658660	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016011	AAATA	2	10	662015	662024	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016011	TTTTA	2	10	662898	662907	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016011	AAAAG	2	10	709463	709472	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016011	GATCG	2	10	714367	714376	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016011	TAAAT	2	10	735914	735923	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016011	TTACC	2	10	737079	737088	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_016011	CATTA	2	10	737576	737585	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016011	AAAAT	2	10	737808	737817	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016011	AGGAA	2	10	738502	738511	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016011	TTCTA	2	10	745146	745155	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016011	TTTAG	2	10	763098	763107	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016011	AACTA	2	10	771409	771418	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016011	AGATT	2	10	790461	790470	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016011	TCTGT	2	10	790762	790771	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016011	ACTGG	2	10	790874	790883	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016011	ACTTA	2	10	791063	791072	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_016011	AAAAT	2	10	791199	791208	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016011	GGAAT	2	10	791727	791736	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016011	GTATA	2	10	793526	793535	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016011	AAAGC	2	10	800328	800337	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_016011	TAAAA	2	10	801522	801531	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016011	ATTTT	2	10	805817	805826	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016011	GTTAG	2	10	811156	811165	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016011	AATTT	2	10	813650	813659	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016011	TGTTT	2	10	825206	825215	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016011	TAAAG	2	10	847749	847758	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016011	AATGT	2	10	854944	854953	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_016011	GAAAA	2	10	863299	863308	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016011	ATGTC	2	10	865450	865459	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_016011	TAAAA	2	10	874193	874202	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016011	GTTTA	2	10	876394	876403	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016011	TTACT	2	10	876411	876420	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_016011	GGTAA	2	10	901525	901534	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016011	TTTAA	2	10	903516	903525	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_016011	ATAGA	2	10	905999	906008	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
157	NC_016011	TTTAT	2	10	937765	937774	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016011	TTTTA	2	10	949475	949484	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_016011	ATAGA	2	10	949527	949536	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_016011	TATAC	2	10	955146	955155	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
161	NC_016011	TTCCA	2	10	966841	966850	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
162	NC_016011	CGTAA	2	10	967963	967972	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
163	NC_016011	TTTTA	2	10	969173	969182	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_016011	TGGAT	2	10	969218	969227	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
165	NC_016011	TAAAA	2	10	971726	971735	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_016011	TTTTA	2	10	977013	977022	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_016011	CTTTT	2	10	979263	979272	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
168	NC_016011	TATAA	2	10	981999	982008	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_016011	GAGAG	2	10	1007411	1007420	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
170	NC_016011	TTCTA	2	10	1012094	1012103	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
171	NC_016011	TTTCT	2	10	1021053	1021062	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_016011	ATAAA	2	10	1028343	1028352	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_016011	AAAAC	2	10	1028355	1028364	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_016011	ACTAA	2	10	1028466	1028475	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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181	NC_016011	AAAAG	2	10	1046912	1046921	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_016011	ATAAA	2	10	1059863	1059872	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_016011	GCTAT	2	10	1060735	1060744	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
187	NC_016011	GTTTT	2	10	1062908	1062917	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
188	NC_016011	TCGTT	2	10	1063456	1063465	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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191	NC_016011	AAAAT	2	10	1080766	1080775	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_016011	ATTTT	2	10	1080806	1080815	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_016011	AAATT	2	10	1114532	1114541	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_016011	TAAAA	2	10	1119686	1119695	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_016011	AGCGA	2	10	1124340	1124349	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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199	NC_016011	TTGGA	2	10	1136673	1136682	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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219	NC_016011	TGGAT	2	10	1249040	1249049	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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227	NC_016011	ATTAA	2	10	1291477	1291486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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253	NC_016011	TACTA	2	10	1431035	1431044	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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275	NC_016011	AATAT	2	10	1623586	1623595	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_016011	TAAAA	2	10	1628040	1628049	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_016011	ATGTA	2	10	1704577	1704586	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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424	NC_016011	CCTCA	2	10	2628066	2628075	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
425	NC_016011	ATCAT	2	10	2630630	2630639	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
426	NC_016011	AATAG	2	10	2644271	2644280	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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428	NC_016011	CACGA	2	10	2651177	2651186	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
429	NC_016011	AATTA	2	10	2652336	2652345	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
430	NC_016011	TTTGC	2	10	2656763	2656772	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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439	NC_016011	TTTTA	2	10	2712971	2712980	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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442	NC_016011	AAAAC	2	10	2722794	2722803	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
443	NC_016011	ATACT	2	10	2751728	2751737	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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445	NC_016011	TTTTA	2	10	2761166	2761175	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
446	NC_016011	TTCAA	2	10	2762326	2762335	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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455	NC_016011	CTTCA	2	10	2826174	2826183	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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462	NC_016011	GTTCT	2	10	2900139	2900148	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
463	NC_016011	ACATT	2	10	2908469	2908478	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
464	NC_016011	ATATT	2	10	2918914	2918923	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
465	NC_016011	ATTTG	2	10	2918996	2919005	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
466	NC_016011	AAATT	2	10	2919186	2919195	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
467	NC_016011	ATCAT	2	10	2928179	2928188	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.